مخطط RA
يُعد مخطط متوسط النسبة (RA) نسخةً قائمة على الأعداد الصحيحة من مخطط المتوسط المتحرك (MA) لتصوير بيانات العد ذات الشرطين . ويستمد شكله المميز الشبيه بالسهم من طريقة تضمينه لنقاط (0، n ) أو ( n ، 0) الفريدة لكل شرط في المخطط عبر عامل إبسيلون .
تعريف
مخطط RA ، مثله مثل مخطط MA ، هو نسخة مُعاد تحجيمها وتدويرها (بزاوية 45 درجة) من مخطط التشتت ثنائي الأبعاد البسيط الذي يُظهر العلاقة بين a و b، حيث a و b متجهان متساويان في الطول من القياسات الموجبة. يُتيح هذا التحجيم والتدوير رؤيةً أفضل وإبرازًا أكبر للنقاط الشاذة المهمة التي تختلف بين حالتي القياس. [ 1 ] وهو في الأساس رسم بياني لنسبة اللوغاريتم [R] مقابل متوسط لوغاريتم [A] لكل زوج من عناصر a و b . ولكن على عكس مخطط MA، ولأن مخطط RA يأخذ أعدادًا صحيحة غير سالبة كمدخلات، فإنه يتطلب حلولًا بديلة لتضمين النقاط غير المرئية رياضيًا (مثل النقاط التي يكون فيها أحد عنصري الزوج أو كلاهما صفرًا).
إذا قمنا بتعديل المتجه الأصلي a (أو b ) عبر:
أين
ويمكن تعريف R و A على النحو التالي :
يُرسم R ، مثل M ، على المحور الصادي ، ويمثل نسبة لوغاريتمية ( نسبة التغير ) بين a و b . أما A فيُرسم على المحور السيني ، ويمثل متوسط الوفرة لزوج إحداثيات. يوفر مخطط RA نظرة عامة سريعة على توزيع وحجم مجموعة بيانات تتكون من عدد غير صفري.
أصل الكلمة
يُنطق البادئة المختصرة "RA" أحيانًا ككلمة "ray" ذات المقطع الواحد نظرًا لتشابه الرسم البياني الكبير مع الشعاع الهندسي . وينشأ هذا الشكل المميز الشبيه بالسهم من سمتين رئيسيتين: على اليمين عند نقطة الأصل ، ذيل تقاربي طويل، وعلى اليسار (مشكلاً رأس السهم) رقعتان (غالبًا ما تكونان كثيفتين) من النقاط الفريدة الشرطية.
حلول بديلة لتحسين رؤية النقاط وإدراجها
نقاط فريدة للحالة
نظرًا لأن جزءًا كبيرًا من أزواج a و b يحتوي على أصفار في أحد الشرطين أو كليهما، فمن المستحيل تمثيلها بيانيًا على مقياس لوغاريتمي. تقوم دوال رسم MA الأخرى بتضمين هذه النقاط الفريدة في الرسم البياني بشكل مصطنع عن طريق نشرها عموديًا على شكل "لطخة" على اليسار أو أفقيًا على شكل " سجادة " في أعلى وأسفل الرسم البياني. في المقابل، في رسم RA، يتم تضمين النقاط الفريدة عن طريق إضافة عامل إبسيلون صغير (بين 0.1 و 0.5) مما يضعها في موقع أكثر ملاءمة إحصائيًا في الرسم البياني.
التراكب في الحبكة
من المشاكل الأخرى التي تواجه رسم هذا النوع من بيانات العد (أو أي نوع آخر) مشكلة التداخل في الرسم ، والتي تُحل في مخطط RA عن طريق إبعاد النقاط عن بعضها البعض، ولكن ليس لدرجة دمجها مع إحداثيات أخرى. ينتج عن هذه الخاصية مظهرٌ يشبه الفسيفساء للمخطط، يتلاشى مع ازدياد قيمة A.
الطرود
تحتوي حزمة كارولين CRAN R على التطبيق الوحيد المعروف لمخطط RA. ومع ذلك، توفر حزمة "مانتا" R الخاصة بعلم النسخ الميتا غلافًا لهذا التطبيق لمخطط RA، وتُستخدم لتقييم التغير النسبي في نسخ الجينات (النقاط) مع عرض التوزيعات التصنيفية لكل جين في الوقت نفسه كنقاط فردية في الرسم البياني الدائري. [ 2 ]
أمثلة
مكتبة (كارولين) a <- rnbinom(n=10000, mu=5, size=2) ب <- رنبينوم (ن = 10000، مو = 5، الحجم = 2) raPlot(a, b)
مراجع
- ↑ دودويت، إس ، يانغ، واي إتش ، كالو، إم جيه، سبيد، تي بي . (2002). الأساليب الإحصائية لتحديد الجينات ذات التعبير التفاضلي في تجارب مصفوفة الحمض النووي التكميلي المتكررة. مجلة الإحصاء الصينية 12:1، 111-139
- ↑ شروث، د. ومارشيتي، أ. (2011). تحليل النسخ الموحد للتجمعات الميكروبية. حزمة R الإصدار 0.9.5.
انظر أيضاً
- التعبير الجيني
- المصفوفات الدقيقة
- الرسوم البيانية (المخططات)
