الحمض النووي الريبي النووي الصغير

يُعدّ الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير ( snRNA ) فئةً من جزيئات الحمض النووي الريبوزي الصغيرة الموجودة داخل بقع التضفير وأجسام كاجال في نواة الخلية حقيقية النواة . يبلغ طول جزيء snRNA المتوسط ​​حوالي 150 نيوكليوتيدًا. ويتم نسخه بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي II أو بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III . [ 1 ] وتتمثل وظيفته الأساسية في معالجة الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي ( hnRNA ) في النواة. كما ثبت أنه يُساعد في تنظيم عوامل النسخ ( 7SK RNA ) أو بوليميراز الحمض النووي الريبوزي II (B2 RNA)، وفي الحفاظ على التيلوميرات .

ترتبط جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) دائمًا بمجموعة من البروتينات المحددة، وتُعرف هذه المركبات باسم البروتينات النووية الريبوزية الصغيرة ( snRNP ). يتكون كل جسيم snRNP من مكون snRNA وعدة بروتينات خاصة بـ snRNP (بما في ذلك بروتينات Sm ، وهي عائلة من البروتينات النووية). تُعرف مكونات snRNA البشرية الأكثر شيوعًا في هذه المركبات، على التوالي، باسم: U1 spliceosomoal RNA ، و U2 spliceosomoal RNA ، وU4 spliceosomoal RNA ، و U5 spliceosomoal RNA ، و U6 spliceosomoal RNA . وتستمد هذه التسمية من محتواها العالي من اليوريدين .

تم اكتشاف جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) بالصدفة أثناء تجربة الفصل الكهربائي الهلامي عام 1966. [ 2 ] عُثر على نوع غير متوقع من الحمض النووي الريبوزي في الهلام، وتمت دراسته. أظهرت التحليلات اللاحقة أن هذه الجزيئات غنية باليوريديلات، وأنها تتواجد في النواة.

لا يُعدّ كلٌّ من الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير ( snRNA ) والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snoRNA) متماثلين، ولا يُعتبر أيٌّ منهما نوعًا فرعيًا من الآخر. بل يُمثّل كلٌّ منهما فئةً مُستقلةً من الحمض النووي الريبوزي الصغير. يلعب الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير أدوارًا أساسيةً في تكوين الحمض النووي الريبوزي ، ويُوجّه التعديلات الكيميائية للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) وجينات الحمض النووي الريبوزي الأخرى، بما في ذلك الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA). يتواجد هذا الحمض في النوية وأجسام كاجال في الخلايا حقيقية النواة (المواقع الرئيسية لتخليق الحمض النووي الريبوزي)، حيث يُطلق عليه اسم الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير الخاص بأجسام كاجال (scaRNA).

الصفوف الدراسية

غالباً ما يتم تقسيم جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) إلى فئتين بناءً على كل من خصائص التسلسل المشتركة وعوامل البروتين المرتبطة بها مثل بروتينات LSm الرابطة للحمض النووي الريبوزي . [ 3 ]

تُعدّ الفئة الأولى، المعروفة باسم snRNA من فئة Sm ، الأكثر دراسةً، وتتألف من U1، وU2، وU4، وU4atac ، وU5، و U7 ، و U11 ، و U12 . تُنسخ جزيئات snRNA من فئة Sm بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي II . تُنسخ جزيئات pre-snRNA وتتلقى غطاء 7-ميثيل غوانوزين الخماسي المعتاد في النواة . ثم تُصدّر إلى السيتوبلازم عبر المسام النووية لمزيد من المعالجة. في السيتوبلازم، تخضع جزيئات snRNA لعملية تقليم من الطرف 3′ لتكوين بنية جذعية حلقية، بالإضافة إلى فرط مثيلة الغطاء 5′ لتكوين ثلاثي ميثيل غوانوزين. [ 4 ] تُعدّ البنية الجذعية 3′ ضرورية للتعرف عليها بواسطة بروتين بقاء الخلايا العصبية الحركية (SMN). [ 5 ] يُجمّع هذا المركب جزيئات snRNA في بروتينات ريبونوكليوبروتينية مستقرة (RNPs). ثم يُعدّ الغطاء 5′ المُعدّل ضروريًا لإعادة استيراد snRNP إلى النواة. تشكل جميع جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير الغنية باليوريدين، باستثناء U7، نواة الجسيم الرابط . يُعدّ الربط، أو إزالة الإنترونات ، جانبًا رئيسيًا من التعديل ما بعد النسخي، ويحدث فقط في نواة حقيقيات النوى. وقد وُجد أن U7 snRNA يؤدي وظيفة في معالجة الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي للهيستونات.

تتألف الفئة الثانية، المعروفة باسم snRNA من فئة Lsm ، من U6 و U6atac . تُنسخ جزيئات snRNA من فئة Lsm بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي III ولا تغادر النواة أبدًا، على عكس جزيئات snRNA من فئة Sm. تحتوي جزيئات snRNA من فئة Lsm على غطاء أحادي ميثيل فوسفات γ-5′ [ 6 ] وحلقة ساقية 3′، تنتهي بسلسلة من اليوريدينات التي تُشكل موقع ارتباط حلقة غير متجانسة سباعية مميزة من بروتينات Lsm. [ 7 ]

في الجسيم الرابط

مقارنة بين آليات التضفير الرئيسية والثانوية

تحفز الجسيمات الرابطة عملية الربط ، وهي خطوة أساسية في نضج الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي في حقيقيات النوى. قد يكون خطأ الربط، حتى في نيوكليوتيد واحد ، كارثيًا على الخلية، لذا فإن وجود طريقة موثوقة وقابلة للتكرار لمعالجة الحمض النووي الريبوزي ضروري لضمان بقاء الخلية. الجسيم الرابط هو مُركب كبير من البروتين والحمض النووي الريبوزي، يتكون من خمسة جزيئات صغيرة من الحمض النووي الريبوزي النووي (U1، U2، U4، U5، وU6) وأكثر من 150 بروتينًا. تُشكل جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير، مع البروتينات المرتبطة بها، مُركبات ريبونوكليوبروتينية (snRNPs)، التي ترتبط بتسلسلات مُحددة على ركيزة الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي . [ 8 ] تُؤدي هذه العملية المُعقدة إلى تفاعلي نقل إستري مُتتاليين. يُنتج هذان التفاعلان إنترونًا حلقيًا حرًا ويربطان إكسونين لتكوين حمض نووي ريبوزي رسول ناضج. يوجد نوعان مُنفصلان من الجسيمات الرابطة. تُعدّ الفئة الرئيسية، الأكثر وفرةً في الخلايا حقيقية النواة، مسؤولةً بشكل أساسي عن وصل الإنترونات من النوع U2. تتمثل الخطوة الأولى في عملية الوصل في ارتباط جسيم U1 snRNP والبروتينات المرتبطة به بالنهاية 5' للوصل في hnRNA . يُنشئ هذا الارتباط مُركّب الالتزام الذي يُقيّد hnRNA في مسار الوصل. [ 9 ] بعد ذلك، يتم استقطاب جسيم U2 snRNP إلى موقع ارتباط الجسيم الرابط، مُشكّلاً المُركّب A، ثم يرتبط مُركّب U5.U4/U6 tri-snRNP بالمُركّب A لتكوين البنية المعروفة باسم المُركّب B. بعد إعادة الترتيب، يتكوّن المُركّب C، ويصبح الجسيم الرابط نشطًا للتحفيز. [ 10 ] في الجسيم الرابط النشط تحفيزيًا، يطوى كل من U2 وU6 snRNA لتكوين بنية محفوظة تُسمى الثلاثية التحفيزية. [ 11 ] تُنسّق هذه البنية أيوني مغنيسيوم يُشكّلان الموقع النشط للجسيم الرابط. [ 12 ] [ 13 ] هذا مثال على التحفيز بواسطة الحمض النووي الريبي .

بالإضافة إلى مُركّب الجسيم الرابط الرئيسي، يوجد جسيم رابط ثانوي أقل شيوعًا (حوالي 1%) . يتألف هذا المُركّب من جسيمات نووية ريبوزية صغيرة (snRNPs) من نوع U11، وU12، وU4atac، وU6atac، وU5. تُعدّ هذه الجسيمات نظائر وظيفية للجسيمات المستخدمة في الجسيم الرابط الرئيسي. يقوم الجسيم الرابط الثانوي بربط الإنترونات من نوع U12. يختلف نوعا الإنترونات بشكل أساسي في مواقع الربط: تحتوي الإنترونات من نوع U2 على مواقع ربط GT-AG عند الطرفين 5′ و3′، بينما تحتوي الإنترونات من نوع U12 على مواقع ربط AT-AC عند الطرفين 5′ و3′. يؤدي الجسيم الرابط الثانوي وظيفته عبر مسار مختلف عن مسار الجسيم الرابط الرئيسي.

U1 snRNA

البنية الثانوية المتوقعة وحفظ تسلسل الحمض النووي الريبوزي الصغير U1

يُعدّ U1 snRNP مُحفّزًا لنشاط الجسيم الرابط في الخلية، وذلك من خلال اقترانه القاعدي بموقع الربط 5′ لجزيء ما قبل mRNA. في الجسيم الرابط الرئيسي، أظهرت البيانات التجريبية أن U1 snRNP موجود بنسبة متساوية مع U2 وU4 وU5 وU6 snRNP. مع ذلك، فإن وفرة U1 snRNP في الخلايا البشرية تفوق بكثير وفرة جزيئات snRNP الأخرى. [ 14 ] من خلال تثبيط جين U1 snRNA في خلايا HeLa ، أظهرت الدراسات أن U1 snRNA ذو أهمية بالغة لوظائف الخلية. عند تعطيل جينات U1 snRNA، أظهرت المصفوفات الدقيقة الجينومية زيادة في تراكم جزيئات ما قبل mRNA غير المربوطة. [ 15 ] بالإضافة إلى ذلك، تبيّن أن التعطيل يُسبب انقسامًا مبكرًا وإضافة ذيل عديد الأدينين ، خاصةً في الإنترونات القريبة من بداية النسخة. عند تعطيل جزيئات snRNA الأخرى القائمة على اليوريدين، لم يُلاحظ هذا التأثير. وهكذا، تبين أن اقتران قواعد الحمض النووي الريبوزي الصغير U1 مع الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي يحمي الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي من إضافة ذيل عديد الأدينين ومن الانقسام المبكر. وقد تفسر هذه الحماية الخاصة وفرة الحمض النووي الريبوزي الصغير U1 في الخلية.

snRNPs والأمراض البشرية

من خلال دراسة البروتينات النووية الريبية الصغيرة (snRNPs) والبروتينات النووية الصغيرة (sno)RNPs، تمكنا من فهم العديد من الأمراض المهمة بشكل أفضل.

ضمور العضلات الشوكي - تؤدي الطفرات في جين SMN1 (جين بقاء الخلايا العصبية الحركية 1) إلى تنكس الخلايا العصبية الحركية في النخاع الشوكي وهزال عضلي حاد. يقوم بروتين SMN بتجميع جزيئات snRNP من فئة Sm، وربما أيضًا جزيئات snoRNP وجزيئات RNP أخرى. [ 16 ] يصيب ضمور العضلات الشوكي ما يصل إلى شخص واحد من بين كل 6000 شخص، وهو ثاني أكثر أسباب الأمراض العصبية العضلية شيوعًا بعد ضمور دوشين العضلي . [ 17 ]

خلل التقرن الخلقي - وُجد أن الطفرات في جزيئات snRNP المُجمَّعة تُعد أيضًا سببًا لخلل التقرن الخلقي، وهو متلازمة نادرة تظهر بتغيرات غير طبيعية في الجلد والأظافر والأغشية المخاطية. تشمل بعض الآثار النهائية لهذا المرض فشل نخاع العظم والسرطان. وقد ثبت أن هذه المتلازمة تنشأ من طفرات في جينات متعددة، بما في ذلك ديسكيرين ، وRNA تيلوميراز، وإنزيم تيلوميراز النسخ العكسي . [ 18 ]

متلازمة برادر-ويلي - تصيب هذه المتلازمة شخصًا واحدًا من بين كل 12000 شخص، وتتميز بأعراض الجوع الشديد، ومشاكل إدراكية وسلوكية، وضعف في قوة العضلات، وقصر القامة. [ 19 ] وقد رُبطت هذه المتلازمة بحذف منطقة من الكروموسوم الأبوي 15 لا تُعبر عنها الكروموسومات الأمومية. تحتوي هذه المنطقة على جزيء snRNA خاص بالدماغ يستهدف mRNA لمستقبل السيروتونين -2 C.

الورم الأرومي النخاعي – يحدث طفرة في الحمض النووي الريبوزي الصغير U1 في مجموعة فرعية من هذه الأورام الدماغية ، مما يؤدي إلى تغيير في عملية تضفير الحمض النووي الريبوزي . [ 20 ] تحدث الطفرات بشكل رئيسي في أورام البالغين، وترتبط بتشخيص سيئ.

التعديل ما بعد النسخ

في حقيقيات النوى ، تحتوي جزيئات الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) على كمية كبيرة من تعديلات الميثيل في الموقع 2′-O وتعديلات اليوريدين الكاذب . [ 21 ] ترتبط هذه التعديلات بنشاط snoRNA الذي يُعدِّل عادةً جزيئات الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي غير الناضجة، ولكن لوحظ أيضًا تعديلها لأهداف أخرى من الحمض النووي الريبوزي الخلوي، مثل snRNA. أخيرًا، يمكن أن يُحدِّد إضافة ذيل عديد الأدينين (ذيل عديد الأدينين القصير) مصير جزيئات snRNA (التي لا تحتوي عادةً على ذيل عديد الأدينين) وبالتالي يُحفِّز تحلُّلها . [ 22 ] ترتبط هذه الآلية التي تُنظِّم وفرة جزيئات snRNA بدورها بتغيير واسع النطاق في عملية التضفير البديل للحمض النووي الريبوزي.

انظر أيضاً

مراجع

  1. هنري، ر. و.، ميتال، ف.، ما، ب.، كوباياشي، ر.، هيرنانديز، ن. (1998). " يُسهّل SNAP19 تجميع مُركّب مُحفّز أساسي وظيفي (SNAPc) مشترك بين بوليميرازات الحمض النووي الريبي II وIII" . الجينات والتطور . 12 (17): 2664-2672 . doi : 10.1101/gad.12.17.2664 . PMC 317148. PMID 9732265 .  
  2. هادجيولوف، أ.أ.، فينكوڤ، ب.ڤ.، تسانيڤ، ر.ج. (نوفمبر 1966). "تجزئة الأحماض الريبية النووية بواسطة الطرد المركزي بتدرج الكثافة والرحلان الكهربائي على هلام الأغار: مقارنة". الكيمياء الحيوية التحليلية . 17 (2): 263-267 . doi : 10.1016/0003-2697(66)90204-1 . PMID 5339429 . 
  3. ماتيرا إيه جي، تيرنز آر إم، تيرنز إم بي (مارس 2007). "الحمض النووي الريبوزي غير المشفر: دروس مستفادة من الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 8 (3): 209-220 . doi : 10.1038/nrm2124 . PMID 17318225. S2CID 30268055 .  
  4. هام جيه، دارزينكيويتش إي، تاهارا إس إم، ماتاج آي دبليو (أغسطس 1990). "بنية غطاء ثلاثي ميثيل غوانوزين لـ U1 snRNA هي أحد مكونات إشارة استهداف نووي ثنائية الأجزاء". الخلية . 62 (3): 569-577 . doi : 10.1016/0092-8674( 90 )90021-6 . PMID 2143105. S2CID 41380601 .  
  5. سيلينكو ب، سبرانغرز ر، شتير ج، بوهلر د، فيشر يو، ساتلر م (يناير 2001). "بنية نطاق تيودور لبروتين SMN وتفاعله مع بروتينات Sm". مجلة Nature Structural Biology . 8 (1): 27-31 . doi : 10.1038/83014 . PMID 11135666. S2CID 27071310 .  
  6. سينغ ر، ريدي ر (نوفمبر 1989). "غاما-أحادي ميثيل الفوسفات: بنية غطاء في الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير U6 الخاص بالجسيم الرابط" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 86 (21): 8280-8283 . Bibcode : 1989PNAS...86.8280S . doi : 10.1073/pnas.86.21.8280 . PMC 298264. PMID 2813391 .  
  7. كيس تي (ديسمبر 2004). "التكوين الحيوي للبروتينات النووية الصغيرة" . مجلة علوم الخلية . 117 (الجزء 25): 5949-5951 . doi : 10.1242/jcs.01487 . PMID 15564372 . 
  8. ويل سي إل، لورمان آر (يوليو 2011). "بنية ووظيفة الجسيم الرابط" . مجلة كولد سبرينغ هاربور لوجهات نظر في علم الأحياء . 3 (7) a003707. doi : 10.1101/cshperspect.a003707 . PMC 3119917. PMID 21441581 .  
  9. ليجرين ب، سيرافين ب، روشباش م (سبتمبر 1988). "الالتزام المبكر لـ pre-mRNA الخميرة بمسار الجسيم الرابط" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 8 (9): 3755-3760 . doi : 10.1128/MCB.8.9.3755 . PMC 365433. PMID 3065622 .  
  10. بيرج سي بي، توشل تي، شارب بي إيه (1999). "تضفير السلائف إلى mRNA بواسطة الجسيمات التضفيرية" . عالم الحمض النووي الريبي . دراسات CSH. المجلد 37 ( الطبعة الثانية). الصفحات 525-560 . doi : 10.1101/0.525-560 (غير نشط في 12 يوليو 2025) . تم الاسترجاع في 13 أبريل 2017 .   {{cite book}}: صيانة CS1: رقم التعريف الرقمي غير نشط اعتبارًا من يوليو 2025 ( رابط )
  11. فيكا إس إم، ميفورد إم إيه، بيتشيريللي جيه إيه، ستالي جيه بي (مايو 2014). "دليل على وجود بنية ثلاثية محفزة شبيهة بالإنترون من المجموعة الثانية في الجسيم الرابط" . مجلة نيتشر للبيولوجيا التركيبية والجزيئية . 21 (5): 464-471 . doi : 10.1038/nsmb.2815 . PMC 4257784. PMID 24747940 .  
  12. ^ Fica SM، Tuttle N، Novak T، Li NS، Lu J، Koodathingal P، Dai Q، Staley JP، Piccirilli JA (نوفمبر 2013). “يحفز الحمض النووي الريبي (RNA) الربط النووي قبل الرنا المرسال” . طبيعة . 503 (7475): 229–234 . بيب كود : 2013Natur.503..229F . دوى : 10.1038 / طبيعة 12734 . بمك 4666680 . بميد 24196718 .  
  13. ستيتز، ت. أ.، وستيتز ، ج. أ. (يوليو 1993). "آلية عامة لأيونين معدنيين لتحفيز الحمض النووي الريبي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 90 (14): 6498-6502 . Bibcode : 1993PNAS...90.6498S . doi : 10.1073/pnas.90.14.6498 . PMC 46959. PMID 8341661 .  
  14. باسيرغا إس جيه ، ستيتز جيه إيه (1993). "العالم المتنوع للبروتينات النووية الريبية الصغيرة" . عالم الحمض النووي الريبي. دراسات الجمعية الكندية لعلم الوراثة البشرية. المجلد 24. الصفحات 359-381 . doi : 10.1101/0.359-381 (غير نشط في 12 يوليو 2025) . تم الاطلاع عليه في 13 أبريل 2017 .  {{cite book}}: صيانة CS1: رقم التعريف الرقمي غير نشط اعتبارًا من يوليو 2025 ( رابط )
  15. كايدا د، بيرغ إم جي، يونس آي، قاسم إم، سينغ إل إن، وان إل، دريفوس جي (ديسمبر 2010). " يحمي مركب U1 snRNP جزيئات ما قبل mRNA من الانقسام المبكر والتذييل المتعدد الأدينين" . مجلة نيتشر . 468 (7324): 664-668 . Bibcode : 2010Natur.468..664K . doi : 10.1038/nature09479 . PMC 2996489. PMID 20881964 .  
  16. ماتيرا إيه جي، شبارجيل كيه بي (يونيو 2006). "ضخ الحمض النووي الريبوزي: بناء الجسم النووي على طول مسار البروتين النووي الريبوزي". الرأي الحالي في بيولوجيا الخلية . 18 (3): 317-324 . doi : 10.1016/j.ceb.2006.03.005 . PMID 16632338 . 
  17. (Sarnat HB. ضمور العضلات الشوكي. في: Kliegman RM، Behrman RE، Jenson HB، Stanton BF. كتاب نيلسون في طب الأطفال. الطبعة التاسعة عشرة. فيلادلفيا، بنسلفانيا: إلسيفير؛ 2011: الفصل 604.2.)
  18. واتندورف دي جيه، مونك إم (سبتمبر 2005). "متلازمة برادر-ويلي". طبيب الأسرة الأمريكي . 72 (5): 827-830 . PMID 16156341 . 
  19. (Cooke DW, Divall SA, Radovick S. النمو الطبيعي والشاذ. في: Melmed S, ed. Williams Textbook of Endocrinology. الطبعة الثانية عشرة. فيلادلفيا: Saunders Elsevier؛ 2011: الفصل 24.)
  20. سوزوكي هـ، كومار س.أ، شواي س، دياز-نافارو أ، غوتيريز-فرنانديز أ، دي أنتونيلليس ب، كافالي ف.م، جوراشكا ك، فاروق هـ، شيباهارا إ، فلادويو م.س (نوفمبر 2019). "طفرات متكررة في الحمض النووي الريبوزي الصغير غير المشفر U1 تُحفز التضفير الخفي في ورم أرومي نخاعي SHH" . مجلة نيتشر . 574 (7780): 707-711 . Bibcode : 2019Natur.574..707S . doi : 10.1038/s41586-019-1650-0 . ISSN 1476-4687 . PMC 7141958. PMID 31664194 .   
  21. أداتشي هـ، يو واي تي (نوفمبر 2014). "نظرة معمقة على آليات ووظائف تعديل الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) بواسطة اليوريدين الكاذب" . المجلة العالمية للكيمياء البيولوجية . 5 (4): 398-408 . doi : 10.4331/wjbc.v5.i4.398 . PMC 4243145. PMID 25426264 .  
  22. كارغابولوفا، ي.، ليفين، م.، لاكنر، ك.، دانكواردت، س. (يونيو 2017). "sCLIP - منصة متكاملة لدراسة تفاعلات الحمض النووي الريبي مع البروتين في البحوث الطبية الحيوية: تحديد CSTF2tau في المعالجة البديلة للحمض النووي الريبي النووي الصغير" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (10): 6074-6086 . doi : 10.1093/nar/gkx152 . PMC 5449641. PMID 28334977 .