استدعاء القاعدة

تحديد القواعد النيتروجينية هو عملية ربط القواعد النيتروجينية بقمم الكروماتوجرام ، أو إشارات شدة الضوء، أو تغيرات التيار الكهربائي الناتجة عن مرور النيوكليوتيدات عبر المسام النانوية . أحد برامج الحاسوب المستخدمة في هذه العملية هو برنامج Phred ، الذي كان برنامجًا شائع الاستخدام لتحديد القواعد النيتروجينية في مختبرات تسلسل الحمض النووي الأكاديمية والتجارية على حد سواء، وذلك لدقته العالية في تحديد القواعد النيتروجينية. ^{[ 1 ]}

تُجرى عملية تحديد القواعد حاليًا بشكل شائع بواسطة برامج مدمجة في الجهاز، مثل خط أنابيب التحليل في الوقت الحقيقي (RTA) الخاص، والذي يتميز بتكامله العالي وتحديثه مع كل إصدار جديد من المنصة. ^{[ 2 ]}

تستخدم برامج تحليل التسلسل بتقنية النانوبور، مثل Guppy أو Dorado ، الشبكات العصبية المدربة على الإشارات الحالية المستمدة من بيانات التسلسل الدقيقة. ^{[ 3 ]}

يمكن تقييم دقة تحديد القواعد باستخدام مقياسين: دقة القراءة ودقة التسلسل التوافقي. تشير دقة القراءة إلى مدى دقة القاعدة المحددة مقارنةً بمرجع معروف. أما دقة التسلسل التوافقي فتشير إلى مدى دقة التسلسل التوافقي مقارنةً بالقراءات المتداخلة من نفس الموضع الجيني . ^{[ 3 ]}