SATB2
البروتين الخاص المرتبط بتسلسل غني بالأدينين والثايمين 2 (SATB2)، المعروف أيضًا باسم البروتين الرابط للحمض النووي SATB2، هو بروتين يُشفَّر في الإنسان بواسطة جين SATB2 . [ 5 ] يرتبط SATB2 تحديدًا بمناطق ارتباط المصفوفة النووية ، ويشارك في تنظيم النسخ وإعادة تشكيل الكروماتين . [ 6 ] يُظهر SATB2 نمط تعبير محدودًا.ويتم التعبير عنه في بعض نوى الخلايايُعبر عن بروتين SATB2 بشكل رئيسي في الخلايا الظهارية للقولون والمستقيم، يليه نوى الخلايا العصبية في الدماغ. [ 7 ]
وظيفة
بمعدل انتشار عالمي يبلغ حالة واحدة لكل 800 ولادة حية، تُعدّ الشقوق الفموية من أكثر العيوب الخلقية شيوعًا. [ 8 ] على الرغم من أن أكثر من 300 متلازمة تشوه خلقي قد تتضمن شقًا فمويًا، فإن الأشكال غير المتلازمية تُمثل حوالي 70% من حالات الشفة المشقوقة مع أو بدون شق الحنك (CL/P)، ونحو 50% من حالات شق الحنك فقط (CP). تُعتبر الشقوق الفموية غير المتلازمية "معقدة" أو "متعددة العوامل" حيث تُساهم كل من الجينات والعوامل البيئية في حدوثها. تشير الأبحاث الحالية إلى أن العديد من الجينات من المرجح أن تتحكم في خطر الإصابة، بالإضافة إلى عوامل بيئية مثل تدخين الأم . [ 9 ]
تشير دراسات إعادة التسلسل لتحديد طفرات محددة إلى أن عدة جينات مختلفة قد تتحكم في خطر الإصابة بشقوق الفم، وقد تم العثور على العديد من المتغيرات أو الطفرات المتميزة في الجينات المسببة على ما يبدو، مما يعكس درجة عالية من عدم تجانس الأليلات. على الرغم من أن معظم هذه الطفرات نادرة للغاية وغالبًا ما تُظهر نفاذية غير كاملة (أي أن أحد الوالدين غير المصابين أو أقارب آخرين قد يحملون الطفرة أيضًا)، إلا أنها مجتمعة قد تُفسر ما يصل إلى 5% من حالات شقوق الفم غير المتلازمية. [ 9 ]
وُجد أن الطفرات في جين SATB2 تُسبب شقوق الحنك المعزولة. [ 10 ] ومن المرجح أن يؤثر SATB2 أيضًا على نمو الدماغ. ويتوافق هذا مع الدراسات التي أُجريت على الفئران والتي تُظهر أن SATB2 ضروري لتكوين روابط عصبية قشرية سليمة عبر الجسم الثفني ، على الرغم من أن الجسم الثفني يبدو طبيعيًا في الفئران المُعدلة وراثيًا غير المتجانسة . [ 11 ]
بناء
SATB2 هو بروتين بشري يحتوي على نطاق هوميودومين، ويتكون من 733 حمضًا أمينيًا، ويبلغ وزنه الجزيئي 82.5 كيلو دالتون، ويُشفّر بواسطة جين SATB2 الموجود على الكروموسوم 2q33. يحتوي البروتين على منطقتين من نطاقات الهوميودومين المتغيرة، والمعروفة باسم نطاقات CUT (الأحماض الأمينية 352-437 و482-560)، بالإضافة إلى نطاق هوميودومين كلاسيكي (الأحماض الأمينية 614-677). يتميز البروتين بدرجة عالية جدًا من الحفاظ على التسلسل، حيث لا توجد سوى ثلاثة استبدالات متوقعة للأحماض الأمينية في البروتين المكون من 733 حمضًا أمينيًا، وهي I481V وA590T وI730T، والتي تمثل الاختلافات بين البروتين البشري والفأري.
الأهمية السريرية
وقد تم ربط جين SATB2 بأنه سبب في حدوث شق أو ارتفاع في سقف الحلق لدى الأفراد المصابين بمتلازمة الحذف الصغير 2q32q33. [ 11 ]
تم العثور على أن جين SATB2 معطل في حالتين غير مرتبطتين مع عمليات نقل كروموسومية متوازنة على ما يبدو مرتبطة بشق الحنك ومتلازمة بيير روبن . [ 12 ]
يُدعم دور جين SATB2 في نمو الأسنان والفكين من خلال تحديد طفرة جديدة في هذا الجين لدى ذكر يعاني من إعاقة ذهنية شديدة وتشوهات في الفك والأسنان، بالإضافة إلى طفرة انتقالية تُعطّل عمل جين SATB2 لدى فرد مصاب بمتلازمة روبن. علاوة على ذلك، أظهرت نماذج الفئران أن نقص أحد أليلي جين SATB2 يؤدي إلى تشوهات قحفية وجهية تُحاكي تلك التي يُسببها حذف المنطقة 2q32q33 لدى البشر؛ كما أن فقدان وظيفة جين SATB2 بالكامل يُفاقم هذه التشوهات. [ 11 ]
يُعد التعبير عن جين SATB2 مؤشراً نوعياً للغاية لسرطان الجهاز الهضمي السفلي، وقد تم اعتباره مؤشراً حيوياً لسرطان القولون والمستقيم . [ 13 ] [ 14 ]
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000119042 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000038331 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ كيكونو ر، ناغاسي ت، إيشيكاوا ك، هيروساوا م، مياجيما ن، تاناكا أ، وآخرون (يونيو 1999). "التنبؤ بالتسلسلات المشفرة لجينات بشرية غير معروفة. الرابع عشر. التسلسلات الكاملة لـ 100 نسخة cDNA جديدة من الدماغ تُشفّر بروتينات كبيرة في المختبر" . أبحاث الحمض النووي . 6 (3): 197-205 . doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851 .
- ↑ "Entrez Gene: SATB homeobox 2" .
- ↑ أولين إم، فاجربيرج إل، هالستروم بي إم، ليندسكوج سي، أوكسفولد بي، ماردينوغلو إيه، وآخرون . (يناير 2015). " علم البروتينات: خريطة نسيجية للبروتينات البشرية". مجلة ساينس . 347 (6220) 1260419. doi : 10.1126/science.1260419 . PMID 25613900. S2CID 802377 .
- ↑ جوجيسور أ، شي م، جيسينغ هـ ك، لي ر ت، ويلكوكس أ ج، واينبرغ س ر، وآخرون (يوليو 2010). "الجينات الأمومية وشقوق الوجه لدى النسل: بحث شامل عن الارتباطات الجينية في دراستين سكانيتين حول الشقوق من الدول الاسكندنافية" . PLOS ONE . 5 (7) e11493. Bibcode : 2010PLoSO...511493J . doi : 10.1371/journal.pone.0011493 . PMC 2901336. PMID 20634891 .

- 1 2 بيتي تي إتش، هيتمانسكي جيه بي، فالين إم دي، بارك جيه دبليو، سول جيه دبليو، ماكنتوش آي، وآخرون . (نوفمبر 2006). " تحليل الجينات المرشحة على الكروموسوم 2 في ثلاثيات آباء وحالات الشفة الأرنبية من ثلاث مجموعات سكانية" . علم الوراثة البشرية . 120 (4): 501-518 . doi : 10.1007/s00439-006-0235-9 . PMID 16953426. S2CID 7836461 .
- ↑ ديكسون إم جيه، مارازيتا إم إل، بيتي تي إتش، موراي جيه سي (مارس 2011). "الشفة الأرنبية والحنك المشقوق: فهم التأثيرات الوراثية والبيئية" . مجلة نيتشر ريفيوز. علم الوراثة . 12 (3): 167-178 . doi : 10.1038/nrg2933 . PMC 3086810. PMID 21331089 .
- 1 2 3 روزنفيلد، جيه إيه، باليف، بي سي، لوكاس، إيه، سبنس، إي جيه، باول، سي، أيلزورث، إيه إس، وآخرون . (أغسطس 2009). "حذف أجزاء صغيرة من جين SATB2 يسبب بعض السمات السريرية لمتلازمة الحذف الصغير 2q33.1" . PLOS ONE . 4 (8) e6568. Bibcode : 2009PLoSO...4.6568R . doi : 10.1371/journal.pone.0006568 . PMC 2719055. PMID 19668335 .

- ↑ فيتزباتريك وآخرون (أكتوبر 2003). "تحديد جين SATB2 كجين شق الحنك على الكروموسوم 2q32-q33" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 12 (19): 2491-2501 . doi : 10.1093/hmg/ddg248 . PMID 12915443 .
- ↑ ماغنوسون ك، دي ويت م، برينان دي جيه، جونسون إل بي، ماكجي إس إف، لوندبيرغ إي، وآخرون . (يوليو 2011). "يُحدد SATB2 بالاشتراك مع السيتوكيراتين 20 أكثر من 95% من جميع سرطانات القولون والمستقيم". المجلة الأمريكية لعلم الأمراض الجراحية . 35 (7): 937-948 . doi : 10.1097/pas.0b013e31821c3dae . PMID 21677534. S2CID 33883685 .
- ↑ دراغومير أ، دي ويت م، يوهانسون س، أولين م، بونتين ف (مايو 2014). "دور SATB2 كعلامة تشخيصية لأورام القولون والمستقيم: نتائج دراسة سريرية استباقية قائمة على علم الأمراض". المجلة الأمريكية لعلم الأمراض السريرية . 141 (5): 630-638 . doi : 10.1309/ajcpww2urz9jkqju . PMID 24713733. S2CID 4564790 .
للمزيد من القراءة
- دوبريفا جي، دامباخر جي، غروسشيدل آر (ديسمبر 2003). "تعديل بروتين SATB2، وهو بروتين جديد يرتبط بـ MAR، بواسطة SUMO، يُعدِّل التعبير الجيني للغلوبولين المناعي ميو" . الجينات والتطور . 17 (24): 3048-3061 . doi : 10.1101/gad.1153003 . PMC 305257. PMID 14701874 .
- دوبريفا جي، شحرور إم، داوتزنبرغ إم، تشيريفيلا إل، كانزلر بي، فاريناس آي، وآخرون (يونيو 2006). "SATB2 عامل متعدد الوظائف في تحديد نمط الجمجمة والوجه وتمايز الخلايا العظمية" . مجلة Cell . 125 (5): 971-986 . doi : 10.1016/j.cell.2006.05.012 . PMID 16751105. S2CID 2882724 .
- ألكامو إيا، تشيريفيلا إل، داوتزينبيرج إم، دوبريفا جي، فاريناس الأول، جروسشيدل آر، وآخرون . (فبراير 2008). "Satb2 ينظم هوية الخلايا العصبية الإسقاطية في القشرة الدماغية النامية" . الخلايا العصبية . 57 (3): 364–377 . دوى : 10.1016/j.neuron.2007.12.012 . بميد 18255030 . S2CID 6716396 .
- بيتي تي إتش، هيتمانسكي جيه بي، فالين إم دي، بارك جيه دبليو، سول جيه دبليو، ماكنتوش آي، وآخرون . (نوفمبر 2006). " تحليل الجينات المرشحة على الكروموسوم 2 في ثلاثيات آباء وحالات الشفة الأرنبية من ثلاث مجموعات سكانية" . علم الوراثة البشرية . 120 (4): 501-518 . doi : 10.1007/s00439-006-0235-9 . PMID 16953426. S2CID 7836461 .
- ماتشادو آر دي، باوتشيلو إم دبليو، فريتويل إن، فيل سي، طومسون جيه آر، فيلارينو غويل سي، وآخرون . (سبتمبر 2000). "خريطة فيزيائية ونسخية مبنية على تحسين الفاصل الحرج لجين PPH1، وهو جين مسؤول عن ارتفاع ضغط الدم الرئوي الأولي العائلي. الاتحاد الدولي لارتفاع ضغط الدم الرئوي الأولي". علم الجينوم . 68 (2): 220-228 . doi : 10.1006/geno.2000.6291 . PMID 10964520 .
- جوجيسور أ، شي م، جيسينغ هـ ك، لي ر ت، ويلكوكس أ ج، واينبرغ س ر، وآخرون (يوليو 2010). "الجينات الأمومية وشقوق الوجه لدى النسل: بحث شامل عن الارتباطات الجينية في دراستين سكانيتين حول الشقوق من الدول الاسكندنافية" . PLOS ONE . 5 (7) e11493. Bibcode : 2010PLoSO...511493J . doi : 10.1371/journal.pone.0011493 . PMC 2901336. PMID 20634891 .

- كارتر تي سي، مولوي إيه إم، بانجيلينان إف، تروندل جيه إف، كيرك بي إن، كونلي إم آر، وآخرون (فبراير 2010). "اختبار الارتباطات المبلغ عنها لعوامل الخطر الوراثية لشقوق الفم في دراسة سكانية أيرلندية واسعة النطاق" . مجلة أبحاث العيوب الخلقية . الجزء أ، علم التشوهات السريري والجزيئي . 88 (2): 84-93 . doi : 10.1002/bdra.20639 . PMC 3503531. PMID 19937600 .
- روزنفيلد وآخرون (أغسطس 2009). "حذف أجزاء صغيرة من جين SATB2 يسبب بعض السمات السريرية لمتلازمة الحذف الصغير 2q33.1" . PLOS ONE . 4 (8) e6568. Bibcode : 2009PLoSO...4.6568R . doi : 10.1371/journal.pone.0006568 . PMC 2719055. PMID 19668335 .

- فييرا إيه آر، أفيلا جيه آر، داك-هيرش إس، دراغان إي، فيليكس تي إم، رحيموف إف، وآخرون . (ديسمبر 2005). "التسلسل الطبي للجينات المرشحة لشق الشفة والحنك غير المتلازمي" . مجلة PLOS Genetics . 1 (6) e64. doi : 10.1371/journal.pgen.0010064 . PMC 1298935. PMID 16327884 .

روابط خارجية
- موقع جين SATB2 البشري في متصفح جينوم UCSC .
- تفاصيل جين SATB2 البشري في متصفح جينوم UCSC .
سجل حالات SATB2 http://satb2gene.com
تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 2
- عوامل النسخ
