معهد ألين لعلوم الدماغ

أُعلن عن المشروع الافتتاحي لمعهد ألين في 26 سبتمبر 2006. ^{[ 6 ]} وكان المشروع، الذي سُمّي أطلس ألين للدماغ، عبارة عن خريطة ثلاثية الأبعاد على الإنترنت لتعبير الجينات في دماغ الفأر، تُفصّل أكثر من 21000 جين على المستوى الخلوي. ومنذ إطلاق المشروع، أُعيدت تسميته إلى أطلس ألين لدماغ الفأر لتمييزه عن مشاريع الأطلس اللاحقة.

في 17 يوليو/تموز 2008، أطلق معهد ألين لعلوم الدماغ أطلس ألين للحبل الشوكي على الإنترنت . ^{[ 4 ]} يُعدّ هذا الأطلس خريطة تفاعلية شاملة للجينوم ، تُظهر مواقع التعبير الجيني، أو "تنشيط" كل جين ، في جميع أنحاء الحبل الشوكي للفأر . وهو مُصمّم على غرار أطلس معهد ألين السابق لدماغ الفأر البالغ. ^{[ 7 ]} قد تُساعد هذه الخريطة في الكشف عن علاجات جديدة للاضطرابات العصبية البشرية ، إذ تُشير إلى مواقع نشاط الجينات. ^{[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]}

أدى استخدام أطلس ألين للحبل الشوكي إلى اكتشاف فئة جديدة من الخلايا في الحبل الشوكي تتصرف كخلايا جذعية ، وفقًا لباحثين في جامعة كولومبيا البريطانية. وقالت جين روسكامز ، عالمة الأعصاب التي قادت الدراسة: "باستخدام أطلس ألين للحبل الشوكي، تمكنا من اكتشاف نوع جديد تمامًا من الخلايا لم يُلتفت إليه سابقًا، والذي قد يكون له دور مهم في جميع أنواع إصابات وأمراض الحبل الشوكي، بما في ذلك التصلب المتعدد والتصلب الجانبي الضموري". ^{[ 11 ]}

في 14 نوفمبر 2008، أعلن معهد ألين لعلوم الدماغ عن إطلاق أطلس ألين لتطور دماغ الفأر، والذي يقدم خريطة مفصلة للغاية لنشاط الجينات في دماغ الفأر في مراحل زمنية متعددة خلال مراحل النمو ، ^{[ 12 ]} بما في ذلك أربع مراحل جنينية، وثلاث مراحل بعد الولادة، ومراحل الشيخوخة. ^{[ 13 ]} وتُرفق بيانات التهجين الموضعي بمجموعة من الأطالس المرجعية التي رسمها عالم التشريح العصبي لويس بويليس.

On May 24, 2010, the Allen Institute announced it was expanding its tools from the mouse into the human brain with the launch of the Allen Human Brain Atlas.^[14] This highly comprehensive atlas integrates several kinds of data, including data collected by magnetic resonance imaging (MRI), diffusion tensor technology (DTI), as well as histology and gene expression data derived from both microarray and in situ hybridization (ISH) approaches.^[15] The Allen Human Brain Atlas allows researchers to see where a gene is turned on. "The location of where these genes are active is at the very center of understanding how brain diseases work", neurologist Jeffrey L. Noebels told The Wall Street Journal in April 2011.^[16] The Allen Human Brain Atlas was profiled in the journal Nature on September 19, 2012.^[17]

The Allen Mouse Brain Connectivity Atlas was launched online on November 3, 2011, and moved the Allen Institute's mapping efforts beyond its historical focus on gene expression toward neural circuitry. The atlas is a three-dimensional, high-resolution map of neural connections throughout the mouse brain, designed to help scientists understand how the brain is wired, offering new insights into how the brain works and what goes awry in brain diseases and disorders.^[18]

Launched in 2015, the Allen Cell Types Database is a new tool to help scientists understand the building blocks of the brain and a major step toward creating a comprehensive map of the brain. The database will help create a common language for researchers around the world to use in observing, measuring and ultimately sorting cells into types much like the periodic table sorts elements. The first release of data includes information on more than 240 cells in the mouse brain.^[19] In 2017, the Allen Institute added data from human brain cells to the database.^[20]

أُطلق مرصد ألين للدماغ عام 2016 لرصد النشاط الخلوي للخلايا العصبية في القشرة البصرية للفأر. ^{[ 21 ]} تستخدم التجارب التي تُجرى في المرصد قراءات بصرية أو كهربائية للنشاط العصبي عندما ترى الحيوانات محفزات بصرية، تتراوح بين الصور الطبيعية وخطوط الشبكة بالأبيض والأسود، وصولًا إلى مقطع من فيلم "لمسة الشر" ( Touch of Evil ) للمخرج أورسون ويلز . في عام 2018، فتح المعهد المرصد أمام مشاريع بحثية يقترحها علماء من المجتمع العلمي الأوسع نطاقًا من خلال برنامج يُسمى "أوبن سكوب" (OpenScope)، والذي صُمم على غرار مراصد الفيزياء المشتركة واسعة النطاق مثل تلسكوب هابل الفضائي . ^{[ 22 ]}

بالإضافة إلى موارد الأطلس، قام معهد ألين بإنشاء العديد من أدوات البحث الأخرى عبر الإنترنت، بما في ذلك:

• مشروع أطلس أورام الدماغ الدبقية (Ivy GAP)، وهو منصة لاستكشاف الأساس التشريحي والجيني لأورام الدماغ الدبقية على المستويين الخلوي والجزيئي. ^{[ 23 ]}
• أطلس BrainSpan للدماغ البشري النامي، وهو مورد لدراسة نمو الدماغ البشري تم تطويره بواسطة اتحاد من الشركاء العلميين وتم تمويله من خلال منح من المعاهد الوطنية للصحة . ^{[ 24 ]}