علم التشريح

يقدم المقطع لمحة عامة عن وظائف خادم التصوير التشريحي.

موقع Anatomography هو موقع إلكتروني تفاعلي يدعم إنشاء رسومات تشريحية ورسوم متحركة لجسم الإنسان. يتولى مركز DBCLS (مركز قواعد بيانات علوم الحياة) البحثي غير الربحي، التابع لجامعة طوكيو، صيانة هذا الموقع. الرسومات التشريحية التي يُنشئها Anatomography، وبيانات المضلعات ثلاثية الأبعاد المستخدمة على الموقع (المسماة BodyParts3D)، متاحة مجانًا بموجب ترخيص Creative Commons Attribution-ShareAlike.

وصف

تم إطلاق مشروع Anatomography في 9 فبراير 2009 [ 1 ] من قبل المؤسس والمدير الرئيسي كوساكو أوكوبو ، أستاذ بنك بيانات الحمض النووي في اليابان في المعهد الوطني لعلم الوراثة .

تُسمى بيانات المضلعات لجسم الإنسان المستخدمة في الموقع " BodyParts3D ". [ 3 ] تُستخرج بيانات المضلعات BodyParts3D من صور الرنين المغناطيسي لكامل الجسم . تُسمى مجموعة صور الرنين المغناطيسي التي يستند إليها BodyParts3D "TARO". تارو اسم شائع للذكور في اللغة اليابانية، كما هو الحال مع جون في اللغة الإنجليزية. TARO عبارة عن مجموعة بيانات فوكسل بحجم 2 مم × 2 مم × 2 مم لجسم الإنسان الذكر، أنشأها المعهد الوطني لتكنولوجيا المعلومات والاتصالات . [ 4 ] نُشرت TARO مجانًا في نوفمبر 2004. [ 5 ] [ 6 ]

تتم عملية بناء BodyParts3D على النحو التالي. [ 3 ]

  • المرحلة 1: تم إدخال تقسيمات تشريحية إضافية في بيانات TARO الأصلية.
  • المرحلة الثانية: بعد ذلك، تم استكمال التفاصيل المفقودة وتوضيح الخطوط الضبابية باستخدام برنامج تحرير ثلاثي الأبعاد بالرجوع إلى الكتب المدرسية والأطالس [ 7 ] ونماذج المحاكاة التي أعدها الرسامون الطبيون.
  • المرحلة الثالثة: سيستمر المزيد من التجزئة وتعديل البيانات بالتعاون مع الباحثين السريريين حتى يتم تحقيق تغطية كافية للمفهوم.

تُوزَّع بيانات مضلعات BodyParts3D بصيغة ملف OBJ . يبلغ حجم ملف البيانات الكامل 127 ميجابايت (بعد تقليل عدد المضلعات) و521 ميجابايت (بجودة عالية) اعتبارًا من الإصدار 3.0. [ 8 ] ويبلغ عدد أجزاء الجسم (الأعضاء) المسجلة في BodyParts3D 1523 جزءًا اعتبارًا من الإصدار 3.0. [ 7 ]

رخصة

الصور التي تم إنشاؤها بواسطة برنامج Anatomography وبيانات المضلعات المضمنة في برنامج BodyParts3D مرخصة بموجب رخصة المشاع الإبداعي ، [ 2 ] على أمل توسيع نطاق استخدامها وإتاحة المعرفة الطبية للجميع. [ 9 ]

التمويل

تم تمويل مشروع BodyParts3D/Anatomography من قبل وزارة التعليم والثقافة والرياضة والعلوم والتكنولوجيا اليابانية (MEXT ) من السنة المالية 2007 إلى السنة المالية 2010. [ 10 ] [ 11 ] واعتبارًا من السنة المالية 2011، أصبح المشروع ممولًا من قبل وكالة العلوم والتكنولوجيا اليابانية (JST ). [ 11 ]

استقبال

تُستخدم الرسوم البيانية من برنامج Anatomography، على سبيل المثال، في البرنامج التلفزيوني العلمي الكندي Le code Chastenay ، [ 12 ] وموسوعة الإنترنت ويكيبيديا، كمادة تعليمية في الجامعات، وفي أماكن أخرى لتبادل المعرفة. [ 9 ] وفيما يتعلق باستخدام برنامج Anatomography على مواقع مثل ويكيبيديا وويكيميديا ​​كومنز، يقول المطورون: "كان انتشار استخدامات البرنامج من قِبل مستخدمين مجهولين على مواقع مثل ويكيبيديا وويكيميديا ​​كومنز هو ما توقعناه". [ 9 ]

الميزات التقنية

يستخدم مشروع BodyParts3D/Anatomography النموذج التأسيسي للتشريح (FMA). يُعدّ FMA أنطولوجيا تشريحية مفتوحة المصدر، طُوّرت وتُدار من قِبل مجموعة المعلوماتية الهيكلية في جامعة واشنطن . في BodyParts3D، يُدار كل جزء من أجزاء الجسم بواسطة مُعرّف FMA (FMAID) مُحدّد من قِبل FMA. على سبيل المثال، يُسجّل العمود الفقري برقم FMA13478 ، والفص الصدغي برقم FMA61825 ، وهكذا.

سجل الإصدارات

  • الإصدار 1.0 (9 فبراير 2009) [ 1 ]
  • الإصدار 2.0 (28 أبريل 2010) [ 13 ] يبلغ إجمالي عدد أجزاء الجسم 1324. [ 14 ]
  • الإصدار 3.0 (20 يونيو 2011) إجمالي عدد أجزاء الجسم هو 1523. [ 7 ]
  • الإصدار 4.0 (16 مايو 2013) [ 15 ]

خدمات مماثلة

  • الإنسان الرقمي الحيوي - خدمة ويب مجانية ومنتج تجاري مقدم من شركة BioDigital , Inc. ومقرها نيويورك، نيويورك، الولايات المتحدة الأمريكية. نُشر الإنسان الرقمي الحيوي عام 2011. وفاز الموقع الإلكتروني بجائزة SXSW التفاعلية عام 2013.

آحرون

تتوفر بعض مقاطع الفيديو التعليمية حول استخدام التصوير التشريحي على موقع يوتيوب ، [ 16 ] انظر الروابط الخارجية .

صور إضافية

انظر أيضاً

مراجع

  1. ١ ٢ ٣ ملاحظات الإصدار (باللغة اليابانية). DBCLS. تم الاسترجاع بتاريخ ١٢-١٠-٢٠١٢.
  2. ١ ٢ الأسئلة الشائعة - حقوق النشر. (باللغة اليابانية) DBCLS. تم الاطلاع عليه بتاريخ ١٢-١٠-٢٠١٢.
  3. 1 2 ميتسوهاشي، ن؛ فوجيدا، ك؛ تامورا، ت؛ كاواموتو، س؛ تاكاجي، ت؛ أوكوبو، ك (2009). "BodyParts3D: قاعدة بيانات ثلاثية الأبعاد للهياكل التشريحية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 37 (عدد قواعد البيانات): D782–5. doi : 10.1093/nar/ gkn613 . PMC 2686534. PMID 18835852 .  أيقونة الوصول المفتوح
  4. ناغاوكا، ت؛ واتانابي، س؛ ساكوراي، ك؛ كونيدا، إ؛ واتانابي، س؛ تاكي، م؛ ياماناكا، ي (2004). "تطوير نماذج فوكسل واقعية عالية الدقة لكامل الجسم لذكور وإناث يابانيين بالغين متوسطي الطول والوزن، وتطبيق هذه النماذج على قياس جرعات المجال الكهرومغناطيسي بترددات الراديو". الفيزياء في الطب وعلم الأحياء . 49 (1): 1-15 . Bibcode : 2004PMB....49....1N . doi : 10.1088/0031-9155/49/1/001 . PMID 14971769 . 
  5. 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10 (باللغة اليابانية). ITMedia. تم الاسترجاع 2012/10/12.
  6. 報道発表: تم إصداره في 2004-11-10 (في اليابانية). المعهد الوطني لتكنولوجيا المعلومات والاتصالات. تم الاسترجاع 2012/10/12.
  7. 1 2 3 ملاحظات إصدار BodyParts3D (الإصدار 3.0، 20/6/2011)DBCLS. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15-10-2012.
  8. تنزيل - BodyParts3D DBCLS. تم الاسترجاع بتاريخ 15-10-2012.
  9. 1 2 3 ​بعنوان "BodyParts3D" Anatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」(في (اليابانية)シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ~10年先のデタベスを考える~」/ نوبوتاكا ميتسوهاشي، كاوري فوجيدا، شيو إيماي، إيسامو موتو، تاكورو تامورا، شوكو كاواموتو، توشيهيسا تاكاجي وكوساكو أوكوبو "BodyParts3D and Anatomography: مواد تحفز تبادل المعلومات في الطب" عرض ملصق في "الندوة: نحو مستقبل علوم الحياة - قواعد بيانات التفكير بعد 10 سنوات" التي عقدت في جامعة طوكيو في 2010-10-05. تم الاطلاع عليه بتاريخ 12-10-2012.
  10. وصف قاعدة بيانات BodyParts3D، أرشيف قاعدة بيانات علوم الحياة. تم الاسترجاع بتاريخ 19-10-2012.
  11. ١ ٢ الأسئلة الشائعة - حول مركز قاعدة بيانات علوم الحياة (DBCLS) مؤرشف بتاريخ ٣٠ يناير ٢٠١٣ في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine ). تم الاطلاع عليه بتاريخ ١٩ أكتوبر ٢٠١٢.
  12. «الرمز القانوني لشاستناي» الحلقة 48، مؤرشفة بتاريخ 4 مارس 2016 في أرشيف الإنترنت ، بُثت بتاريخ 19 يناير 2010
  13. تحديثات "BodyParts3D/Anatomography" مؤرشفة في 5 يونيو 2010، على موقع Wayback Machine . نُشرت في 28 أبريل 2010. DBCLS. تم الاسترجاع في 16 أكتوبر 2012.
  14. ملاحظات إصدار BodyParts3D (الإصدار 2.0، 28/4/2010) DBCLS. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15/10/2012.
  15. "ملاحظات إصدار BodyParts3D، الإصدار 4.0" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 18-11-2015.
  16. كاوانو، س؛ أونو، هـ؛ تاكاجي، ت؛ بونو، هـ (2012). "مقاطع فيديو تعليمية لموارد المعلوماتية الحيوية: تجربة توزيع عبر الإنترنت في اليابان باسم TogoTV" . موجزات في المعلوماتية الحيوية . 13 (2): 258-268 . doi : 10.1093/bib/bbr039 . PMC 3294242. PMID 21803786 .  أيقونة الوصول المفتوح
  17. مؤتمر "موازنة حماية الملكية الفكرية ومشاركة البيانات في العلوم" الذي عُقد في جامعة طوكيو، 5 أكتوبر 2009. عرض أوكوبو باللغة اليابانية، مؤرشف في 10 يونيو 2013 على موقع Wayback Machine ، قبل محاضرة لورانس ليسيغ مباشرةً . تتوفر مقاطع فيديو كاملة لكل محاضرة على صفحة جدول برنامج المؤتمر على موقع الويب (جزء منها باللغة اليابانية، وجزء آخر باللغة الإنجليزية). مؤرشف في 4 فبراير 2013 على موقع Wayback Machine .