ثنائي فوسفاتاز dUTP
في علم الإنزيمات ، يُعد إنزيم ثنائي فوسفاتاز dUTP ( EC 3.6.1.23 ) إنزيمًا يحفز التفاعل الكيميائي
- dUTP + H 2 OdUMP + ثنائي الفوسفات
وبالتالي، فإن الركيزتين لهذا الإنزيم هما dUTP و H 2 O ، في حين أن منتجيه هما dUMP وثنائي الفوسفات .
ينتمي هذا الإنزيم إلى عائلة الهيدرولازات ، وتحديدًا تلك التي تعمل على أنهيدريدات الأحماض في أنهيدريدات تحتوي على الفوسفور. الاسم النظامي لهذه الفئة من الإنزيمات هو نيوكليوتيدوهيدرولاز dUTP . ومن الأسماء الشائعة الأخرى: ديوكسي يوريدين ثلاثي الفوسفاتاز ، وdUTPase ، وdUTP بيروفوسفاتاز ، وديوكسي يوريدين 5'-ثلاثي الفوسفات نيوكليوتيدوهيدرولاز ، وديوكسي يوريدين 5'-ثلاثي الفوسفاتاز . يشارك هذا الإنزيم في استقلاب البيريميدين .
يؤدي هذا الإنزيم وظيفة مزدوجة: فهو من جهة يزيل dUTP من مخزون الديوكسي نيوكليوتيدات ، مما يقلل من احتمالية دمج هذه القاعدة في الحمض النووي بواسطة بوليميرازات الحمض النووي ، ومن جهة أخرى، ينتج طليعة dTTP، وهي dUMP . ويؤدي نقص أو تثبيط عمل إنزيم dUTPase إلى اضطرابات ضارة في مخزون النيوكليوتيدات، مما ينتج عنه زيادة في محتوى اليوراسيل في الحمض النووي، الأمر الذي يُنشّط حلقة مفرغة مفرطة النشاط لإصلاح الحمض النووي. [ 1 ] [ 2 ]
الدراسات الهيكلية
حتى أواخر عام 2007، تم تحديد 48 بنية لهذه الفئة من الإنزيمات، برموز الوصول التالية في بنكبيانات البروتين ( PDB) : PDB : 1DUC ،PDB : 1DUD ،PDB : 1DUN ،PDB : 1DUP ،PDB : 1DUT ،PDB : 1EU5 ،PDB : 1EUW ، PDB : 1F7D ،PDB : 1F7K ،PDB : 1F7N ،PDB : 1F7O ،PDB : 1F7P ،PDB : 1F7Q ، PDB : 1F7R ،PDB : 1MQ7 ،PDB : 1OGH ،PDB : 1OGK ،PDB : 1OGL ،PDB : 1PKH ، PDB : 1PKJ ،PDB : 1PKK ،PDB :1RN8 ، PDB :1RNJ ، PDB: 1SEH ،PDB : 1SIX ،PDB : 1SJN ،PDB : 1SLH ،PDB : 1SM8 ،PDB : 1SMC ،PDB : 1SNF ،PDB : 1SYL ،PDB : 1VYQ ،PDB : 1W2Y ،PDB : 2BSY ،PDB : 2BT1 ،PDB : 2CJE ،PDB : 2D4L، PDB : 2D4M ,PDB : 2D4N ,PDB : 2HQU ,PDB : 2HR6 ,PDB : 2HRM ,PDB : 2OKB ,PDB : 2OKD ,PDB : 2OKE ,PDB : 2OL0 ,PDB : 2OL1 , and PDB : 2PY4 .
يوجد على الأقل عائلتان متميزتان بنيويًا من إنزيمات dUTPase. يكشف التركيب البلوري لإنزيم dUTPase البشري أن كل وحدة فرعية من ثلاثي dUTPase تتخذ شكل برميل بيتا ثماني الخيوط، مع تبادل خيوط بيتا الطرفية بين الوحدات الفرعية . يشبه هذا التركيب تركيب إنزيم الإشريكية القولونية ، على الرغم من انخفاض التشابه في تسلسل الأحماض الأمينية بين الإنزيمين . [ 3 ]
تتميز العائلة الثانية ببنية ألفا جديدة بالكامل ، وأفراد هذه العائلة لا علاقة لهم ببنية بيتا بالكامل الموجودة في dUTPases في غالبية الكائنات الحية . [ 4 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ فيرتيسي بي جي، توث جيه (2009). " إبعاد اليوراسيل عن الحمض النووي" . مجلة أبحاث الكيمياء . 42 (1): 97-106 . doi : 10.1021/ar800114w . PMC 2732909. PMID 18837522 .
- ↑ فاسيليف دي جي، موريكاوا ك (1996). "استبعاد اليوراسيل من الحمض النووي" . التركيب . 4 (12): 1381-5 . doi : 10.1016/S0969-2126(96)00145-1 . PMID 8994964 .
- ↑ مول سي دي، هاريس جيه إم، ماكنتوش إي إم، تاينر جيه إيه (سبتمبر 1996). "إنزيم بيروفوسفاتاز دUTP البشري: التعرف على اليوراسيل بواسطة حلقة بيتا ومواقع نشطة تتكون من ثلاث وحدات فرعية منفصلة" . ستراكشر . 4 (9): 1077-92 . doi : 10.1016/S0969-2126(96)00114-1 . PMID 8805593 .
- ↑ موروز، أو. في.؛ هاركيولاكي، م.؛ غالبرين، م. واي.؛ فاجين، أ. أ.؛ غونزاليس-باكانوفسكا، د.؛ ويلسون، ك. س. (2004). "البنية البلورية لمركب من إنزيم dUTPase من بكتيريا كامبيلوباكتر جيجوني مع نظير الركيزة تُلقي الضوء على الآلية وتقترح "الوحدة الأساسية" لإنزيمات d(C/U)TPases الثنائية". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 342 (5): 1583-1597 . doi : 10.1016/j.jmb.2004.07.050 . PMID 15364583 .
للمزيد من القراءة
- بيرتاني لي؛ هاغمارك أ؛ رايشارد ب؛ التحويل المتبادل لفوسفات ديوكسي يوريدين (1963). "التخليق الإنزيمي لديوكسي ريبونوكليوتيدات. الجزء الثاني: التكوين" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 238 (10): 3407-3413 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)48681-4 . PMID 14085395 .
- جيروار، ل. إي.، ودويتش، و. أ. (1987). "إنزيم ديوكسي يوريدين ثلاثي الفوسفاتاز في ذبابة الفاكهة: تنقيته وتوصيفه" . مجلة الكيمياء البيولوجية ، 262 (1): 130-134 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)75898-0 . PMID 3025197 .
- غرينبيرغ، جي، وسومرفيل، آر (1962). "نشاط كيناز ديوكسي يوريديلات وديوكسي يوريدين ثلاثي الفوسفاتاز في الإشريكية القولونية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 48 (2): 247-257 . Bibcode : 1962PNAS...48..247G . doi : 10.1073 / pnas.48.2.247 . PMC 220766. PMID 13901467 .
- جريندي جي آر، نيكول سي إيه (1971). "إنزيم بيروفوسفاتاز ديوكسي يوريدين 5'-ثلاثي الفوسفات في الثدييات". بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 240 (2): 180-183 . doi : 10.1016/0005-2787(71)90655-1 . PMID 5105331 .
- EC 3.6.1
- إنزيمات ذات بنية معروفة
- EC 3.6 stubs
