SOX17
SRY-box 17 هو بروتين يتم ترميزه في البشر بواسطة جين SOX17 . [ 5 ]
جين
يشفر الجين أحد أفراد عائلة عوامل النسخ SOX (SRY-related HMG-box)، الموجودة على الكروموسوم 8 q11.23.
بناء
يقع جين SOX17 داخل حلقة من الحمض النووي تعزله عن مناطق التحكم في الحمض النووي المحيط، مما يحد من قدرة هذه المناطق على تنظيم التعبير الجيني لـ SOX17. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] وعلى بعد حوالي 230 كيلوبايت من جين SOX17 ، تم تحديد منطقة خاصة بالأنسجة ذات مثيلة تفاضلية (منخفضة) (DMR)، تتكون من عناصر تنظيمية لـ SOX17 . [ 9 ] [ 8 ]
يحمل DMR على وجه الخصوص مُحسِّنًا خاصًا بالأديم الباطن النهائي الأبعد في موضع SOX17 . [ 8 ] وقد تم تعريف SOX17 مؤخرًا على أنه ما يُسمى بالجين المعزول طوبولوجيًا (TIG). وتُعرَّف الجينات المعزولة طوبولوجيًا بأنها جينات ترميز بروتينية مفردة (PCGs) ضمن نطاقات حلقة CTCF ، وهي غنية بشكل أساسي بمنظمات النمو، ويُعتقد أنها تخضع لسيطرة دقيقة للغاية من خلال بنيتها ثلاثية الأبعاد لنطاق الحلقة. [ 8 ]
وظيفة
يشارك SOX17 في تنظيم التطور الجنيني للفقاريات وتحديد مصير خلايا الأديم الباطن. يعمل البروتين المشفر في مسار إشارات TGF-β (أكتيفين) ومسار إشارات WNT الكلاسيكي (Wnt3a). [ 10 ] [ 11 ] يُعدّ الفسفرة الصحيحة لـ SMAD2/3 خلال دورة الخلية (المرحلة G1 المبكرة) أمرًا بالغ الأهمية لتنشيط جينات الأديم الباطن الرئيسية (مثل SOX17) للدخول في سلالة الأديم الباطن النهائية. [ 12 ] إلى جانب ذلك، يؤدي اضطراب حدود SOX17 المركزية CTCF في المراحل المبكرة من تمايز الأديم الباطن النهائي إلى فشل نمائي كبير وحالة خلوية محاصرة تُشبه الأديم المتوسط، والتي يمكن علاجها عن طريق التعبير غير الطبيعي لـ SOX17. [ 8 ] في يرقات الضفدع Xenopus ، ثبت أن SOX17 يُعدِّل استجابات Wnt، حيث يتم تحديد الخصوصية الجينومية لنسخ Wnt/β-catenin من خلال التفاعلات الوظيفية بين SOX17 ومركبات النسخ β-catenin/Tcf. [ 11 ]
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000164736 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000025902 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "Entrez Gene: SRY-box 17" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2017-09-07 .
- ↑ راو إس إس، هوانغ إس سي، غلين سانت هيلير بي، إنجريتز جيه إم، بيريز إي إم، كيفر-كوون كيه آر، وآخرون . (أكتوبر 2017). "فقدان الكوهيسين يُزيل جميع نطاقات الحلقة" . مجلة Cell . 171 (2): 305–320.e24. Bibcode : 2017Cell..171..305R . doi : 10.1016/j.cell.2017.09.026 . hdl : 1721.1 /118942 . PMC 5846482. PMID 28985562 .
- ↑ سزابو كيو، بانتينييه إف، كافالي جي (أبريل 2019). "مبادئ طي الجينوم إلى نطاقات مرتبطة طوبولوجيًا" . ساينس أدفانسز . 5 (4) eaaw1668. Bibcode : 2019SciA....5.1668S . doi : 10.1126 / sciadv.aaw1668 . PMC 6457944. PMID 30989119 .
- وو إتش جيه، لاندشامر إيه، ستامينوفا إي كيه، بولوندي إيه، كريتزمير إتش، ميسنر إيه، وآخرون . (أغسطس 2021). "العزل الطوبولوجي لمنظمات النمو في جينومات الثدييات" . نيتشر كوميونيكيشنز . 12 ( 1 ) 4897. Bibcode : 2021NatCo..12.4897W . doi : 10.1038 / s41467-021-24951-7 . PMC 8361032. PMID 34385432 .
- ↑ تسانكوف إيه إم، غو إتش، أكوبيان في، زيلر إم جيه، دوناغي جيه، أميت آي، وآخرون . (فبراير 2015). "ديناميكيات ارتباط عوامل النسخ أثناء تمايز الخلايا الجذعية الجنينية البشرية" . نيتشر . 518 (7539): 344-349 . Bibcode : 2015Natur.518..344T . doi : 10.1038/ nature14233 . PMC 4499331. PMID 25693565 .
- ↑ إنجرت إس، بورتشر آي، لياو دبليو بي، دوليف إس، شوتا جي، ليكرت إتش (أغسطس 2013). "تنظم إشارات Wnt/β-catenin التعبير عن Sox17 وهي ضرورية لتكوين المنظم والطبقة الداخلية في الفأر" . التطور . 140 (15). كامبريدج، إنجلترا: 3128-3138 . doi : 10.1242/dev.088765 . PMID 23824574 .
- 1 2 موخيرجي إس، تشاتورفيدي بي، رانكين إس إيه، فيش إم بي، وليزلا إم، بارايسو كيه دي، وآخرون (سبتمبر 2020). لابون سي، موريسي إي إي (محرران). "يشغل كل من Sox17 وβ-catenin معًا مُحسِّنات الاستجابة لـ Wnt للتحكم في شبكة تنظيم جينات الأديم الباطن" . eLife . 9 e58029 . doi : 10.7554/eLife.58029 . PMC 7498262. PMID 32894225 .
- ↑ بوكلين إس، فالييه إل (سبتمبر 2013). " حالة دورة الخلية للخلايا الجذعية تحدد ميل مصير الخلية" . الخلية . 155 (1): 135-147 . doi : 10.1016/j.cell.2013.08.031 . PMC 3898746. PMID 24074866 .
للمزيد من القراءة
- تشانغ وآخرون (أبريل 2008). "التثبيط اللاجيني لجين SRY-box 17، وهو جين يحتوي على مُضاد Wnt الكلاسيكي، في سرطان القولون والمستقيم" . أبحاث السرطان . 68 (8): 2764-2772 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6349 . PMC 2823123. PMID 18413743 .
- باترسون إي إس، أديس آر سي، شامبلوت إم جيه، جيرهارت جيه دي (أغسطس 2008). "ينشط SOX17 نسخ Zfp202 مباشرةً أثناء تمايز الأديم الباطن في المختبر". علم الجينوم الفيزيولوجي . 34 (3): 277-284 . doi : 10.1152/physiolgenomics.90236.2008 . PMID 18523156 .
- فيريل، ر. إي.، كيماك، م. أ.، لورانس، إ. س.، فاينغولد، د. ن. (2008). "تحليل الجينات المرشحة في الوذمة اللمفية الأولية". أبحاث وبيولوجيا الجهاز اللمفاوي . 6 (2): 69-76 . doi : 10.1089/lrb.2007.1022 . PMID 18564921 .
- سيغوين، سي. أ.، دريبر، ج. س.، ناجي، أ.، روسانت، ج. (أغسطس 2008). "تكوين الخلايا السلفية للأديم الباطن عن طريق التعبير عن عامل النسخ SOX في الخلايا الجذعية الجنينية البشرية" . مجلة Cell Stem Cell . 3 (2): 182-195 . doi : 10.1016/j.stem.2008.06.018 . PMID 18682240 .
- سيمب هـ (أكتوبر 2008). "الخلايا السلفية الأديمية الباطنة القابلة للتمدد: أدوات جديدة لاستكشاف الأديم الباطن ومشتقاته" . خلية جذعية . 3 (4): 355-356 . doi : 10.1016/j.stem.2008.09.010 . PMID 18940723 .
- فو دي واي، وانغ زد إم، وانغ بي إل، شين زد زد، هوانغ دبليو، شاو زد إم (فبراير 2010). "يُعطَّل Sox17، وهو المُضاد الكلاسيكي لمسار Wnt، وراثيًا عن طريق مثيلة المُحفِّز في سرطان الثدي البشري". أبحاث وعلاج سرطان الثدي . 119 (3): 601-612 . doi : 10.1007/s10549-009-0339-8 . PMID 19301122. S2CID 8614063 .
- نوناكا د (مايو 2009). "التعبير التفاضلي عن SOX2 وSOX17 في أورام الخلايا الجرثومية الخصوية" . المجلة الأمريكية لعلم الأمراض السريرية . 131 (5): 731-736 . doi : 10.1309/AJCP7MNCNBCRN8NO . PMID 19369635 .
- دو واي سي، أوشيما إتش، أوغوما ك، كيتامورا تي، إيتاداني إتش، فوجيمورا تي، وآخرون . (أكتوبر 2009). "التحريض والتنظيم السفلي لـ Sox17 وأدواره المحتملة أثناء عملية تكوين الأورام في الجهاز الهضمي". أمراض الجهاز الهضمي . 137 (4): 1346–1357 . دوى : 10.1053/j.gastro.2009.06.041 . اتش دي ال : 2297/25144 . بميد 19549530 . S2CID 6296792 .
- ستيفانوفيتش إس، عبود ن، ديزيليه إس، نوري د، كوان سي، بوسيه إم (سبتمبر 2009). "التفاعل بين Oct4 وSox2 وSox17: مفتاح جزيئي من قدرة الخلايا الجذعية على التمايز إلى تحديد مصير قلبي" . مجلة بيولوجيا الخلية . 186 (5): 665-673 . doi : 10.1083/jcb.200901040 . PMC 2742180. PMID 19736317 .
- ماكارثي سي إم، مالك في، وو جي، فيليتشكو تي، كيشيت جي، جاوتش آر، وآخرون (2024). "يحفز بروتين سوبر-سوكس الهجين عالي التعاون قدرة الخلايا الجذعية على التمايز إلى أنواع متعددة من الخلايا عبر الأنواع". مجلة Cell Stem Cell ، 31 (1): 127-147.e9. bioRxiv 10.1101/2022.09.23.509242 . doi : 10.1016/j.stem.2023.11.010 . PMID 38141611 .
تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 8
- عوامل النسخ
