مجال ARID
في علم الأحياء الجزيئي ، يُعد نطاق ARID (نطاق التفاعل الغني بالأدينين والثايمين؛ المعروف أيضًا باسم نطاق BRIGHT (منظم نسخ السلسلة الثقيلة للغلوبولين المناعي في الخلايا البائية) [ 1 ] ) [ 2 ] نطاقًا بروتينيًا يرتبط بالحمض النووي . توجد البروتينات الحاوية على نطاق ARID في الفطريات والنباتات [ 3 ] والحيوانات متعددة الخلايا اللافقارية والفقارية . تشارك الجينات المشفرة لنطاق ARID في مجموعة متنوعة من العمليات البيولوجية، بما في ذلك التطور الجنيني، وتنظيم جينات سلالة الخلايا ، والتحكم في دورة الخلية . على الرغم من أن الأدوار المحددة لهذا النطاق والبروتينات الحاوية على نطاق ARID في تنظيم النسخ لم تُحدد بعد، إلا أنها تشمل كلاً من التنظيم الإيجابي والسلبي للنسخ ، ومن المحتمل أن يكون لها دور في تعديل بنية الكروماتين . [ 4 ] يبدو أن البنية الأساسية لنطاق ARID عبارة عن سلسلة من ستة حلزونات ألفا تفصل بينها خيوط بيتا أو حلقات أو انحناءات، ولكن قد تمتد المنطقة المنظمة إلى حلزون إضافي عند أحد طرفي الحلزونات الستة الأساسية أو كليهما. وبناءً على تشابه التسلسل الأولي ، يمكن تقسيمها إلى ثلاث فئات هيكلية : بروتينات ARID الدنيا التي تتكون من نطاق أساسي يتألف من ستة حلزونات ألفا؛ وبروتينات ARID التي تُكمل النطاق الأساسي بحلزون ألفا في الطرف الأميني؛ وبروتينات ARID الممتدة، التي تحتوي على النطاق الأساسي وحلزونات ألفا إضافية في طرفيها الأميني والكربوكسيلي.
يُعدّ بروتين ARID1A، وهو أحد بروتينات مُركّب SWI-SNF البشري، عضوًا في عائلة ARID، ويتميز بنشاط ارتباط غير مُحدد التسلسل بالحمض النووي . يتشابه تسلسل ARID المُتفق عليه، بالإضافة إلى سمات بنيوية أخرى، بين ARID1A وبروتين SWI1 في الخميرة ، مما يُشير إلى أن ARID1A هو النظير البشري لـ SWI1. [ 5 ] يتواجد تسلسل ARID، الذي يبلغ طوله حوالي 100 حمض أميني، في سلسلة من البروتينات التي لها دورٌ هام في تنظيم نمو الخلايا وتطورها والتعبير الجيني الخاص بالأنسجة . على الرغم من إمكانية تحديد حوالي اثني عشر بروتينًا من بروتينات ARID من خلال البحث في قواعد البيانات، إلا أنه حتى الآن، لم يتم تحليل سوى بروتينات Bright (منظم التعبير الجيني الخاص بالخلايا البائية )، وdead ringer ( منتج جيني من ذبابة الفاكهة Drosophila melanogaster ضروري للنمو الطبيعي)، وMRF-2 (الذي يُثبّط التعبير من مُحسِّن الفيروس المضخم للخلايا ) بشكل مباشر فيما يتعلق بخصائص ارتباطها بالحمض النووي. يرتبط كل منها بشكل تفضيلي بالمواقع الغنية بالأدينين والثايمين. في المقابل، لا يُظهر ARID1A أي تفضيل لتسلسل معين في نشاط ارتباطه بالحمض النووي، مما يدل على أن الارتباط الغني بالأدينين والثايمين ليس خاصية جوهرية لمجالات ARID ، وأن بروتينات عائلة ARID قد تشارك في نطاق أوسع من تفاعلات الحمض النووي. [ 5 ]
مراجع
- ↑ ويب سي إف، سميث إي إيه، ميدينا كي إل، بوكانان كي إل، سميثسون جي، دو إس (15 مايو 1998). "تعبير بروتين برايت في مرحلتين متميزتين من تطور الخلايا الليمفاوية البائية" . مجلة علم المناعة . 160 (10): 4747-4754 . PMID 9590220. تاريخ الاسترجاع: 15 يوليو 2020 .
- ↑ هيرشر آر إف، كابلان إم إتش، ليلز دي إل، داس سي، شويرمان آر، تاكر بي دبليو (1995). "ترتبط المناطق المرتبطة بالمصفوفة للسلسلة الثقيلة للغلوبولين المناعي ببروتين برايت: وهو منشط نسخ خاص بالخلايا البائية يصف عائلة جديدة من البروتينات الرابطة للحمض النووي" . جينز ديف . 9 (24): 3067-82 . doi : 10.1101/gad.9.24.3067 . PMID 8543152 .
- ↑ Zheng B, He H, Zheng Y, Wu W, McCormick S (2014) بروتين يحتوي على نطاق ARID داخل الأجسام النووية ضروري لتكوين الخلايا المنوية في نبات رشاد أذن الفأر (Arabidopsis thaliana). PLoS Genet 10(7): e1004421. doi: 10.1371/journal.pgen.1004421
- ↑ كورتشاك، آر. دي.، تاكر، بي. دبليو.، سانت، آر. (يونيو 2000). "بروتينات ARID تأتي من الصحراء". تريندز بيوكيم. ساينس . 25 (6): 294-299 . doi : 10.1016/S0968-0004(00)01597-8 . PMID 10838570 .
- 1 2 دالاس، ب.ب.، باتشيوني، س.، ويلسكر، د.، بورين، ف.، كوباياشي، ر.، موران، إ. (مايو 2000). "بروتين p270، وهو بروتين معقد SWI-SNF البشري، ينتمي إلى عائلة ARID وله نشاط ارتباط غير محدد بتسلسل الحمض النووي" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 20 (9): 3137-46 . doi : 10.1128/MCB.20.9.3137-3146.2000 . PMC 85608. PMID 10757798 .
- نطاقات البروتين
