قاعدة بيانات تصنيفية

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

قاعدة البيانات التصنيفية هي قاعدة بيانات تُنشأ لحفظ معلومات عن التصنيفات البيولوجية - على سبيل المثال، مجموعات الكائنات الحية المصنفة حسب اسم النوع أو أي مُعرّف تصنيفي آخر - وذلك لإدارة البيانات واسترجاع المعلومات بكفاءة . تُستخدم قواعد البيانات التصنيفية بشكل روتيني في الإنشاء الآلي لقوائم المراجعة البيولوجية، مثل قوائم النباتات والحيوانات ، سواءً للنشر المطبوع أو الإلكتروني؛ ولدعم تشغيل أنظمة معلومات الأنواع على الإنترنت؛ وكجزء من إدارة المجموعات البيولوجية (على سبيل المثال، في المتاحف والمجموعات النباتية ) ؛ فضلاً عن توفيرها، في بعض الحالات، عنصر إدارة التصنيف ضمن أنظمة معلومات العلوم أو البيولوجيا الأوسع نطاقًا. كما تُعدّ إسهامًا أساسيًا في مجال معلوماتية التنوع البيولوجي .

الأهداف

تُحوّل قواعد البيانات التصنيفية بيانات التنوع البيولوجي العلمية إلى بيانات رقمية، وتُتيح الوصول إلى البيانات التصنيفية لأغراض البحث. [ 1 ] وتختلف قواعد البيانات التصنيفية في نطاق مجموعات التصنيفات والمساحة الجغرافية التي تسعى إلى تضمينها، على سبيل المثال: الخنافس في منطقة محددة، أو الثدييات على مستوى العالم، أو جميع التصنيفات الموصوفة في شجرة الحياة. [ 2 ] وقد تتضمن قاعدة البيانات التصنيفية مُعرّفات الكائنات الحية (الاسم العلمي، والمؤلف، وسنة النشر الأصلية بالنسبة للتصنيفات الحيوانية)، والمرادفات، والآراء التصنيفية، ومصادر الأدبيات أو الاستشهادات، والرسوم التوضيحية أو الصور الفوتوغرافية، والخصائص البيولوجية لكل تصنيف (مثل التوزيع الجغرافي، والبيئة، والمعلومات الوصفية، وحالة التهديد أو الضعف، وما إلى ذلك). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] تقوم بعض قواعد البيانات، مثل قاعدة بيانات مرفق المعلومات العالمي للتنوع البيولوجي (GBIF) ونظام بيانات الباركود الحيوي ، بتخزين الباركود الجيني للتصنيف إن وُجد (ويُسمى أيضًا رقم فهرس الباركود (BIN) الذي قد يُخصص، على سبيل المثال، من قِبل مشروع الباركود الحيوي الدولي (iBOL) أو UNITE، وهي قاعدة بيانات لترميز الحمض النووي للفطريات ). [ 6 ] [ 7 ]

تهدف قواعد البيانات التصنيفية إلى نمذجة الخصائص المهمة للكائنات الحية التي تندرج ضمن نطاق التغطية والاستخدام المقصودين للنظام بدقة. [ 8 ] فعلى سبيل المثال، تستخدم قواعد بيانات الفطريات والطحالب والنباتات اللاوعائية والنباتات الوعائية ("النباتات العليا") قواعد من المدونة الدولية للتسمية النباتية، بينما تستخدم قواعد بيانات الحيوانات ومعظم الطلائعيات قواعد مكافئة من المدونة الدولية للتسمية الحيوانية . وتُعد نمذجة التسلسل الهرمي التصنيفي ذي الصلة لأي مجموعة تصنيفية مناسبة تمامًا للنموذج العلائقي المستخدم في جميع أنظمة قواعد البيانات تقريبًا. ونظرًا لعدم التوصل إلى إجماع علمي بشأن جميع المجموعات التصنيفية، واستمرار اكتشاف أنواع جديدة، فإن من أهداف قواعد البيانات التصنيفية الأخرى المساعدة في حل الخلافات في الآراء العلمية وتوحيد علم التصنيف. [ 2 ]

تاريخ

ربما كان أول نظام موثق لإدارة المعلومات التصنيفية في شكل محوسب هو نظام الترميز التصنيفي الذي طوره ريتشارد شوارتز وآخرون في معهد فرجينيا لعلوم البحار لأنواع الكائنات الحية في خليج تشيسابيك، والذي وُصف في تقرير منشور عام 1972. [ 9 ] أدى هذا العمل، بشكل مباشر أو غير مباشر، إلى مشاريع أخرى ذات أهمية أكبر، بما في ذلك نظام الترميز التصنيفي التابع للمركز الوطني لبيانات الكائنات الحية [ 10 ] ، والذي مرّ بثماني نسخ قبل إيقافه عام 1996، ليتم دمجه وتحويله إلى نظام المعلومات التصنيفية المتكامل (ITIS) الذي لا يزال قائمًا حتى اليوم. يساهم عدد من قواعد البيانات التصنيفية الأخرى، المتخصصة في مجموعات معينة من الكائنات الحية، والتي ظهرت في سبعينيات القرن الماضي وحتى الآن، بشكل مشترك في مشروع Species 2000، الذي يتعاون منذ عام 2001 مع نظام ITIS لإنتاج منتج مشترك، وهو كتالوج الحياة . بينما يركز فهرس الحياة حاليًا على تجميع معلومات أساسية عن أسماء الأنواع كقائمة مرجعية عالمية، فإن العديد من مشاريع قواعد البيانات التصنيفية الأخرى، مثل Fauna Europaea ودليل الحيوانات الأسترالي، [ 11 ] وغيرها، توفر معلومات إضافية غنية تشمل الأوصاف والرسوم التوضيحية والخرائط وغيرها. وتُدرج العديد من مشاريع قواعد البيانات التصنيفية حاليًا على موقع TDWG "مشاريع معلومات التنوع البيولوجي في العالم". [ 12 ]

المصطلحات

قبل ظهور قواعد البيانات التصنيفية، تم إنشاء العديد من قوائم التسمية لسرد أسماء الأجناس، وأحيانًا الأنواع، إلى جانب أصول (مصادر) هذه الأسماء. وفي بعض الأحيان، تتضمن هذه القوائم معلومات إضافية، مثل التوزيع الجغرافي.

على سبيل المثال، يبدو أحد المدخلات في Nomenclator Zoologicus [ 13 ] على النحو التالي:

أبرونيا جنس من السحالي وصفه جون إدوارد غراي عام 1838 في مجلة حوليات ومجلة التاريخ الطبيعي . وينتهي المدخل بملاحظة حول المجموعة الحيوانية التي ينتمي إليها الجنس، وهي الزواحف .

مشاكل

يُثير تمثيل المعلومات التصنيفية بصيغة قابلة للترميز الآلي عددًا من المشكلات التي لا تُصادف في مجالات أخرى، مثل اختلاف طرق الإشارة إلى النوع نفسه أو اسم تصنيف آخر، واستخدام الاسم نفسه لتصنيفات متعددة (الأسماء المتجانسة )، وتعدد الأسماء غير المُستخدمة للتصنيف نفسه ( المرادفات )، وتغيرات تعريف الاسم ومفهوم التصنيف بمرور الوقت، وغير ذلك. [ 8 ] [ 2 ] [ 1 ] كما أن عدم توحيد الفئات والبيانات الوصفية في قواعد البيانات التصنيفية يُعيق قدرة الباحثين على تحليل البيانات. [ 3 ] ومن المنتديات التي شجعت النقاش والحلول الممكنة لهذه المشكلات وما يتصل بها منذ عام 1985، معايير معلومات التنوع البيولوجي (TDWG) ، والتي كانت تُسمى في الأصل فريق عمل قواعد البيانات التصنيفية.

رغم الفوائد الجمة لقواعد البيانات الإلكترونية (مثل زيادة إمكانية الوصول إلى المعلومات التصنيفية)، إلا أنها تنطوي على مشكلات، منها مخاطر سلامة البيانات نتيجةً لوجود نسخ متصلة وغير متصلة بالإنترنت وتحديثات مستمرة، ومشكلات الوصول التقني بسبب انقطاع الخوادم أو الإنترنت، واختلاف القدرات على تنفيذ الاستعلامات المعقدة لاستخراج البيانات التصنيفية في قوائم. [ 2 ] ومع التوسع السريع لكمية المعلومات في قواعد البيانات التصنيفية الإلكترونية، يُعد تجميع البيانات ودمجها ومواءمتها، لا سيما البيانات غير الموحدة عبر قواعد البيانات، تحديًا كبيرًا في علم التصنيف ومعلوماتية التنوع البيولوجي. [ 1 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 فينغ، شياو؛ إنكويست، برايان جيه؛ بارك، دانيال إس؛ بويل، براد؛ بريشيرز، ديفيد دي؛ غالاغر، راشيل في؛ لين، آرون؛ نيومان، إريكا إيه؛ برغر، جوزيف آر؛ مايتنر، برايان إس؛ ميرو، كوري؛ لي، ياوكي؛ هوينه، كيمبرلي إم؛ إرنست، كيسي؛ بالدوين، إليزابيث (يوليو 2022). "مراجعة للمشهد غير المتجانس لقواعد بيانات التنوع البيولوجي: الفرص والتحديات لقاعدة معرفية مُركّبة للتنوع البيولوجي" . علم البيئة العالمي والجغرافيا الحيوية . 31 (7): 1242-1260 . Bibcode : 2022GloEB..31.1242F . doi : 10.1111/geb.13497 . ISSN 1466-822X . 
  2. 1 2 3 4 5 غريني، ماتياس؛ بيرتي، إميليو؛ كارفاخال-كوينتيرو، خوان؛ دادلو، غالا مونا لويز؛ ساغويس، ألبان؛ وينتر، مارتن (يناير 2023). "توحيد أسماء التصنيفات في بيانات التنوع البيولوجي: مراجعة للأدوات وقواعد البيانات وأفضل الممارسات" . مناهج في علم البيئة والتطور . 14 (1): 12-25 . Bibcode : 2023MEcEv..14...12G . doi : 10.1111/2041-210X.13802 . ISSN 2041-210X . S2CID 246055874 .  
  3. 1 2 بلير، جاريت؛ غفيزدوفسكي، رودجر؛ بوريللي، أندرو؛ هوتشكيس، ميشيل؛ بارك، كانداس؛ بيريت، غلينان؛ هانر، روبرت (27-03-2020). " نحو فهرس لقواعد بيانات التنوع البيولوجي: دراسة حالة أنطولوجية" . مجلة بيانات التنوع البيولوجي . 8 e32765. doi : 10.3897/BDJ.8.e32765 . ISSN 1314-2828 . PMC 7125240. PMID 32269475. S2CID 215516714 .    
  4. ↑ "تعريف بيانات نظام معلومات تكنولوجيا المعلومات" . www.itis.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 أبريل 2023 .
  5. ↑ غليدهيل، ت.؛ فالديكاساس، أ.ج.؛ بيسيرا، ج.م. (2007-02-01). "نموذج للمستقبل: رقمنة وتصنيف مجموعة من الرسوم التوضيحية التصنيفية". علم العث التجريبي والتطبيقي . 41 (1): 109-113 . doi : 10.1007/s10493-007-9054-5 . ISSN 1572-9702 . PMID 17340214. S2CID 27575884 .   
  6. ↑ Registry-Migration.Gbif.Org (2022). "التصنيف الأساسي لـ GBIF" . مرفق المعلومات العالمي للتنوع البيولوجي . أمانة GBIF. doi : 10.15468/39omei .
  7. ↑ "ممالك الحياة تُرمّز بالباركود | BOLDSYSTEMS" . www.boldsystems.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 16 أبريل 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 أبريل 2023 .
  8. 1 2 غودفري، إتش سي جيه (2002). "تحديات التصنيف" . مجلة نيتشر . 417 (6884): 17-19 . Bibcode : 2002Natur.417...17G . doi : 10.1038/417017a . PMID 11986643. S2CID 19116252 .  
  9. ↑ شوارتز، آر سي؛ واس، إم إل؛ بوش، دي إف. (1972). رمز تصنيفي للكائنات الحية في خليج تشيسابيك. تقرير علمي خاص رقم 62 لمعهد فرجينيا لعلوم البحار (ملف PDF) . غلوستر بوينت، فرجينيا: معهد فرجينيا لعلوم البحار. ص 117. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 10 سبتمبر 2006. تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 أغسطس 2009 . 
  10. ↑ "الرمز التصنيفي لمركز البيانات الوطني" . المركز الوطني للمعلومات البيئية . الإدارة الوطنية للمحيطات والغلاف الجوي.
  11. ↑ "دليل الحيوانات الأسترالية" . دراسة الموارد البيولوجية الأسترالية . الحكومة الأسترالية.
  12. ↑ قاعدة بيانات "مشاريع معلومات التنوع البيولوجي في العالم" التابعة لمجموعة عمل التنوع البيولوجي في العالم . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 14 يوليو 2009. تم الاطلاع عليها بتاريخ 6 أغسطس 2009 .
  13. ↑ "Nomenclator Zoologicus" . uio.mbl.edu . مؤرشف من الأصل بتاريخ 26-11-2012 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 09-11-2016 .