الريبوكيناز

📅 آخر تحديث: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 3 صور
الموسوعة الحرة

في علم الإنزيمات ، يُعد الريبوكيناز ( EC 2.7.1.15 ) إنزيمًا يحفز التفاعل الكيميائي

يقوم الإنزيم الذي تم تحديده في الأصل من كبد العجل وبكتيريا Lactobacillus plantarum بتحويل سكر البنتوز ، D-ريبوز (الموضح في شكله الألدهيدي ذي السلسلة المفتوحة )، إلى ريبوز 5-فوسفات عن طريق نقل مجموعة فوسفات من العامل المساعد ، أدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP)، الذي يتحول إلى أدينوسين ثنائي الفوسفات (ADP). [ 1 ] [ 2 ]

الاسم النظامي لهذه الفئة من الإنزيمات هو ATP: د -ريبوز 5-فوسفوتراسفيراز . ومن الأسماء الأخرى الشائعة الاستخدام: ديوكسي ريبوكيناز ، وريبوكيناز (المفسفر) ، ود -ريبوكيناز . [ 3 ]

ينتمي إنزيم الريبوكيناز (RK) إلى عائلة فوسفوفروكتوكيناز B (PfkB) من كينازات السكر. [ 4 ] تشمل الأعضاء الأخرى لهذه العائلة (المعروفة أيضًا باسم عائلة RK) كيناز الأدينوزين (AK)، وكيناز الإينوزين-جوانوزين، وفروكتوكيناز، و1-فوسفوفروكتوكيناز. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] يتم تمييز أعضاء عائلة PfkB/RK من خلال وجود ثلاثة أنماط تسلسلية محفوظة، ويُظهر النشاط الإنزيمي لهذه العائلة من البروتينات عمومًا اعتمادًا على وجود الأيونات الخماسية التكافؤ. [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] يشارك النمط المحفوظ NXXE، وهو خاصية مميزة لعائلة بروتينات PfkB، في الاعتماد على الأيونات الخماسية التكافؤ. تم تحديد بنية RK والعديد من بروتينات عائلة PfK الأخرى من عدد من الكائنات الحية. [ 8 ] على الرغم من انخفاض التشابه في التسلسل بين AdK وبروتينات عائلة PfkB الأخرى، إلا أن هذه البروتينات متشابهة إلى حد كبير على المستويات الهيكلية. [ 4 ]

الدراسات الهيكلية

اعتبارًا من أواخر عام 2007، تم حل 7 هياكل لهذه الفئة من الإنزيمات، مع رموز الوصول PDB 1GQT و1RK2 و1RKA و1RKD و 1 RKS و1VM7 و2FV7 .

مراجع

  1. ↑ أغرانوف، ب. و.، وبرادي، ر. أ. (مارس 1956). "تنقية وخصائص ريبوكيناز كبد العجل" (ملف PDF) . مجلة الكيمياء البيولوجية . 219 (1): 221-229 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)65786-2 . PMID 13295274 . 
  2. ↑ جينسبيرغ أ (مارس 1959). "ديوكسي ريبوكيناز من لاكتوباسيلوس بلانتاروم " (ملف PDF) . مجلة الكيمياء البيولوجية . 234 (3): 481-487 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)70230-5 . PMID 13641245 . 
  3. ↑ الإنزيم 2.7.1.15 في قاعدة بيانات مسارات KEGG .
  4. 1 2 3 4 بارك ج، غوبتا ر.س. (سبتمبر 2008). "كيناز الأدينوزين والريبوكيناز - عائلة بروتينات RK" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 65 (18): 2875-96 . doi : 10.1007/ s00018-008-8123-1 . PMC 11131688. PMID 18560757. S2CID 11439854 .   
  5. 1 2 بورك، ب. ، ساندر، س. ، فالنسيا، أ. (يناير 1993). "التطور التقاربي لوظائف إنزيمية متشابهة على طيات بروتينية مختلفة: عائلات هيكسوكيناز، وريبوكيناز، وجالاكتوكيناز من كينازات السكر" . علم البروتين . 2 (1): 31-40 . doi : 10.1002/pro.5560020104 . PMC 2142297. PMID 8382990 .  
  6. ↑ سبايشالا ج، داتا ن س، تاكاباياشي ك، داتا م، فوكس إ هـ، غريبين ت، ميتشل ب س (فبراير 1996). "استنساخ الحمض النووي التكميلي لكيناز الأدينوزين البشري: تشابه التسلسل مع ريبوكينازات وفركتوكينازات الميكروبات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 93 (3): 1232-1237 . Bibcode : 1996PNAS...93.1232S . doi : 10.1073 / pnas.93.3.1232 . PMC 40062. PMID 8577746 .  
  7. ↑ ماج إم سي، سينغ بي، غوبتا آر إس (مارس 2002). "الاعتماد على الأيونات الخماسية خاصية محفوظة لكيناز الأدينوزين من مصادر متنوعة: تحديد نمط جديد متورط في ربط أيونات الفوسفات والمغنيسيوم وتثبيط الركيزة". الكيمياء الحيوية . 41 (12): 4059-69 . doi : 10.1021/bi0119161 . PMID 11900549 . 
  8. ↑ سيغريل، جيه. إيه.، كاميرون، إيه. دي.، جونز، تي. إيه. ، موبراي، إس. إل. (فبراير 1998). "تحديد بنية ريبوكيناز الإشريكية القولونية في مركب مع الريبوز وثنائي النوكليوتيد بدقة 1.8 أنغستروم: رؤى حول عائلة جديدة من بنى الكيناز" . ستراكشر . 6 (2): 183-193 . doi : 10.1016/s0969-2126(98)00020-3 . PMID 9519409 .