VPg
بروتين VPg (البروتين الفيروسي المرتبط بالجينوم) هو بروتين يرتبط تساهميًا بالنهاية 5′ للحمض النووي الريبي الفيروسي ذي السلسلة الموجبة ، ويعمل كبادئ أثناء تخليق الحمض النووي الريبي في العديد من عائلات الفيروسات، بما في ذلك Picornaviridae و Potyviridae و Astroviridae و Caliciviridae . تشير بعض الدراسات إلى وجود بروتين VPg محتمل في عائلة Astroviridae أيضًا، إلا أن الأدلة التجريبية على ذلك لم تُقدم بعد، وتتطلب المزيد من البحث. [ 1 ] يحدث نشاط البادئ لبروتين VPg عند إضافة النيوكليوتيدات إليه تساهميًا، مما يوفر قواعد نووية قادرة على الارتباط بالنهاية 3′ للحمض النووي الريبي الفيروسي. بالنسبة لبعض عائلات الفيروسات، يلعب بروتين VPg أيضًا دورًا في بدء الترجمة من خلال العمل كغطاء 5′ للحمض النووي الريبي الرسول .
وُصِفَ بروتين VPg لأول مرة في الدراسات الأولية لحمض RNA الخاص بفيروس شلل الأطفال على أنه بروتين مرتبط تساهميًا بالنهاية 5' من الجينوم. [ 2 ] [ 3 ] وشوهد لاحقًا في فيروسات الكاليسيفيروس. [ 4 ]
الارتباط أثناء تخليق الحمض النووي الريبي
يجب أن يخضع بروتين VPg لعملية إضافة النيوكليوتيدات بعد الترجمة قبل أن يتمكن من العمل كبادئ للتضاعف. في فيروس البيكورنا ، يستطيع إنزيم 3Dpol (إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي الريبي) تصنيع VPg-pUpU-OH باستخدام تسلسل متعدد الأدينين ضمن بنية جذعية حلقية ( عنصر تضاعف يعمل في نفس الموقع )، والذي غالبًا ما يقع في الإطار المفتوح للقراءة، كقالب. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] علاوة على ذلك، فإن وجود بنية ورقة البرسيم الطرفية 5' ضروري في نفس الموقع لتكوين معقد تضاعف الحمض النووي الريبي 3Dpol قبل بدء التضاعف، والذي يشارك في إضافة اليوريدين إلى VPg. [ 8 ]
يمكن استخدامه كغطاء بطول 5 أقدام
أظهرت دراسات استخدمت بروتينيز K لفصل بروتين VPg عن الجينوم الفيروسي أن فيروس الطفح الحويصلي لفيروس كاليسيفيروس، الذي يفتقر إلى بروتين VPg، لم يعد مُعديًا [ 9 ] ، بينما يحتفظ فيروس شلل الأطفال بقدرته على العدوى حتى في غياب بروتين VPg [ 10 ] . ولأن بروتين VPg يقع في الطرف 5' من الجينوم، على غرار غطاء mRNA 5' في حقيقيات النوى ، فقد أُجريت عدة تجارب لاستكشاف وظيفته في عملية الترجمة. يستخدم فيروس شلل الأطفال موقع دخول الريبوسوم الداخلي (IRES) بدلًا من الغطاء لبدء الترجمة، مما يُلغي الحاجة إلى بروتين VPg في العدوى الأولية [ 11 ]، بينما أكدت دراسات أُجريت على فيروس كاليسيفيروس القططي أن بروتين VPg يتفاعل مباشرةً مع بروتين ربط الغطاء في الريبوسوم ، eIF4E، وأن هذا التفاعل ضروري للترجمة الفيروسية [ 12 ] .
مصادر
مبادئ علم الفيروسات بقلم SJ Flint، LW Enquist، VR Racaniello، AM Skalka ( ISBN 1-55581-259-7)
- ↑ غودفيلو، آي (نوفمبر 2011). "بروتين VPg المرتبط بالجينوم لفيروسات الفقاريات - بروتين متعدد الوظائف" . مجلة Current Opinion in Virol . 1 (5): 355-362 . doi : 10.1016/j.coviro.2011.09.003 . PMC 3541522. PMID 22440837 .
- ↑ فلانيجان جيه بي، بيترسون آر إف، أمبروز في، هيوليت إم جيه، بالتيمور دي. الارتباط التساهمي لبروتين بتسلسل نيوكليوتيدي محدد عند الطرف 5′ للفيروس والحمض النووي الريبوزي الوسيط التضاعفي لفيروس شلل الأطفال. وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 1977؛74:961-965.
- ↑ لي واي إف، نوموتو إيه، ديتجين بي إم، ويمر إي. البروتين المرتبط بالجينوم لفيروسات البيكورنا 1. بروتين مرتبط تساهميًا بالحمض النووي الريبوزي لجينوم فيروس شلل الأطفال. وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 1977؛74:59-63.
- ↑ شافر إف إل، إهريسمان دي دبليو، فريتز إم كيه، سورجل إم آي. بروتين، VPG، مرتبط تساهميًا بـ 36S RNA لفيروس كاليسي. مجلة علم الفيروسات العام. 1980؛47(1):215-220.
- ↑ غودفيلو آي، تشودري واي، ريتشاردسون إيه، ميريديث جيه، ألموند جيه دبليو، باركلي دبليو، إيفانز دي جيه. تحديد عنصر تضاعف يعمل في نفس الموقع داخل المنطقة المشفرة لفيروس شلل الأطفال. مجلة علم الفيروسات. 2000؛74:4590-4600.
- ↑ بول إيه في، ريدر إي، كيم دي دبليو، فان بوم جيه إتش، ويمر إي. تحديد بنية حلقية من الحمض النووي الريبي في الحمض النووي الريبي لفيروس شلل الأطفال والتي تعمل كقالب أساسي في عملية إضافة اليوريديل إلى بروتين VPg في المختبر. مجلة علم الفيروسات. 2000؛74:10359-10370.
- ↑ ريدر إي، بول إيه في، كيم دي دبليو، فان بوم جيه إتش، ويمر إي. دراسات جينية وكيميائية حيوية لعنصر التضاعف المؤثر في فيروس شلل الأطفال cre فيما يتعلق بـ uridylylation VPg. مجلة علم الفيروسات. 2000؛74:10371–10380.
- ↑ ليونز تي، موراي كي إي، روبرتس إيه دبليو، بارتون دي جيه. الحمض النووي الريبي ذو الشكل الورقي الطرفي 5′ لفيروس شلل الأطفال ضروري في وضعية cis لعملية إضافة اليوريديل إلى بروتين VPg وبدء تخليق الحمض النووي الريبي ذي السلسلة السالبة. مجلة علم الفيروسات. 2001؛75(22):10696–708.
- ↑ بوروز جيه إن، براون إف. وجود بروتين مرتبط تساهميًا على الحمض النووي الريبي لفيروس كاليسي. مجلة علم الفيروسات العام. 1978؛41(2):443-446.
- ↑ فان دير ورف إس، برادلي جيه، ويمر إي، ستودير إف دبليو، دان جيه جيه. تخليق الحمض النووي الريبي لفيروس شلل الأطفال المعدي بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي T7 النقي. وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم. 1986؛83:2330-2334.
- ↑ فيتزجيرالد ك.د، سيملر ب.ل. ربط عناصر ires في mRNAs بجهاز الترجمة حقيقي النواة. بيوشيم بيوفيز أكتا. 2009؛1789(9-10):518–528.
- ↑ غودفيلو آي، تشودري واي، جيولداسي آي، جيروندوبولوس إيه، ناتوني إيه، لابري إل، لاليبيرت جيه إف، روبرتس إل. بدء ترجمة فيروس كاليسي يتطلب تفاعلاً بين vpg و eif 4 e. EMBO Rep. 2005؛6(10):968–972.
- البروتينات الفيروسية غير البنيوية
