ARHGEF7
عامل تبادل النيوكليوتيدات الغوانينية Rho 7 هو بروتين يتم ترميزه في البشر بواسطة جين ARHGEF7 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
يُعرف ARHGEF7 باسم عامل تبادل بروتين كيناز p21 المنشط بيتا ( بيتا- PIX أو βPIX)، لأنه تم التعرف عليه من خلال ارتباطه بكيناز p21 المنشط (PAK) ويحتوي أيضًا على نطاق عامل تبادل نيوكليوتيدات الجوانين . [ 6 ]
المجالات والوظائف
βPIX هو بروتين متعدد المجالات يعمل كبروتين داعم للإشارات وكإنزيم . [ 9 ] يشترك βPIX في بنية المجال ووظيفة الإشارة هذه مع بروتين ARHGEF6/αPIX المشابه له للغاية .
يخضع بروتين βPIX لعملية تضفير بديلة واسعة النطاق لإنتاج بروتينات متعددة متغيرة تحتوي على نطاقات بروتينية معينة أو تفتقر إليها. [ 9 ] تفتقر جميع الأشكال البالغة إلى نطاق CH الطرفي الأميني، ويحتوي المتغيران الرئيسيان البالغان على منطقة طرفية كربوكسيلية بديلة (يُطلق عليهما β1 وβ2): تحتوي أشكال β1 على نطاق التجميع الثلاثي للملف اللولبي ونمط PDZ المستهدف للارتباط ببروتينات PDZ (انظر أدناه)، بينما تفتقر أشكال β2 إلى كلا النطاقين ووظائفهما المقابلة. [ 9 ]
يحتوي βPIX على نطاق RhoGEF مركزي من نوع DH/PH يعمل كعامل تبادل نيوكليوتيدات الغوانين (GEF) لبروتينات GTPases الصغيرة من عائلة Rho ، وتحديدًا Rac و Cdc42 . [ 6 ] ومثل عوامل تبادل نيوكليوتيدات الغوانين الأخرى، يُمكن لـ βPIX أن يُحفز إطلاق GDP من بروتين صغير غير نشط يرتبط بـ GTP، وارتباط GTP لتنشيطه. ترتبط هياكل الإشارات بشركاء محددين لتعزيز نقل الإشارات بكفاءة، وذلك من خلال ترتيب العناصر المتسلسلة للمسار بالقرب من بعضها لتسهيل التفاعل/نقل المعلومات، وأيضًا من خلال تثبيت مُركبات البروتينات الشريكة هذه في مواقع مُحددة داخل الخلية لتعزيز الإشارات الموضعية أو الإقليمية. في حالة βPIX، يرتبط نطاق SH3 الخاص به ببروتينات شريكة ذات أنماط متعددة البرولين مُناسبة، وخاصةً مع كينازات p21 المُنشطة من المجموعة الأولى (PAKs) ( PAK1 و PAK2 و PAK3 ). [ 6 ] يرتبط PAK بمجال βPIX SH3 في الحالة غير النشطة، ويحفز ارتباط Rac1 أو Cdc42 المنشط بهذا PAK نشاط كيناز البروتين الخاص به مما يؤدي إلى فسفرة البروتين المستهدف في اتجاه المصب ؛ نظرًا لأن βPIX يمكنه تنشيط GTPases الصغيرة "p21" Rac1 أو Cdc42 من خلال نشاط GEF الخاص به، فإن مركب βPIX/PAK/Rac هذا يجسد وظيفة السقالة.
بنيويًا، يتجمع بروتين βPIX على شكل ثلاثي الوحدات عبر نطاق حلزوني ملتف في الطرف الكربوكسيلي، وهو موجود في المتغير الرئيسي الناتج عن التضفير الطرفي الكربوكسيلي β1. ويتفاعل أيضًا مع ثنائيات GIT1 أو GIT2 عبر نطاق ارتباط GIT مجاور لتكوين معقدات GIT-PIX متعددة الوحدات. [ 9 ] من خلال هذا المعقد، تتعزز وظيفة βPIX كبروتين داعم، إذ يمكنه أيضًا تثبيت بروتينات GIT بالقرب من بعضها. في المقابل، تفتقر متغيرات الطرف الكربوكسيلي β2 إلى هذا النطاق الحلزوني الملتف، ومن المتوقع ألا تتمكن من تكوين ثلاثي الوحدات. يحتوي المتغير الرئيسي الناتج عن التضفير الطرفي الكربوكسيلي β1 أيضًا على وحدة ربط مستهدفة بنطاق PDZ ، والتي ترتبط بنطاقات PDZ في بروتينات SHANK1 ، [ 10 ] وscribble ، [ 11 ] و SNX27 . [ 12 ] تحتوي بعض المتغيرات الناتجة عن التضفير البديل لبروتين βPIX على نطاق تماثل الكالبونين (CH) في الطرف الأميني، والذي لا تزال وظائفه غير محددة بدقة، ولكنه قد يتفاعل مع بروتينات عائلة البارفين/الأفيكسين . [ 13 ] [ 9 ] وتكون متغيرات βPIX التي تحتوي على نطاق CH الممتد في الطرف الأميني أكثر تعبيرًا في المراحل المبكرة من النمو، ولكنها تبدو نادرة بعد الولادة. [ 9 ]
التفاعلات
أُفيد أن βPIX يتفاعل مع أكثر من 120 بروتينًا. [ 9 ] [ 14 ]
تشمل البروتينات المتفاعلة الرئيسية ما يلي:
- نفسه، أو ARHGEF6/αPIX المرتبط به ارتباطًا وثيقًا من خلال تفاعل حلزوني ثلاثي.
- ثنائيات GIT1 أو GIT2 عبر نطاق ربط GIT.
- الكينازات المنشطة بواسطة p21 (PAKs) 1 و 2 و 3 عبر نطاق SH3.
- c-Cbl عبر نطاق SH3.
- يتم تنشيط أعضاء عائلة بروتين ربط GTP من عائلة Rho، وهما Rac1 و Cdc42 ، عبر مجال DHPH RhoGEF .
- محولات المشابك العصبية SHANK1 و SHANK2 و SHANK3 عبر PDZ
- خربشة عبر PDZ
- SNX27 عبر PDZ
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000102606 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000031511 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ أوه دبليو كيه، يو جيه سي، جو دي، سونغ واي إتش، كيم إم جي، بارك دي (يوليو 1997). "استنساخ بروتين غني بالبرولين يحتوي على نطاق SH3، p85SPR، وتحديد موقعه في الالتصاق البؤري". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 235 (3): 794-798 . doi : 10.1006/bbrc.1997.6875 . PMID 9207241 .
- 1 2 3 4 مانسر إي، لو تي إتش، كوه سي جي، تشاو زد إس، تشين إكس كيو، تان إل، تان آي، ليونغ تي، ليم إل (يوليو 1998). "كينازات PAK مرتبطة مباشرة بعائلة PIX من عوامل تبادل النيوكليوتيدات" . الخلية الجزيئية . 1 (2): 183-192 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80019-2 . PMID 9659915 .
- ↑ باغروديا إس، تايلور إس جيه، جوردون كيه إيه، فان آيلست إل، سيريون آر إيه (أكتوبر 1998). "منظم جديد لكينازات p21 المنشطة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 273 (37): 23633-23636 . doi : 10.1074/jbc.273.37.23633 . PMID 9726964 .
- ↑ "Entrez Gene: ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 7" .
- 1 2 3 4 5 6 7 Zhou W, Li X, Premont RT (مايو 2016). "توسيع وظائف بروتينات GIT Arf GTPase المنشطة، وعوامل تبادل النيوكليوتيدات الغوانينية PIX Rho، ومركبات GIT-PIX" . مجلة علوم الخلية . 129 (10): 1963-1974 . doi : 10.1242/jcs.179465 . PMC 6518221. PMID 27182061 .
- ↑ بارك إي، نا إم، تشوي جيه، كيم إس، لي جيه آر، يون جيه، بارك دي، شينغ إم، كيم إي (2003). "تتفاعل عائلة بروتينات Shank من بروتينات الكثافة بعد المشبكية مع عامل تبادل النيوكليوتيدات الغوانينية بيتا PIX لـ Rac1 وCdc42 وتعزز تراكمه المشبكي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 (21): 19220-19229 . doi : 10.1074/jbc.M301052200 . PMID 12626503 .
- ^ أوديبيرت إس، نافارو سي، نوري سي، شاسيروت-غولاز إس، ليسين بي، بيلايشي واي، دوبونت جيه إل، بريمونت آر تي، سيمبر سي، ستروب جي إم، فان دورسيلير إيه، فيتالي إن، بورغ جي بي (يونيو 2004). "تشكل خربشة الثدييات مجمعًا محكمًا مع عامل التبادل betaPIX" . علم الأحياء الحالي . 14 (11): 987-995 . دوى : 10.1016/j.cub.2004.05.051 . بميد 15182672 .
- ↑ فالديس جيه إل، تانغ جيه، ماكديرموت إم آي، كو جيه سي، زيمرمان إس بي، وينكوفيتش إس إم، ووترمان سي إم، ميلغرام إس إل، بلايفورد إم بي (نوفمبر 2011). "ينظم بروتين فرز نيكسين 27 حركة معقد بروتين GIT (بروتين التفاعل مع عامل التبادل المتفاعل مع كيناز p21 المنشط (PAK)) عبر تفاعل نطاق PDZ" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 286 (45): 39403-39416 . doi : 10.1074/jbc.M111.260802 . PMC 3234764. PMID 21926430 .
- ↑ روزنبرغر جي، جانتكه آي، غال إيه، كوتشه كيه (2003). "يشير تفاعل ألفا بيكس (ARHGEF6) مع بيتا بارفين (PARVB) إلى تورط ألفا بيكس في الإشارات الخلوية التي تتوسطها الإنتغرينات" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 12 (2): 155-167 . doi : 10.1093/hmg/ddg019 . PMID 12499396 .
- ↑ "ملخص نتائج ARHGEF7" .
للمزيد من القراءة
- تيرنر، سي إي، براون، إم سي، بيروتا، جيه إيه، ريدى، إم سي، نيكولوبولوس، إس إن، ماكدونالد، إيه آر، باغروديا، إس، توماس، إس، ليفينثال، بي إس (1999). "يرتبط النمط LD4 لباكسيلين بـ PAK وPIX من خلال بروتين ARF-GAP جديد ذي تكرار أنكيرين بوزن 95 كيلو دالتون: دوره في إعادة تشكيل الهيكل الخلوي" . مجلة بيولوجيا الخلية . 145 (4): 851-863 . doi : 10.1083/jcb.145.4.851 . PMC 2133183. PMID 10330411 .
- باغروديا إس، بيلي دي، لينارد زد، هارت إم، غوان جيه إل، بريمونت آر تي، تايلور إس جيه، سيريون آر إيه (1999). "بروتين مُفسفر على التيروزين يرتبط بمنطقة تنظيمية مهمة في عائلة بروتينات ربط كيناز p21 المُنشط من عائلة كول" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 274 (32): 22393-22400 . doi : 10.1074/jbc.274.32.22393 . PMID 10428811 .
- بريمونت آر تي، كلاينغ إيه، فيتالي إن، بيري إس جيه، ليفكوفيتز آر جيه (2000). "عائلة GIT من البروتينات المنشطة لإنزيم GTPase لعامل ADP-ribosylation. التنوع الوظيفي لـ GIT2 من خلال التضفير البديل" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 275 (29): 22373-80 . doi : 10.1074/jbc.275.29.22373 . PMID 10896954 .
- كو جي إم، يابلونسكي دي، مانسر إي، ليم إل، فايس إيه (2001). "يتم تنشيط مُركّب PAK1-PIX-PKL بواسطة مُستقبل الخلية التائية بشكل مستقل عن Nck وSlp-76 وLAT" . مجلة EMBO . 20 (3): 457-465 . doi : 10.1093/emboj/20.3.457 . PMC 133476. PMID 11157752 .
- كوه سي جي، تان إي جيه، مانسر إي، ليم إل (2002). "يتم تنظيم كيناز PAK المنشط بواسطة p21 سلبًا بواسطة POPX1 وPOPX2، وهما زوج من فوسفاتازات السيرين/ثريونين من عائلة PP2C" . بيولوجيا حالية . 12 (4): 317-321 . doi : 10.1016/S0960-9822(02)00652-8 . PMID 11864573 .
- براون، إم سي، وويست، كيه إيه، وتيرنر، سي إي (2002). "تحديد موقع كيناز الباكسيلين المعتمد على الباكسيلين وكيناز p21 المنشط في الالتصاقات البؤرية يتضمن مسار تنشيط متعدد الخطوات" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 13 (5): 1550-1565 . doi : 10.1091/mbc.02-02-0015 . PMC 111126. PMID 12006652 .
- شين إي واي، شين كيه إس، لي سي إس، وو كيه إن، كوان إس إتش، سونغ إن كيه، كيم واي جي، تشا سي آي، كيم إس آر، بارك دي، بوكوش جي إم، كيم إي جي (2003). "يُعدّ فسفرة بروتين p85 بيتا PIX، وهو عامل تبادل نيوكليوتيدات الغوانين الخاص بـ Rac/Cdc42، عبر مسار Ras/ERK/PAK2 ضروريًا لنمو المحاور العصبية المُحفّز بعامل نمو الخلايا الليفية الأساسي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 277 (46): 44417-30 . doi : 10.1074/jbc.M203754200 . PMID 12226077 .
- روزنبرغر جي، جانتكه آي، غال إيه، كوتشه كيه (2003). "يشير تفاعل ألفا بيكس (ARHGEF6) مع بيتا بارفين (PARVB) إلى تورط ألفا بيكس في الإشارات الخلوية التي تتوسطها الإنتغرينات" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 12 (2): 155-167 . doi : 10.1093/hmg/ddg019 . PMID 12499396 .
- ميجنون إف، غريلو جي، ليوني إس، بيسول جي (2003). "التحديد الحاسوبي لإمكانية ترميز البروتين لعلامات التسلسل المحفوظة من خلال التحليل التطوري عبر الأنواع" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 31 (15): 4639-4645 . doi : 10.1093/nar/gkg483 . PMC 169873. PMID 12888525 .
- ياماموتو واي، فوجيموتو واي، أراي آر، فوجي إم، أوسامي إس، يامادا تي (2003). "استعادة تيلوميرات الكلوريلا بواسطة العناصر المتنقلة الرجعية: تراكم عناصر زيب المتنقلة الرجعية في نهايات الكروموسومات المصغرة المتكونة حديثًا" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 31 (15): 4646-53 . doi : 10.1093 / nar/gkg490 . PMC 169880. PMID 12888526 .
- فلاندرز، جيه. إيه.، فينغ، كيو.، باغروديا، إس.، لوكس، إم. تي.، سينغافارابو، إيه.، سيريون، آر. إيه. (2003). "بروتينات Cbl هي شركاء ارتباط لعائلة Cool/Pix من البروتينات المرتبطة بكيناز p21 المنشط". رسائل FEBS . 550 ( 1-3 ): 119-123 . doi : 10.1016/S0014-5793(03)00853-6 . PMID 12935897. S2CID 46540220 .
- شين إي واي، وو كي إن، لي سي إس، كو إس إتش، كيم واي جي، كيم دبليو جي، باي سي دي، تشانغ إس آي، كيم إي جي (2004). "يحفز عامل نمو الخلايا الليفية الأساسي تنشيط Rac1 عبر مسار يعتمد على فسفرة p85 betaPIX" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (3): 1994-2004 . doi : 10.1074/jbc.M307330200 . PMID 14557270 .
- ليم سي إس، كيم إس إتش، جونغ جي جي، كيم جي كي، سونغ دبليو كي (2004). "تنظيم فسفرة SPIN90 وتفاعله مع Nck بواسطة ERK والتصاق الخلايا" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 (52): 52116-23 . doi : 10.1074/jbc.M310974200 . PMID 14559906 .
روابط خارجية
- معلومات ARHGEF7 مع روابط في بوابة ترحيل الخلايا
- موقع جينوم ARHGEF7 البشري وصفحة تفاصيل جين ARHGEF7 في متصفح جينوم UCSC .
- موقع جينوم PAK3 البشري وصفحة تفاصيل جين PAK3 في متصفح جينوم UCSC .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 13
