سلسلة مثالية
تُعدّ السلسلة المثالية (أو السلسلة ذات المفاصل الحرة ) أبسط نموذج في كيمياء البوليمرات لوصف البوليمرات ، مثل الأحماض النووية والبروتينات . يفترض هذا النموذج أن المونومرات في البوليمر تقع على خطوات جزيء افتراضي يتحرك عشوائيًا دون أن يتذكر خطواته السابقة. وبإهمال التفاعلات بين المونومرات ، يفترض هذا النموذج أن مونومرين (أو أكثر) يمكن أن يشغلا الموقع نفسه. ورغم بساطته، فإن عموميته تُتيح فهمًا أعمق لفيزياء البوليمرات .
في هذا النموذج، تُعتبر المونومرات قضبانًا صلبة ذات طول ثابت l ، ويكون اتجاهها مستقلًا تمامًا عن اتجاهات ومواقع المونومرات المجاورة. في بعض الحالات، يكون للمونومر دلالة فيزيائية، مثل حمض أميني في عديد الببتيد . وفي حالات أخرى، يكون المونومر مجرد جزء من البوليمر يمكن نمذجته كوحدة منفصلة ذات مفاصل حرة. في هذه الحالة، يُسمى l طول كون . على سبيل المثال، يُنمذج الكروماتين كبوليمر يكون فيه كل مونومر جزءًا تقريبًا يتراوح طولها بين 14 و46 كيلو قاعدة . [ 1 ]
نموذج
تُشكّل وحدات N من البوليمر، ويبلغ طوله الإجمالي غير المطوي ما يلي:حيث N هو عدد الوحدات المتكررة، و l هو طول كل وحدة متكررة.
في هذا النهج البسيط للغاية حيث لا يتم النظر في التفاعلات بين الوحدات، يتم اعتبار طاقة البوليمر مستقلة عن شكله، مما يعني أنه عند التوازن الديناميكي الحراري ، فإن جميع تكوينات شكله من المرجح أن تحدث على حد سواء مع تقلب البوليمر بمرور الوقت، وفقًا لتوزيع ماكسويل-بولتزمان .
دعونا نتصلالمتجه الكلي من طرف إلى طرف لسلسلة مثالية والمتجهات التي تُمثل كل وحدة فرعية (mers). لهذه المتجهات العشوائية مركبات في الاتجاهات الثلاثة للفضاء. تفترض معظم الصيغ الواردة في هذه المقالة أن عدد الوحدات الفرعية N كبير، بحيث تنطبق نظرية النهاية المركزية . يوضح الشكل أدناه رسمًا تخطيطيًا لسلسلة مثالية (قصيرة).

لا تتطابق نهايتا السلسلة، بل تتذبذبان حول بعضهما البعض، ولذلك بالطبع:
طوال المقالسيتم استخدام الأقواس للدلالة على المتوسط (للقيم المأخوذة على مدار الوقت) لمتغير عشوائي أو متجه عشوائي، كما هو موضح أعلاه.
منذإذا كانت مستقلة ، فإنه يترتب على ذلك من نظرية النهاية المركزية أنيتم توزيعها وفقًا للتوزيع الطبيعي (أو التوزيع الغاوسي): تحديدًا، في ثلاثة أبعاد،ويتم توزيعها وفقًا للتوزيع الطبيعي بمتوسط 0 وتباين :
لهذا السببيتم توزيع متجه السلسلة من البداية إلى النهاية وفقًا لدالة كثافة الاحتمال التالية :
متوسط المسافة بين طرفي البوليمر هو:
من الكميات التي تستخدم بكثرة في فيزياء البوليمرات نصف قطر الدوران :
تجدر الإشارة إلى أن المسافة بين الطرفين، والتي تمثل في حالة هذا النموذج البسيط السعة النموذجية لتقلبات النظام، تصبح ضئيلة مقارنة بالطول الكلي غير المطوي للبوليمر.عند الحد الديناميكي الحراري . هذه النتيجة هي خاصية عامة للأنظمة الإحصائية.
ملاحظة رياضية: البرهان الدقيق على صيغة كثافة الاحتمالالأمر ليس بهذه البساطة كما يبدو أعلاه: فمن خلال تطبيق نظرية النهاية المركزية (أحادية البعد) المعتادة ، يمكن استنتاج أن،وتتوزع وفقًا لتوزيع طبيعي مركزي للتباينثم، التعبير المذكور أعلاه لـليس هو الوحيد المتوافق مع هذا النوع من التوزيع لـ،وومع ذلك، بما أن مكونات المتجهاتإذا كانت المتغيرات غير مترابطة بالنسبة للمسار العشوائي الذي ندرسه، فإن ذلك يترتب عليه أن،وكما أنها غير مترابطة . لا يمكن تحقيق هذا الشرط الإضافي إلا إذايتم توزيعها وفقًا لـ. بدلاً من ذلك، يمكن إثبات هذه النتيجة أيضًا من خلال تطبيق تعميم متعدد الأبعاد لنظرية النهاية المركزية ، أو من خلال حجج التناظر .
عمومية النموذج
في حين أن النموذج الأولي الموصوف أعلاه غير مناسب تمامًا لوصف البوليمرات في العالم الحقيقي على المستوى المجهري ، إلا أنه يُظهر بعض الأهمية على المستوى العياني في حالة البوليمر الموجود في المحلول والذي تشكل مونومراته مزيجًا مثاليًا مع المذيب (في هذه الحالة، تكون التفاعلات بين المونومر والمونومر، وجزيء المذيب وجزيء المذيب، وبين المونومر والمذيب متطابقة، ويمكن اعتبار طاقة النظام ثابتة، مما يؤكد صحة فرضيات النموذج).
إلا أن أهمية هذا النموذج محدودة، حتى على المستوى العياني، لأنه لا يأخذ في الحسبان أي حجم مستبعد للوحدات الأحادية (أو، بتعبير كيميائي، أنه يتجاهل التأثيرات الفراغية ). ولأن الوحدات الأحادية (N- mers) ذات طول ثابت وصلب، فإن النموذج لا يأخذ في الحسبان تمدد الروابط، مع أنه يمكن توسيعه ليشمل ذلك. [ 2 ]
تتقارب جميع نماذج البوليمرات المتذبذبة الأخرى، التي لا تأخذ في الحسبان التفاعل بين المونومرات ولا الحجم المستبعد، مثل نموذج السلسلة الشبيهة بالدودة ، تقاربًا مقاربًا نحو هذا النموذج عند الحد الديناميكي الحراري . ولغرض هذه المقارنة، يُعرَّف جزء كون ، الذي يُقابل طول المونومر المكافئ الذي يُؤخذ في الاعتبار في السلسلة المثالية المماثلة. ويساوي عدد أجزاء كون التي تُؤخذ في الاعتبار في السلسلة المثالية المماثلة الطول الكلي للبوليمر غير المطوي مقسومًا على طول جزء كون.
المرونة الإنتروبية لسلسلة مثالية
إذا تم فصل طرفي سلسلة مثالية بواسطة جهاز ما، فإن الجهاز يتعرض لقوة من البوليمر. ومع تمدد السلسلة المثالية، تظل طاقتها ثابتة، وكذلك متوسط طاقتها الداخلية ، مما يعني أن هذه القوة ناتجة بالضرورة عن تأثير إنتروبي بحت .
تُشبه هذه القوة الإنتروبية إلى حد كبير الضغط الواقع على جدران صندوق يحتوي على غاز مثالي . تعتمد الطاقة الداخلية للغاز المثالي على درجة حرارته فقط، وليس على حجم الصندوق الذي يحتويه، لذا فإن تأثير الطاقة ليس هو ما يزيد حجم الصندوق كما يفعل ضغط الغاز . وهذا يعني أن ضغط الغاز المثالي ذو أصل إنتروبي بحت .
ما هو الأصل المجهري لمثل هذه القوة أو الضغط الانتروبي ؟ الإجابة الأكثر عمومية هي أن تأثير التقلبات الحرارية يميل إلى دفع النظام الديناميكي الحراري نحو حالة عيانية تتوافق مع الحد الأقصى لعدد الحالات المجهرية (أو الحالات الميكروية) المتوافقة مع هذه الحالة العيانية. بعبارة أخرى، تميل التقلبات الحرارية إلى دفع النظام نحو حالته العيانية ذات الانتروبيا القصوى .
ماذا يعني هذا في حالة السلسلة المثالية؟ أولاً، بالنسبة لسلسلتنا المثالية، تتميز الحالة المجهرية بتراكب الحالاتلكل مونومر على حدة (حيث تتراوح قيمة i من 1 إلى N ). في مذيبها، تتعرض السلسلة المثالية باستمرار لصدمات من جزيئات المذيب المتحركة، وكل صدمة من هذه الصدمات تنقل النظام من حالته المجهرية الحالية إلى حالة مجهرية أخرى مشابهة جدًا. بالنسبة للبوليمر المثالي، كما سيتبين لاحقًا، يوجد عدد أكبر من الحالات المجهرية المتوافقة مع مسافة قصيرة بين طرفي السلسلة مقارنةً بالحالات المجهرية المتوافقة مع مسافة كبيرة بين طرفيها. وبالتالي، بالنسبة للسلسلة المثالية، فإن تعظيم إنتروبيتها يعني تقليل المسافة بين طرفيها الحرين. ونتيجة لذلك، تُمارس السلسلة المثالية قوة بين طرفيها الحرين تميل إلى انهيارها.
في هذا القسم، سيتم اشتقاق متوسط هذه القوة. ثم ستتم مناقشة عمومية التعبير الذي تم الحصول عليه عند الحد الديناميكي الحراري .
سلسلة مثالية في ظل قيود الطول
سيتم في هذا القسم الفرعي دراسة حالة السلسلة المثالية التي ترتبط نهايتاها بنقطتين ثابتتين. المتجهيُحدد الربط بين هاتين النقطتين الحالة العيانية (أو الحالة الكلية) للسلسلة المثالية. كل حالة كلية تُقابل عددًا معينًا من الحالات الجزئية، والتي سنُطلق عليها اسم(تُعرَّف الحالات الميكروية في مقدمة هذا القسم). بما أن طاقة السلسلة المثالية ثابتة، فإن احتمال حدوث كل حالة من هذه الحالات الميكروية متساوٍ. وبالتالي، فإن الإنتروبيا المرتبطة بحالة عيانية تساوي: أينثابت بولتزمان
يُعطي التعبير أعلاه الإنتروبيا المطلقة (الكمية) للنظام. ويتطلب تحديد دقيق لـسيتطلب ذلك نموذجًا كميًا للسلسلة المثالية، وهو أمر يتجاوز نطاق هذه المقالة. ومع ذلك، فقد قمنا بالفعل بحساب كثافة الاحتمال.مرتبط بالمتجه من طرف إلى طرف للسلسلة المثالية غير المقيدة ، أعلاه. بما أن جميع الحالات الجزئية للسلسلة المثالية متساوية الاحتمالية في الحدوث،يتناسب معوهذا يؤدي إلى التعبير التالي عن الإنتروبيا الكلاسيكية (النسبية) للسلسلة المثالية: أينثابت ثابت. لنسميهالقوة التي تُؤثر بها السلسلة على النقطة التي تُثبّت عندها نهايتها. من التعبير السابق للإنتروبيا ، يُمكننا استنتاج تعبير لهذه القوة. لنفترض أن موضعَي طرفي السلسلة المثالية، بدلًا من أن يكونا ثابتين، يُتحكّم بهما الآن بواسطة مُؤثّر. يُتحكّم هذا المُؤثّر في تطوّر مُتجه المسافة بين طرفي السلسلة.إذا تغير المشغلبمقدار ضئيلإذاً، يكون تغير الطاقة الداخلية للسلسلة صفراً، لأن طاقة السلسلة ثابتة. ويمكن كتابة هذا الشرط على النحو التالي:
يُعرَّف بأنه مقدار العمل الميكانيكي الأساسي الذي ينقله المشغل إلى السلسلة المثالية، ويُعرَّف بأنه كمية الحرارة الأولية التي ينقلها المذيب إلى السلسلة المثالية. الآن، إذا افترضنا أن التحول الذي يفرضه المؤثر على النظام شبه ساكن (أي بطيء للغاية)، فإن تحول النظام سيكون قابلاً للانعكاس الزمني، ويمكننا أن نفترض أنه أثناء انتقاله من الحالة العيانيةإلى الحالة الكليةيمر النظام بسلسلة من حالات التوازن الديناميكي الحراري الكلية. ويترتب على ذلك نتيجتان:
- أولاً، يمكن ربط كمية الحرارة التي يتلقاها النظام أثناء التحول بتغير إنتروبيته :حيث T هي درجة حرارة السلسلة.
- ثانيًا، لكي يظل التحويل بطيئًا إلى ما لا نهاية، يجب أن تتوازن القوة المتوسطة التي يبذلها المؤثر على نهايتي السلسلة مع القوة المتوسطة التي تبذلها السلسلة على نهايتيها.القوة التي يبذلها المشغل والقوة التي تبذلها السلسلة، لدينا:
وهكذا نصل إلى:
المعادلة أعلاه هي معادلة حالة السلسلة المثالية. ولأن هذا التعبير يعتمد على نظرية النهاية المركزية ، فإنه يكون دقيقًا فقط في حالة البوليمرات التي تحتوي على عدد كبير من المونومرات (أي الحد الديناميكي الحراري ). كما أنه صالح فقط للمسافات الصغيرة بين طرفي السلسلة، نسبةً إلى طول محيط البوليمر الكلي ، حيث يكون السلوك مشابهًا لنابض هوك. يمكن نمذجة السلوك على نطاقات قوى أكبر باستخدام معالجة المجموعة الكنسية المطابقة لمغنطة اللف المغزلي البارامغناطيسي . بالنسبة للقوى العشوائية، يُعطى اعتماد التمدد على القوة بدالة لانجفين.: حيث يكون الامتداد.
بالنسبة للامتدادات العشوائية، يمكن تقريب اعتماد القوة على الامتداد بواسطة: [ 3 ] أينهي دالة لانجفين العكسية ، وN هو عدد الروابط [ 4 ] في الجزيء (لذلك إذا كان للجزيء N رابطة، فإنه يحتوي على N + 1 مونومرات تشكل الجزيء).
وأخيرًا، يمكن توسيع نطاق النموذج ليشمل نطاقات قوى أكبر من خلال تضمين معامل تمدد على طول محيط البوليمر. أي، من خلال السماح لطول كل وحدة من السلسلة بالاستجابة بمرونة للقوة المطبقة. [ 5 ]
طول التبادل البوليمري المثالي مع الخزان
في هذا القسم الفرعي، كما في القسم السابق، يتم تثبيت طرفي البوليمر بجهاز تحكم دقيق. ولكن هذه المرة، لا يُبقي الجهاز طرفي السلسلة المثالية في وضع ثابت، بل يُبقي على قوة سحب ثابتة.على السلسلة المثالية. في هذه الحالة، يتذبذب طرفا البوليمر حول موضع متوسط .تتفاعل السلسلة المثالية بقوة معاكسة ثابتة.
بالنسبة لسلسلة مثالية تتبادل أطوالها مع خزان، تتميز الحالة الكلية للنظام بالمتجه.
إن التحول بين سلسلة مثالية ذات طول ثابت وسلسلة مثالية متصلة بمستودع طول يشبه إلى حد كبير التحول بين المجموعة الميكروكانونية والمجموعة الكانونية (انظر مقالة الميكانيكا الإحصائية حول هذا الموضوع). [ 6 ] يتمثل هذا التحول في الانتقال من حالة تُفرض فيها قيمة ثابتة على مُعامل معين، إلى حالة يُترك فيها النظام حرًا في تبادل هذا المُعامل مع البيئة الخارجية. المُعامل المعني هو الطاقة في الوصفين الميكروكانوني والكانوني، بينما في حالة السلسلة المثالية، يكون المُعامل هو طول السلسلة المثالية.
كما هو الحال في المجموعات الميكروكانونية والكانونية، يختلف الوصفان للسلسلة المثالية فقط في طريقة معالجتهما لتقلبات النظام. وبالتالي فهما متكافئان عند الحد الديناميكي الحراري . وتبقى معادلة حالة السلسلة المثالية كما هي، باستثناء أنوهي الآن عرضة للتقلبات:
حساب سلسلة مثالية تحت قيد قوة ثابتة

لنفترض سلسلة ذات مفاصل حرة منروابط ذات طولخاضع لقوة استطالة ثابتةمطبقة على أطرافها على طولالمحور ودرجة حرارة البيئةمثال على ذلك سلسلة تحتوي على شحنتين متعاكستينوعند طرفيه في مجال كهربائي ثابتتم تطبيقها على طولالمحور كما هو موضح في الشكل على اليمين. إذا تم تجاهل التفاعل الكولومي المباشر بين الشحنات، فستكون هناك قوة ثابتةعند الطرفين.
لا تكون التشكيلات المختلفة للسلسلة متساوية الاحتمالية، لأنها تتوافق مع طاقة مختلفة للسلسلة في المجال الكهربائي الخارجي.
وبالتالي، فإن التكوينات المختلفة للسلسلة لها عوامل بولتزمان إحصائية مختلفة.[ 4 ]
دالة التقسيم هي :
تتميز كل وصلة مونومر في السلسلة بمتجهمن الطولوالزوايافي نظام الإحداثيات الكروية . يمكن تمثيل متجه النهاية إلى النهاية على النحو التالي:. لذلك:
يمكن حساب طاقة جيبس الحرة G مباشرة من دالة التوزيع :
تُستخدم طاقة جيبس الحرة هنا لأن مجموعة السلاسل تتوافق مع درجة حرارة ثابتةوقوة ثابتة(على غرار المجموعة متساوية الحرارة والضغط ، والتي تتميز بدرجة حرارة وضغط ثابتين).
يمكن الحصول على متوسط المسافة من طرف إلى طرف المقابلة لقوة معينة كمشتق للطاقة الحرة:
هذا التعبير هو دالة لانجفين، كما ورد في الفقرات السابقة:

أين.
للاستطالات النسبية الصغيرة () يكون الاعتماد خطيًا تقريبًا، ويتبع قانون هوك كما هو موضح في الفقرات السابقة:
انظر أيضاً
- بوليمر
- سلسلة تشبه الدودة ، نموذج بوليمر أكثر تعقيدًا
- طول كون
- التحول من الحالة الملفوفة إلى الحالة الكروية
مراجع
- ↑ ريب، كارستن (2001). "تكوين روابط على بوليمر حمض نووي". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 26 (12): 733-740 . doi : 10.1016/S0968-0004(01)01978-8 . PMID 11738597 .
- ↑ بوش، إم آر؛ سيلبرشتاين، إم إن؛ غروتزيك، إس جيه (2022). "سلاسل ذات مفاصل حرة وروابط قابلة للتمدد". فيز. ريف. إي . 106 ( 2-1 ) 024502. arXiv : 2203.05421 . doi : 10.1103/PhysRevE.106.024502 . PMID 36109919 .
- ↑ بتروسيان، ر. (2016). "تقريبات محسّنة لبعض نماذج امتداد البوليمر". Rehol Acta . 56 : 21-26 . arXiv : 1606.02519 . doi : 10.1007/s00397-016-0977-9 .
- 1 2 فيزياء البوليمرات ISBN 019852059-Xروبنشتاين، 76 عامًا
- ↑ سميث، إس بي؛ فينزي، إل؛ بوستامانتي، سي (1992). "قياسات ميكانيكية مباشرة لمرونة جزيئات الحمض النووي المفردة باستخدام الخرز المغناطيسي". مجلة ساينس . 258 (5085): 1122-1126 . رمز Bibcode : 1992Sci...258.1122S . doi : 10.1126/science.1439819 . PMID 1439819 .
- ↑ بوش، إم آر؛ سيلبرشتاين، إم إن (2020). "النظرية التكوينية الميكانيكية الإحصائية لشبكات البوليمر: الروابط الوثيقة بين التوزيع والسلوك والمجموعة". مجلة فيزيكال ريفيو إي . 102 (1) 012501. arXiv : 2004.07874 . Bibcode : 2020PhRvE.102a2501B . doi : 10.1103/PhysRevE.102.012501 .
- كيمياء البوليمرات
- فيزياء البوليمرات
