الحمض النووي التكميلي (C-DNA)

الحمض النووي C ، المعروف أيضًا باسم الحمض النووي ذو الشكل C ، هو أحد الأشكال الحلزونية المزدوجة العديدة الممكنة للحمض النووي . يمكن تحفيز الحمض النووي على اتخاذ هذا الشكل في ظروف معينة، مثل انخفاض الرطوبة نسبيًا ووجود أيونات معينة ، مثل أيونات الليثيوم (Li +) أو المغنيسيوم (Mg2 +) . مع ذلك، فإن الحمض النووي ذو الشكل C غير مستقر ولا يوجد بشكل طبيعي في الكائنات الحية. في عام 1961، اكتشفه مارفن [ 1 ] عندما حاول تكرار نمط محتوى الماء العالي لملح الصوديوم (Na+) لملح الليثيوم. ما وجده مارفن هو الحمض النووي C شبه البلوري. يصف مصطلح "شبه بلوري" نمط حيود تظهر فيه انعكاسات بلورية عند دقة منخفضة، لكنها تتحول بشكل مستمر عند دقة أعلى. [ 2 ]

بناء

يُعدّ الحمض النووي C-DNA حلزونًا غير متكامل ذو أبعاد متغيرة قليلاً، بمتوسط ​​قيم 3.32 أنغستروم للارتفاع و38.60 درجة للالتواء، مما يُعطي حوالي 9 1/3 وحدة لكل لفة بدلاً من 10 وحدات. [ 2 ] وقد طُرحت نماذج مختلفة للحمض النووي C-DNA على مر السنين. في عام 2000، وجد فان دام وليفيت أن كلاً من الحمض النووي C-DNA والحمض النووي B-DNA يتكونان من شكلين نيوكليوتيديين متميزين، هما BI وB-II. تزيد نسبة شكل B-II في الحمض النووي C-DNA عن 40%، بينما تبلغ هذه النسبة في الحمض النووي B-DNA حوالي 10% فقط. يمكن تفسير التحول من الشكل B إلى الشكل C في الحمض النووي الليفي من خلال التغيرات الشكلية BI وB-II. [ 3 ] يُظهر الشكل في تلك الورقة البحثية النموذج المثالي لهذين الشكلين اللذين نشرهما الباحثان. [ 4 ]

استُخدمت الأيونات المضادة ، مثل الأميدات الأولية، في تجارب أجريت في ظروف قاعدية لإظهار العلاقة بين شكلي الحمض النووي B وC. يعتمد الشكل العام للحمض النووي وتوجيهه بشكل كبير على تسلسله الأولي ، بالإضافة إلى الروابط الهيدروجينية بين أزواج قواعده، والتي تُثبّت وتحافظ على بنية الحلزون المزدوج. وقد ثبت أن الحمض النووي C يحافظ على بنيته في غياب الماء، ويتشكل عند الجفاف. [ 3 ] كما ثبت أن بعض الأميدات، في ظروف قاعدية ورطوبة منخفضة، تحافظ على بنية الشكل C، ولكنها تتحول بسلاسة إلى الحمض النووي من الشكل B مع زيادة الرطوبة. قد يشير هذا إلى وجود ارتباط قوي بين الحمض النووي من الشكلين C وB، وهو ما لوحظ أيضًا عند استخدام ملح الليثيوم في ظروف رطوبة منخفضة. [ 5 ] [ 6 ]

السمات الهندسية (أكثر أشكال الحمض النووي شيوعًا) [ 7 ] [ 8 ]
يصفنموذج أنموذج بنموذج Cشكل Z
حاسة الحلزونأيمنأيمنأيمنعسراء
وحدة متكررة1 نقطة أساس1bp1bp2bp
الدوران/bp32.7 درجة34.3 درجة38.6 درجة60°/2
متوسط ​​ضغط الدم/دورة11109.3312
ارتفاع ضغط الدم على طول المحور2.6 أنجستروم3.4 أنجستروم3.3 أنجستروم3.6–3.8 أنغستروم

انظر أيضاً

مراجع

  1. مارفن، د.أ.؛ سبنسر، م.؛ ويلكنز، م.هـ.ف.؛ هاميلتون، ل.د. (أكتوبر 1961). "التكوين الجزيئي للحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين III. دراسة حيود الأشعة السينية للشكل C لملح الليثيوم" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 3 (5): 547–IN14. doi : 10.1016/S0022-2836(61)80021-1 . PMID 14470668 . 
  2. 1 2 مارفن، د.أ. (2017-08-01). "دراسات حيود الألياف للجزيئات الحيوية الكبيرة" . التقدم في الفيزياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 127 : 43-87 . doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2017.04.005 . ISSN 0079-6107 . PMID 28442432 .  
  3. 1 2 ترافرز، أ.أ.؛ موسخيليشفيلي، ج.؛ طومسون، ج.م.ت. (28-06-2012). "معلومات الحمض النووي: من الشفرة الرقمية إلى البنية التناظرية" . المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية أ: العلوم الرياضية والفيزيائية والهندسية . 370 (1969): 2960-2986 . doi : 10.1098/rsta.2011.0231 . ISSN 1364-503X . PMID 22615471. S2CID 890016 .   
  4. فان دام، لورينز؛ ليفيت، مالكولم هـ. (ديسمبر 2000). "نيوكليوتيدات BII في الشكلين B وC من الحمض النووي البوليمري ذي التسلسل الطبيعي: نموذج جديد للشكل C من الحمض النووي" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 304 (4): 541-561 . doi : 10.1006/jmbi.2000.4194 . PMID 11099379 . 
  5. غوش، أنيربان؛ بانسال، مانجو (1 أبريل 2003). "مسرد لبنية الحمض النووي من الألف إلى الياء" . مجلة أكتا كريستالوغرافيكا، القسم د: علم البلورات البيولوجية . 59 (4): 620-626 . doi : 10.1107/S0907444903003251 . ISSN 0907-4449 . PMID 12657780 .  
  6. برتغال، فرانكلين هـ. (1977). قرن من الحمض النووي : تاريخ اكتشاف بنية ووظيفة المادة الوراثية . جاك س. كوهين. كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. ISBN  978-0-262-16067-4. OCLC 2964854 . 
  7. زيمرمان، إس. بي. (يونيو 1982). "البنية ثلاثية الأبعاد للحمض النووي" . المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 51 (1): 395-427 . doi : 10.1146/annurev.bi.51.070182.002143 . ISSN 0066-4154 . PMID 7051961 .  
  8. سيندن، ريتشارد ر. (1994). بنية ووظيفة الحمض النووي . سان دييغو: أكاديميك برس. ISBN 0-12-645750-6. OCLC 30109829 .