XPB
XPB ( xeroderma pigmentosum type B) هو إنزيم فك الحمض النووي المعتمد على ATP في البشر وهو جزء من مركب عامل النسخ TFIIH .
بناء
تم تحديد البنية ثلاثية الأبعاد للنظير الأثري لـ XPB بواسطة علم البلورات بالأشعة السينية من قبل الدكتور جون تاينر ومجموعته في معهد سكريبس للأبحاث . [ 5 ]
وظيفة
يلعب بروتين XPB دورًا هامًا في النسخ الأساسي الطبيعي، وإصلاح الحمض النووي المقترن بالنسخ (TCR)، وإصلاح استئصال النيوكليوتيدات (NER). وقد ثبت أن بروتين XPB النقي يفكّ لولب الحمض النووي باتجاه 3'-5'.
تتمثل وظيفة بروتين XPB(ERCC3) في إصلاح الحمض النووي (NER) في المساعدة على فك اللولب المزدوج للحمض النووي بعد التعرف الأولي على التلف. يُعدّ إصلاح الحمض النووي مسارًا متعدد الخطوات يُزيل طيفًا واسعًا من أنواع تلف الحمض النووي المختلفة التي تُشوّه اقتران القواعد الطبيعية. تشمل هذه الأضرار نواتج الإضافة الكيميائية الضخمة، وثنائيات البيريميدين الناتجة عن الأشعة فوق البنفسجية، والعديد من أشكال التلف التأكسدي . يمكن أن تؤدي الطفرات في جين XPB(ERCC3) لدى البشر إلى الإصابة بجفاف الجلد المصطبغ (XP) أو جفاف الجلد المصطبغ المصحوب بمتلازمة كوكيين (XPCS). [ 6 ] خلايا XPB الطافرة لدى الأفراد المصابين بنمط XPCS الظاهري حساسة للأشعة فوق البنفسجية والإجهاد التأكسدي الحاد . [ 7 ]
يُعد إنزيم XPB helicase أيضًا أحد مكونات مسار موت الخلايا المبرمج ( الاستماتة ) الذي يتوسطه البروتين p53 . [ 8 ]
الاضطرابات
تؤدي الطفرات في XPB ومجموعات التكميل الأخرى ذات الصلة، XPA-XPG، إلى عدد من الاضطرابات الوراثية مثل جفاف الجلد المصطبغ ، ومتلازمة كوكيين ، وداء الشعر الكبريتي .
التفاعلات
وقد ثبت أن XPB يتفاعل مع:
مثبطات الجزيئات الصغيرة
أُبلغ مؤخراً عن استخدام منتجات طبيعية فعالة بيولوجياً، مثل التريبتوليد، التي تثبط عملية النسخ في الثدييات عن طريق تثبيط الوحدة الفرعية XPB لعامل النسخ العام TFIIH، كمركب جلوكوز لاستهداف الخلايا السرطانية ناقصة الأكسجين ذات التعبير المتزايد عن ناقلات الجلوكوز. [ 19 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000163161 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000024382 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ فان إل، أرفاي إيه إس، كوبر بي كيه، إيواي إس، هاناوكا إف، تاينر جيه إيه (أبريل 2006). "بنية XPB الأساسية المحفوظة والزخارف الخاصة بفك التفاف الحمض النووي: آثارها على اختيار مسار النسخ أو إصلاح الاستئصال" . الخلية الجزيئية . 22 (1): 27-37 . doi : 10.1016/j.molcel.2006.02.017 . PMID 16600867 .
- ↑ أوه كيه إس، خان إس جي، جاسبرز إن جي، رامز إيه، أويدا تي، ليمان إيه، فريدمان بي إس، إيمرت إس، غراتشيف إيه، لاكلان كيه، لوكاسان إيه، بيكر سي سي، كرامر كيه إتش (2006). "التغاير النمطي في جين إنزيم فك اللولب الحمض النووي XPB (ERCC3): جفاف الجلد المصطبغ مع وبدون متلازمة كوكيين" . الطفرات البشرية . 27 (11): 1092-103 . doi : 10.1002/humu.20392 . PMID 16947863. S2CID 22852219 .
- ↑ أندريسو، جي أو، ويدا، جي، دي ويت، جي، ميتشل، جي آر، بيمز، آر بي، فان ستيج، إتش، فان دير هورست، جي تي، هويجماكرز، جي إتش (2009). "نموذج فأر Xpb لمتلازمة جفاف الجلد المصطبغ ومتلازمة كوكيين يكشف عن سمات الشيخوخة المبكرة عند زيادة إضعاف إصلاح الحمض النووي" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 29 (5): 1276-1290 . doi : 10.1128/MCB.01229-08 . PMC 2643825. PMID 19114557 .
- ↑ وانغ إكس دبليو، فيرمولين دبليو، كورسين جيه دي، جيبسون إم، لوبولد إس إي، فورستر كيه، شو جي، إلمور إل، ييه إتش، هويجماكرز جيه إتش، هاريس سي سي (مايو 1996). "إن إنزيمات فك اللولب الحمض النووي XPB وXPD هي مكونات مسار موت الخلايا المبرمج بوساطة البروتين p53". جينز ديف . 10 (10): 1219-32 . doi : 10.1101/gad.10.10.1219 . hdl : 1765/3094 . PMID 8675009 .
- ↑ تاكيدا ن، شيبويا م، مارو ي (يناير 1999). "يتفاعل البروتين الورمي BCR-ABL مع بروتين المجموعة B لمرض جفاف الجلد المصطبغ" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 ( 1): 203-207 . Bibcode : 1999PNAS...96..203T . doi : 10.1073/pnas.96.1.203 . PMC 15117. PMID 9874796 .
- 1 2 3 4 5 6 Giglia-Mari G، Coin F، Ranish JA، Hoogstraten D، Theil A، Wijgers N، Jaspers NG، Raams A، Argentini M، van der Spek PJ، Botta E، Stefanini M، Egly JM، Aebersold R، Hoeijmakers JH، Vermeulen W (يوليو 2004). "وحدة فرعية عاشرة جديدة من TFIIH هي المسؤولة عن متلازمة إصلاح الحمض النووي مجموعة الحثل المشعري المجموعة A" . نات. جينيت . 36 (7): 714-9 . دوى : 10.1038 / ng1387 . بميد 15220921 .
- 1 2 روسينيول م، كولب-شينيل إ، إيغلي ج م (أبريل 1997). "تتغير خصوصية الركيزة لكيناز تنشيط cdk (CAK) عند ارتباطه بـ TFIIH" . مجلة EMBO . 16 (7): 1628-37 . doi : 10.1093/ emboj /16.7.1628 . PMC 1169767. PMID 9130708 .
- ↑ يي أ، نيكولز إم إيه، وو إل، هول إف إل، كوباياشي آر، شيونغ واي (ديسمبر 1995). "الاستنساخ الجزيئي لـ MAT1 البشري المرتبط بـ CDK7، وهو عامل تجميع كيناز مُنشِّط لكينازات السيكلين المعتمدة (CAK)". أبحاث السرطان . 55 (24): 6058-6062 . PMID 8521393 .
- مارينوني جيه سي ، روي آر، فيرمولين دبليو، مينيو بي، لوتز واي، ويدا جي، سيروز تي ، غوميز دي إم، هويجماكرز جيه إتش، إيغلي جيه إم (مارس 1997). "استنساخ وتوصيف البروتين p52، الوحدة الفرعية الخامسة من النواة الأساسية لعامل النسخ/إصلاح الحمض النووي TFIIH" . مجلة EMBO . 16 (5): 1093-102 . doi : 10.1093/emboj/16.5.1093 . PMC 1169708. PMID 9118947 .
- ↑ درابكين ر، ريردون جيه تي، أنصاري أ، هوانغ جيه سي، زاول إل، آهن ك، سانكار أ، رينبيرغ د (أبريل 1994). "الدور المزدوج لـ TFIIH في إصلاح استئصال الحمض النووي وفي النسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي II". نيتشر . 368 ( 6473): 769-772 . Bibcode : 1994Natur.368..769D . doi : 10.1038/368769a0 . PMID 8152490. S2CID 4363484 .
- ↑ آير ن، ريغان إم إس، وو كيه جيه، كاناجاراجا ب، فريدبيرغ إي سي (فبراير 1996). "التفاعلات التي تشمل معقد النسخ/إصلاح استئصال النيوكليوتيدات لبوليميراز الحمض النووي الريبي البشري II TFIIH، وبروتين إصلاح استئصال النيوكليوتيدات XPG، وبروتين متلازمة كوكيين من المجموعة ب (CSB)". الكيمياء الحيوية . 35 (7): 2157-2167 . doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
- ↑ وانغ إكس دبليو، ييه إتش، شيفر إل، روي آر، مونكولين في، إيغلي جيه إم، وانغ زد، فريدبيرغ إي سي، إيفانز إم كيه، تافي بي جي (يونيو 1995). "تعديل البروتين p53 لنشاط إصلاح استئصال النيوكليوتيدات المرتبط بعامل النسخ TFIIH" . نات . جينيت . 10 (2): 188-195 . doi : 10.1038/ng0695-188 . hdl : 1765/54884 . PMID 7663514. S2CID 38325851 .
- ↑ ويدا جي، روسينيول إم، فريزر آر إيه، وينكلر جي إس، فيرمولين دبليو، فان ت فير إل جيه ، ما إل، هويجماكرز جيه إتش، إيجلي جيه إم (يونيو 1997). "تتفاعل الوحدة الفرعية XPB لعامل الإصلاح/النسخ TFIIH مباشرةً مع SUG1، وهي وحدة فرعية من البروتيازوم 26S وعامل نسخ محتمل" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 25 (12): 2274-2283 . doi : 10.1093/nar/25.12.2274 . PMC 146752. PMID 9173976 .
- ↑ يوكوي م، ماسوتاني س، مايكاوا ت، سوغاساوا ك، أوكوما ي، هاناوكا ف (مارس 2000). "يلعب مُركّب البروتين XPC-HR23B من المجموعة C لمرض جفاف الجلد المصطبغ دورًا هامًا في استقطاب عامل النسخ IIH إلى الحمض النووي التالف" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 275 (13): 9870-9875 . doi : 10.1074/jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 .
- ↑ داتان إي، مين آي، بينغ إكس، هي كيو إل، آهن إتش، يو بي، بومبر إم جي، ليو جي أو (2020). "مركب جلوكوز-تريبتوليد يستهدف خلايا السرطان بشكل انتقائي في ظروف نقص الأكسجين" . iScience . 23 ( 9) 101536. Bibcode : 2020iSci...23j1536D . doi : 10.1016/j.isci.2020.101536 . PMC 7509213. PMID 33083765 .
للمزيد من القراءة
- جيانغ كيه تي (1998). "بروتين تات، والكيناز المرتبط ببروتين تات، والنسخ". مجلة العلوم الطبية الحيوية 5 (1): 24-27 . doi : 10.1007/BF02253352 . PMID 9570510 .
- يانكولوف ك، بنتلي د (1998). "التحكم النسخي: العوامل المساعدة لبروتين Tat واستطالة النسخ" . بيولوجيا حالية . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y . doi : 10.1016/ S0960-9822 (98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646 .
- كليفر جيه إي، طومسون إل إتش، ريتشاردسون إيه إس، ستيتس جيه سي (1999). "ملخص الطفرات في الاضطرابات الحساسة للأشعة فوق البنفسجية: جفاف الجلد المصطبغ، ومتلازمة كوكيين، وداء الشعر الكبريتي" . الطفرات البشرية . 14 (1): 9-22 . doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1 < 9::AID- HUMU2 > 3.0.CO ; 2-6 . PMID 10447254. S2CID 24148589 .
- ما إل، ويدا جي، جوشيمسن إيه جي، بوتسما دي، هويجماكرز جيه إتش، فان دير إب إيه جيه (1992). "التحليل الجزيئي والوظيفي لمُحفِّز XPBC/ERCC-3: يعتمد نشاط النسخ على سلامة موقع ارتباط Sp1" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 20 (2): 217-224 . doi : 10.1093 / nar/20.2.217 . PMC 310357. PMID 1741247 .
- Weeda G، Wiegant J، van der Ploeg M، Geurts van Kessel AH، van der Eb AJ، Hoeijmakers JH (1991). "توطين مجموعة جفاف الجلد المصطبغ B-تصحيح الجين ERCC3 إلى الكروموسوم البشري 2q21" . علم الجينوم . 10 (4): 1035–1040 . دوى : 10.1016/0888-7543(91)90195-K . اتش دي ال : 1765/3025 . بميد 1916809 .
- ويدا جي، ما إل بي، فان هام آر سي، فان دير إب إيه جيه، هويجمايكرز جيه إتش (1991). "بنية وتعبير جين XPBC/ERCC-3 البشري المتورط في اضطرابات إصلاح الحمض النووي، جفاف الجلد المصطبغ ومتلازمة كوكيين" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 19 (22): 6301-6308 . doi : 10.1093/nar/19.22.6301 . PMC 329143. PMID 1956789 .
- Weeda G، van Ham RC، Masurel R، Westerveld A، Odijk H، de Wit J، Bootsma D، van der Eb AJ، Hoeijmakers JH (1990). "الاستنساخ الجزيئي والتوصيف البيولوجي لجين إصلاح الختان البشري ERCC-3" . مول. خلية. بيول . 10 (6): 2570–2581 . دوى : 10.1128/MCB.10.6.2570 . بمك 360615 . بميد 2111438 .
- ويدا جي، فان هام آر سي، فيرميولين دبليو، بوتسما دي، فان دير إب إيه جيه، هويجماكرز جيه إتش (1990). "إن مروحية الحمض النووي المفترضة المشفرة بواسطة ERCC-3 متورطة في اضطرابات إصلاح الإنسان جفاف الجلد المصطبغ ومتلازمة كوكاين" . خلية . 62 (4): 777-91 . دوى : 10.1016/0092-8674(90)90122-U . اتش دي ال : 1765/3020 . بميد 2167179 . S2CID 31743602 .
- وانغ إكس دبليو، ويه إتش، وشيفر إل، وروي آر، ومونكولين في، وإيغلي جيه إم، ووانغ زد، وفريدبيرغ إي سي، وإيفانز إم كيه، وتافي بي جي (1995). "تعديل البروتين p53 لنشاط إصلاح استئصال النيوكليوتيدات المرتبط بعامل النسخ TFIIH" . مجلة علم الوراثة الطبيعية . 10 (2): 188-195 . doi : 10.1038/ng0695-188 . hdl : 1765/54884 . PMID: 7663514. S2CID : 38325851 .
- ماكسون، إم إي، وجودريتش، جيه إيه، وتجيان، آر (1994). "يرتبط عامل النسخ IIE بشكل تفضيلي بإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي IIa ويستقطب عامل النسخ TFIIH: نموذج لإزالة المحفز" . جينز ديف . 8 (5): 515-24 . doi : 10.1101/gad.8.5.515 . PMID 7926747 .
- ماروياما ك، سوغانو س (1994). "التغطية بالأوليغو: طريقة بسيطة لاستبدال بنية غطاء الحمض النووي الريبوزي الرسول حقيقي النواة بالأوليغوريبونوكليوتيدات". جين . 138 ( 1-2 ): 171-174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- درابكين ر، ريردون جيه تي، أنصاري أ، هوانغ جيه سي، زاول إل، آهن ك، سانكار أ، رينبيرغ د (1994). "الدور المزدوج لـ TFIIH في إصلاح استئصال الحمض النووي وفي النسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي II". نيتشر . 368 ( 6473): 769-772 . Bibcode : 1994Natur.368..769D . doi : 10.1038/368769a0 . PMID 8152490. S2CID 4363484 .
- فان فورين إيه جيه، فيرميولين دبليو، ما إل، ويدا جي، أبلدورن إي، جاسبرز إن جي، فان دير إب إيه جيه، بوتسما دي، هويج ميكرز جيه إتش، همبرت إس (1994). "تصحيح عيب إصلاح جفاف الجلد المصطبغ بواسطة عامل النسخ القاعدي BTF2 (TFIIH)" . إمبو جي . 13 (7): 1645–1653 . دوى : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06428.x . بمك 394995 . بميد 8157004 .
- Schaeffer L، Moncollin V، Roy R، Staub A، Mezzina M، Sarasin A، Weeda G، Hoeijmakers JH، Egly JM (1994). "يرتبط بروتين إصلاح ERCC2/DNA بعامل النسخ من الدرجة الثانية BTF2/TFIIH" . إمبو جي . 13 (10): 2388–2392 . دوى : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06522.x . بمك 395103 . بميد 8194528 .
- جوزدر إس إن، سونغ بي، بايلي في، براكاش إل، براكاش إس (1994). "RAD25 هو إنزيم فك لولب الحمض النووي DNA ضروري لإصلاح الحمض النووي DNA ونسخ بوليميراز الحمض النووي الريبي RNA II". مجلة نيتشر . 369 (6481): 578-81 . Bibcode : 1994Natur.369..578G . doi : 10.1038/369578a0 . PMID 8202161. S2CID 4332757 .
- Vermeulen W، Scott RJ، Rodgers S، Müller HJ، Cole J، Arlett CF، Kleijer WJ، Bootsma D، Hoeijmakers JH، Weeda G (1994). "عدم التجانس السريري داخل جفاف الجلد المصطبغ المرتبط بالطفرات في جين إصلاح الحمض النووي ونسخه ERCC3" . أكون. جي هوم. جينيت . 54 (2): 191- 200. بي إم سي 1918172 . بميد 8304337 .
- سكوت آر جيه، إيتين بي، كليجر دبليو جيه، كولب كيه، أرليت سي، مولر إتش (1993). "متلازمة جفاف الجلد المصطبغ - متلازمة كوكيين لدى مريضين: غياب أورام الجلد على الرغم من النقص الحاد في إصلاح استئصال الحمض النووي". مجلة الأكاديمية الأمريكية للأمراض الجلدية . 29 (5 الجزء 2): 883-889 . doi : 10.1016/0190-9622(93)70263-S . PMID 8408834 .
- بلاو جيه، شياو إتش، مكراكين إس، أوهير بي، غرينبلات جيه، بنتلي دي (1996). "ثلاث فئات وظيفية لنطاق تنشيط النسخ" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 16 (5): 2044-2055 . doi : 10.1128/MCB.16.5.2044 . PMC 231191. PMID 8628270 .
- آير ن، ريغان إم إس، وو كيه جيه، كاناجاراجا ب، فريدبيرغ إي سي (1996). "التفاعلات التي تشمل معقد النسخ/إصلاح استئصال النيوكليوتيدات لبوليميراز الحمض النووي الريبي البشري II TFIIH، وبروتين إصلاح استئصال النيوكليوتيدات XPG، وبروتين متلازمة كوكيين من المجموعة ب (CSB)". الكيمياء الحيوية . 35 (7): 2157-2167 . doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
- هوانج جي آر، مونكولين في، فيرميولين دبليو، سيروز تي، فان فورين إتش، هويج ميكرز جيه إتش، إيجلي جيه إم (1996). "عيب مروحية XPB 3' → 5' في عامل الإصلاح/النسخ TFIIH لمجموعة جفاف الجلد المصطبغ B يؤثر على كل من إصلاح الحمض النووي ونسخه" . جي بيول. الكيمياء . 271 (27): 15898–904 . دوى : 10.1074/jbc.271.27.15898 . اتش دي ال : 1765/3098 . بميد 8663148 .
روابط خارجية
- مقالة GeneReviews/NIH/NCBI/UW حول جفاف الجلد المصطبغ
- بروتين XPBC-ERCC-3+ في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 2
- EC 3.6.4
- تضاعف الحمض النووي
- الهيليكازات
