نطاق SH3

📅 آخر تحديث: ٢٤ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٤ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يُعد نطاق التماثل SRC 3 ( أو نطاق SH3 ) نطاقًا بروتينيًا صغيرًا يتكون من حوالي 60 حمضًا أمينيًا . وُصف نطاق SH3 في البداية بأنه تسلسل محفوظ في البروتين المحول الفيروسي v-Crk. يوجد هذا النطاق أيضًا في جزيئات الفوسفوليباز والعديد من كينازات التيروسين السيتوبلازمية مثل Abl و Src . [ 1 ] [ 2 ] كما تم تحديده في العديد من عائلات البروتينات الأخرى مثل: كيناز PI3 ، وبروتين تنشيط GTPase الخاص بـ Ras ، و CDC24 و cdc25 . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] توجد نطاقات SH3 في بروتينات مسارات الإشارات التي تنظم الهيكل الخلوي ، وبروتين Ras ، وكيناز Src ، وغيرها الكثير. تتفاعل بروتينات SH3 مع البروتينات المحولة وكينازات التيروسين. عند تفاعلها مع كينازات التيروسين، ترتبط بروتينات SH3 عادةً بعيدًا عن الموقع النشط . يوجد ما يقارب 300 نطاق SH3 في البروتينات المشفرة في الجينوم البشري. إضافةً إلى ذلك، فإن نطاق SH3 مسؤول عن التحكم في تفاعلات البروتين-بروتين في مسارات نقل الإشارة [ 6 ] وتنظيم تفاعلات البروتينات المشاركة في الإشارات السيتوبلازمية. [ 7 ]

بناء

يتميز نطاق SH3 ببنية برميلية بيتا مميزة تتكون من خمسة أو ستة خيوط بيتا مرتبة على شكل صفيحتين بيتا متوازيتين عكسيًا ومتراصتين بإحكام . قد تحتوي مناطق الربط على حلزونات قصيرة. تُعد بنية SH3 بنية قديمة موجودة في حقيقيات النوى وبدائيات النوى على حد سواء. [ 8 ]

ارتباط الببتيد

يوجد نطاق SH3 الكلاسيكي عادةً في البروتينات التي تتفاعل مع بروتينات أخرى وتُساهم في تجميع مُركبات بروتينية مُحددة، وذلك عادةً عبر الارتباط بالببتيدات الغنية بالبرولين في البروتين المُرتبط بها. يقتصر وجود نطاقات SH3 الكلاسيكية في البشر على البروتينات داخل الخلايا، على الرغم من أن عائلة بروتينات MIA البشرية الصغيرة خارج الخلايا تحتوي أيضًا على نطاق ذي بنية شبيهة بنطاق SH3.

تحتوي العديد من الحواتم المرتبطة بـ SH3 في البروتينات على تسلسل توافقي يمكن تمثيله كتعبير منتظم أو نمط خطي قصير :

-XPpXP- 1 2 3 4 5

حيث يمثل الرقمان 1 و4 أحماضًا أمينية أليفاتية ، بينما يمثل الرقمان 2 و5 دائمًا، والرقم 3 أحيانًا، البرولين. يرتبط هذا التسلسل بالجيب الكاره للماء في نطاق SH3. وقد وُصفت مؤخرًا نطاقات SH3 التي ترتبط بنمط توافقي أساسي RxxK. ومن الأمثلة على ذلك نطاقات SH3 الطرفية C لبروتينات محولة مثل Grb2 وMona (المعروفة أيضًا باسم Gads وGrap2 وGrf40 وGrpL وغيرها). وقد ظهرت أنماط ارتباط أخرى بنطاق SH3، ولا تزال تظهر، في سياق دراسات جزيئية متنوعة، مما يُبرز تنوع هذا النطاق.

تفاعلات SH3

كشفت شبكات تفاعل البروتين-بروتين بوساطة نطاق SH3، أي ما يُعرف بشبكات تفاعل SH3، أن شبكة تفاعل SH3 في الديدان تُشابه شبكة الخميرة المماثلة، نظرًا لغناها الملحوظ بالبروتينات التي تؤدي أدوارًا في عملية الإدخال الخلوي. [ 9 ] [ 10 ] ومع ذلك، فإن التفاعلات المتماثلة بوساطة نطاق SH3 مُعاد تنظيمها بشكل كبير بين الديدان والخميرة. [ 9 ]

البروتينات التي تحتوي على نطاق SH3

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ باوسون تي، شليسنجرت جيه (يوليو 1993). "مجالات SH2 وSH3". علم الأحياء الحالي . 3 (7): 434-442 . doi : 10.1016/0960-9822(93)90350-W . PMID 15335710. S2CID 53273571 .  
  2. ↑ ماير، بي جيه (أبريل 2001). "مجالات SH3: التعقيد في الاعتدال". مجلة علوم الخلية . 114 (الجزء 7): 1253-1263 . doi : 10.1242/jcs.114.7.1253 . PMID 11256992 . 
  3. ↑ موساشيو أ، جيبسون ت، ليتو ف ب، ساراستي م (يوليو 1992). "SH3 - نطاق بروتيني وفير يبحث عن وظيفة". رسائل FEBS . 307 (1): 55-61 . doi : 10.1016/0014-5793(92)80901-R . PMID 1639195. S2CID 8564342 .  
  4. ↑ ماير بي جيه، بالتيمور دي (يناير 1993). "الإشارات عبر نطاقات SH2 وSH3". اتجاهات في بيولوجيا الخلية . 3 (1): 8-13 . doi : 10.1016/0962-8924(93)90194-6 . PMID 14731533 . 
  5. ↑ باوسون ، ت. (فبراير 1995). "وحدات البروتين وشبكات الإشارات". مجلة نيتشر . 373 (6515): 573-80 . doi : 10.1038/373573a0 . PMID 7531822. S2CID 4324726 .  
  6. ↑ شليسنجر ج (فبراير 1994). "بروتينات الإشارة SH2/SH3". الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 4 (1): 25-30 . doi : 10.1016/0959-437X(94)90087-6 . PMID 8193536 . 
  7. ↑ كوتش، سي. أ.، أندرسون، د.، موران، م. ف.، إليس، س.، باوسون، ت. (مايو 1991). "مجالات SH2 وSH3: عناصر تتحكم في تفاعلات بروتينات الإشارة السيتوبلازمية". مجلة ساينس . 252 (5006): 668-74 . doi : 10.1126/science.1708916 . PMID 1708916 . 
  8. ↑ ويستوك جيه سي، ليسك إيه إم (أبريل 1999). "مجالات SH3 في بدائيات النوى". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 24 (4): 132-133 . doi : 10.1016/s0968-0004(99)01366-3 . PMID 10322416 . 
  9. 1 2 شين، شياو فنغ؛ غفيلر، ديفيد؛ تشنغ جاكي. تونيكيان، رافي؛ صن، لين؛ قوه، ايلان. لوبيز، ليانيت؛ بافلينكو، أليفتينا؛ أكينتوبي ، أدينريل (2013/01/01). "يحافظ SH3 Interactome على الوظيفة العامة على شكل محدد" . بيولوجيا النظم الجزيئية . 9 : 652. دوى : 10.1038/msb.2013.9 . ردمك 1744-4292 . بمك 3658277 . بميد 23549480 .   
  10. ↑ تونيكيان، رافي؛ شين، شياوفينغ؛ توريه، كريستوفر ب.؛ جفيلر، ديفيد؛ لاندغراف، كريستيان؛ باني، سيمونا؛ باولوزي، سيرينا؛ كاستانيولي، لويزا؛ كوريل، بريدجيت (2009-10-01). "نمذجة بايزية لتفاعلات نطاق SH3 في الخميرة تتنبأ بالديناميكيات المكانية والزمانية لبروتينات الإدخال الخلوي" . PLOS Biology . 7 (10) e1000218. doi : 10.1371/journal.pbio.1000218 . ISSN 1545-7885 . PMC 2756588. PMID 19841731 .