المساعدة في علاج ضمور العضلات

شاشة توقف WCG ، المساعدة في علاج ضمور العضلات - المرحلة الثانية

مشروع "المساعدة في علاج ضمور العضلات" هو مشروع حاسوبي تطوعي يعمل على منصة BOINC .

إنه جهد مشترك بين الجمعية الفرنسية الخيرية لضمور العضلات، L'Association française contre les myopathies؛ [ 1 ] ومعهد البيولوجيا الجزيئية والخلوية (معهد البيولوجيا الجزيئية والخلوية).

هدف المشروع

يدرس مشروع "المساعدة في علاج ضمور العضلات" وظائف البروتينات المختلفة التي تنتجها مئتا جين معروف بمشاركتها في إنتاج البروتينات العصبية العضلية ، وذلك من خلال نمذجة التفاعلات بين البروتينات لأربعين ألف بروتين ذي صلة مُدرجة في بنك بيانات البروتينات . وبشكل أكثر تحديدًا، ينمذج المشروع كيفية تأثر البروتين عند ارتباطه ببروتين آخر أو جزيء رابط . [ 2 ]

المنشورات العلمية

  • فك شفرة أسطح البروتينات من خلال الجمع بين التطور والهندسة والالتحام الجزيئي. البروتينات: البنية والوظيفة والمعلوماتية الحيوية (2019). [ 3 ]
  • الشركاء الخفيون: استخدام حسابات الالتحام المتبادل للتنبؤ بمواقع ارتباط البروتينات ذات التفاعلات المتعددة. البروتينات: التركيب والوظيفة والمعلوماتية الحيوية (2018). [ 4 ]
  • يُعدّ السلوك الاجتماعي للبروتينات مؤشراً أقوى لتحديد الشريك من هندسة السطح. البروتينات: التركيب، والوظيفة، والمعلوماتية الحيوية (2017). [ 5 ]
  • تفاعلات رائعة: كيف يمكن أن يعلمنا ارتباط الشركاء غير المناسبين عن التعرف على البروتينات ووظائفها. البروتينات: التركيب والوظيفة والمعلوماتية الحيوية (2016). [ 6 ]
  • التفاعلات بين البروتينات في بيئة مزدحمة: تحليل باستخدام محاكاة الالتحام المتبادل والمعلومات التطورية. مجلة PLOS للبيولوجيا الحاسوبية (2013). [ 7 ]
  • من الشبكة المخصصة إلى الشبكة التطوعية: تنفيذ واسع النطاق لتطبيق المعلوماتية الحيوية. مجلة الحوسبة الشبكية (2009). [ 8 ]
  • الأشجار التطورية المشتركة: طريقة واسعة النطاق للتنبؤ بواجهات البروتين بناءً على أخذ عينات التسلسل. مجلة PLOS للبيولوجيا الحاسوبية (2009). [ 9 ]
  • تحديد شركاء التفاعل البروتيني ومواقع التفاعل بين البروتينات. مجلة البيولوجيا الجزيئية (2008). [ 10 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. "الجمعية الفرنسية لضمور العضلات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 1 ديسمبر 2009. تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 أكتوبر 2009 .
  2. "المساعدة في علاج ضمور العضلات - المرحلة الثانية | بحث | شبكة المجتمع العالمي" . www.worldcommunitygrid.org . تاريخ الوصول: 10 سبتمبر 2022 .
  3. ديكويكر، كلوي؛ لين، إيلودي؛ كاربون، أليساندرا (نوفمبر 2019). "فك شفرة أسطح البروتينات من خلال الجمع بين التطور والهندسة والالتحام الجزيئي" . البروتينات: البنية والوظيفة والمعلوماتية الحيوية . 87 (11): 952-965 . doi : 10.1002/prot.25757 . ISSN 0887-3585 . PMC 6852240. PMID 31199528 .   
  4. لاغارد، ناتالي؛ كاربون، أليساندرا؛ ساكوين-مورا، صوفي (يوليو 2018). "شركاء خفيون: استخدام حسابات الالتحام المتقاطع للتنبؤ بمواقع ارتباط البروتينات ذات التفاعلات المتعددة" . البروتينات : التركيب، الوظيفة، والمعلوماتية الحيوية . 86 (7): 723-737 . doi : 10.1002/prot.25506 . PMID 29664226. S2CID 4900895 .  
  5. لاين، إيلودي؛ كاربون، أليساندرا (يناير 2017). "السلوك الاجتماعي للبروتينات يُعدّ مؤشرًا أقوى لتحديد الشريك من هندسة السطح: السلوك الاجتماعي للبروتينات" . البروتينات : التركيب، الوظيفة، والمعلوماتية الحيوية . 85 (1): 137-154 . doi : 10.1002/prot.25206 . PMC 5242317. PMID 27802579 .  
  6. فامباريس، ليدي؛ لوران، بينوا؛ كاربون، أليساندرا؛ ساكين-مورا، صوفي (أكتوبر 2016). "تفاعلات رائعة: كيف يمكن أن يعلمنا ارتباط الشركاء غير المناسبين عن التعرف على البروتينات ووظائفها" . البروتينات: التركيب، الوظيفة، والمعلوماتية الحيوية . 84 (10): 1408-1421 . doi : 10.1002/prot.25086 . ISSN 0887-3585 . PMC 5516155. PMID 27287388 .   
  7. لوبيز، آن؛ ساكوين-مورا، صوفي؛ ديميتروفا، فيكتوريا؛ لاين، إيلودي؛ بونتي، يان؛ كاربون، أليساندرا (2013-12-05). كان، ماريسيل (محرر). "تفاعلات البروتين-بروتين في بيئة مزدحمة: تحليل عبر محاكاة الالتحام المتقاطع والمعلومات التطورية" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 9 (12) e1003369. Bibcode : 2013PLSCB...9E3369L . doi : 10.1371/journal.pcbi.1003369 . ISSN 1553-7358 . PMC 3854762. PMID 24339765. S2CID 5880229 .    
  8. بيرتيس، فيكتورز؛ بولز، رافائيل؛ ديبريه، فريدريك؛ ريد، كيفن (ديسمبر 2009). "من الشبكة المخصصة إلى الشبكة التطوعية: تنفيذ واسع النطاق لتطبيق في المعلوماتية الحيوية" . مجلة الحوسبة الشبكية . 7 (4): 463-478 . doi : 10.1007/s10723-009-9130-7 . ISSN 1570-7873 . S2CID 22791104 .  
  9. إنجيلين، ستيفان؛ تروجان، لاديسلاس أ.؛ ساكوين-مورا، صوفي؛ لافيري، ريتشارد؛ كاربون، أليساندرا (23 يناير 2009). ليفيت، مايكل (محرر). "الأشجار التطورية المشتركة: طريقة واسعة النطاق للتنبؤ بواجهات البروتين بناءً على أخذ عينات التسلسل" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 5 (1) e1000267. رمز Bibcode : 2009PLSCB...5E0267E . doi : 10.1371/journal.pcbi.1000267 . ISSN 1553-7358 . PMC 2613531. PMID 19165315. S2CID 12292219 .    
  10. ساكوين-مورا، صوفي؛ كاربون، أليساندرا؛ لافيري، ريتشارد (أكتوبر 2008). "تحديد شركاء تفاعل البروتين ومواقع تفاعل البروتين-البروتين" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 382 (5): 1276-1289 . doi : 10.1016/j.jmb.2008.08.002 . PMID 18708070 .