المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يُحدد القانون الدولي لتسمية بدائيات النوى ( ICNP )، أو قانون بدائيات النوى ، والذي كان يُعرف سابقًا بالقانون الدولي لتسمية البكتيريا ( ICNB ) أو قانون علم البكتيريا ( BC )، الأسماء العلمية للبكتيريا والعتائق . [ 1 ] [ 2 ] وهو يُحدد قواعد تسمية أصناف البكتيريا ، وفقًا لرتبتها النسبية. وبذلك، يُعد أحد قوانين التسمية في علم الأحياء .

في الأصل، تناول القانون الدولي لتسمية النباتات البكتيريا، وظلّت الإشارات إليها موجودة حتى تمّ حذفها في المؤتمر الدولي لعلم النبات عام 1975. وقد أُقرّ قانونٌ مبكرٌ لتسمية البكتيريا في المؤتمر الدولي الرابع لعلم الأحياء الدقيقة عام 1947، ولكن تمّ التخلي عنه لاحقاً.

أحدث نسخة مطبوعة في كتاب هي نسخة عام 1990، [ 3 ] إلا أن الكتاب لا يُمثل القواعد الحالية. وقد نُشرت نسختا عامي 2008 و2022 في المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري (IJSEM). [ 2 ] وتتولى اللجنة الدولية لتصنيف بدائيات النوى (ICSP؛ والتي كانت تُعرف سابقًا باسم اللجنة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي، ICSB) مسؤولية تحديث القواعد.

تعتبر القوائم المعتمدة [ 4 ] هي الأساس لأسماء البكتيريا، حيث تبدأ من عام 1980. ويتم مراجعة أسماء البكتيريا الجديدة من قبل ICSP للتأكد من توافقها مع قواعد التسمية ونشرها في IJSEM .

البكتيريا الزرقاء

منذ عام 1975، كانت معظم البكتيريا مشمولة بالتصنيف البكتيري. مع ذلك، ظلت البكتيريا الزرقاء مشمولة بالتصنيف النباتي. ابتداءً من عام 1999، أصبحت البكتيريا الزرقاء مشمولة بالتصنيفين النباتي والبكتيري معًا. وقد تسبب هذا الوضع في مشاكل تسمية للبكتيريا الزرقاء. [ 5 ] [ 6 ] وبحلول عام 2020، طُرحت ثلاثة مقترحات لحل هذه المشكلة:

  1. استبعد البكتيريا الزرقاء من التصنيف البكتيري. [ 7 ]
  2. يُطبَّق الرمز البكتيري على جميع أنواع البكتيريا الزرقاء. [ 8 ]
  3. [ 9 ] تعامل مع المنشورات الصحيحة بموجب قانون علم النبات على أنها منشورات صحيحة بموجب قانون علم البكتيريا.

في عام 2021، أجرت اللجنة الدولية لبرامج الرعاية الصحية تصويتاً رسمياً على المقترحات الثلاثة، وتم اختيار الخيار الثالث. [ 10 ]

السلالة النموذجية

منذ عام ٢٠٠١، يُشترط تحديد سلالة نموذجية عند وصف أي نوع جديد من البكتيريا أو العتائق. [ ١١ ] السلالة النموذجية هي مزرعة حية يُلحق بها الاسم العلمي للكائن الحي رسميًا. وللنشر الصحيح لاسم نوع جديد، يجب إيداع السلالة النموذجية في مجموعة مزارع عامة في دولتين مختلفتين على الأقل. [ ١٢ ] قبل عام ٢٠٠١، كان من الممكن أيضًا تحديد السلالة النموذجية للنوع باستخدام وصف أو عينة محفوظة أو رسم توضيحي. [ ١١ ] توجد سلالة نموذجية واحدة لكل نوع من بدائيات النوى، ولكن قد تُخصص مجموعات المزارع المختلفة اسمًا فريدًا للسلالة نفسها. على سبيل المثال، يُطلق على السلالة النمطية لبكتيريا الإشريكية القولونية (التي كانت تُعرف في الأصل باسم السلالة U5/41) اسم ATCC 11775 من قِبل المجموعة الأمريكية لزراعة الأنماط ، وDSM 30083 من قِبل المجموعة الألمانية للكائنات الدقيقة وزراعات الخلايا ، وJCM 1649 من قِبل المجموعة اليابانية للكائنات الدقيقة ، وLMG 2092 من قِبل المجموعات البلجيكية المنسقة للكائنات الدقيقة . [ 13 ] [ 14 ]

عندما يتعذر استزراع نوع بدائي النواة في المختبر (وبالتالي يتعذر إيداعه في مجموعة مزارع)، يُمكن منحه اسمًا مؤقتًا (Candidatus )، لكنه لا يُعتبر منشورًا بشكل صحيح. [ 15 ] منذ عام 2024، يُمكن اعتماد هذه الأسماء بشكل صحيح، لتصبح أسماءً شرعية ودقيقة. يتطلب ذلك أن يستوفي الاسم معظم متطلبات النشر الصحيح (وكذلك الشرعية والدقة)، باستثناء إيداع المزرعة في القاعدة 30، حيث يُمكن استبداله بمزرعة حية لا تستوفي متطلبات القاعدة 30، أو بعينة محفوظة، أو بتسلسل جينومي مُودع في مركز بيانات الجينوم الوطني ( INSDC )، أو بتسلسل جين واحد مُودع في مركز بيانات الجينوم الوطني (INSDC). تتنافس الأسماء الشرعية ( Candidatus) فيما بينها على الأولوية، لكنها لا تتنافس مع الأسماء الشرعية "الحقيقية". [ 16 ]

قبل آلية النشر المعتمدة، كان التحقق من صحة أسماء Candidatus يقع على عاتق مدونة تسمية بدائيات النوى الموصوفة من بيانات التسلسل ( SeqCode ) التي نشرتها الجمعية الدولية لعلم البيئة الميكروبية ، وهي منظمة منفصلة عن ICSP، في عام 2022. [ 17 ]

اختلافات ملحوظة أخرى عن المدونة النباتية

اختلافات ملحوظة في القواعد:

  • لا يُسمح باستخدام الواصلة. تُدمج الأسماء التي سبق استخدام الواصلة فيها والمركبات الجديدة ببساطة. [ 18 ] : القاعدة 12أ
  • لا يُسمح باستخدام علامات التشكيل. توجد بدائل ثابتة من حرفين لبعض الأحرف التي تحتوي على علامات تشكيل. [ 18 ] : القاعدة 64 : لا يوجد استثناء توضيحي لعلامة التشكيل (ë) كما هو الحال في القاعدة 60.7 من قانون شنتشن . [ 19 ]

اختلافات ملحوظة في الممارسات الموصى بها:

  • يُوصى بتمييز الأسماء العلمية "باستخدام خط مختلف، مثل الخط المائل، أو بأي وسيلة أخرى". ولا يُعدّ استخدام الخط المائل إلزاميًا. [ 18 ] : 4.أ.(3)
    • لا توجد قواعد محددة للرتب فيما يتعلق بالكتابة المائلة في ICNP. في حين أن العديد من الناشرين يختارون كتابة الأجناس والأنواع فقط بخط مائل، فإن المجلة الدولية للعلوم والهندسة الطبية الحيوية (IJSEM) التابعة لها ونص ICNP نفسه يكتبان جميع الأسماء العلمية بخط مائل (باستثناء التنسيق الخاص بجنس Candidatus ).
    • لا تُكتب الكلمات اللاتينية أو الاختصارات التي تلي اسمًا علميًا مكتوبًا بخط مائل بخط مائل. يمكن كتابتها بخط عادي (روماني)، أو بخط غامق إذا رُغِبَ في التمييز. [ 18 ] : القاعدة 33أ: ملاحظة 2
  • يُستخدم مصطلح الاستشهاد بالمؤلف ex بين قوسين، على النحو التالي: " التصنيف (ex سابقًا) لاحقًا ". ويجب الاستشهاد بالتنقيحات اللاحقة على النحو التالي: " التصنيف (لاحقًا ex سابقًا) لاحقًا ". كما يجب وضع non بين قوسين، كما في: " Achromobacter Yabuuchi and Yano 1981 (non Achromobacter Bergey et al. 1923 )". [ 18 ] : 4.ب.(3)

الإصدارات

  • بوكانان، ر. إي.، ورالف سانت جون-بروكس. (يونيو 1947) (محرران). قانون التسمية البكتريولوجية المقترح . تم تطويره بناءً على مقترحات وافقت عليها اللجنة الدولية للتسمية البكتريولوجية في اجتماع المؤتمر الدولي الثالث لعلم الأحياء الدقيقة. نُشر في الجلسة العامة، صفحة  61. مطبعة كلية ولاية أيوا، أميس، أيوا، الولايات المتحدة الأمريكية. هاثي تراست .
  • بوكانان ، ر. إي.، سانت جون-بروكس، ر.، بريد، ر. س. (1948). "المدونة الدولية لتسمية البكتيريا" . مجلة علم البكتيريا . 55 (3): 287-306 . doi : 10.1128/jb.55.3.287-306.1948 . PMC 518444. PMID 16561459 .  {{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) Reprinted 1949, Journal of General Microbiology 3, 444–462.
  • اللجنة الدولية لتسمية البكتيريا. (يونيو 1958). المدونة الدولية لتسمية البكتيريا والفيروسات . أميس، مطبعة كلية ولاية أيوا. مكتبة التراث البيولوجي .
  • لاباج، إس بي، سنيث، بي إتش إيه، ليسيل، إي إف، سكيرمان، في بي دي، سيليجر، إتش بي آر، وكلارك، دبليو إيه (1975). المدونة الدولية لتسمية البكتيريا . مراجعة 1975. الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة، واشنطن العاصمة.
  • لاباج، إس بي، سنيث، بي إتش إيه، ليسيل، إي إف، سكيرمان، في بي دي، سيليجر، إتش بي آر، وكلارك، دبليو إيه (1992). المدونة الدولية لتسمية البكتيريا . المدونة البكتريولوجية. مراجعة 1990. الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة، واشنطن العاصمة .
  • باركر، سي تي، تيندال، بي جيه، وغاريتي، جي إم، محرران. (2019). المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى. مدونة بدائيات النوى (مراجعة 2008) . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري 69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778
  • أورين، أهارون؛ أراهال، ديفيد ر.؛ جوكر، ماركوس؛ مور، إدوارد ر.ب.؛ روسيلو-مورا، رامون؛ سوتكليف، إيان س. (1 مايو 2023). "المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى. مدونة بدائيات النوى (مراجعة 2022)" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 73 (5أ). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID 37219928 . 

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ "الصفحة الرئيسية" . the-icsp.org .
  2. 1 2 ب. هـ. أ. سنيث، 2003. تاريخ موجز لرمز علم البكتيريا. رابط مؤرشف بتاريخ 24-05-2012 على موقع Wayback Machine.
  3. ^ لاباج، ليرة سورية؛ سنيث، فا؛ ليسل، إي إف؛ سكيرمان، VBD. سيليجر، هابر؛ كلارك، واشنطن (5 مارس 1992). قواعد التسمية مع التوصيات . ASM برس – عبر ncbi.nlm.nih.gov.
  4. ↑ VBD Skerman، Vicki McGowan، وPHA Sneath، 1989. قوائم معتمدة لأسماء البكتيريا، طبعة منقحة. واشنطن العاصمة: مطبعة الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة
  5. ↑ أورين، أ. (2011). "تصنيف وتسمية البكتيريا الزرقاء كما ورد في النشرة الدولية لتسمية وتصنيف البكتيريا / المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي / المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري" ( ملف PDF) . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 61 (1): 10-15 . doi : 10.1099/ijs.0.018838-0 . PMID 21097637. S2CID 206169872 .  
  6. ↑ أورين أ، فينتورا س (2017). "الوضع الحالي لتسمية البكتيريا الزرقاء وفقًا للرمز "بدائي النواة" والرمز "النباتي"". أنطوني فان ليفينهوك . 110 (10): 1257-1269 . doi : 10.1007/ s10482-017-0848-0 . PMID 28243951. S2CID 23489558 .  
  7. ↑ أورين أ، غاريتي جي إم (2014). "اقتراح لتغيير الاعتبار العام 5 والمبدأ 2 من المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 64 (1): 309-310 . doi : 10.1099/ijs.0.059568-0 . PMID 24408952 . 
  8. ↑ بينيفيتش، أ. ف. (2015). "مقترح لتطبيق المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى (ICNP) بشكل متسق على أسماء البكتيريا الضوئية المنتجة للأكسجين (البكتيريا الزرقاء)، بما في ذلك تلك المنشورة بشكل صحيح بموجب المدونة الدولية لتسمية النباتات (ICBN)/المدونة الدولية لتسمية الطحالب والفطريات والنباتات (ICN)، ومقترح لتغيير المبدأ 2 من المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى (ICNP)" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 65 (3): 1070-1074 . doi : 10.1099/ijs.0.000034 . PMID 25505344 . 
  9. ↑ أورين أ. (2020). "ثلاثة مقترحات بديلة لتعديل قواعد المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى لحل وضع البكتيريا الزرقاء في تسمية بدائيات النوى" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 70 (7): 4406-4408 . doi : 10.1099/ijsem.0.004268 . PMID 32602831. S2CID 220270571 .  
  10. ↑ أورين أ، أراهال د.ر، روسيلو-مورا ر، سوتكليف إ.س، مور إ.ر (2021). "تعديل الاعتبار العام 5 والقواعد 18أ، 24أ، و30 من المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى لتحديد وضع البكتيريا الزرقاء في تسمية بدائيات النوى" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 71 (8): 004939. doi : 10.1099/ijsem.0.004939 . PMID 34342563. S2CID 236884663 .  
  11. 1 2 قانون بدائيات النوى (مراجعة 2008) ، القاعدة 18أ.
  12. ↑ قانون بدائيات النوى (مراجعة 2008) ، القاعدة 30.
  13. ↑ يوزيبي جيه بي، بارتي إيه سي. " الإشريكية القولونية " . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 21 يونيو 2022 .
  14. ↑ رايمر إل سي، ساردا كارباس جيه، كوبليتز جيه، إبيلينج سي، بودستاوكا أ، أوفرمان جيه. " الإشريكية القولونية U5/41" . باك دايف . تم الاسترجاع في 21 يونيو 2022 .
  15. ↑ الكود بدائيات النوى (مراجعة 2008) ، الملحق 11.
  16. ↑ أورين، أهارون (8 يناير 2025). "إضافة القسم 10، القواعد 66-73 لمزيد من دمج أسماء كانديداتوس في المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 75 (1): 006638. doi : 10.1099/ijsem.0.006638 . PMC 12281813. PMID 39786349 .  
  17. ↑ هيدلوند بي بي، تشوفوشينا إم، هوغنهولتز بي، كونستانتينيديس كيه تي، موراي إيه إي، بالمر إم، باركس دي إتش، بروبست إيه جيه، ريسنباخ إيه إل، رودريغيز-آر إل إم، روسيلو-مورا آر، سوتكليف آي سي، فينتر إس إن، ويتمان دبليو بي (أكتوبر 2022). "SeqCode: رمز تسمية للكائنات بدائية النواة الموصوفة من بيانات التسلسل" . نات ميكروبيول . 7 (10): 1702-1708 . doi : 10.1038/s41564-022-01214-9 . PMC 9519449. PMID 36123442 .  
  18. 1 2 3 4 5 أورين، أهارون؛ أراهال، ديفيد ر.؛ جوكر، ماركوس؛ مور، إدوارد ر.ب.؛ روسيلو-مورا، رامون؛ سوتكليف، إيان س. (1 مايو 2023). "المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى. مدونة بدائيات النوى (مراجعة 2022)" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 73 (5أ). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID 37219928 . 
  19. ↑ "المادة 60" . www.iapt-taxon.org .