التوطين الخلوي الفرعي

تُقسّم خلايا الكائنات حقيقية النواة بدقة إلى حجيرات غشائية متميزة وظيفيًا. ومن المكونات الرئيسية للخلايا حقيقية النواة: الحيز خارج الخلوي ، والغشاء البلازمي ، والسيتوبلازم ، والنواة ، والميتوكوندريا ، وجهاز جولجي ، والشبكة الإندوبلازمية ، والبيروكسيسوم ، والفجوات ، والهيكل الخلوي ، والبلازما النووية ، والنوية ، والمادة النووية ، والريبوسومات .

تمتلك البكتيريا أيضًا مواقع داخلية يمكن فصلها عند تجزئة الخلية. تشمل المواقع الأكثر شيوعًا السيتوبلازم ، والغشاء السيتوبلازمي (المعروف أيضًا بالغشاء الداخلي في البكتيريا سالبة الغرام )، وجدار الخلية (الذي يكون عادةً أكثر سمكًا في البكتيريا موجبة الغرام )، والبيئة خارج الخلوية . يُعد السيتوبلازم والغشاء السيتوبلازمي وجدار الخلية مواقع داخلية، بينما البيئة خارج الخلوية ليست كذلك. تحتوي معظم البكتيريا سالبة الغرام أيضًا على غشاء خارجي وحيز حول البلازم . على عكس حقيقيات النوى، لا تحتوي معظم البكتيريا على عضيات محاطة بغشاء، إلا أن هناك بعض الاستثناءات (مثل المغنيتوسومات ). ^{[ 1 ]}

يمكن العثور على المواقع الخلوية الفرعية للبروتينات التي تم تحديدها تجريبياً في UniProtKB و Compartments وفي عدد قليل من الموارد المتخصصة الأخرى، مثل قاعدة بيانات إفرازات بكتيريا حمض اللاكتيك .

توجد أيضًا العديد من قواعد بيانات المواقع الخلوية الفرعية مع تنبؤات حسابية ، مثل قاعدة بيانات البروتينات الخلوية الفرعية للفطريات - الإصدار 2 ( FunSecKB2 )، وقاعدة بيانات البروتينات الخلوية الفرعية للنباتات (PlantSecKB)، و MetazSecKB (PlantSecKB) لمواقع البروتينات الخلوية الفرعية للإنسان والحيوانات، و ProtSecKB لمواقع البروتينات الخلوية الفرعية لجميع الطلائعيات.

برنامج Proteome Analyst هو خادم ويب ومجموعة أدوات متاحة مجاناً للتنبؤ بموقع البروتين داخل الخلية. ^{[ 2 ]}

• استهداف البروتين
• التنبؤ بموقع البروتين داخل الخلية .