LSID

الموسوعة الحرة

معرّفات علوم الحياة [ 1 ] [ 2 ] هي وسيلة لتسمية وتحديد مواقع المعلومات على الإنترنت. باختصار، معرّف علوم الحياة هو معرّف فريد لبيانات معينة، ويحدد بروتوكول معرّف علوم الحياة طريقة قياسية لتحديد موقع هذه البيانات (بالإضافة إلى طريقة قياسية لوصفها). وهي تشبه إلى حد ما معرّفات الكائنات الرقمية (DOI) التي يستخدمها العديد من الناشرين.

يتم تمثيل LSID كاسم مورد موحد (URN) بالتنسيق التالي:

  • urn:lsid:⟨Authority⟩:⟨Namespace⟩:⟨ObjectID⟩[:⟨Version⟩]

ومع ذلك، فإن نطاق الاسم lsid: غير مسجل لدى هيئة الأرقام المخصصة للإنترنت (IANA)، وبالتالي فهي ليست معرفات موارد موحدة (URNs) أو معرفات موارد موحدة (URIs) بالمعنى الدقيق للكلمة. [ 3 ]

يمكن حلّ معرّفات LSID في عناوين URL، على سبيل المثال: [permanent dead link]"}]],"parts":["http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C",{"template":{"target":{"wt":"Dead link","href":"./Template:Dead_link"},"params":{"date":{"wt":"July 2025"},"bot":{"wt":"InternetArchiveBot"},"fix-attempted":{"wt":"yes"}},"i":0}}]}">http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C

جدل حول استخدام معرّفات نظام تحديد المواقع (LSIDs)

حظيت معرّفات المواقع الجغرافية (LSIDs) باهتمام كبير في كلٍّ من مجتمعات المعلوماتية الحيوية والتنوع البيولوجي ، حيث لا يزال الأخير يستخدمها كوسيلة لتحديد الأنواع في الفهارس العالمية. [ 4 ] ومع ذلك، في الآونة الأخيرة، ومع ازدياد فهم كيفية أداء معرّفات الموارد الموحدة (URIs) عبر بروتوكول HTTP لمهمة تسمية مماثلة، [ 5 ] [ 6 ] وُجّهت انتقادات لاستخدام معرّفات المواقع الجغرافية (LSIDs) كمعرّفات [ 7 ] باعتبارها مخالفة لأفضل ممارسات هندسة الويب المتمثلة في إعادة استخدام مخططات معرّفات الموارد الموحدة (URIs) الحالية. [ 8 ] ومع ذلك، فإن الفصل الواضح بين البيانات والبيانات الوصفية؛ وتحديد طريقة لاكتشاف مواقع متعددة لاسترجاع البيانات؛ والقدرة على اكتشاف مصادر مستقلة متعددة للبيانات الوصفية لأي عنصر مُحدَّد، كانت عناصر أساسية في معرّف الموقع الجغرافي (LSID) ومواصفات دقته، والتي لم ينجح نهج HTTP وحده في محاكاتها.

توفر شبكة الويب العالمية إطارًا للاتصالات موزعًا عالميًا، وهو أمرٌ أساسيٌّ لجميع أشكال التعاون العلمي تقريبًا، بما في ذلك المعلوماتية الحيوية. ومع ذلك، كان يُعتقد بوجود العديد من القيود والنواقص، منها عدم القدرة على تحديد الكائنات ذات الأسماء المحلية برمجيًا، والتي قد تكون موزعة على نطاق واسع عبر الشبكة. كان من شأن هذا القصور المُتصوَّر أن يُحدِّث قدرتنا على دمج قواعد المعرفة المتعددة، التي تُقدِّم كلٌّ منها معلومات جزئية عن مجال مشترك، كما هو شائع في المعلوماتية الحيوية. صُمِّم مُعرِّف علوم الحياة (LSID) ونظام حل LSID (LSRS) لتوفير حلول بسيطة وفعّالة لهذه المشكلة، بما يتوافق مع الجيل التالي من الويب الدلالي والشبكة الدلالية ، استنادًا إلى توسيع تقنيات الإنترنت الحالية. ومع ذلك، فقد أشير مؤخرًا إلى أن بعض هذه النواقص المُتصوَّرة ليست متأصلة في معرّفات الموارد الموحدة (URIs) لبروتوكول HTTP، وأن الكثير من الوظائف التي تُوفِّرها معرّفات علوم الحياة (LSIDs) (وإن لم يكن كلها) يُمكن الحصول عليها باستخدام معرّفات موارد موحدة (URIs) مُصمَّمة بشكل صحيح لبروتوكول HTTP. [ 5 ]

معرّفات بديلة للكائنات الحية

تم اقتراح معرّفات بديلة للكائنات الحية، مثل نظام DOI . وقد أنشأت شركة NamesforLife (N4L)، وهي شركة خاصة، نظامًا لتطبيق معرّفات DOI على الكائنات الحية. على سبيل المثال، doi:10.1601/nm.3093 هو معرّف DOI لبكتيريا الإشريكية القولونية ، وdoi:10.1601/tx.3093 هو التصنيف المقابل لها. [ 9 ]

انظر أيضاً

ملحوظات

  1. ↑ كلارك تي، مارتن إس، ليفيلد تي. موجزات في المعلوماتية الحيوية 5.1:59-70، 1 مارس 2004.
  2. ↑ كوفر، روبن. "مواصفات مُعرّفات علوم الحياة (LSID) من OMG" . xml.coverpages.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10-12-2022 .
  3. ↑ "GitHub - tdwg/wiki-archive: أرشيف ويكي TDWG" . 2018-11-15.
  4. ↑ جونز، أندرو سي؛ وايت، ريتشارد جيه؛ أورم، إيوين آر. (17 أكتوبر 2011). "تحديد وربط المفاهيم البيولوجية في فهرس الحياة" . مجلة علم الدلالة الطبية الحيوية . 2 (1): 7. doi : 10.1186/2041-1480-2-7 . ISSN 2041-1480 . PMC 3245425. PMID 22004596 .   
  5. 1 2 "تحويل مخططات URI الجديدة أو مخططات URN الفرعية إلى URIs HTTP" . dbooth.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10-12-2022 .
  6. ↑ تومسون، هنري س. "سابقة تشير إلى حل وسط لأفضل ممارسات مجموعة عمل SWHCLS" . lists.w3.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2022 .
  7. ↑ مندلسون، نوح. "محادثتي مع شون مارتن حول معرّفات LSID" . lists.w3.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2022 .
  8. ↑ "هندسة شبكة الويب العالمية، المجلد الأول" . www.w3.org . تاريخ الاسترجاع: 10 ديسمبر 2022 .
  9. ↑ غاريتي، جورج م.؛ ليونز، كاثرين (1 يناير 2003). "تأمين التسمية البيولوجية للمستقبل" . مجلة علم الجينوم: مجلة علم الأحياء التكاملي . 7 (1): 31-33 . doi : 10.1089/153623103322006562 . PMID 12831553 .