PPIF
إنزيم ببتيديل-بروليل سيس-ترانس إيزوميراز، الميتوكوندري (PPIF) هو إنزيم يُشفَّر في الإنسان بواسطة جين PPIF . ويُشار إليه أيضًا باسم سيكلوفيلين د (CypD)، ولكن يجب عدم الخلط بينه وبينه، إذ يُشفَّر هذا الإنزيم بواسطة جين PPID . [ 5 ] [ 6 ] وبصفته عضوًا في عائلة ببتيديل-بروليل سيس-ترانس إيزوميراز (PPIase)، يحفز هذا البروتين عملية تحويل روابط البرولين إيميديك الببتيدية إلى سيس-ترانس ، مما يُسهِّل طي البروتينات أو إصلاحها. [ 6 ] يُعدّ PPIF مكونًا رئيسيًا لمسام انتقال نفاذية الميتوكوندريا (MPTP)، وبالتالي فهو يشارك بشكل كبير في استقلاب الميتوكوندريا وموت الخلايا المبرمج ، بالإضافة إلى أمراض الميتوكوندريا والحالات ذات الصلة، بما في ذلك أمراض القلب، والأمراض التنكسية العصبية، وضمور العضلات . [ 7 ] علاوة على ذلك، يشارك PPIF في الالتهاب ، وكذلك في إصابة نقص التروية وإعادة التروية ، والإيدز ، والسرطان . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]
بناء
كغيره من السيكلوفيلينات، يُشكّل بروتين PPIF بنية برميلية بيتا ذات لب كاره للماء. يتألف هذا البرميل من ثمانية خيوط بيتا متوازية عكسيًا، ويُغطّى بحلقتين ألفا في الأعلى والأسفل. إضافةً إلى ذلك، تُساهم الانحناءات والحلقات في الخيوط في مرونة البرميل. [ 10 ] يبلغ وزن بروتين PPIF 17.5 كيلو دالتون، ويُشكّل جزءًا من مسام نفاذية الميتوكوندريا الانتقالية (MPTP) في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا (IMM). [ 6 ] [ 12 ]
وظيفة
البروتين المُشفَّر بواسطة هذا الجين هو أحد أفراد عائلة إنزيمات ببتيديل-بروليل سيس-ترانس إيزوميراز ( PPIase ). تُحفِّز هذه الإنزيمات عملية تحويل روابط البرولين إيميديك الببتيدية في قليلات الببتيد إلى سيس-ترانس ، مما يُسرِّع عملية طي البروتينات. [ 6 ] توجد إنزيمات PPIase عمومًا في جميع البكتيريا الحقيقية وحقيقيات النوى، بالإضافة إلى بعض أنواع العتائق، ولذلك فهي محفوظة بشكل كبير. [ 8 ] [ 13 ] تُقسَّم عائلة إنزيمات PPIase إلى ثلاث عائلات فرعية متميزة بنيويًا: السيكلوفيلين (CyP)، والبروتين الرابط لـ FK506 ( FKBP )، والبارفولين (Pvn). [ 8 ] [ 10 ] يرتبط بروتين PPI، كونه سيكلوفيلين، بالسيكلوسبورين أ (CsA)، ويمكن العثور عليه داخل الخلية أو إفرازه منها. [ 9 ] في حقيقيات النوى، تتمركز السيكلوفيلينات في العديد من أنواع الخلايا والأنسجة، على الرغم من أن الدراسات التي أُجريت على PPIF تركز بشكل أساسي على أنسجة القلب والكبد والدماغ. [ 7 ] [ 9 ] [ 10 ] بالإضافة إلى نشاطها كإنزيم PPIase ومرافقة بروتينية، تؤدي السيكلوفيلينات أيضًا وظائف في استقلاب الميتوكوندريا، والاستماتة الخلوية، والاستجابة المناعية، والالتهاب، ونمو الخلايا وتكاثرها. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] يشارك PPIF بشكل خاص في الاستماتة الخلوية للميتوكوندريا كمكون رئيسي في مسام نفاذية الميتوكوندريا الانتقالية (MPTP). من خلال قدرته على تنظيم نشاط PPIase، يتفاعل البروتين مع ناقل نيوكليوتيدات الأدينين ( ANT )، وهو المكون الآخر لمسام نفاذية الميتوكوندريا الانتقالية، ويحفز تغييرًا في بنيته. يؤدي هذا التنشيط، إلى جانب ارتفاع مستويات أيونات الكالسيوم، إلى فتح مسام الانتقال الميتوكوندري (MPTP)، مما ينتج عنه تورم الميتوكوندريا، وزيادة مستويات أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS)، وإزالة استقطاب الغشاء ، وفشل إنتاج الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP )، وتنشيط سلسلة الكاسبيز ، وفي النهاية، موت الخلايا المبرمج. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]
الأهمية السريرية
باعتباره سيكلوفيلين، يرتبط PPIF بالدواء المثبط للمناعة CsA لتكوين مركب CsA-سيكلوفيلين، والذي يستهدف بدوره الكالسينيورين لتثبيط مسار الإشارات لتنشيط الخلايا التائية. [ 9 ]
نظراً لارتباطه بـ MPTP، يُشارك PPID أيضاً في الأمراض التنكسية العصبية، بما في ذلك الجلوكوما ، واعتلال الشبكية السكري ، ومرض باركنسون ، ومرض الزهايمر . [ 16 ] في الأمراض التنكسية العصبية، يمنع علاج أحداث إعادة التروية باستخدام CsA، وهو مثبط لـ PPID، إطلاق السيتوكروم C ويقلل بشكل كبير من موت الخلايا العصبية. وبذلك، يُعد PPID هدفاً علاجياً فعالاً للمرضى الذين يعانون من الأمراض التنكسية العصبية.
بالإضافة إلى ذلك، يُشارك بروتين PPIF، كجزء من بروتين MPTP، في إصابات نقص التروية/إعادة التروية، وإصابات الدماغ الرضية ، وضمور العضلات، وسمية الأدوية. [ 7 ] على الرغم من تحديد PPIF كمرشح لاعتلال عضلة القلب التوسعي (DCM) لدى إحدى العائلات المصابة، إلا أن دراسة لاحقة لم تكشف عن أي طفرات في الجين تُشير إلى تورطه في المرض. [ 15 ] مع ذلك، لوحظ في خلايا عضلة القلب تنشيط السيكلوفيلينات بفعل الصدمة الحرارية ونقص الأكسجة وإعادة الأكسجة، بالإضافة إلى ارتباطها ببروتينات الصدمة الحرارية. وبالتالي، قد تُساهم السيكلوفيلينات في حماية القلب أثناء إصابات نقص التروية/إعادة التروية.
حالياً، يرتبط التعبير عن السيكلوفيلين ارتباطاً وثيقاً بتكوّن السرطان، ولكن الآليات المحددة لا تزال بحاجة إلى توضيح. [ 9 ]
التفاعلات
وقد ثبت أن PPIF يتفاعل مع:
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000108179 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000021868 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ بيرجسما دي جيه، إيدر سي، غروس إم، كيرستن إتش، سيلفستر دي، أبيلباوم إي، كوسيمانو دي، ليفي جي بي، ماكلولين إم إم، كاسيان كيه (ديسمبر 1991). "عائلة جينات السيكلوفيلين المتعددة لإنزيمات ببتيديل-بروليل إيزوميراز. توصيف ثلاثة نظائر بشرية منفصلة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 266 (34): 23204-14 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)54484-7 . PMID 1744118 .
- 1 2 3 4 "Entrez Gene: PPIF peptidylprolyl isomerase F (cyclophilin F)" .
- هانسون إم جيه ، موروتا إس، تشين إل، ماتسوياما إن، سوزوكي واي، ناكاجيما إس، تانو تي، أومي إيه، شيباساكي إف، شيمازو إم، إيكيدا واي، أوشينو إتش، إلمير إي (يناير 2011). " انتقال نفاذية الميتوكوندريا الحساس للسيكلوفيلين د في ميتوكوندريا دماغ وكبد الإنسان البالغ" . مجلة علم الأعصاب الرضحي . 28 (1): 143-153 . doi : 10.1089/neu.2010.1613 . PMC 3025768. PMID 21121808 .
- 1 2 3 4 كازوي تي، إينوي إن، يامادا أو، كوماتسو إس (يناير 1992). "التروية الدماغية الانتقائية أثناء جراحة تمدد الأوعية الدموية في قوس الأبهر: إعادة تقييم" . حوليات جراحة الصدر . 53 (1): 109-114 . doi : 10.1016/0003-4975(92)90767-x . PMID 1530810 .
- 1 2 3 4 5 6 ياو كيو، لي إم، يانغ إتش، تشاي إتش، فيشر دبليو، تشين سي (مارس 2005). "أدوار السيكلوفيلينات في السرطانات وأجهزة الجسم الأخرى". المجلة العالمية للجراحة . 29 (3): 276-280 . doi : 10.1007/s00268-004-7812-7 . PMID 15706440. S2CID 11678319 .
- 1 2 3 4 5 وانغ تي، يون سي إتش، غو إس واي، تشانغ دبليو آر، ليانغ دي سي (أغسطس 2005). "1.88 البنية البلورية للنطاق C من hCyP33: نطاق جديد من إنزيم ببتيديل-بروليل سيس-ترانس إيزوميراز". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 333 (3): 845-849 . doi : 10.1016/j.bbrc.2005.06.006 . PMID 15963461 .
- ↑ ستوكي، ب.، تشابمان، د.س.، بيتش، ل.أ.، ويليامز، د.ب. (أغسطس 2014). "يؤدي استنفاد السيكلوفيلينات ب وج إلى خلل في تنظيم التوازن التأكسدي والاختزالي للشبكة الإندوبلازمية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 289 (33): 23086-96 . doi : 10.1074/jbc.M114.570911 . PMC 4132807. PMID 24990953 .
- ↑ جاندوفا ج، جاندا ج، سلاي جيه إي (مارس 2013). "يُغير السيكلوفيلين 40 موت الخلايا المبرمج الناتج عن الأشعة فوق البنفسجية أ وتوليد أنواع الأكسجين التفاعلية في الميتوكوندريا في الخلايا الكيراتينية" . بحوث الخلايا التجريبية . 319 (5): 750-760 . doi : 10.1016/j.yexcr.2012.11.016 . PMC 3577976. PMID 23220213 .
- ↑ هوفمان هـ، شين-فيشر س (يوليو 2014). "الجوانب الوظيفية للسايكلوفيلينات خارج الخلوية". الكيمياء الحيوية . 395 ( 7-8 ): 721-35 . doi : 10.1515 / hsz-2014-0125 . PMID 24713575. S2CID 32395688 .
- 1 2 3 McStay GP, Clarke SJ, Halestrap AP (أكتوبر 2002). "دور مجموعات الثيول الحرجة على سطح مصفوفة ناقل نيوكليوتيد الأدينين في آلية مسام انتقال نفاذية الميتوكوندريا" . مجلة الكيمياء الحيوية . 367 (الجزء 2): 541-548 . doi : 10.1042/BJ20011672 . PMC 1222909. PMID 12149099 .
- 1 2 باولز كيه آر، زينتز سي، أبراهام إس إي، براندون إل، باولز إن إي، تاوبين جيه إيه (ديسمبر 1999). "التوصيف الجينومي لجين طليعة الميتوكوندريا لإنزيم ببتيديل-بروليل-سيس-ترانس-إيزوميراز البشري: تقييم دوره في اعتلال عضلة القلب التوسعي العائلي". علم الوراثة البشرية . 105 (6): 582-586 . doi : 10.1007/s004390051149 . PMID 10647893 .
- 1 2 هي واي، جي جي، تومبران-تينك جيه (نوفمبر 2008). "عيوب الميتوكوندريا واختلال تنظيم الكالسيوم في خلايا الشبكة التربيقية المصابة بالزرق". طب العيون الاستقصائي وعلوم الرؤية . 49 (11): 4912-22 . doi : 10.1167/iovs.08-2192 . PMID 18614807 .
للمزيد من القراءة
- كرومبتون م، فيرجي س، وارد ج م (ديسمبر 1998). "يرتبط السيكلوفيلين-د بقوة بمركبات قناة الأنيون المعتمدة على الجهد الكهربائي وناقل نيوكليوتيد الأدينين لتشكيل مسام انتقال النفاذية" . المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 258 (2): 729-35 . doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2580729.x . PMID 9874241 .
- باولز كيه آر، زينتز سي، أبراهام إس إي، براندون إل، باولز إن إي، تاوبين جيه إيه (ديسمبر 1999). "التوصيف الجينومي لجين طليعة الميتوكوندريا لإنزيم ببتيديل-بروليل-سيس-ترانس-إيزوميراز البشري: تقييم دوره في اعتلال عضلة القلب التوسعي العائلي". علم الوراثة البشرية . 105 (6): 582-586 . doi : 10.1007/s004390051149 . PMID 10647893 .
- باولز كيه آر، أبراهام إس إي، بروجادا آر، زينتز سي، كومو جيه، سوراجا دي، تسوباتا إس، لي إتش، براندون إل، جيبس آر إيه، شيرر إس إي، باولز إن إي، تاوبين جيه إيه (يوليو 2000). "بناء خريطة فيزيائية عالية الدقة لموقع اعتلال عضلة القلب المتوسع على الكروموسوم 10q22-q23 وتحليل الجينات المرشحة". علم الجينوم . 67 (2): 109-127 . doi : 10.1006/geno.2000.6242 . PMID 10903836 .
- أندرسن جيه إس، ليون سي إي، فوكس إيه إتش، ليونغ إيه كيه، لام واي دبليو، ستين إتش، مان إم، لاموند إيه آي (يناير 2002). " تحليل البروتينات الموجه للنواة البشرية" . علم الأحياء الحالي . 12 (1): 1-11 . Bibcode : 2002CBio...12....1A . doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033 .
- لين دي تي، وليشتلايتر جيه دي (أغسطس 2002). "يحمي السيكلوفيلين د الموجه إلى الميتوكوندريا الخلايا من الموت الخلوي عن طريق تحويل الببتيديل بروليل" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 277 (34): 31134-41 . doi : 10.1074/jbc.M112035200 . PMID 12077116 .
- Clark HF، Gurney AL، Abaya E، Baker K، Baldwin D، Brush J، Chen J، Chow B، Chui C، Crowley C، Currell B، Deuel B، Dowd P، Eaton D، Foster J، Grimaldi C، Gu Q، Hass PE، Heldens S، Huang A، Kim HS، Klimowski L، Jin Y، Johnson S، Lee J، Lewis L، Liao D، Mark M، Robbie E، Sanchez C، Schoenfeld J، Seshagiri S، Simmons L، Singh J، Smith V، Stinson J، Vagts A، Vandlen R، Watanabe C، Wieand D، Woods K، Xie MH، Yansura D، Yi S، Yu G، Yuan J، Zhang M، Zhang Z، Goddard A، Wood WI، Godowski P، Gray A (أكتوبر 2003). مبادرة اكتشاف البروتينات المفرزة (SPDI)، وهي جهد واسع النطاق لتحديد البروتينات البشرية المفرزة والبروتينات الغشائية الجديدة: تقييم معلوماتي حيوي . مجلة أبحاث الجينوم . 13 (10): 2265-2270 . doi : 10.1101/gr.1293003 . PMC 403697. PMID 12975309 .
- أندرسن جيه إس، لام واي دبليو، ليونغ إيه كيه، أونغ إس إي، ليون سي إي، لاموند إيه آي، مان إم (يناير 2005). "ديناميكيات البروتينات النووية". نيتشر . 433 (7021): 77-83 . Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038 / nature03207 . PMID 15635413. S2CID 4344740 .
روابط خارجية
- موقع جين PPIF البشري في متصفح جينوم UCSC .
- تفاصيل جين PPIF البشري في متصفح جينوم UCSC .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري رقم 10
