ARMH3

في البشر، يمتد جين ARMH3، المعروف أيضاً بالاسم المستعار FLJ13114، على مسافة 210,577 زوجاً قاعدياً على الشريط العكسي للذراع الطويلة للكروموسوم 10. ^{[ 10 ]} وتشفر إكسوناته الـ 26 المتغيرة بالتضفير البديل 5 متغيرات نسخ محتملة ، أكبرها يبلغ طوله 4101 زوجاً قاعدياً. ^{[ 10 ]}

يُحاط موقع ARMH3 البشري من الجانبين الأيسر والأيمن ببروتين HPS6 وبروتين KCNIP2 على التوالي. ^{[ 5 ]} يُعدّ HPS6 بروتينًا قد يلعب دورًا في تكوين العضيات، ^{[ 12 ]} بينما يُعدّ KCNIP2 بروتينًا يتفاعل مع قنوات البوتاسيوم ذات البوابات الفولتية. ^{[ 13 ]} ويُلاحظ النمط نفسه في الموقع المتماثل في الفئران، ^{[ 14 ]} وكذلك في معظم الفقاريات الأخرى.

يُشير ملف تعريف الجين c10orf76 في قاعدة بيانات NCBI (GenBank) إلى بداية الإكسون الأول المُستنسخ كبداية للجين. ^{[ 5 ]} يبدأ المُحفِّز الأساسي المُتوقع بواسطة أداة El Dorado من Genomatix على بُعد 519 زوجًا قاعديًا قبل موقع بدء النسخ هذا. ^{[ 15 ]} يُتوقع أن يبلغ طول هذا المُحفِّز 658 زوجًا قاعديًا، وبالتالي يشمل الإكسون الأول المُستنسخ عند طرفه 3' . ^{[ 5 ]}

يُعتقد أن موقع c10orf76 يخضع لعملية تضفير بديلة إلى خمسة أشكال متغايرة فريدة على الأقل ، على الرغم من أن كيفية تنظيم هذا التضفير غير واضحة. ^{[ 5 ]} من المرجح أن مُحفِّزًا ثانيًا محتملاً، تم التنبؤ به أيضًا بواسطة برنامج El Dorado، يُحفِّز التعبير عن أحد المتغيرات الأقصر الموثقة (الموجودة قبل الإكسون 23). ^{[ 10 ] [ 15 ]}

يبلغ طول أكبر متغير بروتيني 689 حمضًا أمينيًا . ^{[ 5 ]} تبلغ كتلته الجزيئية حوالي 78.7 كيلو دالتون ، وهو متساوي الكهربائية عند درجة حموضة 6.13. ^{[ 16 ]} قد يُفرز عبر مسار غير تقليدي . ^{[ 17 ]} حدد المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) نطاقًا بروتينيًا ذا وظيفة غير معروفة بين الحمضين الأمينيين أسبارتات 435 وليوسين 671 ، يُعرف باسم DUF1741 ( نطاق الوظيفة غير المعروفة 1741). ^{[ 5 ]} لا يُعرف وجود هذا النطاق في أي بروتينات أخرى. ^{[ 7 ]}

تنبأ برنامج Dotlet من ExPASy بوجود منطقة حلقة جذعية محتملة عند الطرف 3' للإكسون الأول (وبالتالي، نهاية المحفز). ^{[ 18 ]} قد تُسهم هذه المنطقة في تنظيم ترجمة البروتين . ^{[ 19 ]} كما أن قطعة Alu في المنطقة غير المترجمة 3' من mRNA الناضج قد تُشكل آلية تنظيمية محتملة للترجمة. ^{[ 20 ]}

وُجد أن هذا البروتين يُعبَّر عنه بشكلٍ مختلف في بعض الحالات الطبية واستجابةً لإشارات خلوية معينة. على سبيل المثال، لوحظ انخفاض في التعبير عن جين c10orf76 لدى مرضى ابيضاض الدم الليمفاوي المزمن من الخلايا البائية. ^{[ 21 ]} كما لوحظ انخفاض في التعبير عنه في الخلايا المعالجة بعامل نمو بطانة الأوعية الدموية . ^{[ 22 ]}

يُعتقد أن البروتين يتمركز في السيتوبلازم، ^{[ 23 ]} على الرغم من أن هذا الأمر غير مؤكد. كما تم التنبؤ بأنه بروتين غشائي ثلاثي المرور. ^{[ 16 ]} بالإضافة إلى ذلك، تم تحديد إشارة فرز ميتوكوندرية في بداية أحد أشكال البروتين باستخدام MitoProt II (تقع عند الميثيونين 416 لأكبر شكل بروتيني). ^{[ 24 ]}

لم تُدرس بنية بروتين c10orf76 تجريبيًا. يُتوقع أن تكون بنيته الثانوية حلزونية بالكامل ، مع وجود مناطق فاصلة غير منتظمة. ^{[ 26 ] [ 27 ]} يقع نطاق الارتباط المحتمل بـ SH3 في منطقة غير منتظمة متوقعة، مما يدعم وظيفة ارتباط البروتين ببروتين c10orf76. وقد تم التنبؤ بأن المنطقة الحلزونية بين الأحماض الأمينية 610-655 هي نمط حلزوني ملتف . ^{[ 28 ]}

أشارت تنبؤات بنية البروتين باستخدام برنامج Phyre 2 [ ^{29 ] إلى} أن أول 200 حمض أميني من c10orf76 قد تشترك في أوجه تشابه هيكلية قوية مع Symplekin ^{[ 26 ]} ، وهو بروتين متمركز في النواة يُعتقد أنه مكون هيكلي لمركب البولي أدينيل . ^{[ 25 ]}

وُجد أن التعبير عن mRNA الخاص بـ c10orf76 يرتبط عكسيًا بالتعبير عن العديد من mRNAs الأخرى، بما في ذلك NFYB و CCR5 و NSBP1 . ^{[ 6 ]} على الرغم من أن هذه الدراسة ونطاق الارتباط SH3 المتوقع يشيران إلى أن c10orf76 يشارك في تفاعلات ارتباط البروتين-بروتين، إلا أنه لم يتم التحقق من أي منها تجريبيًا. كما أن بحثًا سريعًا باستخدام IntAct ^{[ 30 ]} وMINT ^{[ 31 ]} و STRING ^{[ 32 ]} لم يُسفر عن أي تفاعلات بروتين-بروتين متوقعة.

يُحتمل أن يُفرز البروتين عبر مسار غير تقليدي، ^{[ 17 ]} وهو ما قد يُفسر وظيفة بعض التعديلات اللاحقة للترجمة. توجد عشرة مواقع فسفرة محتملة محفوظة ضمن تسلسل البروتين. ^{[ 33 ]} كما توجد تسعة بقايا يُتوقع، بثقة تزيد عن 90%، أن تخضع لعملية الغلكزة المرتبطة بالأكسجين ( O-linked glycosylation ) وفقًا لبرنامج NetOGlyc ^{[ 34 ]} ، وتقع جميعها ضمن المنطقة ذات التعقيد المنخفض بين الليوسين 325 والسيرين 359.

يشفر البروتين المُشفَّر بواسطة أكبر نسخة mRNA من الجين c10orf76 وحدة غنية بالبرولين تحتوي على نطاقين PxxP، حيث يُمثل "P" بقايا البرولين ، بينما يُمثل "x" أي حمض أميني آخر ^{[ 5 ]} (مُظلل باللون الأزرق أدناه). وقد ثبت أن هذين النطاقين يُشاركان في تفاعلات ارتباط البروتين-بروتين، وتحديدًا عبر نطاق ارتباط البروتين SH3 . ^{[ 8 ]} يقع نطاق ارتباط SH3 المُحتمل ضمن منطقة ذات تعقيد منخفض، تحتوي على عدد كبير بشكل غير عادي من الأحماض الأمينية ذات المجموعات الجانبية المحتوية على الأكسجين (مُظلل باللون الأخضر أدناه). يُشير تحليل NetOGlyc ^{[ 34 ]} لهذه المنطقة إلى أن هذه البقايا من المُحتمل أن تخضع لعملية الغلكزة المرتبطة بالأكسجين، وبالتالي قد تُساهم في تنظيم الارتباط بنطاق ارتباط SH3 المُحتمل. ^{[ 35 ]}

<code="text"> 325 LV TT P V S P A P T T P V T PLG TT PP S S 359

تم تحديد عنصر Alu في منطقة 3`-UTR لأطول نسخة mRNA ^{[ 5 ].} من غير الواضح ما إذا كان لهذا التسلسل أي غرض وظيفي أو تنظيمي، ولكن هناك أدلة موجودة على تنظيم ترجمة البروتين بواسطة Alu، لذلك لا يمكن استبعاد ذلك في c10orf76. ^{[ 20 ]}

تم التنبؤ، باستخدام أداة MitoProt II، بوجود إشارة فرز ميتوكوندرية في الطرف الأميني ( N-terminus ) لنسخة قصيرة (الإكسونات 17-26) بنسبة ثقة 96%. ^{[ 24 ]} ولا يزال من غير الواضح ما إذا كانت هذه النسخة فريدة من نوعها أم أنها ناتجة عن انقسام البروتين كامل الحجم. ولا توجد محفزات بديلة متوقعة تقع قبل الإكسون الأول لهذه النسخة. ^{[ 15 ]}