الليغيموغلوبين

الليغيموغلوبين أ من فول الصويا (PDB: 1BIN)

الليغيموغلوبين (يُعرف أيضًا باسم ليغيموغلوبين أو ليغوغلوبين ) هو فيتوجلوبين ناقل للأكسجين يوجد في عُقيدات جذور النباتات البقولية المُثبِّتة للنيتروجين . تُنتجه هذه النباتات استجابةً لاستعمار جذورها ببكتيريا مُثبِّتة للنيتروجين تُسمى الريزوبيا ، وذلك كجزء من التفاعل التكافلي بين النبات والبكتيريا: فالجذور غير المُستعمرة بالريزوبيوم لا تُنتج الليغيموغلوبين. يتميز الليغيموغلوبين بتشابه كيميائي وبنيوي وثيق مع الهيموغلوبين ، وهو، مثله، أحمر اللون. كان يُعتقد في الأصل أن مجموعة الهيم الاصطناعية لليغيموغلوبين النباتي تُوفرها البكتيريا التكافلية داخل عُقيدات الجذور التكافلية. [ 1 ] [ 2 ] ومع ذلك، تُظهر الدراسات اللاحقة أن النبات المُضيف يُعبِّر بقوة عن جينات التخليق الحيوي للهيم داخل العُقيدات، وأن تنشيط هذه الجينات يرتبط بتعبير جين الليغيموغلوبين في العُقيدات النامية. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]

في النباتات التي تستعمرها بكتيريا الريزوبيوم ، مثل البرسيم وفول الصويا ، يؤدي وجود الأكسجين في العقد الجذرية إلى تقليل نشاط إنزيم النيتروجيناز الحساس للأكسجين ، وهو الإنزيم المسؤول عن تثبيت النيتروجين الجوي. وقد ثبت أن الليغيموغلوبين يعمل على تنظيم تركيز الأكسجين الحر في سيتوبلازم خلايا النبات المصابة لضمان الأداء السليم للعقد الجذرية. ومع ذلك، فإن تثبيت النيتروجين عملية مكلفة للغاية من الناحية الطاقية، لذا فإن التنفس الهوائي ، الذي يتطلب تركيزًا عاليًا من الأكسجين، ضروري في خلايا العقد الجذرية. [ 7 ] يحافظ الليغيموغلوبين على تركيز منخفض بما يكفي من الأكسجين الحر لتمكين إنزيم النيتروجيناز من العمل، ولكنه يحافظ على تركيز عالٍ بما يكفي من الأكسجين الكلي (الحر والمرتبط بالليغيموغلوبين) للتنفس الهوائي.

يُصنَّف الليغيموغلوبين ضمن فئة الغلوبينات التكافلية ، والتي تشمل أيضاً غلوبينات العقد الجذرية للنباتات الأكتينوريزية مثل الكازوارينا . ويُعتبر غلوبين الكازوارينا التكافلي وسيطاً بين الليغيموغلوبين والفيتوغلوبين-2 غير التكافلي. [ 8 ] [ 9 ]

بناء

الليغيموغلوبينات بروتينات أحادية الكتلة، يبلغ وزنها الجزيئي حوالي 16 كيلو دالتون، وهي متشابهة بنيويًا مع الميوغلوبين . [ 10 ] يتكون بروتين الليغيموغلوبين الواحد من هيم مرتبط بذرة حديد، وسلسلة ببتيدية واحدة (الغلوبين). [ 10 ] وكما هو الحال في الميوغلوبين والهيموغلوبين، يوجد حديد الهيم في حالته الحديدية الثنائية (الحديدوز) داخل الجسم الحي، وهو الجزء المسؤول عن ارتباط الأكسجين. [ 10 ] على الرغم من التشابه في آلية ارتباط الأكسجين بين الليغيموغلوبين والهيموغلوبين الحيواني، وحقيقة أن الليغيموغلوبين والهيموغلوبين الحيواني تطورا من سلف مشترك، إلا أن هناك اختلافًا في تسلسل الأحماض الأمينية بين هذين البروتينين في حوالي 80% من المواقع. [ 10 ]

تثبيت الليغيموغلوبين أ بالأكسجين (PDB: 1BIN)

تتراوح قدرة الليغيموغلوبين على الارتباط بالأكسجين بين 11 و24 ضعفًا مقارنةً بقدرة الميوغلوبين في حوت العنبر على الارتباط به. [ 11 ] ويعود هذا الاختلاف في القدرة إلى تباين معدلات الارتباط بين نوعي البروتين. [ 11 ] أحد تفسيرات هذه الظاهرة هو أن جزيء الماء المرتبط في الميوغلوبين يستقر في جيب يحيط بمجموعة الهيم. يجب إزاحة هذه المجموعة المائية لكي يرتبط الأكسجين. لا يوجد ماء مرتبط في الجيب المماثل في الليغيموغلوبين، مما يُسهّل على جزيء الأكسجين الاقتراب من هيم الليغيموغلوبين. [ 10 ] يتميز الليغيموغلوبين بمعدل تفكك بطيء للأكسجين، مشابهًا للميوغلوبين. [ 12 ] ومثل الميوغلوبين والهيموغلوبين، يتمتع الليغيموغلوبين بألفة عالية لأول أكسيد الكربون. [ 12 ]

في البنية الأولية لبروتين الليغيموغلوبين A في فول الصويا، يوجد حمض الفالين (F7) في موضع حمض السيرين (F7) الموجود في الميوغلوبين. وبدون رابطة هيدروجينية تُثبّت اتجاه السلسلة الجانبية للهيستيدين القريبة، يمكن لحلقة الإيميدازول أن تتخذ وضعية متداخلة بين ذرات نيتروجين البيرول، وأن تتحرك بسهولة لأعلى باتجاه مستوى الهيم. وهذا يزيد بشكل كبير من تفاعلية ذرة الحديد وقدرتها على الارتباط بالأكسجين. في بروتين الليغيموغلوبين A، تدور السلسلة الجانبية للهيستيدين البعيدة أيضًا بعيدًا عن الرابطة المرتبطة بها عن طريق تكوين رابطة هيدروجينية مع التيروسين. [ 13 ]

تتشابه مجموعات الهيم في جميع أنواع الليغيموغلوبين المعروفة، لكن تسلسل الأحماض الأمينية للغلوبين يختلف قليلاً باختلاف سلالة البكتيريا ونوع البقوليات. [ 10 ] حتى داخل نبات بقولي واحد، قد توجد أشكال متغايرة متعددة من الليغيموغلوبين. غالباً ما تختلف هذه الأشكال في ألفة الأكسجين، وتساعد في تلبية احتياجات الخلية في بيئة معينة داخل العقدة الجذرية. [ 14 ]

نقاش حول الدالة الرئيسية

أشارت نتائج دراسة أجريت عام 1995 إلى أن انخفاض تركيز الأكسجين الحر في خلايا العقد الجذرية يعود في الواقع إلى انخفاض نفاذية الأكسجين في هذه الخلايا. [ 15 ] وبناءً على ذلك، فإن الغرض الرئيسي من الليغيموغلوبين هو استخلاص الأكسجين الحر المحدود في الخلية وتوصيله إلى الميتوكوندريا للتنفس الخلوي. ولكن، يشير علماء في مقال نُشر لاحقًا عام 2005 إلى أن الليغيموغلوبين مسؤول عن كلٍ من تنظيم تركيز الأكسجين وتوصيله إلى الميتوكوندريا. [ 16 ] وقد أظهرت دراساتهم التي أجريت على طفرات حذف جين الليغيموغلوبين أن الليغيموغلوبين يُقلل بالفعل تركيز الأكسجين الحر في خلايا العقد الجذرية بشكل ملحوظ، وأن التعبير عن إنزيم النيتروجيناز قد توقف في هذه الطفرات، ويُعزى ذلك على الأرجح إلى تحلل النيتروجيناز عند ارتفاع تركيز الأكسجين الحر. كما أظهرت دراستهم ارتفاع نسبة ATP / ADP في خلايا العقد الجذرية من النوع البري التي تحتوي على ليغيموغلوبين نشط، مما يُشير إلى أن الليغيموغلوبين يُساعد أيضًا في توصيل الأكسجين للتنفس الخلوي.

تحتوي النباتات على نوعين من الهيموجلوبين: هيموجلوبين تكافلي وهيموجلوبين غير تكافلي. يُعتقد أن الهيموجلوبين التكافلي مهم لتثبيت النيتروجين التكافلي. في البقوليات، يحدث تثبيت النيتروجين التكافلي في أعضاء متخصصة تُسمى العُقيدات، والتي تحتوي على بكتيرويدات، أو بكتيريا جذرية مُثبتة للنيتروجين. يصاحب نمو العُقيدات تحفيز جينات نباتية خاصة بها، بما في ذلك تلك التي تُشفّر الهيموجلوبينات الليغيموجلوبينية التكافلية. تتراكم الهيموجلوبينات الليغيموجلوبينات بتراكيز تصل إلى المليمول في سيتوبلازم خلايا النبات المُصابة قبل تثبيت النيتروجين، وذلك لتنظيم تركيز الأكسجين الحر في نطاق النانومول، مما يمنع تعطيل إنزيم النيتروجيناز الحساس للأكسجين، مع الحفاظ على تدفق أكسجين كافٍ للتنفس الخلوي. تُعد الهيموجلوبينات الليغيموجلوبينات ضرورية لتثبيت النيتروجين التكافلي، ولكنها ليست ضرورية لنمو النبات وتطوره في وجود مصدر خارجي للنيتروجين المُثبت. تُساهم الهيموجلوبينات الليغيموجلوبينات بشكل أساسي في الحفاظ على تركيزات منخفضة من الأكسجين الحر، مع الحفاظ على مستوى عالٍ من الطاقة في الخلايا. هذه هي الشروط اللازمة لتثبيت النيتروجين التكافلي الفعال. [ 16 ]

أنواع أخرى من الهيموجلوبين النباتي

تم منذ ذلك الحين تحديد الغلوبينات كبروتين مشترك بين العديد من أنواع النباتات، وليس مقتصراً على الأنواع التكافلية. وفي ضوء هذا الاكتشاف، اقتُرح استخدام مصطلح "فيتوجلوبينات" للإشارة إلى غلوبينات النباتات بشكل عام. [ 8 ]

يمكن تقسيم الفيتوغلوبينات إلى مجموعتين. تحتوي المجموعة 3/3 على الفئتين الأولى والثانية من فيتوغلوبينات كاسيات البذور، وهي المجموعة المشتركة بين جميع حقيقيات النوى ( نقل جيني أفقي لفلافوهيموغلوبين بكتيري). يُعد الليغيموغلوبين بالمعنى الدقيق للكلمة فيتوغلوبين من الفئة الثانية. أما المجموعة 2/2 "TrHb2" فتحتوي على الفئة الثالثة في تسمية كاسيات البذور، ويبدو أنها اكتُسبت من كلوروفليكسوتا (كلوروفليكسي سابقًا) بواسطة سلف النباتات البرية. [ 8 ]

للاستخدام التجاري

طلبت شركة إمبوسيبل فودز من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية الموافقة على استخدام بروتين ليغيموغلوبين الصويا المُعاد تركيبه، المُنتَج بواسطة فطر بيكيا باستوريس، في بدائل اللحوم كبديل للهيموغلوبين المُستخلص من اللحوم . [ 17 ] [ 18 ] صدرت الموافقة من إدارة الغذاء والدواء في يوليو 2019، [ 19 ] ثم طُعِن فيها، [ أ ] وأُيِّدت لاحقًا في 3 مايو 2021 من قِبَل محكمة استئناف فيدرالية في سان فرانسيسكو. [ 20 ] [ 21 ] ويُستخدم حاليًا في منتجاتها لمحاكاة لون اللحوم وطعمها وملمسها. [ 22 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. نادلر، كينيث د.؛ أفيسار، ييل ج. (1 سبتمبر 1977). "تخليق الهيم في عُقيدات جذور فول الصويا: 1. حول دور سينثاز حمض دلتا-أمينوليفولينيك البكتيري وديهايدريز حمض دلتا-أمينوليفولينيك في تخليق هيم الليغيموغلوبين" . علم وظائف النبات . 60 (3): 433-436 . doi : 10.1104/pp.60.3.433 . PMC 542631. PMID 16660108 .  
  2. أوبراين، إم آر؛ كيرشبوم، بي إم؛ ماير، آر جيه (ديسمبر 1987). "تخليق الهيم البكتيري ضروري للتعبير عن بروتين الليغيموغلوبين الكامل، وليس البروتين غير الكامل، في عُقيدات جذور فول الصويا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 84 (23): 8390-8393 . Bibcode : 1987PNAS...84.8390O . doi : 10.1073/pnas.84.23.8390 . PMC 299548. PMID 3479799 .  
  3. سانغوان، إندو؛ أوبراين، مارك ر. (8 مارس 1991). "دليل على وجود مسار حيوي لتخليق الهيم بين الكائنات الحية في عُقيدات جذور فول الصويا التكافلية". مجلة ساينس . 251 (4998): 1220-1222 . Bibcode : 1991Sci...251.1220S . doi : 10.1126/science.251.4998.1220 . PMID 17799282. S2CID 11471787 .  
  4. فروستاتشي، جانا م.؛ سانغوان، إندو؛ أوبراين، مارك ر. (مارس 1995). "جين gsa1 هو جين عالمي لتخليق رباعي البيرول في فول الصويا، ويتم تنظيمه بواسطة عنصر GAGA" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 270 (13): 7387-7393 . doi : 10.1074/jbc.270.13.7387 . PMID 7706283 . 
  5. سانتانا، ماريا أ.؛ بيهاكاسكي-ماونسباخ، كارينا؛ ساندال، نيلز؛ ماركر، كيلد أ.؛ سميث، أليسون ج. (1 أبريل 1998). " دليل على أن النبات المضيف يُركّب جزء الهيم من الليغيموغلوبين في عُقيدات الجذر1" . علم وظائف النبات . 116 (4): 1259-1269 . doi : 10.1104/pp.116.4.1259 . PMC 35032. PMID 9536042 .  
  6. سانغوان، إندو؛ أوبراين، مارك ر. (1 فبراير 1999). "تعبير جين فول الصويا الذي يرمز لإنزيم اختزال غلوتاميل-tRNA المسؤول عن تخليق رباعي البيرول في العقد الجذرية التكافلية1" . علم وظائف النبات . 119 (2): 593-598 . doi : 10.1104/pp.119.2.593 . PMC 32136. PMID 9952455 .  
  7. بيرغ، ج.؛ تيموتشكو، ج.؛ غاتو الابن، ج.؛ ستراير، ل. (2015). الكيمياء الحيوية ( الطبعة الثامنة). شركة دبليو إتش آند فريمان. 
  8. بيكانا ، مانويل؛ يرويلا، إنماكولادا؛ ساراث، غوتام؛ كاتالان، بيلار؛ هارغروف، مارك س. (سبتمبر 2020). "هيموغلوبينات النباتات: رحلة من الطحالب الخضراء وحيدة الخلية إلى النباتات الوعائية" . مجلة نيو فايتولوجيست . 227 ( 6 ): 1618-1635 . Bibcode : 2020NewPh.227.1618B . doi : 10.1111 / nph.16444 . hdl : 10261/219101 . PMID 31960995 . 
  9. هيل، روبرت؛ هارجروف، مارك؛ أريدوندو-بيتر، راؤول (24 فبراير 2016). "فيتوجلوبين: تسمية جديدة لغلوبينات النبات ، معتمدة من قبل مجتمع الغلوبين في المؤتمر الثامن عشر لعام 2014 حول بروتينات ربط واستشعار الأكسجين" . F1000Research . 5 : 212. doi : 10.12688/f1000research.8133.1 . PMC 4792203. PMID 26998237 .  
  10. 1 2 3 4 5 6 سينغ إس، فارما أ. (2017) بنية ووظيفة وتقدير الليغيموغلوبين. في: هانسن أ، تشودري د، أغراوال ب، فارما أ. (محررون) بيولوجيا وتكنولوجيا حيوية الريزوبيوم. بيولوجيا التربة، المجلد 50. سبرينغر، تشام
  11. هاروتونيان ، إي إتش؛ سافونوفا، تي إن؛ كورانوفا، آي بي؛ بوبوف، إيه إن؛ تيبلياكوف، إيه في؛ أوبمولوفا، جي في؛ روساكوف، إيه إيه؛ فاينشتين، بي كيه؛ دودسون، جي جي؛ ويلسون، جي سي؛ بيروتز، إم إف (أغسطس 1995). "بنية ديوكسي- وأوكسي-ليغيموغلوبين من الترمس". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 251 (1): 104-115 . doi : 10.1006/jmbi.1995.0419 .
  12. 1 2 ويتنبرغ، جوناثان ب.؛ أبلبي، سيريل أ.؛ ويتنبرغ، بياتريس أ. (يناير 1972). "حركية تفاعلات الليغيموغلوبين مع الأكسجين وأول أكسيد الكربون" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 247 (2): 527-531 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)45734-7 . PMID 4333266 . 
  13. سماغ، بينوا ج.؛ هوي، جولي أ.؛ بيرسيفيلد، رايان؛ كوندو، سومان؛ هارغروف، مارك س.؛ ساراث، غوتام؛ هيلبرت، جان لويس؛ واتس، ريتشارد أ.؛ دينيس، إليزابيث س.؛ بيكوك، دبليو. جيمس؛ ديوايلد، سيلفيا؛ موينز، لوك؛ بلوان، جورج س.؛ أولسون، جون س.؛ أبلبي، سيريل أ. (ديسمبر 2009). "مراجعة: علاقات الارتباط بين ألفة الأكسجين وتصنيفات تسلسل الهيموغلوبين النباتي". البوليمرات الحيوية . 91 (12): 1083-1096 . doi : 10.1002/bip.21256 . ISSN 0006-3525 . PMID 19441024. S2CID 1891302 .   
  14. كاواشيما، كازويا؛ سوغانوما، نوريو؛ تاماكي، ماسانوري؛ كوتشي، هيروشي (1 فبراير 2001). "نوعان من جينات الليغيموغلوبين في البازلاء يُظهران تقاربًا مختلفًا لربط الأكسجين وأنماطًا متباينة للتعبير المكاني في العُقيدات" . علم وظائف النبات . 125 (2): 641-651 . doi : 10.1104/pp.125.2.64 . PMC 64866. PMID 11161022 .  
  15. لودفيج، ر. أ.؛ دي فريس، ج. إ. (1986). "الفيزيولوجيا الكيميائية الحيوية لتثبيت النيتروجين بواسطة بكتيريا الريزوبيوم" . في: بروتون، و. ج.؛ بولر، س. (محرران). تثبيت النيتروجين، المجلد 4: البيولوجيا الجزيئية . أكسفورد، المملكة المتحدة: مطبعة جامعة كلارندون. الصفحات 50-69 . ISBN  978-0-19-854575-0.
  16. 1 2 أوت، توماس؛ فان دونجن، جوست ت.؛ غونتر، كاترين؛ كروسيل، لين؛ ديبروسيس، غيليم؛ فيجيولاس، هيلين؛ بوك، فيفيان؛ تشيكوفسكي، توماش؛ غايجنبرغر، بيتر؛ أودفاردي، مايكل ك. (29-03-2005). "الليغيموغلوبينات التكافلية ضرورية لتثبيت النيتروجين في عُقيدات جذور البقوليات، ولكنها ليست ضرورية لنمو النبات وتطوره بشكل عام" . علم الأحياء الحالي . 15 (6): 531-535 . Bibcode : 2005CBio...15..531O . doi : 10.1016/j.cub.2005.01.042 . ISSN 0960-9822 . PMID 15797021 .  
  17. "إشعار GRAS رقم 540" . www.accessdata.fda.gov . مؤرشف من الأصل بتاريخ 30-06-2017 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 21-01-2018 .
  18. "إشعار GRAS رقم 737" . www.accessdata.fda.gov . مؤرشف من الأصل بتاريخ 4 مايو 2018. تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 أغسطس 2018 .
  19. «تخطط شركة إمبوسيبل فودز، المنافسة لشركة بيوند ميت، لإطلاق منتجاتها في متاجر البقالة في سبتمبر بعد حصولها على موافقة إدارة الغذاء والدواء الأمريكية» . سي إن بي سي . 31 يوليو 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 31 يوليو 2019 .
  20. جوستين كالما (3 مايو 2021). "شركة إمبوسيبل فودز تفوز في معركة قانونية بشأن المكون الذي يجعل لحومها "تنزف"" . theverge.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2021-05-07.
  21. سالي هو (6 مايو 2021). "شركة إمبوسيبل فودز تفوز في معركة قانونية بشأن مكون الهيم الذي يُستخدم في برجر نباتي 'ينزف'" . greenqueen.com.hk . مؤرشف من الأصل بتاريخ 6 مايو 2021.
  22. باندويم، ل. (20 ديسمبر 2019). "ماذا يعني قرار إدارة الغذاء والدواء الأمريكية بشأن ليغيموغلوبين الصويا بالنسبة لبرغر إمبوسيبل؟" . فوربس . تم الاطلاع عليه في 4 مارس 2020 .

ملحوظات

  1. مقدم من قبل منظمة "مركز سلامة الغذاء" غير الربحية المعنية بالدفاع عن حقوق المستهلك

للمزيد من القراءة