تسلسل توافقي دائري

📅 آخر تحديث: ٢٧ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٧ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة

يُعدّ تسلسل التوافق الدائري (CCS) طريقةً لتسلسل الحمض النووي تُستخدم بالتزامن مع تسلسل الجزيء الواحد في الوقت الحقيقي لإنتاج مجموعات بيانات تسلسل طويلة القراءة عالية الدقة، بمتوسط ​​طول قراءة يتراوح بين 15 و25 كيلوبايت، وبدقة متوسطة تتجاوز 99.9%. [ 1 ] [ 2 ] يمكن استخدام هذه القراءات الطويلة، التي تُنشأ عبر تكوين تسلسل توافقي مُستخلص من عدة تمريرات على جزيء حمض نووي واحد، لتحسين نتائج التطبيقات المعقدة، مثل الكشف عن النوكليوتيدات المفردة والمتغيرات البنيوية، وتجميع الجينوم ، وتجميع الجينومات متعددة الصيغ الصبغية أو شديدة التكرار، وتجميع الميتاجينومات . [ 3 ]

تتيح تقنية تسلسل الكروموسومات المتعامدة (CCS) تحليل الجينومات الكبيرة أو المعقدة - مثل جينوم أشجار السيكويا العملاقة في كاليفورنيا ، الذي يزيد حجمه تسعة أضعاف حجم الجينوم البشري - لأي نوع، بما في ذلك الكشف عن المتغيرات، بدءًا من متغيرات النوكليوتيدات المفردة (SNVs) وصولًا إلى المتغيرات البنيوية، بدقة عالية. [ 4 ] [ 5 ] كما تُمكّن تقنية CCS من فصل النسخ المختلفة لكل كروموسوم (مثل النسخ الأمومية والأبوية في الكائنات ثنائية المجموعة الكروموسومية )، والمعروفة باسم الأنماط الفردية . توفر قراءات CCS مزايا الدقة العالية التي تُعادل بيانات التسلسل قصير القراءة ، ولكن بالطول اللازم لتجميع الجينومات المعقدة وتحديد طور المتغيرات عبر الجينوم. [ 6 ] [ 7 ]

تكنولوجيا

خلية Revio SMRT.

في هذه الطريقة، تطفو شظايا دائرية من الحمض النووي في محلول على سطح شريحة نانوية سائلة تُسمى خلية SMRT (خلية جزيء واحد، في الوقت الحقيقي). يُغطى سطح الشريحة بملايين الآبار تُسمى الموجهات الموجية ذات النمط الصفري (ZMWs)، ويبلغ عرض كل منها بضعة نانومترات. [ 8 ] ولتحضير عينة لتسلسل CCS/HiFi، تُضاف البادئات وإنزيم بوليميراز الحمض النووي إلى مكتبات SMRTbell. يُحاصر الحمض النووي الدائري في الموجهات الموجية ذات النمط الصفري، وتُضاف النيوكليوتيدات، ويبدأ إنزيم بوليميراز الحمض النووي بنسخ الجزيء قاعدةً تلو الأخرى. أثناء ذلك، تُطلق كمية ضئيلة من الضوء ويقرأها كاشف، مما يساعد حاسوب جهاز التسلسل على تحديد ترتيب القواعد الموجودة في العينة. يُسلسل الحمض النووي الدائري على مراحل متكررة لضمان الدقة - ومن هنا جاءت تسمية "التسلسل التوافقي الدائري" - ثم تُزال البادئات والمحولات باستخدام المعلوماتية الحيوية للحصول على قراءة توافقية عالية الدقة للحمض النووي. [ 9 ]

في تقنية CCS، يُحضّر الحمض النووي الجينومي دون تضخيم، مما يسمح بالكشف عن تعديلات القواعد الفردية، مثل المثيلة، أثناء التسلسل. وهذا يتيح الحصول على كل من معلومات التسلسل ومعلومات المثيلة القيّمة في تجربة واحدة. [ 10 ]

تاريخ

وُصفت طريقة التسلسل هذه لأول مرة من قِبل ترافرز، كيه جيه، وآخرون في مجلة أبحاث الأحماض النووية عام 2010. [ 3 ] ثم قامت شركة باسيفيك بيوساينسز بتسويقها عام 2018، وأتاحتها على أجهزة التسلسل طويلة القراءة Sequel II وRevio. [ 11 ] [ 12 ]

استُخدمت تقنية CCS لاحقًا لدعم العديد من الدراسات في مجالات متعددة، منها: دراسات الجينوم البشري، من التيلومير إلى التيلومير ، وتجميع الجينوم الكامل، وأبحاث الجينوم الشامل ، [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]، وتحليل الجينوم للأمراض النادرة لدى الأطفال ، [ 16 ] [ 17 ]، وفهم مثيلة الحمض النووي في مجموعات مرضى الأمراض النادرة، [ 18 ] ، وتجميع الجينومات الكاملة للفقاريات غير البشرية، [ 19 ]، وتجميع الجينومات الكاملة لأنواع أخرى ذات أهمية زراعية، [ 20 ] ، وتحليل جينومات السرطان، [ 21 ] [ 22 ] ، وعلم الميتاجينوميات، والأبحاث الميكروبية، وغيرها. [ 23 ] [ 24 ]

إدراكًا لأهمية هذه التقنية في الاستكشاف والاكتشاف الجينومي في المستقبل، أطلق محررو مجلة Nature Methods على تقنية التسلسل طويل القراءة اسم طريقة العام لعام 2022. [ 25 ]

التطبيقات

علم الأحياء البشري وعلم الأحياء الحفظي

يمكن أن تكون تقنية تسلسل الكروموسومات المتسلسلة (CCS) مفيدة للباحثين الذين يسعون إلى إجراء تجميع تسلسلي جديد أو دراسة التسلسلات المُحددة الطور من كل نسخة كروموسومية ، بغض النظر عن عدد الكروموسومات الموجودة في النوع. وقد استفادت العديد من التحالفات المعنية بالتنوع البيولوجي من هذه التقنية لإكمال دراساتها في علم الأحياء الحفظي، بما في ذلك مشروع الجينوم الحيوي الأفريقي، ومشروع علم الجينوم الحفظي في كاليفورنيا، وشجرة داروين للحياة، ومبادرة الزراعة الصحراوية،  ومشروع الجينوم الحيوي للأرض ، والتحالف العالمي لعلم جينوم النمل، والجينوم البشري الشامل، وتحالف التيلومير-إلى-التيلومير، ومشروع 10000 جينوم سمكي، ومشروع جينومات الفقاريات . [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ]

صحة الإنسان

يُساعد تسلسل الإجماع الدائري الباحثين على تحديد وتوصيف المتغيرات النادرة أو البنيوية بدرجة عالية من الثقة، مما يُسهم في فهم أفضل للجينوم الكامن وراء نمط ظاهري مُعين ، مع تطبيقات عديدة في مجال صحة الإنسان، بما في ذلك أبحاث الأمراض النادرة، وعلم الأحياء الدقيقة والأمراض المعدية ، وأبحاث السرطان، وغيرها من مجالات أبحاث الأمراض الوراثية. [ 29 ] [ 30 ]

الأمراض النادرة

على الرغم من ندرة حدوثها بين البشر، إلا أن الأمراض النادرة كمجموعة شائعة، ومعظمها ذو منشأ وراثي، مما يطرح تحديات تشخيصية فريدة. وتشير التقديرات إلى أن ما بين 50 و80% من المتغيرات البنيوية هي تكرارات متتالية . [ 31 ]

نظراً لأن تقنية CCS توفر رؤية شاملة للتنوع في الجينوم البشري، وتنتج تجميعات كاملة ودقيقة ومتدرجة لتحديد المتغيرات، وتحديد تكرارات التوسع وتسلسلات الانقطاع ذات الصلة الطبية، فإنها تُمكّن من تحديد المتغيرات المسببة للأمراض وتساعد الباحثين على اكتشاف جينات جديدة مرتبطة بالأمراض. [ 32 ]

علم الأحياء الدقيقة والأمراض المعدية

يمكن لتقنية التسلسل التوافقي الدائري تحديد مسببات الأمراض الناشئة بسرعة و/أو الكشف عن التغيرات في جينوميات مسببات الأمراض كجزء من عمليات المراقبة الإقليمية أو العالمية. في حين أن التقنيات الجزيئية الأخرى لمراقبة الصحة العامة قد تتطلب إعادة التحقق أو تطوير لوحات جديدة، فإن الطبيعة غير المتحيزة لتقنية التسلسل التوافقي الدائري توفر معلومات جينية شاملة لمزيد من توصيف تفشي الأمراض العالمية والأوبئة . [ 12 ]

أبحاث السرطان

يُمكّن التحليل الشامل للتغيرات البنيوية الباحثين من دراسة وكشف المتغيرات الجسدية المُسببة للسرطان بشكل أفضل. ونظرًا لحجمها الكبير (أكثر من 50 زوجًا قاعديًا)، تُفسر التغيرات البنيوية والتكرارات المتتالية جزءًا كبيرًا من التباين الجيني بين الأفراد. [ 33 ]

يُعدّ تسلسل الحمض النووي الريبوزي طويل القراءة مفيدًا في أبحاث السرطان للكشف عن مصادر التضفير البديل وأحداث الاندماج التي تُغذي نمو السرطان. [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] كما يُوفر تسلسل الحمض النووي الريبوزي المتداخل (CCS) ميزةً على تقنيات التسلسل الأخرى، إذ يُمكنه توفير معلومات عن طور الطفرات المُعبَّر عنها . [ 38 ]

مراجع

  1. ↑ ماستروروزا، فرانشيسكو كومارا؛ ميلر، داني إي؛ إيخلر، إيفان إي. (14 يونيو 2023). "تطبيقات تسلسل القراءة الطويلة على علم الوراثة المندلية" . طب الجينوم . 15 (1): 42. doi : 10.1186/s13073-023-01194-3 . ISSN 1756-994X . PMC 10266321. PMID 37316925 .   
  2. ↑ وينغر، آرون م.؛ بيلوسو، بول؛ رويل، ويليام ج.؛ تشانغ، بي-تشوان؛ هول، ريتشارد ج.؛ كونسبسيون، غريغوري ت.؛ إبلر، جانا؛ فونغتاماسان، أركاراتشاي؛ كوليسنيكوف، أليكسي؛ أولسون، ناثان د.؛ توبفر، أرمين (12 أكتوبر 2019). "التسلسل الدائري الدقيق للقراءات الطويلة يحسن اكتشاف المتغيرات وتجميع الجينوم البشري" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 37 (10): 1155-1162 . doi : 10.1038/s41587-019-0217-9 . ISSN 1546-1696 . PMC 6776680. PMID 31406327 .   
  3. 1 2 ترافرز، كيه جيه؛ تشين، سي-إس؛ رانك، دي آر؛ عيد، جيه إس؛ تيرنر، إس دبليو (2010-08-01). "صيغة قالب مرنة وفعالة لتسلسل الإجماع الدائري والكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة" . أبحاث الأحماض النووية . 38 (15): e159. doi : 10.1093/nar/ gkq543 . ISSN 0305-1048 . PMC 2926623. PMID 20571086 .   
  4. ↑ شارما، بريانكا؛ ماسوله، أردشير خربيان؛ توب، بروس؛ فورتادو، أنجيلو؛ هنري، روبرت ج. (فبراير 2022). "تجميع جينوم نباتي على مستوى الكروموسوم من بيانات تسلسل القراءة الطويلة" . مجلة النبات . 109 (3): 727-736 . doi : 10.1111 / tpj.15583 . ISSN 0960-7412 . PMC 9300133. PMID 34784084 .   
  5. ↑ تشنغ، هاويو؛ كونسبسيون، غريغوري ت؛ فينغ، شياو وين؛ تشانغ، هاو وين؛ لي، هنغ (2021-02-01). "التجميع الجديد المُحَلَّل للنمط الفرداني باستخدام رسوم بيانية للتجميع المرحلي مع hifiasm" . Nature Methods . 18 (2): 170–175 . doi : 10.1038/s41592-020-01056-5 . ISSN 1548-7091 . PMC 7961889. PMID 33526886 .   
  6. ↑ تشنغ، هاويو؛ كونسبسيون، غريغوري ت.؛ فينغ، شياو وين؛ تشانغ، هاو وين؛ لي، هنغ (2021-02-01). "التجميع الجديد المُحَلَّل للنمط الفرداني باستخدام رسوم بيانية للتجميع المرحلي مع hifiasm" . Nature Methods . 18 (2): 170–175 . doi : 10.1038/s41592-020-01056-5 . ISSN 1548-7105 . PMC 7961889. PMID 33526886 .   
  7. ↑ نورك، سيرجي؛ والينز، برايان ب.؛ ري، أرانغ؛ فولغر، ميتشل ر.؛ لوغسدون، غلينيس أ.؛ غروث، روبرت؛ ميغا، كارين هـ.؛ إيشلر، إيفان إي.؛ فيليبي، آدم م.؛ كورين، سيرجي (2020-09-01). " HiCanu: تجميع دقيق للتكرارات القطاعية، والأقمار الصناعية، والمتغيرات الأليلية من قراءات طويلة عالية الدقة" . أبحاث الجينوم . 30 (9): 1291-1305 . doi : 10.1101/gr.263566.120 . ISSN 1088-9051 . PMC 7545148. PMID 32801147 .   
  8. ↑ عيد، جون؛ فهر، أدريان؛ غراي، جيريمي؛ لونغ، خاي؛ لايل، جون؛ أوتو، جيف؛ بيلوسو، بول؛ رانك، ديفيد؛ بايبايان، بريمو؛ بيتمان، براد؛ بيبيلو، أركاديوس؛ بيورنسون، كيث؛ تشودري، بيدان؛ كريستيانز، فريدريك؛ سيسيرو، رونالد (2009-01-02). "تسلسل الحمض النووي في الوقت الحقيقي من جزيئات بوليميراز مفردة" . مجلة ساينس . 323 (5910): 133-138 . Bibcode : 2009Sci...323..133E . doi : 10.1126/science.1162986 . ISSN 0036-8075 . PMID 19023044 . S2CID 54488479 .   
  9. ↑ ترافرز، كيه جيه؛ تشين، سي-إس؛ رانك، دي آر؛ عيد، جيه إس؛ تيرنر، إس دبليو (22-06-2010). " صيغة قالب مرنة وفعالة لتسلسل الإجماع الدائري والكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 38 (15): e159. doi : 10.1093/nar/gkq543 . ISSN 0305-1048 . PMC 2926623. PMID 20571086 .   
  10. ↑ فلوسبرغ، بنجامين أ.؛ ويبستر، ديل ر.؛ لي، جيسيكا هـ.؛ ترافيرز، كيفن ج.؛ أوليفاريس، إريك س.؛ كلارك، تايسون أ.؛ كورلاش، جوناس؛ تيرنر، ستيفن و. (9 مايو 2010). "الكشف المباشر عن مثيلة الحمض النووي أثناء التسلسل في الوقت الحقيقي لجزيء واحد" . مجلة نيتشر ميثودز . 7 (6): 461-465 . doi : 10.1038/nmeth.1459 . ISSN 1548-7105 . PMC 2879396. PMID 20453866 .   
  11. ↑ وينغر، آرون م.؛ بيلوسو، بول؛ رويل، ويليام ج.؛ تشانغ، بي-تشوان؛ هول، ريتشارد ج.؛ كونسبسيون، غريغوري ت.؛ إبلر، جانا؛ فونغتاماسان، أركاراتشاي؛ كوليسنيكوف، أليكسي؛ أولسون، ناثان د.؛ توبفر، أرمين؛ ألونج، مايكل؛ محمود، مدحت؛ تشيان، يوفينغ؛ تشين، تشين-شان (12 أغسطس/آب 2019). "التسلسل الدائري الدقيق للقراءات الطويلة يحسن اكتشاف المتغيرات وتجميع الجينوم البشري" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 37 (10): 1155-1162 . doi : 10.1038/s41587-019-0217-9 . ISSN 1546-1696 . PMC 6776680 . PMID 31406327 . S2CID 199542686 .    
  12. 1 2 أوهلر، جوزفين ب.؛ رايت، هيلين؛ ستارك، زورنيتزا؛ ماليت، أندرو ج.؛ شميتز، أولف (2023-08-08). "تطبيق تسلسل القراءة الطويلة في البيئات السريرية" . علم الجينوم البشري . 17 (1): 73. doi : 10.1186 / s40246-023-00522-3 . ISSN 1479-7364 . PMC 10410870. PMID 37553611 .   
  13. ^ جارفيس، إريك د. فورمينتي، جوليو. ري، أرانج؛ جوراسينو، أندريا؛ يانغ، تشينتاو؛ وود جوناثان. تريسي، آلان. تيبو نيسن، فرانسواز؛ فولجر، ميتشل ر. بوروبسكي، ديفيد؛ تشنغ، هاويو؛ أسري، مبين؛ لوجسدون، جلينيس أ؛ كارنيفالي، باولو؛ تشيسون ، مارك جي بي (2022/11/22). "التجميع شبه الآلي للجينومات المرجعية البشرية ثنائية الصيغة الصبغية عالية الجودة" . طبيعة . 611 (7936): 519–531 . بيب كود : 2022Natur.611..519J . دوى : 10.1038/s41586-022-05325-5 . ISSN 1476-4687 . PMC 9668749. PMID 36261518 .​   
  14. ^ نورك، سيرجي. كورين، سيرجي. ري، أرانج؛ راوتياينن، ميكو؛ بزيكادزه، أندريه ف؛ ميخينكو، علاء؛ فولجر، ميتشل ر. التيموس، نيكولاس. أورالسكي، ليف؛ غيرشمان، أرييل؛ اجانيزوف، سيرجي؛ هويت، سافانا J.؛ ديخانس، مارك؛ لوجسدون، جلينيس أ؛ ألونج ، مايكل (2022/03/31). "التسلسل الكامل للجينوم البشري" . علوم . 376 (6588): 44– 53. بيب كود : 2022Sci...376...44N . دوى : 10.1126/science.abj6987 . ISSN 0036-8075 . بمك 9186530 . PMID 35357919 .   
  15. ^ جاو ، يانغ. يانغ، شياوفى؛ تشن، هاو؛ تان، شينجيانغ؛ يانغ، تشاوتشينغ؛ دينغ، ليان؛ وانغ، باونان؛ كونغ، شوانغ؛ لي، سونغ يانغ؛ كوي، يوهانغ؛ لي، تشانغ. وانغ، يمين؛ بان، يوين؛ ما، سين؛ صن ، هاو (2023/06/14). "مرجع بانجينوم لـ 36 مجموعة صينية" . طبيعة . 619 (7968): 112– 121. بيب كود : 2023Natur.619..112G . دوى : 10.1038/s41586-023-06173-7 . ردمك 1476-4687 . بمك 10322713 . بميد 37316654 .   
  16. ↑ كوهين، آنا س.أ.؛ فارو، إميلي ج.؛ عبد المعطي، أحمد ت.؛ ألايمو، جوزيف ت.؛ أمودهافالي، شيفاراجان م.؛ أندرسون، جون ت.؛ بانسال، لاليت؛ بارتيك، لورين؛ بايبايان، بريمو؛ بيلدن، برادلي؛ بيرريوس، كورتني د.؛ بيسويل، ريبيكا ل.؛ بوتشكوفيتش، باول؛ بوسكي، أوريون؛ تشاكرابورتي، شرياسي (يونيو 2022). "إجابات جينومية للأطفال: تحليلات ديناميكية لأكثر من 1000 جينوم لأمراض نادرة لدى الأطفال" . علم الوراثة في الطب . 24 (6): 1336-1348 . doi : 10.1016/j.gim.2022.02.007 . PMID 35305867 . S2CID 263467538 .  
  17. ↑ سانفورد كوباياشي، إريكا؛ باتالوف، سيرج؛ وينجر، آرون م.؛ لامبرت، كريستين؛ ديلون، هارشاران؛ هول، ريتشارد ج.؛ بايبايان، بريمو؛ دينغ، يان؛ ريغو، سيما؛ ويغبي، كريستين؛ فريدمان، جينيفر؛ هوبز، شارلوت؛ بينبريدج، ماثيو ن. (2022-10-09). "مناهج التسلسل طويل القراءة في بيئة سريرية لتحسين معدل التشخيص" . التقارير العلمية . 12 (1): 16945. Bibcode : 2022NatSR..1216945S . doi : 10.1038/s41598-022-20113- x . ISSN 2045-2322 . PMC 9548499. PMID 36210382 .   
  18. ↑ تشيونغ، وارن أ.؛ جونسون، آدم ف.؛ رويل، ويليام ج.؛ فارو، إميلي؛ هول، ريتشارد؛ كوهين، آنا س.أ.؛ مينز، جون س.؛ زيون، تريشيا ن.؛ بورتيك، دانيال م.؛ سوندرز، كريستوفر ت.؛ كوسيفا، بوريانا؛ بي، تشينغبينغ؛ ترونغ، تينا ك.؛ شويندينغر-شريك، كارل؛ يو، بيونغجيل (29-05-2023). "التسلسل المباشر عالي الدقة لخمس قواعد مع تحديد النمط الفرداني لتحليل الجينوم الكامل للحالات الشاذة لفرط المثيلة في مجموعة من المرضى المصابين بأمراض نادرة" . نيتشر كوميونيكيشنز . 14 (1): 3090. Bibcode : 2023NatCo..14.3090C . doi : 10.1038/s41467-023-38782-1 . ISSN 2041-1723 . PMC 10226990. PMID 37248219 .​   
  19. ↑ ري، أرانغ؛ مكارثي، شين أ.؛ فيدريغو، أوليفييه؛ داماس، جوانا؛ فورمنتي، جوليو؛ كورين، سيرجي؛ أوليانو-سيلفا، مارسيلا؛ تشاو، ويليام؛ فونغتاماسان، أركاراتشاي؛ كيم، جووان؛ لي، تشول؛ كو، بيونغ جون؛ تشايسون، مارك؛ جيدمان، غريغوري ل.؛ كانتين، ليندسي ج. (29 أبريل 2021). "نحو تجميعات جينومية كاملة وخالية من الأخطاء لجميع أنواع الفقاريات" . مجلة نيتشر . 592 (7856): 737-746 . Bibcode : 2021Natur.592..737R . doi : 10.1038/s41586-021-03451-0 . ISSN 0028-0836 . PMC 8081667 . PMID 33911273 .   
  20. ^ تشن جيان. وانغ، زيجيان. تان، كايوين؛ هوانغ، وي. شي، جونبينج؛ لي، تونغ؛ هو، جيانغ؛ وانغ، كاي. وانغ تشاو. شين، بيبي؛ تشاو، هايمينغ؛ أغنية ويبين. هوفورد، ماثيو ب. شنبل، جيمس C.؛ جين ويوي (يوليو 2023). "تجميع كامل من التيلومير إلى التيلومير لجينوم الذرة" . علم الوراثة الطبيعة . 55 (7): 1221-1231 . دوى : 10.1038 / s41588-023-01419-6 . ISSN 1546-1718 . بمك 10335936 . بميد 37322109 .   
  21. ↑ فيغا، ديوغو إف تي؛ نيستا، أليكس؛ تشاو، يوكي؛ مايز، آن ديزلاتس؛ هوينه، ريتشي؛ روسي، روبرت؛ وو، تي-تشيا؛ بالوكا، كارولينا؛ أنكزوكو، أولغا؛ بيك، كريستين آر؛ بانشيرو، جاك (2022-01-21). " منصة شاملة لتحليل الأشكال المتغايرة طويلة القراءة ومورد تسلسل لسرطان الثدي" . مجلة ساينس أدفانسز . 8 (3) eabg6711. رمز Bibcode : 2022SciA....8.6711V . doi : 10.1126/sciadv.abg6711 . ISSN 2375-2548 . PMC 8769553. PMID 35044822 .   
  22. ↑ تشوي، إل واي لويس؛ بينغ، وينلي؛ جيانغ، بييونغ؛ تشنغ، سوك هانغ؛ يو، ستيفاني سي واي (19 مايو 2022). "تسلسل الجزيء المفرد يُمكّن من الكشف عن الحمض النووي الخالي من الخلايا وتحليل المثيلة المباشر لمرضى السرطان" . الكيمياء السريرية . 68 (9): 1151-1163 . doi : 10.1093/clinchem/hvac086 . PMID 35587130 . 
  23. ↑ رايتر، تايلور إي؛ براون، سي. تيتوس (22-03-2022). "مجموعات الجينوم المجمّع تحقق دقة تحديد السلالة" . مجلة نيتشر لعلم الأحياء الدقيقة . 7 (2): 193-194 . doi : 10.1038/s41564-021-01027-2 . ISSN 2058-5276 . PMID 34980920. S2CID 245653539 .   
  24. ↑ أويوول، أولواسيوون رومي-أبيولا؛ لاتزين، فيليب؛ بروجر، سيلفيو د.؛ هيلتي، ماركوس (22-09-2022). "تحديد مستوى السلالة وديناميكيات حمل المكورات الرئوية من خلال تسلسل الجزيء المفرد في الوقت الحقيقي (SMRT) لعلامة plyNCR: دراسة طولية على الرضع السويسريين" . ميكروبيوم . 10 ( 1): 152. doi : 10.1186/s40168-022-01344-6 . ISSN 2049-2618 . PMC 9502908. PMID 36138483 .   
  25. ↑ ماركس، فيفيان (12 يناير 2023). "طريقة العام: تسلسل القراءة الطويلة" . مجلة نيتشر ميثودز . 20 ( 1): 6-11 . doi : 10.1038/s41592-022-01730-w . ISSN 1548-7105 . PMID 36635542. S2CID 255773787 .   
  26. ^ نورك، سيرجي. كورين، سيرجي. ري، أرانج؛ راوتياينن، ميكو؛ بزيكادزه، أندريه ف؛ ميخينكو، علاء؛ فولجر، ميتشل ر. التيموس، نيكولاس. أورالسكي، ليف؛ غيرشمان، أرييل؛ اجانيزوف، سيرجي؛ هويت، سافانا J.؛ ديخانس، مارك؛ لوجسدون، جلينيس أ؛ ألونج ، مايكل (2022/03/31). "التسلسل الكامل للجينوم البشري" . علوم . 376 (6588): 44– 53. بيب كود : 2022Sci...376...44N . دوى : 10.1126/science.abj6987 . ISSN 0036-8075 . بمك 9186530 . PMID 35357919 .   
  27. ↑ أغانيزوف، سيرجي؛ يان، ستيفاني م.؛ سوتو، دانييلا س.؛ كيرش، ميلاني؛ زاراتي، سامانثا؛ أفدييف، بافيل؛ تايلور، ديلان ج.؛ شافين، كيشوار؛ شومات، ألينا؛ شياو، تشونلين؛ فاغنر، جاستن؛ ماكدانيال، جينيفر؛ أولسون، ناثان د.؛ ساوريا، مايكل إي جي؛ فولغر، ميتشل ر. (2022-04-01). "مرجع جينومي كامل يُحسّن تحليل التباين الجيني البشري" . مجلة ساينس . 376 (6588) eabl3533. doi : 10.1126/science.abl3533 . ISSN 0036-8075 . PMC 9336181. PMID 35357935 .   
  28. ↑ فولجر، ميتشل ر.؛ غيتارت، تشافي؛ ديشوك، فيليب س.؛ ميركوري، لودوفيكا؛ هارفي، ويليام ت.؛ غيرشمان، أرييل؛ ديكهانز، مارك؛ سولوفاري، أرفيس؛ مونسون، كاثرين م.؛ لويس، ألكسندرا ب.؛ هوكزيما، كيندرا؛ بوروبسكي، ديفيد؛ لي، رويانغ؛ نورك، سيرجي؛ كورين، سيرجي (2022-04-01). "التضاعفات القطاعية وتنوعها في جينوم بشري كامل" . مجلة ساينس . 376 (6588) eabj6965. doi : 10.1126/science.abj6965 . ISSN 0036-8075 . PMC 8979283. PMID 35357917 .   
  29. ↑ وينغر، آرون م.؛ بيلوسو، بول؛ رويل، ويليام ج.؛ تشانغ، بي-تشوان؛ هول، ريتشارد ج.؛ كونسبسيون، غريغوري ت.؛ إبلر، جانا؛ فونغتاماسان، أركاراتشاي؛ كوليسنيكوف، أليكسي؛ أولسون، ناثان د.؛ توبفر، أرمين؛ ألونج، مايكل؛ محمود، مدحت؛ تشيان، يوفينغ؛ تشين، تشين-شان (12 أغسطس/آب 2019). "التسلسل الدائري الدقيق للقراءات الطويلة يحسن اكتشاف المتغيرات وتجميع الجينوم البشري" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 37 (10): 1155-1162 . doi : 10.1038/s41587-019-0217-9 . ISSN 1546-1696 . PMC 6776680 . PMID 31406327 .   
  30. ↑ سالك، جيسي جيه؛ شميت، مايكل دبليو؛ لوب، لورانس إيه. (26 مارس 2018). "تحسين دقة تسلسل الجيل التالي للكشف عن الطفرات النادرة والفرعية" . مجلة Nature Reviews Genetics . 19 (5): 269-285 . doi : 10.1038/nrg.2017.117 . PMC 6485430. PMID 29576615 .  
  31. ↑ إنجلش، آدم سي؛ مينون، فيبين ك؛ جيبس، ريتشارد أ؛ ميتكالف، جينجر أ؛ سيدلازيك، فريتز ج. (27-12-2022). "تروفاري: مقارنة محسّنة للمتغيرات البنيوية تحافظ على التنوع الأليلي" . علم الأحياء الجينومي . 23 (1): 271. doi : 10.1186/s13059-022-02840-6 . ISSN 1474-760X . PMC 9793516. PMID 36575487 .   
  32. ↑ "قصة نجاح عميل: خبراء في مستشفى ميرسي للأطفال في مدينة كانساس سيتي يلجؤون إلى تسلسل الجينوم الكامل طويل القراءة لإيجاد حلول للأمراض النادرة" . PacBio . تم ​​الاطلاع عليه بتاريخ 2 نوفمبر 2023 .
  33. ^ ايبرت، بيتر. أودانو، بيتر أ. تشو، تشيهوي؛ رودريجيز مارتن، برناردو؛ بوروبسكي، ديفيد؛ بوندر، مارك جان؛ سولوفاري، أرفيس؛ إبلر، جانا؛ تشو، ويتشين؛ سيرا ماري، ريبيكا؛ يلماز، فايزة؛ تشاو، شيويفانغ؛ هسيه، بينجهسون؛ لي جويس. كومار، سوشانت (2021-04-02). “الجينومات البشرية المتنوعة التي تم حلها من خلال النمط الفرداني والتحليل المتكامل للتنوع الهيكلي” . علوم . 372 (6537) eabf7117. دوى : 10.1126/science.abf7117 . ردمك 1095-9203 . بمك 8026704 . بميد 33632895 .   
  34. ↑ فيغا، ديوغو إف تي؛ نيستا، أليكس؛ تشاو، يوكي؛ ديسلاتس مايز، آن؛ هوينه، ريتشي؛ روسي، روبرت؛ وو، تي-تشيا؛ بالوكا، كارولينا؛ أنكزوكو، أولغا؛ بيك، كريستين ر.؛ بانشيرو، جاك (2022-01-21). " منصة شاملة لتحليل الأشكال المتغايرة طويلة القراءة ومورد تسلسل لسرطان الثدي" . مجلة ساينس أدفانسز . 8 (3) eabg6711. رمز Bibcode : 2022SciA....8.6711V . doi : 10.1126/sciadv.abg6711 . ISSN 2375-2548 . PMC 8769553. PMID 35044822 .   
  35. ↑ ميخينكو، آلا؛ بريبيلسكي، أندريه د.؛ جوجليكار، أنوشكا؛ تيلجنر، هاجن يو. (2022-04-01). "تسلسل الحمض النووي التكميلي (cDNA) المُرمَّز باستخدام تقنيات Pacific Biosciences وOxford Nanopore يكشف عن أنماط أخطاء خاصة بكل منصة" . أبحاث الجينوم . 32 (4): 726-737 . doi : 10.1101/gr.276405.121 . PMC 8997348. PMID 35301264 .  
  36. ↑ ناتستاد، ماريا؛ غودوين، سارة؛ نغ، كارين؛ باسلان، تيمور؛ سيدلازيك، فريتز جيه؛ ريشنيدر، فيليب؛ غارفين، تايلر؛ فانغ، هان؛ غورتوفسكي، جيمس؛ هاتون، إليزابيث؛ تسينغ، إليزابيث؛ تشين، تشين-شان؛ بيك، تيموثي؛ سوندارافادانام، يوغي؛ كرامر، ميليسا (28 أغسطس/آب 2018). "إعادة ترتيب معقدة وتضخيم الجينات الورمية تم الكشف عنها من خلال تسلسل الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA طويل القراءة لخط خلوي لسرطان الثدي" . أبحاث الجينوم . 28 (8): 1126-1135 . doi : 10.1101/gr.231100.117 . ISSN 1549-5469 . PMC 6071638. PMID 29954844 .   
  37. ↑ ميلر، أنتوني ر.؛ ويجيراتني، سارانغا؛ ماكغراث، شون د.؛ شيفر، كاثلين م.؛ ميلر، كاثرين إ.؛ لي، كريستي؛ ماثيو، مريم؛ لاهاي، ستيفاني؛ فيتش، جيمس ر.؛ كيلي، بنجامين ج.؛ وايت، بيتر؛ مارديس، إيلين ر.؛ ويلسون، ريتشارد ك.؛ كوتريل، كاثرين إ.؛ ماغريني، فنسنت (ديسمبر 2022). "دمج علوم المحيط الهادئ وخط أنابيب الأشكال المتغايرة الطويلة لحل تعقيد الأشكال المتغايرة بناءً على النسخ الجيني للسرطان" . مجلة التشخيص الجزيئي . 24 (12): 1292-1306 . doi : 10.1016/j.jmoldx.2022.09.003 . PMID 36191838 . S2CID 252653559 .  
  38. ^ أولسون ، ناثان د. فاغنر، جوستين؛ ماكدانيال، جينيفر؛ ستيفنس، سارة ه. ويستريش، صموئيل T .؛ براسانا، أنيش ج.؛ جوهانسون، إيلين؛ بوجا، إميلي؛ ماير، حزقيال J.؛ سيرانج، عمر؛ جاسبيز، ديفيد؛ لورنزو سالازار، خوسيه م.؛ مونيوز باريرا، أدريان؛ روبيو رودريغيز، لويس أ. فلوريس ، كارلوس (2022/05/11). "تحدي الحقيقة الخاص بـ PrecisionFDA V2: استدعاء المتغيرات من القراءات القصيرة والطويلة في المناطق التي يصعب رسم خرائطها" . علم الجينوم الخلوي . 2 (5) 100129. دوى : 10.1016/j.xgen.2022.100129 . ISSN 2666-979X . PMC 9205427 . PMID 35720974 .