علم الأحياء الإلكتروني

EmBiology (المعروف سابقًا باسم EMBiology) هو برنامج قائم على الويب كخدمة من Elsevier ، حيث يمكن للباحثين من خلاله عرض العلاقات البيولوجية بين الكيانات، مثل الجينات والبروتينات والخلايا . [ 1 ]

تم إطلاق منصة EmBiology في عام 2023، وهي تستعلم عن مخطط المعرفة البيولوجية الذي يضم 1.4 مليون كيان مرتبط بـ 15.7 مليون علاقة. [ 1 ] وتستخدم المنصة مخطط سانكي لتصور نتائج البحث، وتعرض مقتطفات نصية من الأدبيات العلمية ذات الصلة .

الإصدار السابق

تم إطلاق EmBiology في الأصل باسم EMBiology في عام 2005 كقاعدة بيانات ببليوغرافية لعلوم الحياة في شراكة مع Ovid Technologies كنسخة أصغر من Embase . [ 2 ]

تغطية المحتوى

تشمل مصادر بيانات علم الأحياء الجنيني ما يلي: [ 3 ]

  • 7.2 مليون مقالة كاملة من 936 مجلة تابعة لدار النشر Elsevier و939 مجلة غير تابعة لها.

المفاهيم البيولوجية

تتضمن مفاهيم علم الأحياء الجنيني ما يلي: [ 4 ]

مفهوموصف
المخدرات والمواد الكيميائيةالمستقلبات الطبيعية، والجزيئات الصغيرة الموجودة في الخلية، والأدوية (بما في ذلك الجزيئات الصغيرة والمستحضرات البيولوجية)
الأمراضالمصطلحات المتعلقة بالحالات الصحية والأمراض
البروتيناتيمثل كلاً من الجينات ومنتجاتها، بما في ذلك البروتينات وmiRNAs
الفئات الوظيفيةتصنيفات البروتينات بناءً على الوظيفة البيولوجية
المركبات البروتينيةببتيد واحد أو أكثر يشكل مركباً عبر التفاعلات الفيزيائية
متغير جينييمكن البحث عن المتغيرات باستخدام SNPID والنص
الخلاياأنواع الخلايا وسلالات الخلايا لدى الثدييات
عملية الخليةالعمليات البيولوجية (مثل موت الخلايا المبرمج، والالتهاب)
الأعضاءأنواع أعضاء الثدييات
مناديل ورقيةأنواع أنسجة الثدييات
الفيروساتعامل مسبب للأمراض المعدية
المعايير السريريةالمعايير المقاسة لجسم الإنسان المستخدمة في الممارسة السريرية
علاجالمعالجات غير الكيميائية والظروف البيئية
كائن الخليةالعضيات، المكونات الهيكلية للخلية

العلاقات البيولوجية

العلاقات البيولوجية التالية مدرجة في علم الأحياء الجنيني [ 5 ]

العلاقةوصفمثال
تعبيريُغير وفرة البروتين عن طريق التأثير على مستويات النسخ أو استقرار البروتينيُظهر MDM2 علاقة "تعبير" سلبية مع TP53
تأثير الحمض النووي الريبوزي الميكرويالتأثير المثبط لـ miRNA على هدف mRNA الخاص بهيُظهر miR-30 علاقة "تأثير miRNA" سلبية مع TP53
ربط المحفزيرتبط بمحفز الجينيرتبط FOXC1 بعلاقة "ارتباط المحفز" الإيجابية مع MMP7
أنظمةيُغير النشاط بآلية غير معروفة (قد تكون مباشرة أو غير مباشرة)يُظهر بروتين SOCS3 علاقة تنظيمية إيجابية مع داء السكري
التنظيم المباشريؤثر على النشاط من خلال التفاعل البدني المباشريرتبط جين BRCA1 بعلاقة تنظيمية مباشرة مع جين BARD1
ملزمالتفاعل الفيزيائي المباشر بين جزيئينيرتبط جين FANCD2 بجين BRCA1 ارتباطاً وثيقاً.
تعديل البروتينيُغير تعديل الجزيء المستهدف، عادةً عن طريق التفاعل المباشرتربط SRC علاقة "تعديل البروتين" مع GRB2
المؤشرات الحيويةتحديد البروتينات/المجمعات/الفئات الوظيفية/المستقلبات التي تُعد مؤشرات حيوية تنبؤية أو تشخيصية لمرض مايرتبط سرطان الرئة بعلاقة "مؤشر حيوي" مع إنترلوكين-6
التغير الجينيالتغيرات الجينية مثل حذف الجينات، أو تضخيمها، أو الطفرات، أو التغيرات فوق الجينيةيرتبط سرطان الرئة بتغير جيني مرتبط بـ ALK
التغير الكميالتغيرات في وفرة/نشاط/تعبير جين/بروتين/جزيء صغير في حالة مرضيةيرتبط سرطان الثدي بعلاقة "تغير كمي" إيجابية مع AGK
تغيير الحالةالتغيرات في حالة تعديل ما بعد الترجمة للبروتين أو أحداث التضفير البديليرتبط سرطان الثدي بعلاقة "تغيير الحالة" مع مستقبلات هرمون الإستروجين
مساعد وظيفيبين مرض وعملية خلوية أو مرض آخريرتبط التهاب البنكرياس المزمن بعلاقة "ارتباط وظيفي" مع سرطان البنكرياس
التفاعل الكيميائيإما تفاعل كيميائي محفز بالإنزيم أو تفاعل كيميائي تلقائييرتبط إنزيم CYP3A بعلاقة "تفاعل كيميائي" مع تيكاغريلور
التخليق الجزيئييغير تركيز الهدفيرتبط إنزيم CYP3A بعلاقة "تخليق الجزيئات" مع الميدازولام
النقل الجزيئييغير موضع الهدفيُظهر عقار تاموكسيفين علاقة نقل جزيئي إيجابية مع MAPK3
تجربة سريريةالتجارب السريرية التي أجريت على دواء لعلاج مرض ما (من موقع CT.gov)أظهرت التجارب السريرية أن عقار تاموكسيفين يرتبط إيجابياً بسرطان الثدي.
التعبير الخلويالتعبير عن البروتينات داخل الخلية أو على سطحهاتوجد علاقة "تعبير خلوي" بين الخلايا الكبدية ومستقبل عامل نمو البشرة (EGFR).

مراجع