أليكس بيتمان

ألكسندر جورج بيتمان عالم أحياء حاسوبية ورئيس قسم موارد تسلسل البروتين في المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية (EBI) ، التابع للمختبر الأوروبي للبيولوجيا الجزيئية (EMBL) في كامبريدج، المملكة المتحدة. [ 9 ] [ 11 ] قاد تطوير قاعدة بيانات Pfam البيولوجية [ 12 ] وقدّم قاعدة بيانات Rfam لعائلات الحمض النووي الريبي (RNA ). كما شارك في استخدام ويكيبيديا لشرح قواعد البيانات البيولوجية بشكل جماعي. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]

تعليم

حصل باتمان على درجة البكالوريوس في الكيمياء الحيوية من جامعة نيوكاسل عام ١٩٩٤. ونال درجة الدكتوراه من جامعة كامبريدج عام ١٩٩٧، عن بحثٍ أشرف عليه سايروس تشوثيا في مختبر البيولوجيا الجزيئية التابع لمجلس البحوث الطبية [ ١٨ ] [ ١٩ ] [ ٢٠ ] حول تطور عائلة البروتينات المناعية الفائقة . [ ٢١ ] [ ٢٢ ] وخلال هذه الفترة، عمل أيضًا مع شون إيدي لاكتشاف نطاقات بروتينية جديدة باستخدام برنامج HMMER . [ ٢٣ ]

المسار الوظيفي والبحث

في عام ١٩٩٧، انضم باتمان إلى معهد ويلكوم ترست سانجر ليقود تطوير قاعدة بيانات Pfam البيولوجية. وفي عام ٢٠٠٣، أطلق قاعدة بيانات Rfam لعائلات الحمض النووي الريبوزي (RNA). [ ٦ ] [ ٢٣ ] كما شارك في تقديم تحليلات البروتينات لنشر مشروع الجينوم البشري. [ ٢٣ ] [ ٢٤ ]

اعتبارًا من عام 2012، شغل منصب رئيس قسم موارد تسلسل البروتين في EMBL-EBI. [ 25 ]

كما شارك باتمان في تعزيز استخدام ويكيبيديا داخل المجتمع العلمي [ 26 ] وعلى وجه الخصوص، في إضافة التعليقات التوضيحية لقواعد البيانات البيولوجية من خلال ويكيبيديا، على سبيل المثال، إضافة التعليقات التوضيحية لقاعدة بيانات Rfam من خلال مشروع ويكي RNA . [ 27 ]

شغل باتمان منصب رئيس تحرير مجلة المعلوماتية الحيوية من عام 2004 إلى عام 2012، كما شغل منصب محرر في مجلات أبحاث الأحماض النووية ، وعلم الأحياء الجينومي ، والبروتوكولات الحالية في المعلوماتية الحيوية . [ 2 ] [ 3 ] وفي عام 2014، عُيّن أحد أوائل المحررين الفخريين لمجلة المعلوماتية الحيوية . [ 28 ] ومنذ عام 2015، يشغل باتمان أيضًا عضوية مجلس إدارة الجمعية الدولية لعلم الأحياء الخلوية والجزيئية (ISCB). [ 29 ]

الجوائز والتكريمات

حصل باتمان على جائزة بنجامين فرانكلين في المعلوماتية الحيوية لعام 2010. [ 30 ] [ 31 ] وأصبح ثالث عضو سابق في مختبر ريتشارد دوربين يفوز بهذه الجائزة، بعد شون إيدي وإيوان بيرني . [ 30 ] [ 10 ] وانتُخب باتمان زميلًا في الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB ) عام 2017. [ 8 ] [ 32 ]

أليكس بيتمان (يسار) وسيروس تشوثيا (يمين)، في مؤتمر ISMB في دبلن عام 2015

مراجع

  1. أليكس بيتمان في مكتبة الكونغرس
  2. 1 2 "أليكس بيتمان: كبير قادة فريق موارد تسلسل البروتين وقائد مجموعة بيتمان البحثية" . Uniprot.org. مؤرشف من الأصل في 16 مارس 2015.
  3. 1 2 "أليكس بيتمان بابلونز" . Publons.com. مؤرشف من الأصل في 16 مارس 2015.
  4. باتمان، أ .؛ كوين، ل.؛ دوربين، ر .؛ فين، ر.د.؛ هوليتش، ف.؛ غريفيثس-جونز، س.؛ خانا، أ.؛ مارشال، م.؛ موكسون، س.؛ سونهمر، إ.ل.؛ ستودولم، د.ج.؛ ييتس، س.؛ إيدي، س.ر. (2004). "قاعدة بيانات عائلات بروتينات Pfam" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 32 (عدد قواعد البيانات): 138D–1141. doi : 10.1093 / nar/gkh121 . ISSN 0305-1048 . PMC 308855. PMID 14681378 .   أيقونة الوصول المفتوح
  5. ساموت، إس جيه؛ فين، آر دي؛ بيتمان، إيه (2008). "مشروع Pfam بعد عشر سنوات: 10000 عائلة وما زال العدد في ازدياد" . موجزات في المعلوماتية الحيوية . 9 (3): 210-219 . doi : 10.1093/bib/bbn010 . PMID 18344544 . 
  6. 1 2 غريفيثس-جونز، إس؛ بيتمان، أ؛ مارشال، م؛ خانا، أ؛ إيدي، إس آر (2003). "Rfam: قاعدة بيانات لعائلات الحمض النووي الريبوزي" . أبحاث الأحماض النووية . 31 (1): 439-441 . doi : 10.1093 / nar/gkg006 . PMC 165453. PMID 12520045 .  
  7. غريفيثس-جونز، إس؛ غروكوك، آر جيه؛ فان دونجن، إس؛ بيتمان، إيه؛ إنرايت، إيه جيه (2006). "MiRBase: تسلسلات الحمض النووي الريبوزي الميكروي، والأهداف، وتسمية الجينات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (عدد قواعد البيانات): D140-4. doi : 10.1093/nar/ gkj112 . PMC 1347474. PMID 16381832 .  
  8. 1 2 مجهول (2017). "زملاء الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي" . iscb.org . الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي . مؤرشف من الأصل في 20 مارس 2017.
  9. 1 2 منشورات أليكس بيتمان المفهرسة بواسطة جوجل سكولار
  10. 1 2 تشاكراهار، شرادها (2012). "هينغ لي ينسب الفضل إلى نسب دوربين في قبول جائزة فرانكلين" . bio-itworld.com. مؤرشف من الأصل في 30 مارس 2013.
  11. أليكس بيتمان على خادم ببليوغرافيا DBLP
  12. فين، آر دي؛ ميستري، جيه؛ شوستر-بوكلر، بي؛ غريفيثس-جونز، إس؛ هوليتش، في؛ لاسمان، تي؛ موكسون، إس؛ مارشال، إم؛ خانا، إيه؛ دوربين، آر؛ إيدي، إس آر؛ سونهمر، إي إل؛ بيتمان، إيه. (يناير 2006). "Pfam: العشائر، أدوات وخدمات الويب" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (عدد قواعد البيانات): D247– D251. doi : 10.1093/nar/gkj149 . ISSN 0305-1048 . PMC 1347511. PMID 16381856 .   
  13. لوغان، د. و.؛ ساندال، م.؛ غاردنر، ب. ب.؛ مانسكي، مبيتمان، أ. (2010). "عشر قواعد بسيطة لتحرير ويكيبيديا" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 6 (9) e1000941. رمز Bibcode : 2010PLSCB...6E0941L . doi : 10.1371/journal.pcbi.1000941 . PMC 2947980. PMID 20941386 .  أيقونة الوصول المفتوح
  14. "مجموعة باتمان < ​​بحث < EMBL-EBI" . المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية. مؤرشف من الأصل في 1 أكتوبر 2013.
  15. منشورات أليكس بيتمان من قاعدة بيانات PubMed Central الأوروبية
  16. منشورات أليكس بيتمان مفهرسة في قاعدة بيانات سكوبس الببليوغرافية. (الاشتراك مطلوب)
  17. بيرج، س.؛ أتوود، ت.كباتمان، أ .؛ بيرارديني، ت.ز.؛ تشيري، م.؛ أودونوفان، س.؛ زيناريوس، ل.؛ غوديت، ب. (2012). " منسقو البيانات الحيوية والتنسيق الحيوي: استعراض تحديات القرن الحادي والعشرين" . قاعدة البيانات . 2012 bar059. doi : 10.1093/database/bar059 . PMC 3308150. PMID 22434828 .  
  18. "القيم العائلية - الناس - إمبو" . 8 يونيو 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 يوليو 2023 .
  19. باتمان، أ ؛ إيدي، إس آر ؛ تشوثيا، سي (1996). " أفراد عائلة الغلوبولين المناعي الفائقة في البكتيريا" . علم البروتين . 5 (9): 1939-1941 . doi : 10.1002/pro.5560050923 . PMC 2143528. PMID 8880921 .  
  20. باتمان، أ؛ جويه، م؛ ماكفارلين، ج؛ دو، ج.س؛ كينويك، س؛ تشوثيا، س (1996). "البنية العامة لجزيء الالتصاق الخلوي L1 البشري والمواقع التي تسبب فيها الطفرات اضطرابات عصبية" . مجلة EMBO . 15 (22): 6050-9 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00993.x . PMC 452426. PMID 8947027 .  
  21. باتمان، ألكسندر جورج (1997). تطور بنية ووظيفة عائلة الغلوبولين المناعي الفائقة . ethos.bl.uk (أطروحة دكتوراه). جامعة كامبريدج. OCLC 879391333 . 
  22. باتمان، أ ؛ مورزين، أ.ج؛ تايخمان، س.أ (1998). "بنية وتوزيع تكرارات الببتيد الخماسي في البكتيريا" . علم البروتين . 7 (6): 1477-1480 . doi : 10.1002/pro.5560070625 . PMC 2144021. PMID 9655353 .  
  23. ١ ٢ ٣ "صفحة الأرشيف: د. أليكس بيتمان - معهد ويلكوم ترست سانجر" . معهد ويلكوم ترست سانجر. مؤرشف من الأصل بتاريخ ١٣ أكتوبر ٢٠١٤.
  24. لاندر، إريك س. وآخرون (15 فبراير 2001). "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 409 (6822): 860-921 . doi : 10.1038/35057062 . hdl : 2027.42/62798 . PMID 11237011 .  
  25. "أليكس بيتمان < ​​الأشخاص والمجموعات < نبذة عنا < EMBL-EBI" . EBI. مؤرشف من الأصل في 1 أكتوبر 2013.
  26. باتمان، أليكس (2012). "لماذا ينبغي على العلماء النشر على ويكيبيديا" . وايرد المملكة المتحدة . مؤرشف من الأصل في 9 يوليو 2012.
  27. داوب، ج.؛ غاردنر، ب.ب.؛ تيت، ج.؛ رامسكولد، د.؛ مانسكي، م .؛ سكوت، و.ج.؛ واينبرغ، ز.؛ غريفيثس-جونز، س.؛ بيتمان، أ. (2008). "مشروع ويكي الحمض النووي الريبي: شرح مجتمعي لعائلات الحمض النووي الريبي" . الحمض النووي الريبي . 14 (12): 2462-2464 . doi : 10.1261/rna.1200508 . PMC 2590952. PMID 18945806 .  
  28. مجهول (2014). "15 عامًا من "المعلوماتية الحيوية"" . المعلوماتية الحيوية . 30 (6): 747. doi : 10.1093/bioinformatics/btu076 . PMID 24642573 . 
  29. "مسؤولو ومجلس إدارة الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي". مؤرشف من الأصل في 24 يوليو 2014.
  30. ١ ٢ "أليكس بيتمان يفوز بجائزة بنجامين فرانكلين لعام ٢٠١٠ - عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية" . www.bio-itworld.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ ١٤ أغسطس ٢٠١٢.
  31. «أليكس يفوز بجائزة بنجامين فرانكلين!» مدونة إكس فام. أبريل 2010. مؤرشف من الأصل في 28 أبريل 2010.
  32. «١٣ فبراير ٢٠١٧: الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي تُعلن عن سبعة أعضاء كزملاء في دفعة ٢٠١٧» . www.iscb.org . تاريخ الاطلاع: ١٣ فبراير ٢٠١٧ .