هالوروبروم

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

هالوروبروم هو جنس نباتي ينتمي إلى عائلة هالوروبراسيا . عادةً ما تكون أنواع هالوروبروم محبة للملوحة ويمكن العثور عليها في المياه ذات التركيز الملحي العالي مثل البحر الميت أو بحيرة زابوي .

التبادل الجيني

تبادلت مجموعة من بكتيريا هالوآركيا هالوروبروم، في بيئتها الطبيعية ذات التركيز الملحي العالي، المعلومات الوراثية بشكل متكرر عن طريق إعادة التركيب. [ 2 ] وأظهرت هذه المجموعة درجة من التوازن الارتباطي تقارب تلك الموجودة في مجموعة تتكاثر جنسياً.

صِنف

تم عزل فطر Halorubrum ejinorense لأول مرة من بحيرة إيجينور في منغوليا الداخلية ، الصين. [ 3 ]

عُزلت بكتيريا هالوروبروم لاكوس بروفوندي لأول مرة في ثمانينيات القرن الماضي من بحيرة ديب في القارة القطبية الجنوبية. [4] يتكون جينومها ، الذي تم تسلسله عام 2008 ، من كروموسومين ( أحدهما 2.74 ميجابايت والآخر 0.53 ميجابايت) وبلازميد واحد (0.43 ميجابايت). [ 5 ] دُرِسَ إنزيم بيتا-جالاكتوزيداز الخاص بها على نطاق واسع لفهم كيفية عمل البروتينات في بيئات منخفضة الحرارة وعالية الملوحة. [ 6 ] [ 7 ] تحتوي إحدى سلالات هالوروبروم لاكوس بروفوندي على بلازميد لنقل الجينات الأفقي ، والذي يتم عبر آلية تستخدم جسيمات شبيهة بالفيروسات مغلفة بحويصلات. [ 8 ]

تم التعرف على بكتيريا هالوروبروم سودومينس لأول مرة في البحر الميت عام 1980. وهي تتطلب تركيزًا أعلى من أيونات المغنيسيوم (Mg2 +) للنمو مقارنةً بالبكتيريا المحبة للملوحة الأخرى . [ 9 ] يحتوي غشاء سطح الخلية على بروتين أركايرهودوبسين-3 (AR3)، وهو بروتين مستقبل للضوء يستمد الطاقة من ضوء الشمس لتوليد قوة دافعة بروتونية تُستخدم في تخليق الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP) . [ 10 ] [ 11 ] تُستخدم طفرات AR3 على نطاق واسع كأدوات في علم البصريات الوراثية لأبحاث علم الأعصاب. [ 12 ]

تم عزل فطر Halorubrum tibetense لأول مرة من بحيرة زابوي في التبت، الصين. [ 13 ]

تم عزل فطر Halorubrum xinjiangense لأول مرة من بحيرة Xiao-Er-Kule في شينجيانغ، الصين. [ 14 ]

الأنواع المقترحة

تم اقتراح العديد من الأنواع والأسماء الثنائية الجديدة، ولكن لم يتم نشرها بشكل صحيح.

  • " Halorubrum africanae " خروب وآخرون. 2007 ب و" هالوروبروم كونستانتيننسي " خروب وآخرون. تم عزل 2007b في الجزائر واقترحت كأنواع جديدة في عامي 2007 [ 15 ] و 2005. [ 16 ]
  • " Halorubrum alimentarium " Nam et al. 2008 nom. nud. و " Halorubrum koreense " Nam et al. 2008 nom. nud. هما الاسمان المقترحان للسلالتين غير الموصوفتين B43 و B6 ، واللتان ظهرتا في منشور عام 2008. [ 17 ]
  • " Halorubrum halotolerans " Sabet et al. 2009 هو الاسم المقترح لسلالة غير موصوفة تم عزلها من أحواض الملح الشمسية في باجا كاليفورنيا في عام 2009. [ 18 ]
  • هالوروبروم هوكستينيومهو الاسم المقترح للجينوم الكامل للسلالة غير الموصوفة ATCC 700873 ، والتي تم توريدها إلى قواعد البيانات في عام 2014. [ 19 ] [ 20 ]
  • تم عزل نوع " Halorubrum jeotgali " (Roh et al. 2007b) من عينات من المأكولات البحرية الكورية التقليدية، واقتُرح كنوع جديد في عام 2007. [ 21 ] واقتُرح نوع "Halorubrum cibarium" في نفس المنشور. ثم اقتُرح مرة أخرى تحت اسم "H. cibi" وقُبل في عام 2009.
  • " Halorubrum kribbense " Nkamga, Henrissat & Drancourt 2017 و " Halorubrum norisence " Nkamga, Henrissat & Drancourt 2017 هي أسماء مقترحة لسلالات غير معزولة من ميكروبيوم الأمعاء البشرية، والتي تمت الإشارة إليها في منشور عام 2017. [ 22 ]
  • H. ميلتونداكوستاي ألبوكيرك وآخرون. 2025
  • " Halorubrum salipaludis " Gong et al. 2021 نُشر لأول مرة في عام 2021. [ 23 ]
  • " Halorubrum salsolis "
  • هالوروبروم سالسامينتيتم عزله من محلول ملحي واقتراحه كنوع جديد في عام 2017. [ 24 ]
  • " هالوروبروم الصفاقسي " تريغي وآخرون. تم عزل 2011 في تونس واقترح كنوع جديد في 2017. [ 25 ]
  • " Halorubrum tropicale "تم عزله في بورتوريكو واقتراحه كنوع جديد في عام 2016. [ 26 ]

نسالة

يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 1 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 27 ]

LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]53 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB 10-RS226 [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ]
هالوروبروم

H. vacuolatum (مواثا وجرانت 1993) كاميكورا وآخرون. 1997

H. gandharaense كوندو وآخرون. 2015

H. luteum Hu et al. 2008

H. alkaliphilum Feng et al. 2005

H. tibetense Fan et al. 2004

H. glutamatedens Xu et al. 2019

H. aquaticum جوتيريز وآخرون. 2011

H. إثيوبيكوم جيبتان وآخرون. 2018

H. rubrum Qiu et al. 2014

H. cibi Roh & Bae 2009

H. halodurans Corral et al. 2016

H. التوزيع (Zvyagintseva & Tarasov 1989) أورين & فينتوسا 1996

H. إيجينورينس كاستيلو وآخرون. 2007

H. تيبنكويشنس ليزاما وآخرون. 2002

H. hochsteinianum فريلاند وآخرون. 2024

H. salinarum Han et al. 2022

H. شينجيانغينس فنغ وآخرون. 2004

H. كورينسي (Kamekura & Dyall-Smith 1996) أورين & فينتوسا 1996

ح. عزمولينس خروب وآخرون. 2006

H. sodomense (Oren 1983) McGenity & Grant 1996

H. كاليفورنيا بيسنتي وآخرون. 2008

H. trapanicum (Petter 1931) McGenity & Grant 1996

H. اميلوليتيكوم صن وآخرون. 2019

H. برسيكوم كورال وآخرون. 2015

H. saccharovorum (Tomlinson & Hochstein 1977) McGenity & Grant 1996

H. pallidum Chen et al. 2016

H. laminariae Han & Cui 2015

H. salinum Zhang & Cui 2014

H. ليبوليتيكوم كوي وآخرون. 2006

ه. كوكوري جوتيريز وآخرون. 2008

H. lacusprofundi (Franzmann et al. 1989) McGenity & Grant 1996

حاء سالسامنتي تشن وآخرون. 2019

H. halophilum Yim et al. 2014

H. أورينتال كاستيلو وآخرون. 2006

H. trueperi Chen et al. 2017

H. aidingense Cui et al. 2006

H. يوناننسي تشن وآخرون. 2015

H. depositum Chen et al. 2019

H. rutilum Yin et al. 2016

هالوروبروم

H. vacuolatum

H. alkaliphilum

H. aquaticum

H. cibi

H. rubrum

H. aethiopicum

H. halodurans

H. ejinorense

H. xinjiangense

H. salinarum

H. الاستوائية سانشيز نيفيس وآخرون. 2016

H. californiense

H. distributum

" H. ruber " هوانغ وآخرون 2022

H. laminariae

H. salinum

H. aidingense

H. depositum

H. yunnanense

H. lacusprofundi

H. persicum

H. saccharovorum

H. halophilum

" H. salipaludis " جونج وآخرون. 2021

هيستوليزوماب

H. salsamenti

مراجع

  1. 1 2 3 ج.ب. أوزيبي. "هالوروبروم" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 10-10-2023 .
  2. ↑ بابكي آر تي، كونيغ جيه إي، رودريغيز-فاليرا إف، دوليتل دبليو إف (ديسمبر 2004). "إعادة التركيب المتكررة في مجموعة من نبات هالوروبروم في ملاحات". مجلة ساينس . 306 (5703): 1928-1929 . رمز Bibcode : 2004Sci...306.1928P . doi : 10.1126/science.1103289 . PMID 15591201. S2CID 21595153 .  
  3. ↑ كاستيلو آم، جوتيريز إم سي، كاميكورا إم، شيويه واي، ما واي، كوان دا، جونز بي، جرانت دبليو دي، فينتوسا أ (2007). "Halorubrum Ejinorense Sp. نوفمبر، معزولة عن بحيرة Ejinor، منغوليا الداخلية، الصين" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 57 (11): 2538–2542 . دوى : 10.1099/ijs.0.65241-0 . بميد 17978215 . 
  4. ↑ فرانزمان، ب. د.، ستاكل براندت، إ.، ساندرسون، ك.، فولكمان، ج. ك.، كامبيرون، د. إ.، ستيفنسون، ب. ل.، ماكميكين، ت. أ.، بيرتون، هـ. ر. (1988). " هالوبكتيريوم لاكوس بروفوندي ، نوع جديد، بكتيريا محبة للملوحة معزولة من بحيرة ديب، أنتاركتيكا". علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . 11 (1): 20-27 . doi : 10.1016/S0723-2020(88)80044-4 .
  5. ↑ أندرسون، آي جيه، داس سارما، بي، لوكاس، إس، كوبلاند، إيه، لابيدوس، إيه، ديل ريو، تي، تايس، إتش، دالين، إي، بروس، دي سي، غودوين، إل، بيتلوك، إس، سيمز، دي، بريتين، تي إس، ديتر، جيه سي، هان، سي إس، لاريمر، إف، هاوزر، إل، لاند، إم، إيفانوفا، إن، ريتشاردسون، بي، كافيكيولي، آر، داس سارما، إس، ووز، سي آر، كيربيدس (2008). " التسلسل الجينومي الكامل لسلالة هالوروبروم لاكوس بروفوندي النمطية ACAM 34 في القطب الجنوبي" . معايير في علوم الجينوم . 11 (1): 70. doi : 10.1186/s40793-016-0194-2 . PMC 5018182. PMID 27617060 .  
  6. ↑ كاران ر، كابيس إم دي، داس سارما ب، داس سارما س (2013). "استنساخ، وإفراط التعبير، والتنقية، وتوصيف بيتا-جالاكتوزيداز متعدد الظروف القاسية من هالواركيون هالوروبروم لاكوس بروفوندي في القطب الجنوبي " . بي إم سي للتكنولوجيا الحيوية . 13 : 10.1186/1472-6750-13-3. doi : 10.1186/1472-6750-13-3 . PMC 3556326. PMID 23320757 .  
  7. ↑ لاي في جيه، كاران آر، كيم جيه إم، بيشر دبليو تي، داس سارما بي، داس سارما إس (2017). "بقايا الأحماض الأمينية الرئيسية التي تُعزز نشاط الإنزيم في درجات الحرارة المنخفضة في بيتا-جالاكتوزيداز متعدد الظروف القاسية في القطب الجنوبي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 114 ( 47): 12530-35 . رمز Bibcode : 2017PNAS..11412530L . doi : 10.1073/pnas.1711542114 . PMC 5703305. PMID 29109294 .  
  8. ↑ إردمان إس، تشيتشكو بي، تشونغ إل، رافتري إم جيه، كافيكيولي آر (9 سبتمبر 2017). "بلازميد من هالواركيون قطبي جنوبي يستخدم حويصلات غشائية متخصصة لنشر وإصابة الخلايا الخالية من البلازميد". مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 2 (10): 1446-1455 . doi : 10.1038/s41564-017-0009-2 . hdl : 1959.4/unsworks_49908 . PMID 28827601. S2CID 38729395 .  
  9. ↑ أورين أ (1983). " هالوبكتيريوم سودومينس نوع جديد. بكتيريا هالوباكتيريوم من البحر الميت ذات احتياج عالٍ للغاية للمغنيسيوم" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 33 (2): 381-386 . doi : 10.1099/00207713-33-2-381 .
  10. ^ إيهارا ك، أوميمورا تي، كاتاجيري الأول، كيتاجيما إيهارا تي، سوجياما واي، كيمورا واي، موكوهاتا واي (يناير 1999). “تطور الرودوبسين الأثري: يتغير معدل التطور عن طريق ازدواج الجينات والتمايز الوظيفي”. مجلة البيولوجيا الجزيئية . 285 (1): 163–74 . دوى : 10.1006/jmbi.1998.2286 . بميد 9878396 . 
  11. ↑ بادا خواريز جيه إف، جادج بي جيه، آدم إس، أكسفورد دي، فينالز جيه، بيرش جيه، كوان تي أو، هوي كيه كيه، ين إتش واي، فيال إيه، ميليهيت بي إي، روبنسون سي في، شابيرو آي، مورايس آي، واتس إيه (2021). "تكشف بنى ناقل الأركيرودوبسين 3 أن اضطراب شبكات الماء الداخلية يدعم تحسس المستقبلات" . نيتشر كوميونيكيشنز . 12 (1): 629. Bibcode : 2021NatCo..12..629B . doi : 10.1038/ s41467-020-20596-0 . PMC 7840839. PMID 33504778 .  
  12. ↑ فلايتزانيس، ن. س.، بيدبروك، س. ن.، تشيو، هـ.، إنجكفيست، م. ك.، شياو، س.، تشان، ك. ي.، ستيرنبرغ، ب. و.، أرنولد، ف. هـ.، غرادينارو، ف. (2014). " متغيرات أركيرودوبسين ذات تألق حساس للجهد مُعزز في الخلايا العصبية للثدييات والديدان الأسطوانية Caenorhabditis elegans " . نيتشر كوميونيكيشنز . 5 : 4894. Bibcode : 2014NatCo...5.4894F . doi : 10.1038/ncomms5894 . PMC 4166526. PMID 25222271 .  
  13. ↑ فان هـ، شيو ي، ما ي، فينتوسا أ، غرانت و.د. (2004). " Halorubrum tibetense sp. nov.، نوع جديد من العتائق المحبة للملوحة والقلوية من بحيرة زابوي في التبت، الصين" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 54 (4): 1213-1216 . doi : 10.1099/ijs.0.03032-0 . hdl : 2381/15040 . PMID 15280294 . 
  14. ↑ فينغ جيه، تشو بي جيه، ليو إس جيه (2004). " Halorubrum xinjiangense sp. nov.، نوع جديد من البكتيريا المحبة للملوحة معزولة من البحيرات المالحة في الصين" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 54 (5): 1789-1791 . doi : 10.1099/ijs.0.63209-0 . PMID 15388744 . 
  15. ^ متصفح التصنيف NCBI (Halorubrum africanae) ، استرجاعها 2022-07-14
  16. ↑ متصفح تصنيف NCBI (Halorubrum constantinense) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  17. نام يونغ دو؛ تشانغ هو وون؛ كيم كيونغ هو؛ روه سيونغ وون؛ كيم مين سو؛ جونغ مي جا؛ لي سي وو؛ كيم جونغ يول؛ يون جونغ هون؛ باي جين وو (2008). "التنوع البكتيري والأثري وحقيقي النواة في أمعاء الشعب الكوري". مجلة علم الأحياء الدقيقة . 46 (5): 491-501 . doi : 10.1007 / s12275-008-0199-7 . PMID 18974948. S2CID 24070213 .  
  18. ↑ سابيت إس، ديالو إل، هايز إل، جونغ دبليو، ديلون جي جي (2009). "توصيف الكائنات المحبة للملوحة المعزولة من أحواض التبخير الشمسي في باجا كاليفورنيا، المكسيك". الكائنات المحبة للظروف القاسية . 13 (4): 643-656 . doi : 10.1007/s00792-009-0247-1 . PMID 19418017. S2CID 1040194 .  
  19. ↑ متصفح تصنيف NCBI (Halorubrum hochstenium ATCC 700873) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  20. ↑ الصفحة: "Halorubrum hochstenium 1-13-28" في كتاب Integrated Microbial Genomes&Microbioms ، تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 يوليو 2022
  21. ^ متصفح التصنيف NCBI (Halorubrum cibarium) ، استرجاعها 2022/07/14
  22. ↑ نكامغا، فانيسا ديمونفورت؛ هنريسات، برنارد؛ درانكور، ميشيل (2017). "العتائق: سكان أساسيون في الميكروبات المعوية البشرية" . مجلة الميكروبيوم البشري . 3 : 1-8 . doi : 10.1016/j.humic.2016.11.005 .
  23. ↑ الصفحة: "الأنواع: Halorubrum salipaludis" في "LPSN - قائمة أسماء بدائيات النواة ذات التصنيف في التسميات" . Deutsche Sammlung von Microorganismen und Zellkulturen . تم الاسترجاع 2022-07-14 .
  24. ↑ متصفح تصنيف NCBI (Halorubrum salsamenti) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  25. ↑ متصفح تصنيف NCBI (Halorubrum sfaxense) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  26. ↑ متصفح تصنيف NCBI (Halorubrum tropicale) ، تم استرجاعه في 14 يوليو 2022
  27. ↑ سايرز وآخرون . "هالوروبروم" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 10 أكتوبر 2023 . 
  28. ↑ "برنامج النقل طويل الأجل" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  29. ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  30. ↑ "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  31. ↑ "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  32. ↑ "ar53_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  33. ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .

للمزيد من القراءة

المجلات العلمية

الكتب العلمية

  • جيبونز، ن. إي. (1974). "العائلة الخامسة: هالوباكتيرياسيا، عائلة جديدة". في: ر. إي. بوكانان؛ ن. إي. جيبونز (محرران). دليل بيرجي لتصنيف البكتيريا (  الطبعة الثامنة). بالتيمور: شركة ويليامز وويلكنز. ISBN 0-683-01117-0.