بعثة أخذ عينات من المحيط العالمي

تُعدّ البعثة العالمية لأخذ عينات من المحيطات ( GOS ) مشروعًا لاستكشاف جينوم المحيطات ، يهدف إلى تقييم التنوع الجيني في المجتمعات الميكروبية البحرية وفهم دورها في العمليات الأساسية للطبيعة. انطلقت الرحلة التي استغرقت عامين، والتي استخدمت يخت كريغ فينتر الشخصي، من هاليفاكس في كندا، وجابت العالم، وانتهت في الولايات المتحدة في يناير 2006. وقد جمعت البعثة عينات من المياه من هاليفاكس، نوفا سكوتيا ، إلى شرق المحيط الهادئ الاستوائي . وخلال عام 2007، استمر جمع العينات على طول الساحل الغربي لأمريكا الشمالية.
تحليل البيانات
تم تقديم مجموعات بيانات GOS إلى كل من المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية ( NCBI) [ 1 ] والبنية التحتية الإلكترونية المجتمعية لأبحاث وتحليلات علم البيئة الميكروبية البحرية المتقدمة (CAMERA)، وهو مورد إلكتروني جديد لعلم الجينوم البيئي البحري ممول من مؤسسة غوردون وبيتي مور ، وقد طورته مؤسسة JCVI وتستضيفه شعبة معهد كاليفورنيا للاتصالات وتكنولوجيا المعلومات (Calit2) التابعة لجامعة كاليفورنيا في سان دييغو . وقد طورت مؤسسة JCVI مجموعة أدوات CAMERA، وهي تعكس الأدوات المستخدمة في النشر الأولي لمجموعات بيانات GOS.
التمويل
تم تمويل مشروع الساحر الثاني من قِبل:
- مؤسسة غوردون وبيتي مور ( التسلسل والتحليل) [ 2 ]
- وزارة الطاقة الأمريكية ، مكتب العلوم (التسلسل والتحليل) [ 2 ]
- معهد جيه كريج فينتر (تشغيل السفن) [ 2 ]
- منحة مؤسسة مور لمدة سبع سنوات بقيمة 24.5 مليون دولار ( كاميرا ) [ 2 ]
إناء
أكملت سفينة "سورسيرر 2" ، وهي سفينة شراعية بطول 95 قدمًا ، رحلة استكشافية علمية استمرت عامين حول العالم في خطوط العرض المتوسطة، حيث جمعت عينات من الميكروبات في مياه البحر لتحليلها وتصنيفها جينيًا. صُممت السفينة لتكون أكثر من مجرد يخت للإبحار حول العالم، بل لتكون قادرة على تحمل الظروف المناخية القاسية في خطوط العرض، من حرارة ورطوبة خط الاستواء إلى خطوط العرض بين 60 و70 درجة. يتميز هيكل "سورسيرر 2" بخفة وزنه لتحقيق أداء متميز، ولكنه في الوقت نفسه قوي للغاية، بفضل استخدام صفائح من الكيفلار والألياف الزجاجية من نوع E، والربط بالإيبوكسي، والمواد الأساسية المختارة بعناية.
تم تصميم السفينة بواسطة جيرمان فريرز وتحمل 2400 لتر (630 جالون أمريكي ) من الماء.
المنشورات
القائمة التالية تتضمن المنشورات الرسمية للمشروع ومعهد جيه كريج فينتر .
- فينتر، جيه سي ؛ ريمنجتون، كيه؛ هايدلبرغ، جيه إف؛ هالبرن، إيه إل؛ روش، دي؛ آيزن، جيه إيه؛ وو، دي؛ بولسن، آي؛ وآخرون . (2 أبريل 2004). "التسلسل الجيني البيئي لبحر سارجاسو" . مجلة ساينس . 304 (5667). نيويورك، نيويورك: الجمعية الأمريكية لتقدم العلوم : 66-74 . Bibcode : 2004Sci...304...66V . doi : 10.1126/science.1093857 . ISSN 0193-4511 . PMID 15001713. S2CID 1454587 .
- يوسف، س؛ ساتون، ج؛ روش، د.ب؛ هالبرن، أ.ل؛ ويليامسون، س.ج؛ ريمنجتون، ك؛ آيزن، ج.أ؛ هايدلبرغ، ك.ب؛ وآخرون . (13 مارس 2007). "رحلة سورسرر 2 العالمية لأخذ عينات من المحيط: توسيع نطاق عائلات البروتينات" . مجلة PLOS Biology . 5 (3) e16. الولايات المتحدة الأمريكية: مكتبة العلوم العامة . doi : 10.1371/journal.pbio.0050016 . ISSN 1544-9173 . PMC 1821046. PMID 17355171 .
- كانان، ن؛ تايلور، س.س؛ تشاي، ي؛ فينتر، ج.س ؛ مانينغ، ج (13 مارس 2007). " التنوع البنيوي والوظيفي للكينوم الميكروبي" . مجلة PLOS Biology . 5 (3) e17. الولايات المتحدة الأمريكية: مكتبة العلوم العامة . doi : 10.1371/journal.pbio.0050017 . ISSN 1544-9173 . PMC 1821047. PMID 17355172 .
- روش، د.ب.؛ هالبرن، أ.ل.؛ ساتون، ج.؛ هايدلبرغ، ك.ب.؛ ويليامسون، س.؛ يوسف، س.؛ وو، د.؛ آيزن، ج.أ.؛ وآخرون . (13 مارس 2007). "رحلة سورسرر 2 العالمية لأخذ عينات من المحيط: من شمال غرب المحيط الأطلسي إلى شرق المحيط الهادئ الاستوائي" . مجلة PLOS Biology . 5 (3) e77. الولايات المتحدة الأمريكية: مكتبة العلوم العامة . doi : 10.1371/journal.pbio.0050077 . ISSN 1544-9173 . PMC 1821060. PMID 17355176 .
- يوتين، ن؛ سوزوكي، م.ت؛ تيلينغ، هـ؛ ويبر، م؛ فينتر، ج.س ؛ روش، د.ب؛ بيجا، أ (1 يونيو 2007). "تقييم التنوع والجغرافيا الحيوية للبكتيريا الهوائية اللاهوائية الضوئية التغذية في المياه السطحية للمحيطين الأطلسي والهادئ باستخدام بيانات الميتاجينوم لرحلة أخذ عينات المحيطات العالمية" (ملف PDF) . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 9 (6). إنجلترا: بلاكويل ساينس : 1464-1475 . رمز Bibcode : 2007EnvMi...9.1464Y . doi : 10.1111/j.1462-2920.2007.01265.x . ISSN 1462-2912 . PMID 17504484 .
- شارون، آي؛ تزاهور، إس؛ ويليامسون، إس؛ شمويش، إم؛ مان-أهارونوفيتش، دي؛ روش، دي بي؛ يوسف، إس؛ زيدنر، جي؛ وآخرون . (1 أكتوبر 2007). "جينات ونسخ مركز التفاعل الضوئي الفيروسي في البيئة البحرية" . مجلة ISME . 1 (6). إنجلترا: مجموعة Nature Publishing Group : 492-501 . Bibcode : 2007ISMEJ...1..492S . doi : 10.1038/ismej.2007.67 . ISSN 1751-7362 . PMID 18043651 .
- ويليامسون، إس جيه؛ روش، دي بي؛ يوسف، إس؛ هالبرن، إيه إل؛ هايدلبرغ، كيه بي؛ غلاس، جيه آي؛ أندروز-فانكوش، سي؛ فادروش، دي؛ وآخرون . (23 يناير 2008). هول، نيل (محرر). "رحلة سورسرر 2 العالمية لأخذ عينات من المحيط: توصيف الميتاجينوميات للفيروسات داخل عينات الميكروبات المائية" . PLoS ONE . 3 (1) e1456. الولايات المتحدة الأمريكية: مكتبة العلوم العامة . Bibcode : 2008PLoSO...3.1456W . doi : 10.1371/journal.pone.0001456 . ISSN 1932-6203 . PMC 2186209. PMID 18213365 .
- شو، أ.ك.؛ هالبرن، أ.ل.؛ بيسون، ك.؛ تران، ب.؛ فينتر، ج.س .؛ مارتيني، ج.ب.هـ. (10 سبتمبر 2008). "الأمر نسبي: تصنيف تنوع المجتمعات البكتيرية المائية". علم الأحياء الدقيقة البيئية . 10 (9). إنجلترا: بلاكويل ساينس : 2200-2210 . رمز Bibcode : 2008EnvMi..10.2200S . doi : 10.1111/j.1462-2920.2008.01626.x . ISSN 1462-2912 . PMID 18637951 .
انظر أيضاً
ملحوظات
- ↑ مشروع البعثة العالمية لأخذ عينات من المحيطات في معهد جيه كريج فينتر، رقم المشروع 13694 ، المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية ، تم الوصول إلى الموقع الإلكتروني في 17 مارس 2007
- ١ ٢ ٣ ٤ تم اكتشاف أكثر من ستة ملايين جين جديد، وآلاف العائلات البروتينية الجديدة، ودرجة مذهلة من التنوع الميكروبي من المرحلة الأولى من رحلة سورسرر ٢ العالمية لأخذ عينات من المحيط [ تم حذف الرابط ] ، ١٣ مارس ٢٠٠٧، بيان صحفي، معهد جيه كريج فينتر
روابط خارجية
- الموقع الرسمي
- المدونة الرسمية لبطولة 2009-2010
- صورة كبيرة لفينتر على مؤخرة سفينة الساحر الثاني
- بيانات GOS من CAMERA
- مشاريع الجينوم
- 2003 في العلوم
- البعثات الأوقيانوغرافية
