نيوروليكس
NeuroLex هو معجم لمفاهيم علم الأعصاب، مدعوم من مشروع إطار معلومات علم الأعصاب ، الممول من برنامج NIH Blueprint لأبحاث علم الأعصاب. [ 1 ] وهو الجزء المعجمي من قاعدة معارف NIF ، ويهدف NeuroLex إلى تسهيل مراجعة الأدبيات وضمان اتساق المصطلحات واستخدامها بين الباحثين في مواضيع علم الأعصاب التجريبي والسريري والعابر للحدود، وكذلك في الموارد الجينية والجينومية. [ 2 ] وهو مُصمم على شكل ويكي دلالي ، باستخدام Semantic MediaWiki .
يُتيح إطار عمل NIF الوصول إلى موارد ذات صلة بعلم الأعصاب، واستراتيجيات بحث مُصممة خصيصًا لهذا المجال، بالإضافة إلى الوصول إلى محتوى كان يُعتبر تقليديًا "مخفيًا" عن محركات البحث على الإنترنت . ويُعدّ هذا الإطار بمثابة فهرس لقواعد بيانات علم الأعصاب، مُفهرس ومُدمج مع نظام موحد للمصطلحات الطبية الحيوية (مثل NeuroLex). يدعم NIF الاستعلامات القائمة على المفاهيم عبر مستويات متعددة من البنية البيولوجية ووظائفها.
كجزء من مبادرة البنية التحتية لعلم الأعصاب (NIF)، تُوفّر واجهة بحث للعديد من مصادر المعلومات والبيانات في علم الأعصاب. ولجعل هذا البحث أكثر فعالية، تعمل المبادرة على بناء أنطولوجيات تُساعد في تنظيم مفاهيم علم الأعصاب ضمن تسلسلات هرمية، على سبيل المثال، تعريف الخلية العصبية بأنها نوع من الخلايا . سيتيح ذلك للمستخدمين إجراء عمليات بحث أكثر فعالية، وتنظيم المعلومات المُسترجعة وفهمها. ولكن من المهم أيضًا، إلى جانب ذلك، تحديد جميع المصطلحات المستخدمة لوصف البيانات تعريفًا دقيقًا.
محتوى
استُندت المدخلات الأولية في NeuroLex إلى أنطولوجيات NIFSTD، التي استوعبت بدورها معجمًا سابقًا هو BIRNLex. ويحتوي حاليًا على مفاهيم تشمل التشريح العام، وخلايا الجهاز العصبي ، والبنى الخلوية، والأمراض ، والوظائف، والتقنيات. ويعتمد NIF على مساهمات المجتمع لإضافة المزيد من المحتوى وتصحيح المعلومات الحالية.
انظر أيضاً
ملاحظات ومراجع
- ↑ تم اقتباس المحتوى الأولي لهذه المقالة من مشروع NeuroLex المرخص بموجب ترخيص Creative Commons Attribution .
- ↑ لارسون إس دي، مارتون إم إي (2013). " NeuroLex.org: إطار عمل إلكتروني لمعرفة علم الأعصاب" . مجلة فرونتيرز في المعلوماتية العصبية . 7 : 18. doi : 10.3389/fninf.2013.00018 . PMC 3757470. PMID 24009581 .
للمزيد من القراءة
تم تسليط الضوء على مؤسسة NIF في عدد خاص من مجلة Neuroinformatics ، نُشر في سبتمبر 2008:
- Bug WJ, Ascoli GA, Grethe JS, Gupta A, Fennema-Notestine C, Laird AR, Larson SD, Rubin D, Shepherd GM, Turner JA, Martone ME (سبتمبر 2008). " مفردات NIFSTD وBIRNLex: بناء أنطولوجيات شاملة لعلم الأعصاب" . Neuroinformatics . 6 (3): 175–94 . doi : 10.1007/s12021-008-9032-z . PMC 2743139. PMID 18975148. مؤرشف من الأصل في 12 فبراير 2009.
- غاردنر د، أكيل هـ، أسكولي غا، باودن د م، بوغ و، دونوهيو د إ، غولدبيرغ د هـ، غرافشتاين ب، غريث ج س، غوبتا أ، حلافي م، كينيدي د ن، مارينكو ل، مارتون م إ، ميلر ب ل، مولر هـ م، روبرت أ، شيبرد غ م، ستيرنبرغ ب و، فان إيسن د س، ويليامز ر و (سبتمبر 2008). " إطار معلومات علم الأعصاب: بيئة بيانات ومعرفة لعلم الأعصاب" . معلوماتية الأعصاب . 6 (3): 149-160 . doi : 10.1007/s12021-008-9024-z . PMC 2661130. PMID 18946742 .
- غاردنر د، غولدبيرغ د.هـ، غرافشتاين ب، روبرت أ، غاردنر إ.ب (سبتمبر 2008). "مصطلحات لاكتشاف بيانات علم الأعصاب: بناء الجملة متعدد الأشجار والدلالات المستمدة من الباحث" . المعلوماتية العصبية . 6 (3): 161-174 . doi : 10.1007/s12021-008-9029-7 . PMC 2663521. PMID 18958630 .
- غوبتا أ، بوغ و، مارينكو ل، تشيان إكس، كوندت سي، رانجاراجان أ، مولر إتش إم، ميلر بي إل، ساندرز ب، غريث جيه إس، أستاخوف في، شيبرد جي، ستيرنبرغ بي دبليو، مارتون إم إي (سبتمبر 2008). " الوصول الموحد إلى موارد المعلومات غير المتجانسة في إطار معلومات علم الأعصاب (NIF)" . علم المعلومات العصبية . 6 (3): 205-217 . doi : 10.1007/s12021-008-9033-y . PMC 2689790. PMID 18958629 .
- هالافي م، بولافارام س، دونوهيو دي إي، هاميلتون ج، هويت ج، سميث كيه بي، أسكولي جي إيه (سبتمبر 2008). " تطبيق NeuroMorpho.Org لعلم الأعصاب الرقمي: تغطية شاملة وتكامل مع NIF" . معلوماتية الأعصاب . 6 (3): 241-252 . doi : 10.1007/s12021-008-9030-1 . PMC 2655120. PMID 18949582 .
- مارينكو إل، أسكولي جي إيه، مارتون إم إي، شيبرد جي إم، ميلر بي إل (سبتمبر 2008). "وسيط NIF LinkOut: مورد ويب لتسهيل تكامل البيانات الموحدة باستخدام معرّفات NCBI" . علم المعلومات العصبية . 6 (3): 219-227 . doi : 10.1007/s12021-008-9025-y . PMC 2704600. PMID 18975149 .
- مارينكو إل، لي واي، مارتون إم إي، ستيرنبرغ بي دبليو، شيبرد جي إم، ميلر بي إل (سبتمبر 2008). " قضايا في تصميم واجهة استعلام تجريبية قائمة على المفاهيم لإطار معلومات علم الأعصاب" . علم الأعصاب . 6 (3): 229-239 . doi : 10.1007/s12021-008-9035-9 . PMC 2664632. PMID 18953674 .
- مولر إتش إم، رانجاراجان إيه، تيل تي كيه، ستيرنبرغ بي دبليو (سبتمبر 2008). "Textpresso لعلم الأعصاب: البحث في النص الكامل لآلاف الأبحاث في علم الأعصاب" . معلوماتية الأعصاب . 6 (3): 195-204 . doi : 10.1007/s12021-008-9031-0 . PMC 2666735. PMID 18949581 .
روابط خارجية
- موقع نيورولكس
- موقع إطار معلومات علم الأعصاب (NIF)
- موقع المعاهد الوطنية للصحة NIF
- موارد المعلوماتية الحيوية في NeuroLex
- مواقع ميدياويكي
- الويكي الدلالي
- برامج علم الأعصاب
- علم الوجود (علم المعلومات)
- المصطلحات التشريحية
- مواقع تشريحية
- قواعد البيانات البيولوجية
