انتفاخ بيتا
يمكن وصف انتفاخ بيتا بأنه اضطراب موضعي في الروابط الهيدروجينية المنتظمة لصفائح بيتا ، وذلك بإدخال بقايا إضافية في أحد أو كلا خيطي بيتا المرتبطين بروابط هيدروجينية. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
الأنواع
يمكن تصنيف انتفاخات بيتا وفقًا لطول التمزق، وعدد الأحماض الأمينية المُدخلة في كل خيط، وما إذا كانت خيوط بيتا الممزقة متوازية أم متضادة، وزواياها ثنائية السطوح (التي تتحكم في موضع سلاسلها الجانبية). يوجد نوعان شائعان. الأول، انتفاخ بيتا الكلاسيكي ، يحدث داخل أو على حافة صفيحة بيتا متضادة التوازي ؛ وعادةً ما يكون للحمض الأميني الأول عند الانتفاخ الخارجي التكوين αR ، بدلاً من التكوين β الطبيعي.
النوع الآخر هو انتفاخ بيتا G1 ، وله نوعان شائعان، وكلاهما يظهر بشكل رئيسي مرتبطًا بالصفائح المتوازية المعاكسة؛ أحد الأحماض الأمينية له بنية α L وعادةً ما يكون جليسين. في أحد النوعين، حلقة انتفاخ بيتا ، تشكل إحدى الروابط الهيدروجينية لانتفاخ بيتا أيضًا انعطاف بيتا أو انعطاف ألفا، بحيث يكون النمط غالبًا في حلقة دبوس شعر بيتا . [ 5 ] في النوع الآخر، رابط بيتا ، يظهر انتفاخ بيتا بالتزامن مع انعطاف بيتا من النوع الثاني ويتداخل معه .
التأثيرات على البنية
على مستوى بنية العمود الفقري، يمكن أن تتسبب انتفاخات بيتا الكلاسيكية في حدوث تمدد بسيط في صفيحة بيتا، على سبيل المثال، الانتفاخ في حلقة بيتا الطويلة لريبونيوكلياز A (بقايا 88-91). كما يمكن أن يتسبب انتفاخ بيتا في طي صفيحة بيتا على نفسها وتقاطعها، على سبيل المثال، عند إدخال بقايا ذات زوايا ثنائية السطوح حلزونية ألفا يسارية ويمنية متقابلة في حلقة بيتا، كما يحدث في Met9 وAsn16 في pseudoazurin (رمز الوصول إلى PDB هو 1PAZ).
تأثير ذلك على وظائف البروتينات
تؤثر الانتفاخات المحفوظة بشكل منتظم على وظائف البروتينات. وتتمثل وظيفتها الأساسية في استيعاب بقايا إضافية ناتجة عن الطفرات وغيرها، مع الحفاظ على نمط الترابط وبالتالي البنية العامة للبروتين. وتشارك انتفاخات أخرى في مواقع ارتباط البروتينات. في حالات محددة، مثل بروتينات عائلة الغلوبولين المناعي، تساعد الانتفاخات المحفوظة في تكوين ثنائيات نطاقات الغلوبولين المناعي. كما أنها ذات أهمية وظيفية في بروتيني DHFR (مختزل ثنائي هيدروفولات) وSOD (ديسموتاز الفائق)، حيث تحيط حلقات تحتوي على انتفاخات بالموقع النشط.
مراجع
- ↑ ريتشاردسون، جيه إس؛ جيتزوف، إي دي ؛ ريتشاردسون، دي سي (1978). "الانتفاخ بيتا: وحدة صغيرة مشتركة في بنية البروتين غير المتكررة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 75 (6): 2574-2578 . Bibcode : 1978PNAS...75.2574R . doi : 10.1073/pnas.75.6.2574 . PMC 392604. PMID 275827 .
- ↑ ريتشاردسون، جيه إس (1981). "تشريح وتصنيف بنية البروتين". التقدم في كيمياء البروتين. 34 : 167-339 . doi : 10.1016/S0065-3233(08)60520-3 . ISBN 9780120342341PMID 7020376
- ↑ تشان، أ. و.؛ هاتشينسون، إ. ج.؛ هاريس، د.؛ ثورنتون، ج. م. (1993). "تحديد وتصنيف وتحليل انتفاخات بيتا في البروتينات" . علوم البروتين . 2 (10): 1574-1590 . doi : 10.1002/pro.5560021004 . PMC 2142268. PMID 8251933 .
- ↑ كرافور، ب؛ جوزيف، أ.ب؛ ريبهمد، ج؛ دي بريفيرن، أ.ج (2013). "انتفاخات بيتا: تحليل بنيوي شامل لعدم انتظام صفائح بيتا" . علم البروتين . 22 (10): 1366-1378 . doi : 10.1002/pro.2324 . PMC 3795495. PMID 23904395 .
- ↑ ميلنر-وايت إي جيه (1987). "انتفاخات بيتا داخل الحلقات كسمات متكررة لبنية البروتين". بيوشيم بيوفيز أكتا . 911 (2): 261-265 . doi : 10.1016/0167-4838(87)90017-3 . PMID 3801498 .
- ريتشاردسون جيه إس، جيتزوف إي دي، ريتشاردسون دي سي (1978). "الانتفاخ بيتا: وحدة صغيرة مشتركة في بنية البروتين غير المتكررة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 75 (6): 2574-2578 . Bibcode : 1978PNAS...75.2574R . doi : 10.1073/pnas.75.6.2574 . PMC 392604. PMID 275827 .
- ريتشاردسون، ج. س. (1981). "تشريح وتصنيف بنية البروتين" . مجلة التقدم في كيمياء البروتين. 34 : 167-339 . doi : 10.1016/S0065-3233(08)60520-3 . ISBN 9780120342341PMID 7020376. مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 فبراير 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 يناير 2009 .
- تشان، أ. و.، هاتشينسون، إ. ج.، هاريس، د.، ثورنتون، ج. م. (1993). " تحديد وتصنيف وتحليل انتفاخات بيتا في البروتينات" . مجلة علوم البروتين . 2 (10): 1574-1590 . doi : 10.1002/pro.5560021004 . PMC 2142268. PMID 8251933 .
- ميلنر-وايت إي جيه (1987). "انتفاخات بيتا داخل الحلقات كسمات متكررة لبنية البروتين". بيوشيم بيوفيز أكتا . 911 (2): 261-265 . doi : 10.1016/0167-4838(87)90017-3 . PMID 3801498 .
- الأنماط البنيوية للبروتين
