سيتمار
إنزيم ناقل ميثيل N-الليسين الهيستوني SETMAR هو إنزيم يتم ترميزه في البشر بواسطة جين SETMAR . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
وظيفة
يحتوي بروتين SETMAR على نطاق SET الذي يمنحه نشاط ميثيل ترانسفيراز الهيستون ، على الليسين-4 والليسين-36 من الهيستون H3 ، وكلاهما علامات محددة للتنشيط فوق الجيني. وقد تم تحديده كبروتين إصلاحي لأنه يتوسط عملية الميثيل الثنائي عند الليسين-36 في مواقع انقطاع الحمض النووي المزدوج ، وهي إشارة تعزز إصلاح NHEJ . [ 7 ] [ 8 ]
تمتلك الرئيسيات الشبيهة بالبشر ، بما فيها الإنسان، نسخة من البروتين مُدمجة مع ناقل مارينر/Tc1 . توفر منطقة الاندماج هذه قدرة البروتين على الارتباط بالحمض النووي، بالإضافة إلى بعض النشاط النيوكليازي . يفقد البروتين نشاط الناقل نتيجةً لوجود عدة طفرات مُعطِّلة، [ 9 ] بما في ذلك الطفرة D610N. [ 10 ] [ 11 ] ومع ذلك، يحتفظ نطاق الناقل المُستأنس بقدرته على الارتباط بعناصر تكرار مارينر في الجينوم. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] وقد وُجد أن SETMAR يؤثر على التعبير الجيني وتضفير الجينات القريبة من عناصر تكرار مارينر أو التي تحتوي عليها، وذلك من خلال وظائفه في مثيلة الهيستون. [ 12 ] [ 13 ] [ 15 ] وقد ثبت أن كل من SET، من خلال نشاط ميثيل ترانسفيراز الخاص به، [ 7 ] [ 8 ] [ 16 ] و mariner، مع نشاط ربط الحمض النووي [ 17 ] والنشاط النيوكليازي، [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 16 ] لمجالات SETMAR تعمل في ربط النهايات غير المتجانسة (NHEJ) لإصلاح كسور الحمض النووي المزدوجة.
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000170364 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ روبرتسون إتش إم، زومبانو كيه إل (ديسمبر 1997). "التطور الجزيئي لعنصر نقل مارينر قديم، Hsmar1، في الجينوم البشري". جين . 205 ( 1-2 ): 203-217 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00472-1 . PMID 9461395 .
- ↑ "Entrez Gene: SETMAR SET domain and mariner transposase fusion gene" .
- ↑ تيلير م (ديسمبر 2021). "بنية ونشاط ووظيفة إنزيم ميثيل ترانسفيراز الليسين البروتيني SETMAR" . مجلة لايف . 11 (12): 1342. Bibcode : 2021Life...11.1342T . doi : 10.3390/life11121342 . PMC 8704517. PMID 34947873 .
- ↑ لي أو، رينو إس، أوجي-غويو سي (أبريل 2022). "سيتمار، حالة من الجينات المُستغلة في الرئيسيات: نحو آفاق جديدة" . الحمض النووي المتنقل . 13 (1) 9. doi : 10.1186/s13100-022-00267-1 . PMC 8994322. PMID 35395947 .
- 1 2 لي إس إتش، أوشيغي إم، دورانت إس تي، راسيل كيه كيه، ويليامسون إي إيه، رامزي إتش، وآخرون . (ديسمبر 2005). "بروتين ميتناز ذو نطاق SET يُسهّل دمج الحمض النووي الغريب ويربط الدمج بإصلاح الربط غير المتجانس للنهايات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (50): 18075-18080 . Bibcode : 2005PNAS..10218075L . doi : 10.1073/pnas.0503676102 . PMC 1312370. PMID 16332963 .
- 1 2 Fnu S, Williamson EA, De Haro LP, Brenneman M, Wray J, Shaheen M, et al. (يناير 2011). "تعزيز إصلاح الحمض النووي عن طريق الربط غير المتجانس للنهايات من خلال مثيلة الليسين 36 في الهيستون H3" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 108 (2): 540-545 . Bibcode : 2011PNAS..108..540F . doi : 10.1073/pnas.1013571108 . PMC 3021059. PMID 21187428 .
- ↑ تيلير م، تشالمرز ر (10 يناير 2020). "التعويض عن تثبيط الإنتاج المفرط لعنصر Hsmar1 المتحرك في الإشريكية القولونية باستخدام سلسلة من المحفزات التكوينية" . الحمض النووي المتحرك . 11 (1) 5. doi : 10.1186/s13100-020-0200-5 . PMC 6954556. PMID 31938044 .
- ↑ ميسكي سي، باب بي، ماتيس إل، سينزيل إل، كيلر إتش، إزفاك زد، إيفيكس زد (يونيو 2007). "البحار القديم يبحر من جديد: نقل عنصر Hsmar1 البشري بواسطة ترانسبوزاز مُعاد بناؤه ونشاط بروتين SETMAR على نهايات الترانسبوزون" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 27 (12): 4589-4600 . doi : 10.1128/MCB.02027-06 . PMC 1900042. PMID 17403897 .
- ↑ ليو د، بيشيرور ج، صديق أ، بويزين ن، بيغو ي، تشالمرز ر (فبراير 2007). "يحافظ بروتين SETMAR البشري على معظم أنشطة ناقل Hsmar1 السلفي" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 27 (3): 1125-1132 . doi : 10.1128/MCB.01899-06 . PMC 1800679. PMID 17130240 .
- 1 2 تيلير م، تشالمرز ر (يناير 2019). "إنزيم SETMAR البشري هو ميثيلاز هيستون متخصص في تسلسل الحمض النووي وله تأثير واسع على النسخ الجيني" . أبحاث الأحماض النووية . 47 (1): 122-133 . doi : 10.1093/nar/gky937 . PMC 6326780. PMID 30329085 .
- 1 2 أنطوان-لوركين أ، أرينسبورغر ب، أرناوتي أ، أسغاري س، باتاييه م، بوكلير ل، وآخرون . (مايو 2021). "يرتبط نمطان متكرران غنيان داخل بعض المحفزات ومواقع بدء التضاعف بنظائر SETMAR في خلايا القولون البشري" . علم الجينوم . 113 (3): 1589-1604 . doi : 10.1016/ j.ygeno.2021.03.032 . PMID 33812898. S2CID 233028866 .
- ↑ ميسكي م، هورفاث أ، فيولا ل، فارغا ل، ناجي إ، فيرو أ، وآخرون . (2021-01-01). "رسم خرائط مواقع ارتباط بروتين SETMAR المشتق من الترانسبيوزاز في الجينوم البشري على مستوى الجينوم" . مجلة التكنولوجيا الحيوية الحاسوبية والبنيوية . 19 : 4032-4041 . doi : 10.1016/j.csbj.2021.07.010 . PMC 8327481. PMID 34377368 .
- 1 2 تشين كيو، بيتس إيه إم، هانكير جيه إن، سيمبسون إي، روش دي بي، بوديتشيتي آر، وآخرون . (مايو 2022). "تشير التحليلات البنيوية والجينومية إلى أن البروتين SETMAR المشتق من الترانسبوزون يُغير النسخ والتضفير" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 298 (5) 101894. doi : 10.1016/j.jbc.2022.101894 . PMC 9062482. PMID 35378129 .
- 1 2 تيلير م، تشالمرز ر (أغسطس 2019). "أدوار بروتين SETMAR (Metnase) البشري في إعادة تركيب الحمض النووي غير الشرعي وإصلاح وصل النهايات غير المتجانسة" . إصلاح الحمض النووي . 80 : 26-35 . doi : 10.1016/j.dnarep.2019.06.006 . PMC 6715855. PMID 31238295 .
- ↑ بيك، ب.د.، بارك، س.ج.، لي، ي.ج.، رومان، ي.، هرومس، ر.أ.، لي، س.هـ. (أبريل 2008). " بروتين Pso4 البشري هو شريك ارتباط لإنزيم الميتناز (SETMAR) ينظم وظيفة الميتناز في إصلاح الحمض النووي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (14): 9023-9030 . doi : 10.1074/jbc.M800150200 . PMC 2431028. PMID 18263876 .
- ↑ هرومس ر، وراي ج، لي ش ه، مارتينيز ل، فارينغتون ج، كورين ل ك، وآخرون . (ديسمبر 2008). "يتفاعل بروتين ميتناز، وهو بروتين بشري يحتوي على نطاقي مجموعة وترانسبوزاز، مع إنزيم ربط الحمض النووي الرابع، ويعزز كفاءة ودقة ربط النهايات غير المتجانسة" . إصلاح الحمض النووي . 7 (12): 1927-1937 . doi : 10.1016/j.dnarep.2008.08.002 . PMC 2644637. PMID 18773976 .
- ↑ بيك، ب.د.، لي، س.س.، ويليامسون، إ.، هرومس، ر.أ.، لي، س.هـ. (مايو 2011). " التوصيف البيوكيميائي لنشاط الإندونوكلياز الخاص بإنزيم الميتناز ودوره في إصلاح الحمض النووي غير المتجانس" . الكيمياء الحيوية . 50 (20): 4360-4370 . doi : 10.1021/bi200333k . PMC 3388547. PMID 21491884 .
- ↑ موهاباترا إس، يانوني إس إم، لي إس إتش، هروماس آر إيه، أكوبيانتس كيه، مينون في، وآخرون . (يونيو 2013). "تقليم الأطراف المتدلية التالفة 3' لكسور الحمض النووي المزدوجة بواسطة إنزيمات Metnase وArtemis الداخلية" . إصلاح الحمض النووي . 12 (6): 422-432 . doi : 10.1016/j.dnarep.2013.03.005 . PMC 3660496. PMID 23602515 .
- ↑ كيم إتش إس، تشين كيو، كيم إس كيه، نيكولوف جيه إيه، هرومس آر، جورجياديس إم إم، لي إس إتش (أبريل 2014). "النمط التحفيزي DDN ضروري لوظائف Metnase في إصلاح الربط غير المتجانس للنهايات (NHEJ) وإعادة بدء التضاعف" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 289 (15): 10930-10938 . doi : 10.1074/jbc.M113.533216 . PMC 4036204. PMID 24573677 .
للمزيد من القراءة
- بيري ر، ستيفنز ت ج، والتر ن أ، ويلكوكس أ س، روبانو ت، هوبكنز ج أ، وآخرون . (أغسطس 1995). " مواقع التسلسل الموسومة القائمة على الجينات (STSs) كأساس لخريطة الجينات البشرية". علم الوراثة الطبيعية . 10 (4): 415-423 . doi : 10.1038/ng0895-415 . PMID 7670491. S2CID 22277955 .
- ماروياما ك، سوغانو س (يناير 1994). "التغطية بالأوليغو: طريقة بسيطة لاستبدال بنية غطاء الحمض النووي الريبوزي الرسول في حقيقيات النوى بالأوليغوريبونوكليوتيدات". جين . 138 ( 1-2 ): 171-174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- أندرسون ب، وينتلاند إم إيه، ريكافرينتي جيه واي، ليو دبليو، جيبس آر إيه (أبريل 1996). "طريقة "المحول المزدوج" لتحسين بناء مكتبة الشوتجن". الكيمياء الحيوية التحليلية . 236 (1): 107-113 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- يو وآخرون (أبريل 1997). "تسلسل الحمض النووي التكميلي المتسلسل على نطاق واسع" . أبحاث الجينوم . 7 (4): 353-358 . doi : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC 139146. PMID 9110174 .
- سوزوكي واي، يوشيتومو-ناكاجاوا كيه، ماروياما كيه، سوياما إيه، سوجانو إس (أكتوبر 1997). "بناء وتوصيف مكتبة cDNA غنية بالطول الكامل ومكتبة غنية بالنهاية 5'". جين . 200 ( 1-2 ): 149-156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- لي إس إتش، أوشيغي إم، دورانت إس تي، راسيل كيه كيه، ويليامسون إي إيه، رامزي إتش، وآخرون . (ديسمبر 2005). "بروتين ميتناز ذو نطاق SET يُسهّل دمج الحمض النووي الغريب ويربط الدمج بإصلاح الربط غير المتجانس للنهايات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (50): 18075-18080 . Bibcode : 2005PNAS..10218075L . doi : 10.1073/pnas.0503676102 . PMC 1312370. PMID 16332963 .
- كوردو آر، أوديت إس، باتزر إم إيه، فيشوت سي (مايو 2006). "نشأة جين هجين في الرئيسيات عن طريق استخلاص جين الترانسبيوزاز من عنصر متحرك" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (21): 8101-8106 . Bibcode : 2006PNAS..103.8101C . doi : 10.1073/pnas.0601161103 . PMC 1472436. PMID 16672366 .
- كيرافالا أ، ليو د، ليتشمان إي آر، وولف د، ناش جيه إيه، لامبي دي جيه، روبنز بي دي (أكتوبر 2006). "إنزيم هيمار1 فائق النشاط يُسهّل عملية النقل في مزارع الخلايا ويعزز التعبير الجيني في الجسم الحي". العلاج الجيني البشري . 17 (10): 1006-1018 . doi : 10.1089/hum.2006.17.1006 . PMID 16989604 .
- ليو د، بيشيرور ج، صديق أ، بويزين ن، بيغو ي، تشالمرز ر (فبراير 2007). "يحافظ بروتين SETMAR البشري على معظم أنشطة ناقل Hsmar1 السلفي" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 27 (3): 1125-1132 . doi : 10.1128/MCB.01899-06 . PMC 1800679. PMID 17130240 .
- ميسكي سي، باب بي، ماتيس إل، سينزيل إل، كيلر إتش، إزفاك زد، إيفيكس زد (يونيو 2007). "البحار القديم يبحر من جديد: نقل عنصر Hsmar1 البشري بواسطة ترانسبوزاز مُعاد بناؤه ونشاط بروتين SETMAR على نهايات الترانسبوزون" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 27 (12): 4589-4600 . doi : 10.1128/MCB.02027-06 . PMC 1900042. PMID 17403897 .
- رومان واي، أوشيغي إم، لي واي جيه، غودوين كيه، جورجياديس إم إم، هروماس آر إيه، لي إس إتش (أكتوبر 2007). " التوصيف البيوكيميائي لبروتين اندماجي من نوع SET و ترانسبوزاز، ميتناز: نشاطه في الارتباط بالحمض النووي وقطعه" . الكيمياء الحيوية . 46 (40): 11369-11376 . doi : 10.1021/bi7005477 . PMC 3374406. PMID 17877369 .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 3
- الجينات المتحولة في الفئران
