هالوفراكس

هالوفيراكس (اختصار شائع: Hfx. ) هو جنس من البكتيريا المحبة للملوحة في رتبة هالوفيراكاسيا . [ 2 ]

التبادل الجيني

يمكن لخلايا H. mediterranei وخلايا النوع ذي الصلة H. volcanii أن تخضع لعملية تبادل جيني بين خليتين، تتضمن اندماج الخلايا مما ينتج عنه خلية غير متجانسة ثنائية الصيغة الصبغية (تحتوي على كروموسومين مختلفين في خلية واحدة). [ 3 ] على الرغم من أن هذا التبادل الجيني يحدث عادةً بين خليتين من النوع نفسه، إلا أنه قد يحدث أيضًا بتردد أقل بين خلية H. mediterranei وخلية H. volcani . يبلغ متوسط ​​تطابق تسلسل النيوكليوتيدات بين هذين النوعين 86.6%. [ 3 ] خلال عملية التبادل هذه، تتشكل خلية ثنائية الصيغة الصبغية تحتوي على كامل التركيب الجيني لكلا الخليتين الأبويتين، مما يُسهّل عملية إعادة التركيب الجيني. بعد ذلك، تنفصل الخليتان، مما يؤدي إلى ظهور خلايا مُعاد تركيبها.

التصنيف

اعتبارًا من عام 2022، تم نشر 13 نوعًا بشكل صحيح تحت جنس Haloferax . [ 1 ]

الأنواع المقترحة

تم اقتراح العديد من الأنواع والأسماء الثنائية الجديدة، ولكن لم يتم نشرها بشكل صحيح.

  • تم عزل الأنواع " Haloferax antrum " Enache et al. 2006 ، [ 4 ] و " Haloferax opilio " Enache et al. 2006 و" Haloferax rutilus " Enache et al. 2006 و" Haloferax viridis " Enache et al. 2006 من البحيرات المالحة الرومانية ، واقترحت لأول مرة كأنواع جديدة في عام 2006. [ 5 ] أما النوع H. prahovense ، الذي تم اقتراحه معها، فهو الوحيد الذي تم نشره بشكل صحيح منذ ذلك الحين.
  • تم عزل " Haloferax berberensis " Kharroub et al. 2005e في الجزائر واقتراحها كنوع جديد في عام 2005. [ 6 ]
  • تم نشر Haloferax litoreum و Haloferax marinisediminis و Haloferax marinum لأول مرة في عام 2021، ولكن لم يتم قبولها اعتبارًا من عام 2022. [ 7 ]
  • تم نشر Haloferax marisrubri و Haloferax profundi لأول مرة في عام 2020، ولكن لم يتم قبولهما اعتبارًا من عام 2022. [ 8 ]
  • نُشرت معلومات عن نوع Haloferax massilisiensis أو Haloferax massiliense لأول مرة في عام 2016، ثم مرة أخرى في عام 2018، باعتباره من العتائق المحبة للملوحة المرتبطة بالإنسان. واعتبارًا من عام 2022، لم يعد هذا النوع معترفًا به. [ 9 ]

نسالة

يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 1 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 2 ]

LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]53 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB 10-RS226 [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
هالوفراكس

H. ناماكاوكاهاي ماكدوف وآخرون. 2017

هالوفراكس

H. elongans Allen et al. 2008

H. larsenii Xu et al. 2007

H. litoreum Cho et al. 2025

" H. عميق " تشانغ وآخرون. 2020

H. marinisediminis تشو وآخرون. 2025

H. marinum Cho et al. 2025

H. البحر الأبيض المتوسط ​​(رودريجيز فاليرا وآخرون. 1983) توريبلانكا وآخرون. 1987

H. mucosum Allen et al. 2008

H. gibbonsii Juez et al. 1986

H. براهوفنسي Enache وآخرون. 2007

" H. marisrubri " تشانغ وآخرون. 2020

H. denitrificans (Tomlinson et al. 1986) Tindall et al. 1989 [incl. H. sulfurifontis ]

" H. ماسيلينسيس " خليفية وراولت 2016

H. فولكاني (مولاخانباي ولارسن 1975) توريبلانكا وآخرون. 1986 [بما في ذلك. H. ألكسندرينوس ، H. لوسينتنس ]

هالوفراكس غير مُخصص :

  • " H. الغار " Enache وآخرون. 2006
  • " H.berberensis " خروب وآخرون. 2005هـ
  • " H. opilio " Enache وآخرون. 2006
  • " H. rutilus " Enache وآخرون. 2006
  • " H. viridis " Enache وآخرون. 2006

التكنولوجيا الحيوية الصناعية

اكتسبت العديد من أنواع بكتيريا هالوفراكس ، ولا سيما هالوفراكس مديتراني، شهرةً واسعةً لقدرتها على العمل كركيزة فعّالة للإنتاج الحيوي. تُعرف هالوفراكس مديتراني بإنتاجها لبولي هيدروكسي ألكانوات ، وهو بلاستيك حيوي مستدام وقابل للتحلل. [ 16 ] وقد دُرست هذه البكتيريا لإنتاج العديد من المنتجات ذات القيمة المضافة، مثل البلاستيك الحيوي والأصباغ والإنزيمات الخارجية. [ 17 ] تتميز هالوفراكس مديتراني بقدرتها على تجميع كميات كبيرة من كلٍّ من بولي هيدروكسي ألكانوات المتجانسة والمشتركة من مجموعة واسعة من ركائز الكربون المستدامة. [ 16 ] [ 18 ] كما استُخدمت أنواع هالوفراكس لإنتاج إنزيمات خارجية ذات أهمية صناعية، مثل إنزيم اللاكاز، للمعالجة الحيوية. [ 19 ] ونظرًا لقدرتها على النمو في ظروف قاسية من الملوحة والسمية والتعرض للمعادن الثقيلة والأشعة فوق البنفسجية، تنخفض تكاليف التخمير بشكل ملحوظ لانخفاض احتمالية التلوث. [ 17 ] في البيئات شديدة الملوحة مثل البحر الميت وبحيرة الملح الكبرى ، تتحمل أنواع هالوفراكس معظم مسؤولية إزالة النيتروجين . [ 20 ] يمكن الاستفادة من هذه السلالات في أنظمة إزالة النيتروجين المصممة لمعالجة النفايات المالحة من مصائد الأسماك وصناعات النسيج ومصانع تجهيز الأغذية.

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 ج.ب. أوزيبي. "هالوفيراكس" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 10-10-2023 .
  2. 1 2 سايرز وآخرون . "هالوفيراكس" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 10 أكتوبر 2023 . 
  3. 1 2 ناور أ، لابير ب، ميفاريش م، بابكي ر ت، غوفنا يو (أغسطس 2012). "حواجز الأنواع المنخفضة في العتائق المحبة للملوحة وتكوين الهجائن المؤتلفة" . بيولوجيا حالية . 22 (15): 1444-8 . Bibcode : 2012CBio...22.1444N . doi : 10.1016/j.cub.2012.05.056 . PMID 22748314 . 
  4. الأرشيف الأوروبي للنيوكليوتيدات (EBA) ، تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 يوليو 2022
  5. متصفح تصنيف NCBI (Haloferax antrum) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  6. متصفح تصنيف NCBI (Haloferax berberensis) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  7. "LPSN - قائمة أسماء بدائيات النوى ذات التصنيف التصنيفي" . Deutsche Sammlung von Microorganismen und Zellkulturen . تم الاسترجاع 2022-07-14 .
  8. "LPSN - قائمة أسماء بدائيات النوى ذات التصنيف التصنيفي" . Deutsche Sammlung von Microorganismen und Zellkulturen . تم الاسترجاع 2022-07-14 .
  9. "LPSN - قائمة أسماء بدائيات النوى ذات التصنيف التصنيفي" . Deutsche Sammlung von Microorganismen und Zellkulturen . تم الاسترجاع 2022-07-14 .
  10. "برنامج النقل طويل الأجل" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  11. "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  12. "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  13. "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  14. "ar53_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  15. "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  16. 1 2 باروكين-غونزاليس، ماريانا؛ وينتربيرن، جيمس (13-09-2023). "الإنتاج المستمر لمتعدد هيدروكسي ألكانوات في مفاعل حيوي في هالوفراكس مديتراني" . مجلة فرونتيرز في الهندسة الحيوية والتكنولوجيا الحيوية . 11 1220271. doi : 10.3389/fbioe.2023.1220271 . ISSN 2296-4185 . 
  17. 1 2 غريفيث، دانا ب.؛ تيواري، رافي ب.؛ مورفي، دانيال ف.؛ سكوت، كولين (نوفمبر 2025). "هالوفيراكس وعائلة هالوفيراكاسيا: دور محتمل في الصناعات الحيوية". التقدم في التكنولوجيا الحيوية . 84 108666. doi : 10.1016/j.biotechadv.2025.108666 . ISSN 1873-1899 . PMID 40744239 .  
  18. وانغ، كي؛ تشانغ، روي هونغ (28 فبراير 2021). "إنتاج بولي هيدروكسي ألكانوات (PHA) بواسطة هالوفراكس مديتراني من مغذيات مشتقة من نفايات الطعام لتطبيقات البلاستيك القابل للتحلل الحيوي" . مجلة علم الأحياء الدقيقة والتكنولوجيا الحيوية . 31 (2): 338-347 . doi : 10.4014/jmb.2008.08057 . ISSN 1738-8872 . PMC 9706037. PMID 33203825 .   
  19. كاسيرجان، لاكشمي؛ آدامز، زاكاري؛ كوتو-رودريغيز، ريكاردو ل.؛ غال، دانيال؛ جيا، هويونغ؛ موندراغون، باولا؛ واسيل، بول س.؛ يو، ديفيد؛ أوثاندي، سيفاكومار؛ موبين-فورلو، جولي أ. (2021). "التخليق والإفراز عالي المستوى لإنزيم اللاكاز، وهو إنزيم حيوي محفز، بواسطة الأركيا المحبة للملوحة هالوفراكس فولكاني". التعبير عن البروتين المؤتلف: المضيفات بدائية النواة والأنظمة الخالية من الخلايا . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 659. الصفحات 297-313 . doi : 10.1016/bs.mie.2021.05.012 . ISBN   978-0-323-90146-8ISSN 1557-7988 . PMC 8867731. PMID 34752290 .​   
  20. توريغروسا-كريسبو، خافيير؛ بير، كارمن؛ مارتينيز-إسبينوزا، روزا ماريا؛ بيرغاوست، ليندا (2019). "تُظهر البكتيريا القديمة المُزيلة للنترات من جنس هالوفراكس أنماطًا تنفسية مُتباينة، مع ما يترتب على ذلك من آثار على إطلاقها للغازات النيتروجينية" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 21 (1): 427-436 . Bibcode : 2019EnvMi..21..427T . doi : 10.1111/1462-2920.14474 . ISSN 1462-2920 . 

للمزيد من القراءة