دخول
Entrez ( IPA: [ ɒnˈtreɪ ] ) [1] نظام البحث العالمي عبر قواعد البيانات هو محرك بحث موحد أو بوابة ويب تسمح للمستخدمين بالبحث في العديد من قواعد بيانات العلوم الصحية المنفصلة على موقع المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [2] يعد NCBI جزءًا من المكتبة الوطنية للطب (NLM)، وهي نفسها قسم من المعاهد الوطنية للصحة (NIH)، والتي بدورها جزء من وزارة الصحة والخدمات الإنسانية الأمريكية . تم اختيار اسم "Entrez" (تحية تعني "تفضل" بالفرنسية) ليعكس روح الترحيب بالجمهور للبحث في المحتوى المتاح من المكتبة الوطنية للطب.
Entrez Global Query هو نظام بحث واسترجاع متكامل يوفر إمكانية الوصول إلى جميع قواعد البيانات في وقت واحد باستخدام سلسلة استعلام واحدة وواجهة مستخدم واحدة. يمكن لـ Entrez استرجاع التسلسلات والهياكل والمراجع ذات الصلة بكفاءة . يمكن لنظام Entrez توفير وجهات نظر لتسلسلات الجينات والبروتينات وخرائط الكروموسومات . تتوفر بعض الكتب المدرسية أيضًا عبر الإنترنت من خلال نظام Entrez.
سمات
توفر الصفحة الرئيسية لبرنامج Entrez، بشكل افتراضي، إمكانية الوصول إلى الاستعلام العالمي. ويمكن البحث في جميع قواعد البيانات المفهرسة بواسطة Entrez عبر سلسلة استعلام واحدة، مع دعم عوامل التشغيل المنطقية وعلامات مصطلحات البحث للحد من أجزاء من بيان البحث إلى حقول معينة. ويؤدي هذا إلى إرجاع صفحة نتائج موحدة، تعرض عدد النتائج للبحث في كل قاعدة بيانات، والتي ترتبط أيضًا بنتائج البحث الفعلية لقاعدة البيانات المعينة.
كما يوفر برنامج Entrez واجهة مشابهة للبحث في كل قاعدة بيانات معينة ولتحسين نتائج البحث. وتتيح ميزة Limits للمستخدم تضييق نطاق البحث، وهي عبارة عن واجهة نماذج ويب. وتقدم ميزة History قائمة مرقمة بالاستعلامات التي تم إجراؤها مؤخرًا. ويمكن الرجوع إلى نتائج الاستعلامات السابقة بالأرقام ودمجها عبر عوامل تشغيل منطقية. ويمكن حفظ نتائج البحث مؤقتًا في الحافظة. ويمكن للمستخدمين الذين لديهم حساب MyNCBI حفظ الاستعلامات إلى أجل غير مسمى، كما يمكنهم اختيار تلقي التحديثات بنتائج البحث الجديدة عبر البريد الإلكتروني للاستعلامات المحفوظة لمعظم قواعد البيانات. ويستخدم على نطاق واسع في مجال التكنولوجيا الحيوية كأداة مرجعية للطلاب والمحترفين على حد سواء.
قواعد البيانات
يقوم Entrez بالبحث في قواعد البيانات التالية:
- PubMed : الاستشهادات والملخصات في الأدبيات الطبية الحيوية، بما في ذلك Medline — مقالات من مجلات ( طبية في الأساس ) ، غالبًا ما تتضمن ملخصات. يتم توفير روابط إلى PubMed Central وموارد النصوص الكاملة الأخرى للمقالات من تسعينيات القرن العشرين.
- PubMed Central : مقالات مجانية كاملة النصوص
- البحث في الموقع: مواقع الويب التابعة لـ NCBI ومواقع الويب الخاصة بـ FTP
- كتب: كتب على الانترنت
- الوراثة المندلية عبر الإنترنت في الإنسان (OMIM)
- قاعدة بيانات تسلسل النوكليوتيدات ( GenBank )
- البروتين : قاعدة بيانات التسلسل (GenPept)
- الجينوم : تسلسل الجينوم الكامل ورسم الخرائط
- البنية : هياكل جزيئية ثلاثية الأبعاد
- التصنيف : الكائنات الحية في بنك الجينات التصنيف
- dbSNP : تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة
- الجين : [3] معلومات مركزية حول الجين
- HomoloGene : مجموعات التماثل في الكائنات حقيقية النواة
- مركب PubChem : هياكل كيميائية فريدة من نوعها لجزيئات صغيرة
- PubChem Substance: سجلات المواد الكيميائية المودعة
- مشروع الجينوم : معلومات عن مشروع الجينوم
- UniGene : مجموعات من تسلسلات النسخ الموجهة للجينات
- CDD : قاعدة بيانات نطاقات البروتين المحفوظة
- PopSet : مجموعات بيانات دراسة السكان ( علم الأوبئة )
- ملفات تعريف GEO : ملفات تعريف التعبير والوفرة الجزيئية
- مجموعات بيانات GEO : مجموعات تجريبية من بيانات GEO
- أرشيف قراءة التسلسل : بيانات التسلسل عالية الإنتاجية
- كروموسومات السرطان : قواعد البيانات الخلوية الوراثية
- PubChem BioAssay : فحص النشاط الحيوي للمواد الكيميائية
- المسبار : الكواشف الخاصة بالتسلسل
- فهرس المكتبة الوطنية للطب : بيانات ببليوغرافية من المكتبة الوطنية للطب لأكثر من 1.2 مليون مجلة وكتاب ومواد سمعية وبصرية وبرامج كمبيوتر وموارد إلكترونية ومواد أخرى مقيمة في LocatorPlus (يتم تحديثها كل يوم من أيام الأسبوع).
وصول
بالإضافة إلى استخدام نماذج محرك البحث للاستعلام عن البيانات في Entrez، توفر NCBI أدوات برمجة Entrez [4] (eUtils) للوصول المباشر إلى نتائج الاستعلام. يمكن الوصول إلى أدوات eUtils عن طريق نشر عناوين URL مُشكَّلة خصيصًا على خادم NCBI، وتحليل استجابة XML. كانت هناك أيضًا واجهة eUtils SOAP والتي تم إنهاؤها في يوليو 2015. [5]
تاريخ
في عام 1991، تم تقديم Entrez في شكل قرص مضغوط. في عام 1993، وفرت نسخة خادم العميل للبرنامج اتصالاً بالإنترنت. في عام 1994، أنشأت NCBI موقعًا على الويب، وكان Entrez جزءًا من هذا الإصدار الأولي. في عام 2001، تم إصدار رف الكتب Entrez وفي عام 2003، تم تطوير قاعدة بيانات Entrez Gene. [6]
مراجع
- ^ "تعريف 'entrez'". قاموس كولينز [الإنترنت] .
- ^ منسقو موارد المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (2012). "موارد قاعدة البيانات للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية". أبحاث الأحماض النووية . 41 (إصدار قاعدة البيانات): D8–D20. doi : 10.1093/nar/gks1189. PMC 3531099. PMID 23193264.
- ^ "الصفحة الرئيسية - الجين - NCBI".
- ^ Entrez Utilities. المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (الولايات المتحدة). 2010.
- ^ خدمة الويب للمرافق الإلكترونية (SOAP). المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (الولايات المتحدة). 23 يناير 2015.
- ^ سميث، كينت. "تاريخ موجز لنشأة ونمو NCBI". دليل NCBI [الإنترنت]. الطبعة الثانية . تم الاسترجاع في 3 مايو 2014 .
روابط خارجية
- نموذج محرك البحث Entrez
- مساعدة الدخول
