الزائفة
تُعدّ الزائفة [ 6 ] مملكة بدائيات النوى، تضمّ ما يقارب ثلث أنواع بدائيات النوى ، ومعظمها بكتيريا سالبة الغرام وأقاربها. [ 5 ] وهي أقرب الأقارب إلى مملكة أكبر من البكتيريا ، وهي العصيات ، التي تتكون في معظمها من بكتيريا موجبة الغرام . [ 7 ] [ 5 ]
الأسماء
يشير الاسم المرادف "Hydrobacteria" (hydro = "ماء") إلى البيئة الرطبة التي يُفترض أنها كانت موطن السلف المشترك لهذه الأنواع. في المقابل، تمتلك أنواع Bacillati تكيفات للحياة على اليابسة. [ 7 ] [ 5 ] منذ عام 2024، أصبح الاسم المنشور الوحيد الصحيح لهذه المجموعة هو مملكة Pseudomonadati (لم يكن هناك اسم سابقًا، لأنه لم يكن من الممكن وجود مستويات أعلى من الشعبة في الإصدارات السابقة من شفرة بدائيات النوى ). [ 8 ]
يُستخدم مصطلح "Gracilicutes"، الذي وصفه جيبونز وموراي عام 1978، [ 9 ] أحيانًا بدلاً من Pseudomonadati. مع ذلك، كان مصطلح "Gracilicutes" يشمل البكتيريا الزرقاء (وهي عضو في Bacillati) ولم يُبنَ وفقًا لنظام المجالات الثلاثة المقبول حاليًا . [ 9 ] في الآونة الأخيرة، اقتُرح تعريف جديد لمصطلح "Gracilicutes" [ 10 ] ، لكنه لم يتضمن دراسة تطورية جزيئية أو تحليلات إحصائية. كما أنه لم يتبع نظام المجالات الثلاثة ، بل ادعى أن سلالة حقيقيات النوى + العتائق تقع ضمن البكتيريا كقريبة من Actinomycetota ، وهو تصنيف لا تدعمه أي دراسة تطورية جزيئية.
تطور
يُعتقد أن فصيلتي Pseudomonadati و Bacillati قد تباعدتا منذ حوالي 3 مليارات سنة، مما يشير إلى أن اليابسة (القارات) كانت مستعمرة بواسطة بدائيات النوى في ذلك الوقت. [ 5 ]
علم الوراثة والتصنيف
وتشمل هذه الشعب والفصائل العليا ما يلي: Acidobacteriota ، وAquificota ، و Bdellovibrionota ، و Campylobacterota ، وDeferribacterota ، وDependentiae، وDesulfobacterota ، وDesulfuromonadota، وElusimicrobiota ، وشعبة FCB العليا ، و Myxococcota ، وNitrospirota ، و Proteobacteria ، وشعبة PVC العليا ، و Spirochaetota . [ 11 ] [ 12 ]
لم تدعم بعض التحليلات الجزيئية الوراثية غير الجذرية [ 13 ] [ 14 ] هذا الانقسام الثنائي بين Bacillati و Pseudomonadati، ولكن أحدث التحليلات الجينومية، [ 11 ] [ 12 ] بما في ذلك تلك التي ركزت على تأصيل الشجرة، [ 11 ] وجدت أن هاتين المجموعتين أحاديتان النمط.
تشكل شعبتا Pseudomonadati وBacillati معًا فرعًا حيويًا كبيرًا يضم 97% من بدائيات النوى و99% من جميع أنواع البكتيريا المعروفة حتى عام 2009، وقد صنّفها باتيستوزي وهيدجز ضمن التصنيف المقترح Selabacteria ، في إشارة إلى قدرتها على التغذية الضوئية (من اليونانية σέλας = ضوء). [ 15 ] حاليًا، لا تزال الشعب البكتيرية التي تقع خارج Pseudomonadati + Bacillati، والتي تبرر تصنيف Selabacteria، محل نقاش، وقد تشمل أو لا تشمل Fusobacteria . [ 11 ] [ 12 ]
استند تعريف قسمين رئيسيين ضمن نطاق البكتيريا ، وهما الزائفة والعصيات، إلى حد كبير على التحليلات التطورية الجذرية للجينومات. [ 7 ] [ 5 ] [ 11 ] [ 12 ] ولم تدعم التحليلات غير الجذرية هذا التقسيم بشكل كامل، [ 14 ] [ 13 ] مما يسلط الضوء على أهمية أشجار الحياة الجذرية.
أيدت دراستان حديثتان لتطور السلالات البكتيرية تقسيم البكتيريا إلى شعبتي الزائفة والعصيات. [ 11 ] [ 12 ] ومع ذلك، فقد فسرتا تطور جدار الخلية بشكل مختلف، حيث خلصت إحداهما إلى أن السلف المشترك الأخير للبكتيريا كان أحادي الطبقة ( بكتيريا موجبة الجرام [ 11 ] )، بينما خلصت الأخرى إلى أنه كان ثنائي الطبقة ( بكتيريا سالبة الجرام [ 12 ] ). أُعيد رسم الشجرة التالية من إحدى هاتين الدراستين الحديثتين، [ 11 ] ، موضحةً تطور السلالات البكتيرية، مع بقاء موقع الفيوزوبكتيريا غير محدد، وكون DST أقرب أقرباء العصيات.
شجرة تطورية لشعب البكتيريا وفوق شعبها وفقًا لكولمان وآخرون (2021). [ 11 ] وقد أشير إلى الزائفة باسم "الجراسيلكيوت" في تلك الدراسة.
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 16 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 17 ]
شعب غير مصنفة:
- " كانجلونجوتا " تشانغ وآخرون. 2022
- فيديليباكتروتا كاتاياما وآخرون. 2024 [بما في ذلك. "نيومارينيميكروبيوتا" رينكي وآخرون. 2013 ]
- " هيلونجوتا " تشانغ وآخرون. 2022
- " Nitrosediminicolota " Zhao, Jorgensen & Babbin 2024
- " سالتاتوريلوتا " ويجاند وآخرون. 2019
- " Tianyabacteriota " كوريج. تسوى وآخرون. 2021
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ Pseudomonadati in LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 نوفمبر 2020). "انتقال قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) إلى DSMZ" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 70 (11): 5607–5612 . doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ↑ بارتي، أ.س.، ساردا كارباس، ج.، ماير-كولثوف، ج.ب.، رايمر، ل.س.، وجوكر، م. (2020). قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) تنتقل إلى DSMZ. المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري ، 70 ، 5607-5612؛ DOI: 10.1099/ijsem.0.004332
- ↑ "شعبة كالديفارسيمينوتا " . LPSN - قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية . تم الاسترجاع في 13 يوليو 2026 .
- ^ موري ، كوجي. هيداكا، كوهي؛ تامازاوا، ساتوشي؛ هوسوياما، أكيرا؛ تاماكي، هيديوكي؛ كاكيجاوا، تاكيشي؛ هانادا ، ساتوشي (3 يوليو 2026). "Caldifarcimen microaerophilum gen. nov., sp. nov.، بكتيريا لاهوائية اختيارية، محبة للحرارة من فصيلة بكتيرية جديدة، Caldifarciminota phyl. nov.، كانت تسمى سابقًا الشعبة المرشحة WOR-3، وصف Caldifarciminaceae fam. nov.، Caldifarciminales ord. nov. وCaldifarciminia classis nov". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 76 (7). دوى : 10.1099/ijsem.0.007229 . بميد 42397696 .
- 1 2 3 4 5 6 7 باتيستوزي، إف يو؛ هيدجز، إس بي (1 فبراير 2009). "مجموعة رئيسية من بدائيات النوى ذات تكيفات قديمة للحياة على اليابسة". علم الأحياء الجزيئي والتطور . 26 (2): 335-343 . doi : 10.1093/molbev/msn247 . PMID 18988685 .
- ↑ "المملكة: الزائفة" . lpsn.dsmz.de. تم الاطلاع عليه بتاريخ 2025-04-02 .
- باتيستوزي، فابيا يو؛ فيجاو، أندريا؛ هيدجز، إس بلير (2004). "مقياس زمني جينومي لتطور بدائيات النوى: رؤى حول أصل إنتاج الميثان، والتغذية الضوئية، واستيطان اليابسة" . مجلة بي إم سي لعلم الأحياء التطوري . 4 ( 1 ) : 44. doi : 10.1186/1471-2148-4-44 . PMC 533871. PMID 15535883 .
- ↑ غوكر، ماركوس؛ أورين، أهارون (22 يناير 2024). "نشرٌ صحيحٌ لأسماء نطاقين وسبع ممالك من بدائيات النوى" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 74 (1). doi : 10.1099/ijsem.0.006242 .
- 1 2 جيبونز، ن. إي.؛ موراي، ر. ج. إي. (1 يناير 1978). "مقترحات بشأن التصنيفات العليا للبكتيريا" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 28 (1): 1-6 . doi : 10.1099/00207713-28-1-1 .
- ↑ كافاليير-سميث، توماس (2006). " تحديد جذور شجرة الحياة من خلال تحليلات الانتقال" . بيولوجي دايركت . 1 (1): 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193. PMID 16834776 .
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 كولمان، غاريث أ؛ دافين، أدريان أ. ماهيندراراجا، تارا أ؛ زانثو، لينارد إل؛ سبانج، أنجا؛ هوغنهولتز، فيليب؛ زولوسي، جيرجيلي ج.؛ ويليامز ، توم أ. (7 مايو 2021). "سلالة الجذور تحل التطور البكتيري المبكر" . علوم . 372 (6542) eabe0511. دوى : 10.1126/science.abe0511 . اتش دي ال : 1983/51e9e402-36b7-47a6-91de-32b8cf7320d2 . بميد 33958449 . S2CID 233872903 .
- 1 2 3 4 5 6 ليونارد، رافائيل ر.؛ سوفاج، اريك. لوبو، فاليريان؛ بيرين، أماندين. سيرجاكوبس، داميان؛ شارلييه، بوليت؛ كيرف، فريديريك؛ بورين ، دينيس (18 فبراير 2022). "هل كان السلف المشترك البكتيري الأخير هو الجلد الأحادي بعد كل شيء؟" . الجينات . 13 (2): 376. دوى : 10.3390 / الجينات 13020376 . بمك 8871954 . بميد 35205421 .
- 1 2 هوغ، لورا أ.؛ بيكر، بريت ج.؛ أنانثارامان، كارتيك؛ براون، كريستوفر ت.؛ بروبست، ألكسندر ج.؛ كاستيل، سيندي ج.؛ باترفيلد، كريستينا ن.؛ هيرنسدورف، أليكس و.؛ أمانو، يوكي؛ إيسي، كوتارو؛ سوزوكي، يوهي؛ دوديك، ناتاشا؛ ريلمان، ديفيد أ.؛ فينستاد، كاري م.؛ أموندسون، رونالد؛ توماس، برايان س.؛ بانفيلد، جيليان ف. (مايو 2016). " نظرة جديدة لشجرة الحياة" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID 27572647. S2CID 3833474 .
- 1 2 تشو، تشيون؛ مي، أوين؛ فايفر، واين؛ يانسن، ستيفان؛ أسنيكار، فرانشيسكو؛ ساندرز، جون ج. بيلدا فيري، بيدرو؛ الغاليث، جبرائيل أ. كوبيلوفا، إيفجينيا؛ ماكدونالد، دانيال؛ كوسيوليك، توماسز؛ يين، جون ب. هوانغ، شي؛ سلام، نيميتشاند؛ جياو، جيان يو؛ وو، زيجون. شو، تشنجيانغ Z.؛ كانتريل، كالين؛ يانغ، يمنغ. سياري، عرفان؛ ربيع، مريم؛ مورتون، جيمس T.؛ بوديل، شيلا؛ فرسان، دان؛ لي، ون جون؛ هوتنهاور، كيرتس. سيجاتا، نيكولا؛ سمار، لاري. ميراراب، سيافاش؛ نايت ، روب (ديسمبر 2019). "علم الوراثة التطورية لـ 10575 جينومًا يكشف عن تقارب تطوري بين نطاقي البكتيريا والعتائق" . مجلة نيتشر كوميونيكيشنز . 10 (1): 5477. Bibcode : 2019NatCo..10.5477Z . doi : 10.1038/s41467-019-13443-4 . PMC 6889312. PMID 31792218 .
- ↑ باتيستوزي، إف يو؛ هيدجز، إس بي (2009). "البكتيريا الحقيقية". في هيدجز، إس بي؛ كومار، إس (محرران). شجرة الحياة الزمنية . نيويورك: مطبعة جامعة أكسفورد. ص 106-115 .
- ↑ الزائفة في LPSN ؛ فريز، إتش إم؛ ماير-كولثوف، جيه بي؛ ساردا كارباس، جيه؛ أفولايان، إيه أو؛ جوكر، إم. (29 أكتوبر 2025). "TYGS وLPSN في عام 2025: مورد عالمي أساسي للبيانات الحيوية لتصنيف وتسمية بدائيات النوى بناءً على الجينوم ضمن التنوع الرقمي DSMZ". أبحاث الأحماض النووية . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
- ↑ شوخ سي إل؛ وآخرون . "الزائفة" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 2025-06-05 .
- ↑ "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "bac120_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- تصنيفات البكتيريا
- علم البكتيريا
- الممالك (علم الأحياء)
