علم الأحياء الإلكتروني
EmBiology (المعروف سابقًا باسم EMBiology) هو برنامج قائم على الويب كخدمة من Elsevier ، حيث يمكن للباحثين من خلاله عرض العلاقات البيولوجية بين الكيانات، مثل الجينات والبروتينات والخلايا . [ 1 ]
تم إطلاق منصة EmBiology في عام 2023، وهي تستعلم عن مخطط المعرفة البيولوجية الذي يضم 1.4 مليون كيان مرتبط بـ 15.7 مليون علاقة. [ 1 ] وتستخدم المنصة مخطط سانكي لتصور نتائج البحث، وتعرض مقتطفات نصية من الأدبيات العلمية ذات الصلة .
الإصدار السابق
تم إطلاق EmBiology في الأصل باسم EMBiology في عام 2005 كقاعدة بيانات ببليوغرافية لعلوم الحياة في شراكة مع Ovid Technologies كنسخة أصغر من Embase . [ 2 ]
تغطية المحتوى
تشمل مصادر بيانات علم الأحياء الجنيني ما يلي: [ 3 ]
- 7.2 مليون ملخص من PubMed
- 430,000 من موقع Clinicaltrials.gov
- 7.2 مليون مقالة كاملة من 936 مجلة تابعة لدار النشر Elsevier و939 مجلة غير تابعة لها.
المفاهيم البيولوجية
تتضمن مفاهيم علم الأحياء الجنيني ما يلي: [ 4 ]
| مفهوم | وصف |
|---|---|
| المخدرات والمواد الكيميائية | المستقلبات الطبيعية، والجزيئات الصغيرة الموجودة في الخلية، والأدوية (بما في ذلك الجزيئات الصغيرة والمستحضرات البيولوجية) |
| الأمراض | المصطلحات المتعلقة بالحالات الصحية والأمراض |
| البروتينات | يمثل كلاً من الجينات ومنتجاتها، بما في ذلك البروتينات وmiRNAs |
| الفئات الوظيفية | تصنيفات البروتينات بناءً على الوظيفة البيولوجية |
| المركبات البروتينية | ببتيد واحد أو أكثر يشكل مركباً عبر التفاعلات الفيزيائية |
| متغير جيني | يمكن البحث عن المتغيرات باستخدام SNPID والنص |
| الخلايا | أنواع الخلايا وسلالات الخلايا لدى الثدييات |
| عملية الخلية | العمليات البيولوجية (مثل موت الخلايا المبرمج، والالتهاب) |
| الأعضاء | أنواع أعضاء الثدييات |
| مناديل ورقية | أنواع أنسجة الثدييات |
| الفيروسات | عامل مسبب للأمراض المعدية |
| المعايير السريرية | المعايير المقاسة لجسم الإنسان المستخدمة في الممارسة السريرية |
| علاج | المعالجات غير الكيميائية والظروف البيئية |
| كائن الخلية | العضيات، المكونات الهيكلية للخلية |
العلاقات البيولوجية
العلاقات البيولوجية التالية مدرجة في علم الأحياء الجنيني [ 5 ]
| العلاقة | وصف | مثال |
|---|---|---|
| تعبير | يُغير وفرة البروتين عن طريق التأثير على مستويات النسخ أو استقرار البروتين | يُظهر MDM2 علاقة "تعبير" سلبية مع TP53 |
| تأثير الحمض النووي الريبوزي الميكروي | التأثير المثبط لـ miRNA على هدف mRNA الخاص به | يُظهر miR-30 علاقة "تأثير miRNA" سلبية مع TP53 |
| ربط المحفز | يرتبط بمحفز الجين | يرتبط FOXC1 بعلاقة "ارتباط المحفز" الإيجابية مع MMP7 |
| أنظمة | يُغير النشاط بآلية غير معروفة (قد تكون مباشرة أو غير مباشرة) | يُظهر بروتين SOCS3 علاقة تنظيمية إيجابية مع داء السكري |
| التنظيم المباشر | يؤثر على النشاط من خلال التفاعل البدني المباشر | يرتبط جين BRCA1 بعلاقة تنظيمية مباشرة مع جين BARD1 |
| ملزم | التفاعل الفيزيائي المباشر بين جزيئين | يرتبط جين FANCD2 بجين BRCA1 ارتباطاً وثيقاً. |
| تعديل البروتين | يُغير تعديل الجزيء المستهدف، عادةً عن طريق التفاعل المباشر | تربط SRC علاقة "تعديل البروتين" مع GRB2 |
| المؤشرات الحيوية | تحديد البروتينات/المجمعات/الفئات الوظيفية/المستقلبات التي تُعد مؤشرات حيوية تنبؤية أو تشخيصية لمرض ما | يرتبط سرطان الرئة بعلاقة "مؤشر حيوي" مع إنترلوكين-6 |
| التغير الجيني | التغيرات الجينية مثل حذف الجينات، أو تضخيمها، أو الطفرات، أو التغيرات فوق الجينية | يرتبط سرطان الرئة بتغير جيني مرتبط بـ ALK |
| التغير الكمي | التغيرات في وفرة/نشاط/تعبير جين/بروتين/جزيء صغير في حالة مرضية | يرتبط سرطان الثدي بعلاقة "تغير كمي" إيجابية مع AGK |
| تغيير الحالة | التغيرات في حالة تعديل ما بعد الترجمة للبروتين أو أحداث التضفير البديل | يرتبط سرطان الثدي بعلاقة "تغيير الحالة" مع مستقبلات هرمون الإستروجين |
| مساعد وظيفي | بين مرض وعملية خلوية أو مرض آخر | يرتبط التهاب البنكرياس المزمن بعلاقة "ارتباط وظيفي" مع سرطان البنكرياس |
| التفاعل الكيميائي | إما تفاعل كيميائي محفز بالإنزيم أو تفاعل كيميائي تلقائي | يرتبط إنزيم CYP3A بعلاقة "تفاعل كيميائي" مع تيكاغريلور |
| التخليق الجزيئي | يغير تركيز الهدف | يرتبط إنزيم CYP3A بعلاقة "تخليق الجزيئات" مع الميدازولام |
| النقل الجزيئي | يغير موضع الهدف | يُظهر عقار تاموكسيفين علاقة نقل جزيئي إيجابية مع MAPK3 |
| تجربة سريرية | التجارب السريرية التي أجريت على دواء لعلاج مرض ما (من موقع CT.gov) | أظهرت التجارب السريرية أن عقار تاموكسيفين يرتبط إيجابياً بسرطان الثدي. |
| التعبير الخلوي | التعبير عن البروتينات داخل الخلية أو على سطحها | توجد علاقة "تعبير خلوي" بين الخلايا الكبدية ومستقبل عامل نمو البشرة (EGFR). |
مراجع
- ١ ٢ "أطلقت دار النشر Elsevier مجلة EmBiology لتقديم رؤى غير مسبوقة حول الأنشطة البيولوجية التي تُسرّع اكتشاف الأدوية" . elsevier.com . تاريخ الاطلاع: ١٨ سبتمبر ٢٠٢٣ .
- ↑ وصف EMBiology "أوفيد وإلسيفير تعلنان عن شراكة حصرية..." (موقع إلكتروني) . شركة أوفيد تكنولوجيز، 2005. تاريخ الاسترجاع: 30 يناير 2011 .بيان صحفي
- ↑ "بيانات بيولوجية منظمة لاستخلاص الرؤى | علم الأحياء الجنيني | إلسيفير" . beta.elsevier.com . تاريخ الاسترجاع: 18 سبتمبر 2023 .
- ↑ "ما هي المفاهيم البيولوجية التي يتضمنها علم الأحياء الجنيني؟ - مركز دعم علم الأحياء الجنيني" . service.elsevier.com . تاريخ الاسترجاع: 18 سبتمبر 2023 .
- ↑ "ما هي العلاقات البيولوجية المستخلصة في علم الأحياء الجنيني؟ - مركز دعم علم الأحياء الجنيني" . service.elsevier.com . تاريخ الاسترجاع: 18 سبتمبر 2023 .
فئات :
- قواعد البيانات والفهارس الببليوغرافية
- قواعد البيانات البيولوجية
- منشورات تأسست عام 2005
- إلسيفير
- اكتشاف الأدوية
