SMC5

بروتين الصيانة الهيكلية للكروموسومات 5 هو بروتين مشفر بواسطة جين SMC5 في الإنسان. [ 5 ] [ 6 ]

لا تزال الآليات المعقدة الكامنة وراء الحفاظ على بنية الكروموسومات، والتي تُسهم في ديناميكيات الكروماتين، غير معروفة، وتُلقي الاكتشافات الضوء على وظائفها المختلفة. [7] يُسهّل مُركّب SMC التفاعلات بعيدة المدى التي تُمكّن من طي الكروماتين عالي الرتبة في الطور البيني. يمتلك مُركّب SMC نشاط ATPase ، وبروتين كليسين محفوظ، ووحدات تنظيمية فرعية. [ 7 ] تُشارك مُركّبات بروتين SMC في إصلاح الحمض النووي، ومسارات النسخ، وتنظيم انفصال الكروموسومات، والمناعة في نبات الأرابيدوبسيس . في حقيقيات النوى، تتكون الكروموسومات المسؤولة عن الحفاظ على بنيتها من مُركّبات الكوهيسين (SMC1 وSMC3)، والكوندنسين (SMC2 وSMC4)، وSMC5/6.

بناء

تم اكتشاف معقد Smc5/6 في خميرة الانشطار. يُشفّر جين RAD18 (SMC6)، المسؤول عن تلف الحمض النووي في خميرة الانشطار، بروتينًا شبيهًا بـ SMC، ويُشكّل معقدًا ثنائيًا غير متجانس مع بروتين Spr18 (SMC5). [ 8 ] [ 9 ] في الخميرة، يتكون معقد SMC5/6 من وحدات فرعية تشمل SMC5 وSMC6 وستة بروتينات غير بنيوية لصيانة الكروموسومات (NSE). تربط الوحدات الفرعية Nse1 وNse3 وNse4 رأس Smc5 بـ Smc6، مما يسمح بارتباط الحمض النووي. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]

وهو يشارك في آلية إطالة التيلوميرات البديلة في السرطان. [ 13 ] [ 14 ]

وحدات Nse الفرعية

يوضح هذا الرسم البياني موضع بروتينات Nse على طول معقد SMC5/6 في الخميرة المتبرعمة والمنشطرة. لا يتضمن هذا الرسم بروتين Nse2، لأن موضعه في المعقد غير معروف حاليًا.

تربط الوحدات الفرعية Nse1-Nse3-Nse4 رؤوس بروتيني Smc5 وSmc6، مما يسمح للمركب بالارتباط بالحمض النووي. يشكل Nse5 وNse6 مركبًا فرعيًا يتمركز في رأس مركب SMC5/6 في خميرة التبرعم Saccharomyces cerevisiae ، وفي مفصلات مركب SMC5/6 في خميرة الانشطار Schizosaccharomyces pombe . يُعد المركب الفرعي Nse5/6 ضروريًا لتضاعف S. cerevisiae ، ولكنه لم يُحدد كضروري في S. pombe . توجد بروتينات متماثلة لـ Nse5-Nse6 في حقيقيات النوى الأخرى، وهي ASAP1-SNI1 في نبات Arabidopsis thaliana وSLF1-SLF2 في الإنسان، والتي يُعتقد أن لها وظيفة مشابهة لنظائرها من Nse. لا يزال موقع SLF1 وSLF2 على مركب SMC5/6 البشري غير معروف. [ 15 ] [ 16 ]

التموضع في الكائنات الحية المختلفة

يتميز معقد Smc5/6 بآليات تموضع غير محفوظة بشكل كبير. في البشر، يتموضع هذا المعقد على تسلسلات الحمض النووي الفيروسي باستخدام عاملي التموضع SMC5/6 1 و2 (SLF1 وSLF2)، مما يساهم في مقاومة الفيروس. [ 17 ] في نبات الرشاد (Arabidopsis thaliana) ، يمكن تموضع هذا الثنائي غير المتجانس على فواصل الحمض النووي المزدوجة لإعادة التركيب المتماثل باستخدام معقد SWI3B من مسار SWI/SNF . [ 18 ] بمجرد تموضعه على الحمض النووي، يرتبط معقد SCM5/6 بشكل غير محدد بحوالي 20 زوجًا من قواعد الحمض النووي. [ 19 ]

دور في إعادة التركيب والانقسام الاختزالي

يشكل بروتينا Smc5 و Smc6 بنية حلقية غير متجانسة، ويشكلان مع عناصر أخرى غير SMC معقد SMC-5/6. في دودة Caenorhabditis elegans، يتفاعل هذا المعقد مع إنزيم الهيليكاز HIM-6(BLM) لتعزيز معالجة وسائط إعادة التركيب الميوزي ونضج الكروموسومات . [ 20 ] يُعد معقد SMC-5/6 في بويضات الفئران ضروريًا لتكوين ثنائيات كروموسومية قادرة على الانفصال أثناء الانقسام الميوزي . [ 21 ] في البشر، ترتبط متلازمة انكسار الكروموسومات ، التي تتميز بمرض رئوي حاد في الطفولة المبكرة، بطفرة في أحد مكونات معقد SMC-5/6. [ 22 ] تُظهر خلايا المريض إعادة ترتيب الكروموسومات ، ونوى صغيرة ، وحساسية لتلف الحمض النووي ، وخلل في إعادة التركيب المتماثل .

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000198887 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000024943 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. ناغاسي تي، إيشيكاوا ك، مياجيما ن، تاناكا أ، كوتاني هـ، نومورا ن، وآخرون (فبراير 1998). "التنبؤ بالتسلسلات المشفرة لجينات بشرية غير معروفة. التاسع: التسلسلات الكاملة لـ 100 نسخة cDNA جديدة من الدماغ قادرة على ترميز بروتينات كبيرة في المختبر" . أبحاث الحمض النووي . 5 (1): 31-39 . doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .  
  6. "Entrez Gene: SMC5 structure maintenance of chromosomes 5" .
  7. 1 2 جيبسون ك، كانو ت، شيراهيج ك، سيوجرين س (سبتمبر 2014). "صيانة بنية الكروموسوم: تحديد موقع ووظيفة معقدات SMC". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 15 (9): 601-614 . doi : 10.1038/nrm3857 . PMID 25145851. S2CID 23908801 .  
  8. فوستيري، إم. آي.، وليمان ، إيه. آر. (أبريل 2000). "مركب بروتيني جديد من نوع SMC في فطر Schizosaccharomyces pombe يحتوي على بروتين إصلاح الحمض النووي Rad18" . مجلة EMBO . 19 (7): 1691-1702 . doi : 10.1093/emboj/19.7.1691 . PMC 310237. PMID 10747036 .  
  9. ليمان إيه آر، واليكا إم، غريفيثس دي جيه، موراي جيه إم، واتس إف زد، مككريدي إس، وآخرون (ديسمبر 1995). " يُعرّف جين rad18 في فطر Schizosaccharomyces pombe مجموعة فرعية جديدة من عائلة SMC الفائقة المشاركة في إصلاح الحمض النووي" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 15 (12): 7067-7080 . doi : 10.1128/mcb.15.12.7067 . PMC 230962. PMID 8524274 .   
  10. باليسيك ج، فيدوت س، فينغ م، دوهرتي أ ج، ليمان أ ر (ديسمبر 2006). "مركب إصلاح الحمض النووي Smc5-Smc6: ربط رؤوس Smc5-Smc6 بواسطة الوحدات الفرعية KLEISIN وNse4 والوحدات الفرعية غير Kleisin" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 281 (48): 36952-36959 . doi : 10.1074/jbc.M608004200 . PMID 17005570 . 
  11. زابرادي ك، أداموس م، فوندروفا ل، لياو س، سكوبيلوفا ه، نوفاكوفا م، وآخرون . (فبراير 2016). "ارتباط معقد SMC5/6 بالكروماتين يعتمد على ارتباط وحدته الفرعية NSE3 بالحمض النووي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 44 (3): 1064-1079 . doi : 10.1093/nar/ gkv1021 . PMC 4756808. PMID 26446992 .   
  12. ^ Vondrova L، Kolesar P، Adamus M، Nociar M، Oliver AW، Palecek JJ (يونيو 2020). "دور الوحدات الفرعية Nse4 kleisin و Nse1/Nse3 KITE في دورة ATPase لـ SMC5/6" . التقارير العلمية . 10 (1): 9694. بيب كود : 2020NatSR..10.9694V . دوى : 10.1038/s41598-020-66647-ث . بمك 7297730 . بميد 32546830 .  
  13. بوتس، بي آر، ويو، إتش (يوليو 2007). "يحافظ مُركّب SMC5/6 على طول التيلومير في خلايا سرطان ALT من خلال إضافة جزيء SUMO إلى البروتينات المرتبطة بالتيلومير". مجلة Nature Structural & Molecular Biology ، 14 (7): 581-590 . doi : 10.1038/nsmb1259 . PMID 17589526. S2CID 7915836 .  
  14. غرانج إل جيه، رينولدز جيه جيه، الله إف، إيسيدور بي، شيرر آر إف، لاتيبوفا إكس، وآخرون . (نوفمبر 2022). "الطفرات المسببة للأمراض في SLF2 وSMC5 تسبب كروموسومات مجزأة وفرط صبغي فسيفسائي متنوع" . نيتشر كوميونيكيشنز . 13 (1): 6664. Bibcode : 2022NatCo..13.6664G . doi : 10.1038/s41467-022-34349-8 . PMC 9636423. PMID 36333305 .   
  15. يان إس، وانغ دبليو، ماركيز جيه، موهان آر، صالح إيه، دورانت دبليو إي، وآخرون . (نوفمبر 2013). " حمض الساليسيليك ينشط استجابات تلف الحمض النووي لتعزيز مناعة النبات" . الخلية الجزيئية . 52 (4): 602-610 . doi : 10.1016/j.molcel.2013.09.019 . PMC 3863363. PMID 24207055 .   
  16. دياز م، بيسينكا أ (يناير 2018). "البنية الداعمة للإصلاح: فهم الوظائف الجزيئية لمركب SMC5/6" . الجينات . 9 (1). بازل: 36. doi : 10.3390/genes9010036 . PMC 5793187. PMID 29329249 .  
  17. أورافكوفا م، ني م، زيليو ن، مايدا س، جامي الأحمدي ي، لازيريني-دينشي إ، وآخرون (نوفمبر 2022). تشيولو إي إي، تايلر جيه كيه (محرران). "مركب SIMC1-SLF2 الشبيه بـ Nse5/6 يحدد موقع SMC5/6 في مراكز تضاعف الفيروس" . eLife . 11 e79676 . doi : 10.7554/eLife.79676 . PMC 9708086. PMID 36373674 .   
  18. جيانغ جيه، ماو إن، هو إتش، تانغ جيه، هان دي، ليو إس، وآخرون . (يوليو 2019). "وحدة فرعية من SWI/SNF تنظم تفكك الكروموسوم لمركب الصيانة الهيكلية 5 أثناء إصلاح الحمض النووي في الخلايا النباتية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 116 (30): 15288-15296 . Bibcode : 2019PNAS..11615288J . doi : 10.1073/pnas.1900308116 . PMC 6660752. PMID 31285327 .   
  19. يو واي، لي إس، سير زد، كوانغ إتش، ثان تي، غوان دي، وآخرون (يونيو 2022). "بنية Smc5/6 المرتبطة بالحمض النووي والمُصوَّرة بتقنية المجهر الإلكتروني فائق البرودة تكشف عن تثبيت الحمض النووي المُمكن بواسطة تغييرات بنيوية متعددة الوحدات الفرعية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 119 (23) e2202799119. Bibcode : 2022PNAS..11902799Y . doi : 10.1073/pnas.2202799119 . PMC 9191643. PMID 35648833 .   
  20. هونغ واي، سونفيل آر، أغوستينو إيه، ماير بي، وانغ بي، بلو جيه جيه، وآخرون (مارس 2016). "يعزز معقد SMC-5/6 وإنزيم الهيليكاز HIM-6 (BLM) بشكل تآزري معالجة وسيطة لإعادة التركيب الميوزي ونضج الكروموسومات أثناء الانقسام الميوزي في دودة Caenorhabditis elegans" . PLoS Genetics . 12 (3) e1005872. doi : 10.1371/journal.pgen.1005872 . PMC 4807058. PMID 27010650 .   
  21. هوانغ جي، صن إف، أوبراين إم، إيبيغ جيه جيه، هاندل إم إيه، جوردان بي دبليو (مايو 2017). " يُعدّ SMC5/6 ضروريًا لتكوين الكروموسومات الثنائية القادرة على الانفصال خلال الانقسام الاختزالي الأول في بويضات الفئران" . التطور . 144 (9). كامبريدج، إنجلترا: 1648-1660 . doi : 10.1242/dev.145607 . PMC 5450844. PMID 28302748 .  
  22. فان دير كرابن إس إن، هينوس إم بي، ماكجريجور جي إيه، ريتر دي آي، ناجاماني إس سي، ويلز أو إس، وآخرون . (أغسطس 2016). "يؤدي عدم استقرار مُركّب SMC5/6 إلى متلازمة انكسار الكروموسومات المصحوبة بمرض رئوي حاد" . مجلة التحقيقات السريرية . 126 (8): 2881-2892 . doi : 10.1172/JCI82890 . PMC 4966312. PMID 27427983 .   

للمزيد من القراءة