فيروسات ليبوثريكس
ليبوثريكسفيريداي هي عائلة من الفيروسات تنتمي إلى رتبة ليجامينفيراليس . وتُعدّ العتائق المحبة للحرارة من شعبة ثيرموبروتيوتا عوائل طبيعية لها. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
التصنيف
تم تصنيف الأجناس والأنواع التالية ضمن هذه العائلة: [ 2 ]
تتألف هذه العائلة من ثلاثة أجناس: ألفاليبوثريكسفيروس ، وبيتاليبوتريكسفيروس ، ودلتاليبوثريكسفيروس . كان الكابتوفيروس يُصنَّف سابقًا ضمن هذه العائلة تحت جنس غاماليبوتريكسفيروس، ولكنه الآن الجنس الوحيد في عائلة أونغولافيريداي . [ 6 ] [ 7 ] تُصنَّف هذه الفيروسات إلى أجناس بناءً على خصائصها الجينومية وتنوع زوائدها الطرفية، التي تُشارك في التعرّف على الخلية المضيفة. أُعيد تسمية الجنس المُقترح أصلاً ألفاليبوثريكسفيروس إلى ألفاتريسترومافيروس، ونُقل إلى عائلة تريسترومافيريداي . [ 8 ] [ 9 ] في عام 2020، أُعيد إنشاء جنس ألفاليبوثريكسفيروس لتصنيف فيروس سلفولوبوس الخيطي 1 [ 10 ] وفيروس سلفولوباليس بيبو الخيطي 2. [ 11 ]
في جنس فيروسات غاماليبوتريكس، توجد تراكيب تشبه المخالب في طرفي الفيروس. [ 12 ]
تتشابه فيروسات عائلة Lipothrixviridae في خصائصها البنيوية والجينومية مع فيروسات عائلة Rudiviridae ، التي تضم فيروسات عصوية الشكل غير مغلفة. تمتلك فيروسات العائلتين جينومات خطية من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ثنائي السلسلة (dsDNA)، وتتشارك في ما يصل إلى تسعة جينات. إضافةً إلى ذلك، تتكون الجسيمات الخيطية لفيروسات Rudiviridae وLipothrixviridae من بروتينات غلاف رئيسية متماثلة بنيويًا. وبسبب هذه الخصائص المشتركة، تُصنف فيروسات العائلتين ضمن رتبة Ligamenvirales . [ 13 ]
تتشابه فيروسات رتبة Ligamenvirales بنيويًا مع فيروسات عائلة Tristromaviridae ، التي تشبه فيروسات lipothrixviruses في كونها مغلفة، وتُشفّر بروتينين رئيسيين متماثلين للغلاف البروتيني، لهما نفس بنية بروتينات فيروسات ligamenviruses. [ 14 ] ونظرًا لهذه التشابهات البنيوية، اقتُرح توحيد رتبة Ligamenvirales وعائلة Tristromaviridae ضمن فئة تُسمى "Tokiviricetes" (كلمة toki تعني "خيط" باللغة الجورجية، و viricetes لاحقة رسمية لفئة الفيروسات). [ 14 ]
علم الفيروسات
الفيروسات مغلفة وخيطية الشكل. يختلف طول الغلاف البروتيني اختلافًا كبيرًا - من 410 إلى 1950 نانومترًا - وقطره من 24 إلى 38 نانومترًا. يتكون الغلاف من طبقتين ويحتوي على دهون رباعية الإيثر ثنائية الفيتانيل. [ 1 ] [ 12 ] الغلاف البروتيني مستطيل الشكل وله نواة حلزونية. توجد في نهايتي الفيروس نتوءات تشبه المخالب. [ 12 ]
يوجد بروتينان رئيسيان للغلاف الفيروسي (MCP1 وMCP2). يشكل MCP1 وMCP2 ثنائيًا غير متجانس، يلتف حول جينوم الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ثنائي السلسلة الخطي، محولًا إياه إلى الشكل A. يؤدي التفاعل بين الجينوم وبروتينات MCP إلى تكثيف الجينوم في بنية حلزونية فائقة للفيروس. [ 10 ] [ 15 ] [ 16 ] تكون الجينومات خطية، ويصل طولها إلى 40 كيلوبايت. [ 1 ]
| جنس | بناء | التناظر | كابسيد | الترتيب الجينومي | التجزئة الجينومية |
|---|---|---|---|---|---|
| فيروس ألفاليبوثريكس | خيطي | حلزوني | مغلف | خطي | أحادي الجزء |
| فيروس بيتاليبوتريكس | خيطي | حلزوني | مغلف | خطي | أحادي الجزء |
| فيروس دلتاليبوثريكس | خيطي | حلزوني | مغلف | خطي | أحادي الجزء |
دورة الحياة
يتكاثر الفيروس في السيتوبلازم. ويدخل إلى الخلية المضيفة عن طريق الامتزاز عليها. وقد وُجد أن فيروس Acidianus filamentous 1 يرتبط بالزوائد الخلوية الشبيهة بالأهداب. وتُعد عملية النسخ المعتمدة على قالب الحمض النووي هي طريقة النسخ. وتُعتبر العتائق المضيف الطبيعي. وتنتقل العدوى عن طريق الانتشار السلبي. [ 1 ]
تمت دراسة تجميع الفيروسات وخروجها في حالة فيروس Sulfolobus islandicus الخيطي (SIFV). تتجمع الفيروسات داخل الخلية. يؤدي ارتباط ثنائيات بروتين الغلاف الرئيسي بجينوم الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ثنائي السلسلة الخطي إلى تجميع النيوكليوكابسيدات، والتي تُغلّف لاحقًا داخل الخلية عبر آلية غير معروفة. [ 17 ] من المرجح أن تكون جميع فيروسات الليبوثريكس فيروسات محللة. في حالة فيروسات بيتاليبوثريكس ودلتاليبوثريكس، تُطلق الفيروسات من خلال بوابات هرمية، تُعرف باسم الأهرامات المرتبطة بالفيروس (VAPs). تتميز الأهرامات المرتبطة بالفيروس لفيروس SIFV بقاعدة سداسية (أي أنها تتكون من ستة أوجه مثلثة). [ 17 ]
| جنس | تفاصيل المضيف | التوجه النسيجي | تفاصيل الدخول | تفاصيل الإصدار | موقع النسخ | موقع التجميع | الانتقال |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| فيروس ألفاليبوثريكس | العتائق: سكرولوبوس | لا أحد | حقن | مجهول | السيتوبلازم | السيتوبلازم | الانتشار السلبي |
| فيروس بيتاليبوتريكس | العتائق: أسيديانوس ، ساشارولوبوس | لا أحد | حقن | ليتيك | السيتوبلازم | السيتوبلازم | الانتشار السلبي |
| فيروس دلتاليبوثريكس | العتائق: أسيديانوس | لا أحد | حقن | ليتيك | السيتوبلازم | السيتوبلازم | الانتشار السلبي |
مراجع
- 1 2 3 4 "Lipothrixviridae" . ExPASy . تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 يونيو 2015 .
- 1 2 "تصنيف الفيروسات: إصدار 2020" . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV). مارس 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 مايو 2021 .
- ↑ أرنولد، إتش بي، زيليغ، دبليو، زيس، يو، هولز، آي، كروسبي، إم، أترباك، تي، وايدمان، جيه إف، كريستجانسون، جيه كيه، كلينك، إتش بي، نيلسون، كيه إي، وفريزر، سي إم (2000). فيروس ليبوثريكس جديد، SIFV، يصيب الكائن الحي المحب للحرارة الشديدة Sulfolobus. علم الفيروسات، 267، 252-266.
- ↑ جانيكوفيتش، د.، ووندرل، س.، هولز، إ.، زيليغ، و.، جيرل، أ.، نيومان، هـ. (1983) TTV1، TTV2، وTTV3، عائلة من الفيروسات التي تصيب البكتيريا القديمة Thermoproteus tenax، وهي بكتيريا لاهوائية شديدة الحرارة ومختزلة للكبريت. علم الوراثة الجزيئية العامة 19239-19245
- ↑ بيتستيتر، م.، بينغ، إكس.، غاريت، آر إيه، وبرانجيشفيلي، د. (2003). AFV-1، فيروس جديد يصيب العتائق المحبة للحرارة الشديدة من جنس أسيديانوس. علم الفيروسات، 315، 68-79.
- ↑ "الإصدار الحالي لتصنيف ICTV | ICTV" .
- ↑ هارينغ م، فيسترجارد ج، بروجر ك، راشيل ر، غاريت ر.أ، برانغيشفيلي د (2005) بنية وتنظيم جينوم فيروس AFV2، وهو فيروس ليبوثريك أثري جديد ذو بنية طرفية وأساسية غير عادية. مجلة علم البكتيريا 187(11): 3855-3858 doi : 10.1128/JB.187.11.3855-3858.2005
- ↑ برانجيشفيلي، د؛ رينسن، إ؛ موتشيزوكي، ت؛ كروبوفيتش، م؛ تقرير اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات، اتحاد (فبراير 2019). "ملف تصنيف فيروسات اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات: عائلة تريسترومافيريداي" . مجلة علم الفيروسات العام . 100 (2): 135-136 . doi : 10.1099/jgv.0.001190 . PMC 12662031. PMID 30540248 .
- ↑ "تقرير اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات Tristromaviridae" .
- 1 2 ليو، واي؛ أوسينسكي، تي؛ وانغ، إف؛ كروبوفيتش، إم؛ شوتين، إس؛ كاسون، بي؛ برانغيشفيلي، دي؛ إيغلمان، إي إتش (2018). "الحفاظ على البنية في فيروس خيطي مغلف بغشاء يصيب كائنًا محبًا للحرارة الشديدة ومحبًا للأحماض" . نيتشر كوميونيكيشنز . 9 (1): 3360. Bibcode : 2018NatCo...9.3360L . doi : 10.1038/s41467-018-05684-6 . PMC 6105669. PMID 30135568 .
- ↑ ليو، واي؛ براندت، دي؛ إيشينو، إس؛ إيشينو، واي؛ كونين، إي في؛ كالينوفسكي، جيه؛ كروبوفيتش، إم؛ برانغيشفيلي، دي (2019). "اكتشاف فيروسات أثرية جديدة من خلال التحليل الميتاجينومي للمجتمعات الفيروسية في مزارع الإثراء" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 21 (6): 2002-2014 . Bibcode : 2019EnvMi..21.2002L . doi : 10.1111/1462-2920.14479 . PMC 11128462. PMID 30451355. S2CID 53950297 .
- 1 2 3 "العائلة: Lipothrixviridae " . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاطلاع عليه في 1 أكتوبر 2025 .
- ↑ برانجيشفيلي د، كروبوفيتش م (2012). "تصنيف جديد مقترح لفيروسات الحمض النووي المزدوجة، رتبة "Ligamenvirales"" . Arch Virol . 157 (4): 791– 795. doi : 10.1007/s00705-012-1229-7 . PMID 22270758 .
- 1 2 وانغ، فنغبين؛ باكيرو ، ديانا ب . سو، تشانغلي؛ أوسينسكي، توماسز؛ برانجشفيلي، ديفيد؛ إيجلمان ، إدوارد هـ ؛ كروبوفيتش، مارت (2020). "بنية الفيروس الخيطي تكشف عن الروابط العائلية داخل الغلاف الفيروسي العتائي" . تطور الفيروس . 6 (1) veaa023. دوى : 10.1093/ve/veaa023 . بمك 7189273 . بميد 32368353 .
- ↑ كاسون، ب؛ ديمايو، ف؛ يو، إكس؛ لوكاس-ستات، س؛ كروبوفيتش، م؛ شوتين، س؛ برانغيشفيلي، د؛ إيغلمان، إي إتش (2017). "نموذج لغلاف غشائي جديد في فيروس خيطي محب للحرارة المفرطة" . eLife . 6 e26268 . doi : 10.7554/eLife.26268 . PMC 5517147. PMID 28639939 .
- ↑ وانغ، ف؛ باكيرو، د.ب؛ بلتران، ل.س؛ سو، ز؛ أوسينسكي، ت؛ تشنغ، و؛ برانغيشفيلي، د؛ كروبوفيتش، م؛ إيغلمان، إ.هـ (2020). "بنية الفيروسات الخيطية التي تصيب العتائق المحبة للحرارة الشديدة تفسر استقرار الحمض النووي في البيئات القاسية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 117 (33): 19643-19652 . Bibcode : 2020PNAS..11719643W . doi : 10.1073/pnas.2011125117 . PMC 7443925. PMID 32759221 .
- باكيرو ، د.ب .؛ غازي، أ.د.؛ ساكس، م.؛ ليو، ج.؛ شميت، س.؛ مويا-نيلجيس، م.؛ شوتين، س.؛ برانغيشفيلي، د.؛ كروبوفيتش، م. (2021). "فيروس أثري خيطي مُغلّف داخل الخلية ويُطلق عبر بوابات هرمية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 118 (32) e2105540118. Bibcode : 2021PNAS..11805540B . doi : 10.1073/pnas.2105540118 . PMC 8364153. PMID 34341107 .
روابط خارجية
الوسائط المتعلقة بفيروسات ليبوثريكس في ويكيميديا كومنز- المنطقة الفيروسية : ليبوثريكسفيريداي
- فيروسات ليبوثريكس
- عائلات الفيروسات
