ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين III
إنزيم يوروبورفيرينوجين III ديكاربوكسيلاز ( يوروبورفيرينوجين ديكاربوكسيلاز ، أو UROD ) هو إنزيم ( EC 4.1.1.37 ) يتم ترميزه في البشر بواسطة جين UROD . [ 5 ]
وظيفة
إنزيم يوروبورفيرينوجين III ديكاربوكسيلاز هو إنزيم متجانس ثنائي ( PDB : 1URO ) يحفز الخطوة الخامسة في التخليق الحيوي للهيم ، والتي تتوافق مع إزالة مجموعات الكربوكسيل من السلاسل الجانبية الأربعة للأسيتات في يوروبورفيرينوجين III لإنتاج كوبروبورفيرينوجين III: [ 6 ]
الأهمية السريرية
من المعروف أن الطفرات ونقص هذا الإنزيم تسببان البورفيريا الجلدية المتأخرة العائلية والبورفيريا الكبدية المكونة للدم . [ 5 ] وقد تم اكتشاف ما لا يقل عن 65 طفرة مسببة للمرض في هذا الجين. [ 7 ]
الآلية
عند تركيزات منخفضة للمادة المتفاعلة، يُعتقد أن التفاعل يتبع مسارًا منظمًا، مع إزالة متسلسلة لثاني أكسيد الكربون من الحلقات D وA وB وC، بينما عند مستويات أعلى من المادة المتفاعلة/الإنزيم، يبدو أن مسارًا عشوائيًا هو السائد. يعمل الإنزيم على شكل ثنائي في المحلول، وقد تم بلورة كلا الإنزيمين من الإنسان والتبغ وحل بنيتهما بدقة عالية.

يُعتبر إنزيم UroD من إنزيمات نزع الكربوكسيل غير التقليدية، إذ يُجري تفاعلات نزع الكربوكسيل دون الحاجة إلى أي عوامل مساعدة، على عكس غالبية إنزيمات نزع الكربوكسيل. وقد اقتُرحت آلية عمله من خلال بروتنة الركيزة بواسطة بقايا الأرجينين . [ 8 ] وأظهر تقرير نُشر عام 2008 أن معدل التفاعل غير المحفز لإنزيم UroD هو 10⁻¹⁹ ثانية⁻¹ ، لذا عند درجة حموضة 10، يكون تسارع معدل تفاعل UroD مقارنةً بالمعدل غير المحفز، أي الكفاءة التحفيزية، هو الأكبر بين جميع الإنزيمات المعروفة، حيث يبلغ 6 × 10²⁴ مول⁻¹ . [ 6 ]

مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000126088 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000028684 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- 1 2 "Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase" .
- 1 2 لويس، سي. أ.، وولفندن، ر. (نوفمبر 2008). "نزع الكربوكسيل من اليوروبورفيرينوجين كمعيار للكفاءة التحفيزية للإنزيمات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 105 (45): 17328-33 . Bibcode : 2008PNAS..10517328L . doi : 10.1073/pnas.0809838105 . PMC 2582308. PMID 18988736 .
- ↑ شيمتشيكوفا د، هينبرغ ب (ديسمبر 2019). "تحسين تنبؤات الطب التطوري بناءً على الأدلة السريرية لمظاهر الأمراض المندلية" . التقارير العلمية . 9 (1) 18577. Bibcode : 2019NatSR...918577S . doi : 10.1038/ s41598-019-54976-4 . PMC 6901466. PMID 31819097 .
- ↑ سيلفا، بي. جيه.، وراموس، إم. جيه. (2005). "دراسة نظرية الكثافة الوظيفية لآليات نزع الكربوكسيل الخالي من العوامل المساعدة الذي يقوم به إنزيم يوروبورفيرينوجين III ديكاربوكسيلاز". مجلة الكيمياء الفيزيائية ب . 109 (38): 18195-200 . doi : 10.1021/jp051792s . PMID 16853337 .
للمزيد من القراءة
- إلدر جي إتش، لي جي بي، توفي جا (1978). "انخفاض نشاط ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين الكبدي في البورفيريا الجلدية الآجلة المتفرقة". ن. إنجل. جيه ميد . 299 (6): 274– 8. دوى : 10.1056/NEJM197808102990603 . بميد 661926 .
- دي فيرنوي إتش، بورجوا إف، دي روي إف، وآخرون (1992). "توصيف طفرة جديدة (R292G) وحذف في موضع ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين البشري لدى مريضين مصابين بالبورفيريا الكبدية الإريثروبويتيوية" . علم الوراثة البشرية 89 (5): 548-552 . doi : 10.1007 /bf00219182 . hdl : 1765/58484 . PMID 1634232. S2CID 31811381 .
- رومانا م، غراندشامب ب، دوبار أ، وآخرون (1991). "تحديد طفرة جديدة مسؤولة عن البورفيريا الكبدية الإريثروبويتييكية". المجلة الأوروبية للبحوث السريرية . 21 (2): 225-229 . doi : 10.1111/j.1365-2362.1991.tb01814.x . PMID 1905636. S2CID 22358220 .
- غاري جيه آر، هاريسون إل إم، فرانكلين كيه إف، وآخرون (1990). "إنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين: طفرة في موقع الربط تسبب حذف الإكسون 6 في عائلات متعددة مصابة بالبورفيريا الجلدية المتأخرة" . مجلة التحقيقات السريرية . 86 (5): 1416-1422 . doi : 10.1172/JCI114856 . PMC 296884. PMID 2243121 .
- غاري جيه آر، هانسن جيه إل، هاريسون إل إم، وآخرون (1989). "طفرة نقطية في المنطقة المشفرة لإنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين مرتبطة بالبورفيريا الجلدية المتأخرة العائلية" . مجلة الدم . 73 (4): 892-895 . doi : 10.1182/blood.V73.4.892.892 . PMID 2920211 .
- روميو، بي. إتش.، رايش، إن.، دوبارت، إيه.، وآخرون . (1986). "الاستنساخ الجزيئي وتسلسل النيوكليوتيدات لنسخة cDNA كاملة من إنزيم يوروبورفيرينوجين ديكاربوكسيلاز البشري" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 261 (21): 9825-31 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)67589-1 . PMID 3015909 .
- دوبارت أ، ماتي إم جي، رايش إن، وآخرون . (1986). "تخصيص إنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين البشري (URO-D) إلى النطاق p34 من الكروموسوم 1". همم. جينيت . 73 (3): 277– 9. دوى : 10.1007 / BF00401245 . بميد 3460962 . S2CID 34478515 .
- رومانا م، دوبار أ، بوبان د، وآخرون (1987). "بنية جين ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين البشري" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 15 (18): 7343-56 . doi : 10.1093 / nar/15.18.7343 . PMC 306252. PMID 3658695 .
- دي فيرنوي إتش، غراندشامب بي، بومونت سي، وآخرون (1986). "طفرة بنيوية في ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين (Gly281----Glu) في حالة بورفيريا". مجلة ساينس . 234 (4777): 732-734 . Bibcode : 1986Sci...234..732D . doi : 10.1126/science.3775362 . PMID 3775362 .
- روبرتس إيه جي، إلدر جي إتش، دي سالامانكا آر إي، وآخرون (1995). "طفرة (G281E) في جين ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين البشري تسبب كلاً من البورفيريا الكبدية الإريثروبويتيوية والبورفيريا الجلدية المتأخرة العائلية الظاهرة: دراسات بيوكيميائية وجينية على مرضى إسبان" . مجلة الأمراض الجلدية الاستقصائية . 104 (4): 500-502 . doi : 10.1111/1523-1747.ep12605953 . PMID 7706766 .
- ماروياما ك، سوغانو س (1994). "التغطية بالأوليغو: طريقة بسيطة لاستبدال بنية غطاء الحمض النووي الريبوزي الرسول حقيقي النواة بالأوليغوريبونوكليوتيدات". جين . 138 ( 1-2 ): 171-174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- ميغورو ك، فوجيتا هـ، إيشيدا ن، وآخرون (1994). "عيوب جزيئية في إنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين لدى مريض مصاب ببورفيريا كبدية إريثروبويتي خفيفة" . مجلة الأمراض الجلدية الاستقصائية . 102 (5): 681-685 . doi : 10.1111/1523-1747.ep12374134 . PMID 8176248 .
- موران-خيمينيز إم جيه، جيد سي، رومانا إم، وآخرون (1996). "إنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين: التسلسل الجيني البشري الكامل ودراسة جزيئية لثلاث عائلات مصابة بالبورفيريا الكبدية الإريثروبويتيوية" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 58 (4): 712-721 . PMC 1914669. PMID 8644733 .
- ماكمانوس جيه إف، بيجلي سي جي، ساسا إس، راتنايك إس (1996). "خمس طفرات جديدة في جين ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين تم تحديدها في عائلات مصابة بالبورفيريا الجلدية" . مجلة الدم . 88 (9): 3589-3600 . doi : 10.1182/blood.V88.9.3589.bloodjournal8893589 . PMID 8896428 .
- سوزوكي واي، يوشيتومو-ناكاجاوا كيه، ماروياما كيه، وآخرون (1997). "بناء وتوصيف مكتبة cDNA غنية بالطول الكامل ومكتبة غنية بالنهاية 5'". جين . 200 ( 1-2 ): 149-156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- ويتبي إف جي، فيليبس جيه دي، كوشنر جيه بي، هيل سي بي (1998). " البنية البلورية لإنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين البشري" . مجلة EMBO . 17 (9): 2463-2471 . doi : 10.1093/emboj/17.9.2463 . PMC 1170588. PMID 9564029 .
- مينديز م، سوركين ل، روسيتي م ف، وآخرون (1998). "البورفيريا الجلدية المتأخرة العائلية: توصيف سبع طفرات جديدة في إنزيم ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين وتواتر أليلات داء ترسب الأصبغة الدموية الشائعة" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 63 (5): 1363-1375 . doi : 10.1086/302119 . PMC 1377546. PMID 9792863 .
- وانغ هـ، لونغ كيو، مارتي إس دي، وآخرون ( 1998). "نموذج سمكة الزيبرا لمرض البورفيريا الكبدية الإريثروبويتييكية". نات. جينيت . 20 (3): 239-243 . doi : 10.1038/3041 . PMID 9806541. S2CID 28379777 .
- ماكمانوس جيه إف، بيجلي سي جي، ساسا إس، راتنايك إس (1999). "ثلاث طفرات جديدة في جين ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين في البورفيريا الجلدية المتأخرة العائلية. الطفرة الموجزة رقم 237. منشور إلكترونيًا" . الطفرات البشرية . 13 (5): 412-413 . doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1999)13:5 < 412::AID-HUMU13 > 3.0.CO ; 2-N . PMID 10338097 .
- كريستيانسن إل، جيد سي، هومبرادوس آي، وآخرون (1999). "فحص الطفرات في جين ديكاربوكسيلاز اليوروبورفيرينوجين باستخدام الرحلان الكهربائي الهلامي المتدرج المُشوه. تحديد وتوصيف ست طفرات جديدة مرتبطة بداء البورفيرينوجين العائلي" . الطفرات البشرية . 14 (3): 222-32 . doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:3 < 222::AID-HUMU5 > 3.0.CO ; 2 -V . PMID 10477430. S2CID 245442 .
روابط خارجية
- نظرة عامة على جميع المعلومات الهيكلية المتاحة في PDB لـ UniProt : P06132 (Uroporphyrinogen decarboxylase) في PDBe-KB .

- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 1
- EC 4.1.1
