ترميز الحمض النووي للأسماك

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 2 صور
الموسوعة الحرة

تُستخدم طرق الترميز الجيني للأسماك لتحديد مجموعات الأسماك بناءً على تسلسل الحمض النووي ضمن مناطق مُحددة من الجينوم . يمكن استخدام هذه الطرق لدراسة الأسماك، حيث تنتشر المادة الوراثية، على شكل حمض نووي بيئي (eDNA) أو خلايا، بحرية في الماء. وهذا يسمح للباحثين بتحديد الأنواع الموجودة في أي مسطح مائي من خلال جمع عينة من الماء، واستخلاص الحمض النووي منها، وعزل تسلسلات الحمض النووي الخاصة بالنوع المطلوب. [ 1 ] كما يمكن استخدام طرق الترميز الجيني في الرصد البيولوجي والتحقق من سلامة الأغذية ، وتقييم النظام الغذائي للحيوانات ، وتقييم الشبكات الغذائية وتوزيع الأنواع ، والكشف عن الأنواع الغازية . [ 1 ]

في أبحاث الأسماك، يمكن استخدام الترميز الشريطي كبديل لأساليب أخذ العينات التقليدية. غالباً ما توفر أساليب الترميز الشريطي معلومات دون إلحاق الضرر بالحيوان المدروس. [ 2 ]

تتمتع البيئات المائية بخصائص فريدة تؤثر على كيفية توزيع المادة الوراثية للكائنات الحية. تنتشر المادة الوراثية (DNA) بسرعة في البيئات المائية، مما يُتيح رصد الكائنات الحية من مساحة واسعة عند أخذ عينة من موقع محدد. [ 1 ] ونظرًا للتحلل السريع للحمض النووي في البيئات المائية، فإن الأنواع المرصودة تُمثل وجودًا معاصرًا، دون وجود إشارات مُشوشة من الماضي. [ 3 ]

يُعدّ التحديد القائم على الحمض النووي سريعًا وموثوقًا ودقيقًا في توصيف مختلف مراحل الحياة والأنواع. [ 4 ] تُستخدم المكتبات المرجعية لربط تسلسلات الباركود بأنواع محددة، ويمكن استخدامها لتحديد الأنواع الموجودة في عينات الحمض النووي. كما تُفيد مكتبات التسلسلات المرجعية في تحديد الأنواع في حالات الغموض المورفولوجي ، كما هو الحال في المراحل اليرقية . [ 4 ]

تُستخدم عينات الحمض النووي البيئي وطرق الترميز الشريطي في إدارة المياه ، إذ يُمكن استخدام تكوين الأنواع كمؤشر على صحة النظام البيئي . [ 5 ] وتُعدّ طرق الترميز الشريطي والترميز الشريطي الفائق مفيدة بشكل خاص في دراسة الأسماك المهددة بالانقراض أو المراوغة، حيث يُمكن الكشف عن الأنواع دون صيدها أو إلحاق الضرر بها. [ 6 ]

التطبيقات

الرصد البيئي

يُعدّ الرصد البيولوجي للنظم البيئية المائية إلزاميًا بموجب التشريعات الوطنية والدولية (مثل التوجيه الإطاري للمياه والتوجيه الإطاري للاستراتيجية البحرية ). تتسم الطرق التقليدية بأنها تستغرق وقتًا طويلاً وتتضمن ممارسات مدمرة قد تضرّ بأفراد الأنواع النادرة أو المحمية. يُعدّ الترميز الجيني للحمض النووي طريقة فعّالة من حيث التكلفة وسريعة نسبيًا لتحديد أنواع الأسماك في البيئات المائية. [ 7 ] يمكن تحديد وجود أو غياب أنواع الأسماك الرئيسية باستخدام الحمض النووي البيئي من عينات المياه، كما يمكن دراسة التوزيع المكاني والزماني لأنواع الأسماك (مثل توقيت وموقع التكاثر ). [ 8 ] وهذا بدوره يساعد في اكتشاف آثار الحواجز المادية، مثل بناء السدود، وغيرها من الأنشطة البشرية. تُستخدم أدوات الحمض النووي أيضًا في الدراسات الغذائية للأسماك وبناء الشبكات الغذائية المائية . يُحدد الترميز الجيني الشامل لمحتويات أمعاء الأسماك أو برازها أنواع الفرائس التي تم استهلاكها مؤخرًا. مع ذلك، يجب مراعاة الافتراس الثانوي. [ 9 ]

الأنواع الغازية

يُعدّ الكشف المبكر أمراً بالغ الأهمية للسيطرة على الأنواع غير الأصلية الضارة بالبيئة وإزالتها (مثل أسماك الأسد ( Pterois sp.) في المحيط الأطلسي ومنطقة البحر الكاريبي). ويمكن استخدام تقنية الترميز الجيني البيئي (Metabarcoding ) للكشف عن الأنواع الخفية أو الغازية في النظم البيئية المائية. [ 10 ]

إدارة مصايد الأسماك

تُوفر تقنيات الترميز الشريطي والترميز الشريطي الفائق بيانات دقيقة وشاملة حول التكاثر والبيئة والنطاقات الجغرافية لموارد مصايد الأسماك. كما تُحسّن هذه التقنيات معرفة مناطق الحضانة ومواقع التكاثر، مما يُفيد إدارة مصايد الأسماك . قد تكون الطرق التقليدية لتقييم مصايد الأسماك مُدمرة للغاية، مثل أخذ العينات بشباك الخيشوم أو الصيد بشباك الجر . تُقدم الطرق الجزيئية بديلاً لأخذ العينات غير المُتلف. على سبيل المثال، يُمكن أن يُساعد الترميز الشريطي والترميز الشريطي الفائق في تحديد بيض الأسماك على مستوى الأنواع لضمان بيانات موثوقة لتقييم المخزون، حيث أثبتت هذه الطرق موثوقيتها العالية مقارنةً بالتحديد عبر الصفات الظاهرية. كما يُعد الترميز الشريطي والترميز الشريطي الفائق أدوات فعّالة في رصد حصص مصايد الأسماك والصيد العرضي. [ 11 ]

يمكن لتقنية الحمض النووي البيئي (eDNA) الكشف عن وفرة بعض الأنواع المهاجرة بين المياه العذبة والمالحة وتحديد كمياتها ، بالإضافة إلى تحديد توزيعها الزمني. ويمكن استخدام هذا النهج لتطوير تدابير إدارية مناسبة، ذات أهمية خاصة لمصائد الأسماك التجارية. [ 12 ] [ 13 ]

سلامة الغذاء

أدت عولمة سلاسل إمداد الغذاء إلى زيادة عدم اليقين بشأن منشأ وسلامة المنتجات السمكية. ويمكن استخدام الترميز الشريطي للتحقق من صحة ملصقات المنتجات وتتبع منشأها. وقد تم اكتشاف حالات غش في الأسماك في جميع أنحاء العالم. [ 14 ] [ 15 ] ووجدت دراسة حديثة أجريت على متاجر كبرى في ولاية نيويورك أن 26.92% من مشتريات المأكولات البحرية التي تحمل رمزًا شريطيًا واضحًا كانت تحمل ملصقات خاطئة. [ 16 ]

يمكن استخدام الترميز الشريطي لتحديد أنواع الأسماك، نظرًا لوجود مخاطر صحية محتملة مرتبطة باستهلاكها . علاوة على ذلك، قد تتركز السموم البيولوجية أحيانًا عند انتقالها عبر السلسلة الغذائية. ومن الأمثلة على ذلك أنواع أسماك الشعاب المرجانية، حيث تم رصد أسماك مفترسة مثل الباراكودا كسبب للتسمم الغذائي (التسمم السيغواتيري) . ويمكن الكشف عن هذه الارتباطات الجديدة للتسمم الغذائي باستخدام الترميز الشريطي للأسماك.

زعانف أسماك القرش المصادرة

حماية الأنواع المهددة بالانقراض

يمكن استخدام الترميز الشريطي في حماية الأنواع المهددة بالانقراض من خلال منع الاتجار غير المشروع بالأنواع المدرجة في اتفاقية سايتس . يوجد سوق سوداء واسعة النطاق للمنتجات السمكية، وكذلك في تجارة أحواض الأسماك والحيوانات الأليفة. ولحماية أسماك القرش من الاستغلال المفرط ، يمكن الكشف عن الاستخدام غير المشروع من خلال الترميز الشريطي لحساء زعانف القرش والأدوية التقليدية. [ 17 ]

المنهجية

أخذ العينات في البيئات المائية

تتميز البيئات المائية بخصائص فريدة يجب مراعاتها عند أخذ عينات لتحليل الحمض النووي البيئي للأسماك . ويُعدّ أخذ عينات مياه البحر ذا أهمية خاصة لتقييم صحة النظم البيئية البحرية وتنوعها البيولوجي. ورغم أن انتشار الحمض النووي البيئي في مياه البحر واسع النطاق، وأن الملوحة تؤثر سلبًا على حفظه، إلا أن عينة الماء قد تحتوي على كميات كبيرة من الحمض النووي البيئي للأسماك لمدة تصل إلى أسبوع بعد أخذها. وتُعدّ الجزيئات الحرة، وبطانة الأمعاء، وبقايا خلايا الجلد المصادر الرئيسية للحمض النووي البيئي للأسماك. [ 18 ]

بالمقارنة مع البيئات البحرية، تتمتع البرك بخصائص بيولوجية وكيميائية قد تؤثر على كشف الحمض النووي البيئي. فصغر حجم البرك مقارنةً بالمسطحات المائية الأخرى يجعلها أكثر حساسية للظروف البيئية، مثل التعرض للأشعة فوق البنفسجية وتغيرات درجة الحرارة ودرجة الحموضة. هذه العوامل قد تؤثر على كمية الحمض النووي البيئي. علاوة على ذلك، تُشكل الأشجار والنباتات الكثيفة المحيطة بالبرك حاجزًا يمنع تهوية المياه بفعل الرياح. كما يمكن لهذه الحواجز أن تُعزز تراكم المواد الكيميائية التي تُلحق الضرر بسلامة الحمض النووي البيئي. [ 19 ] قد يؤثر التوزيع غير المتجانس للحمض النووي البيئي في البرك على كشف الأسماك. كما أن توافر الحمض النووي البيئي للأسماك يعتمد على مرحلة نموها ونشاطها وموسميتها وسلوكها. وتُستخلص أكبر كميات من الحمض النووي البيئي من التكاثر ومراحل اليرقات ونشاط التربية. [ 20 ]

المناطق المستهدفة

يُعدّ تصميم البادئات أمرًا بالغ الأهمية لنجاح الترميز الجيني الشامل. وقد وصفت بعض الدراسات التي تناولت تطوير البادئات السيتوكروم B و16S كمنطقتين مستهدفتين مناسبتين للترميز الجيني الشامل للأسماك. وذكر إيفانز وآخرون (2016) أن مجموعتي البادئات Ac16S وL2513/H2714 قادرتان على الكشف عن أنواع الأسماك بدقة في بيئات تجريبية مختلفة. [ 21 ] كما أظهرت دراسة أخرى أجراها فالنتيني وآخرون (2016) أن زوج البادئات L1848/H1913، الذي يُضخّم منطقة من موقع 12S rRNA، قادر على تحقيق تغطية تصنيفية عالية وتمييز دقيق حتى مع جزء مستهدف قصير. وأثبت هذا البحث أيضًا أن نهج الترميز الجيني الشامل كان مماثلاً أو حتى أعلى من الطرق التقليدية (مثل الصيد الكهربائي والشباك) في 89% من مواقع أخذ العينات . [ 22 ] أجرى باحثون (2016) تجارب ترميز جيني شاملة تركز على مجتمعات أسماك البحيرات باستخدام أزواج البادئات 12S_F1/12S_R1 وCytB_L14841/CytB_H15149، والتي تقع أهدافها في منطقتي الميتوكوندريا 12S والسيتوكروم B على التوالي. أظهرت النتائج أن الكشف عن أنواع الأسماك كان أعلى عند استخدام بادئات 12S مقارنةً ببادئات CytB. ويعود ذلك إلى استمرار وجود أجزاء 12S الأقصر (حوالي 100 زوج قاعدي) مقارنةً بجزء CytB الأكبر (حوالي 460 زوج قاعدي). [ 23 ] وبشكل عام، تُشير هذه الدراسات إلى ضرورة مراعاة اعتبارات خاصة عند تصميم البادئات واختيارها وفقًا لأهداف التجربة وطبيعتها.

قواعد بيانات مرجعية للأسماك

تتوفر العديد من قواعد البيانات المفتوحة المصدر للباحثين حول العالم. ويعتمد التحديد الدقيق لعينات الأسماك باستخدام طرق الترميز الجيني للحمض النووي اعتمادًا كبيرًا على جودة قواعد بيانات التسلسل المتاحة وشموليتها للأنواع . قاعدة بيانات مرجعية للأسماك هي قاعدة بيانات إلكترونية تحتوي عادةً على رموز الحمض النووي، وصور، وإحداثيات جغرافية مكانية لعينات الأسماك التي تم فحصها. كما يمكن أن تحتوي قاعدة البيانات على روابط لعينات مرجعية، ومعلومات عن توزيع الأنواع، وتسمياتها، ومعلومات تصنيفية موثوقة، ومعلومات تاريخية طبيعية إضافية، ومراجع منشورة. قد تكون قواعد البيانات المرجعية مُدققة، أي أن مدخلاتها تخضع لتقييم الخبراء قبل إدراجها، أو غير مُدققة، وفي هذه الحالة قد تتضمن عددًا كبيرًا من التسلسلات المرجعية ولكن مع تحديد أقل دقة للأنواع.

فيش-بول

أُطلقت مبادرة الباركود الجيني للأسماك (FISH-BOL) عام 2005، وهي عبارة عن تعاون بحثي دولي يهدف إلى إنشاء مكتبة تسلسل الحمض النووي المرجعية الموحدة لجميع أنواع الأسماك. [ 24 ] وهو مشروع بحثي عالمي مُنسق يهدف إلى جمع وتجميع تسلسلات الباركود الجيني الموحدة وبيانات المصدر المرجعية المرتبطة بها في مكتبة تسلسل مرجعية مُنسقة للمساعدة في التحديد الجزيئي لجميع أنواع الأسماك. [ 25 ]

إذا رغب الباحثون في المساهمة في مكتبة FISH-BOL المرجعية، فسيتم توفير إرشادات واضحة لجمع العينات وتصويرها وحفظها وأرشفتها، بالإضافة إلى بروتوكولات جمع البيانات الوصفية وتقديمها. [ 26 ] تعمل قاعدة بيانات FISH-BOL كبوابة لأنظمة بيانات الباركود الحيوي (BOLD) .

قاعدة بيانات ترميز الأسماك في بولينيزيا الفرنسية

تحتوي قاعدة بيانات ترميز الأسماك في بولينيزيا الفرنسية على جميع العينات التي تم اصطيادها خلال رحلات ميدانية متعددة نظمها أو شارك فيها مركز أبحاث الجزر والمرصد البيئي (CRIOBE) منذ عام 2006 في أرخبيلات بولينيزيا الفرنسية. لكل عينة مصنفة، تتوفر المعلومات التالية: الاسم العلمي، الصورة، التاريخ، إحداثيات نظام تحديد المواقع العالمي (GPS)، العمق وطريقة الصيد، الحجم، وتسلسل الحمض النووي لوحدة فرعية 1 من إنزيم سيتوكروم أوكسيداز سي (CO1). يمكن البحث في قاعدة البيانات باستخدام الاسم (الجنس أو النوع) أو باستخدام جزء من تسلسل الحمض النووي CO1.

أكواجين

يوفر Aquagene ، وهو منتج تعاوني طورته عدة مؤسسات ألمانية، وصولاً مجانياً إلى معلومات جينية موثقة لأنواع الأسماك البحرية. تتيح قاعدة البيانات تحديد الأنواع من خلال مقارنة تسلسل الحمض النووي. تتميز جميع الأنواع بتسلسلات جينية متعددة، تشمل حالياً جين الترميز الشريطي CO1 القياسي بالإضافة إلى CYTB وMYH6، وقريباً RHOD، مما يسهل تحديد الأنواع بدقة حتى للأنواع المتقاربة أو تلك التي تتميز بتنوع كبير داخل النوع الواحد. تُستكمل البيانات الجينية عبر الإنترنت ببيانات إضافية عن العينة المأخوذة، مثل الصور الرقمية ورقم التوثيق والمنشأ الجغرافي.

مصادر إضافية

ومن قواعد البيانات المرجعية الأخرى الأكثر عمومية، ولكنها قد تكون مفيدة أيضًا لترميز الأسماك، نظام بيانات Barcode of Life و Genbank . 

المزايا

توفر تقنية الترميز الشريطي/الترميز الشريطي الفائق تحديدًا سريعًا وموثوقًا للأنواع، مما يعني عدم الحاجة إلى التحديد المورفولوجي، أي الخبرة التصنيفية. كما تُمكّن هذه التقنية من تحديد الأنواع حتى في حالة تدهور الكائنات الحية [ 27 ] أو عند توفر جزء منها فقط. وهي أداة فعّالة للكشف عن الأنواع النادرة و/أو الغازية، والتي يمكن رصدها رغم قلة أعدادها. تشمل الطرق التقليدية لتقييم التنوع البيولوجي للأسماك [ 6 ] ووفرتها وكثافتها استخدام أدوات مثل الشباك، ومعدات الصيد الكهربائي [ 6 ] ، وشباك الجر، والأقفاص، وشباك الصيد ذات الفخاخ، أو غيرها من الأدوات التي تُظهر نتائج موثوقة لوجود الأنواع الوفيرة فقط. في المقابل، تقل احتمالية رصد الأنواع المحلية النادرة، وكذلك الأنواع الدخيلة حديثة الاستيطان، عبر الطرق التقليدية، مما يؤدي إلى افتراضات خاطئة بشأن وجودها أو غيابها [ 6 ] . تُعد تقنية الترميز الشريطي/الترميز الشريطي الفائق في بعض الحالات طريقة غير جراحية لأخذ العينات، إذ تُتيح تحليل الحمض النووي من الحمض النووي البيئي أو عن طريق أخذ عينات من الكائنات الحية. [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]

بالنسبة لطفيليات الأسماك، يسمح الترميز الجيني الفائق بالكشف عن الطفيليات الخفية أو المجهرية في البيئات المائية، وهو أمر يصعب تحقيقه باستخدام الطرق المباشرة (مثل تحديد الأنواع من العينات باستخدام المجهر). تُظهر بعض الطفيليات تنوعًا خفيًا، ويمكن أن يكون الترميز الجيني الفائق طريقة مفيدة في الكشف عنه. [ 31 ]

يُعدّ تطبيق تقنية الترميز الجيني البيئي (eDNA metabarcoding) فعالاً من حيث التكلفة في الدراسات الاستقصائية واسعة النطاق أو عند الحاجة إلى عينات كثيرة. إذ يُمكن لتقنية eDNA أن تُقلل من تكاليف الصيد ونقل العينات والوقت الذي يستثمره علماء التصنيف، وفي معظم الحالات لا تتطلب سوى كميات صغيرة من الحمض النووي من الأنواع المستهدفة للوصول إلى كشف موثوق. ويُعدّ الانخفاض المستمر في أسعار الترميز الجيني/الترميز الجيني البيئي نتيجةً للتطور التقني ميزةً أخرى. [ 2 ] [ 22 ] [ 32 ] كما أن تقنية eDNA مناسبة لرصد البيئات التي يصعب الوصول إليها.

التحديات

تقتصر النتائج المستخلصة من الترميز الجيني الشامل على معدل حدوثها أو تكون متحيزة له. ومن المشكلات الأخرى أن ليس كل الأنواع تحمل رموزًا جينية مرتبطة بها. [ 27 ]

على الرغم من أن تقنية الترميز الفائق قد تتغلب على بعض القيود العملية لأساليب أخذ العينات التقليدية، إلا أنه لا يوجد إجماع حتى الآن بشأن تصميم التجارب ومعايير المعلوماتية الحيوية لتطبيق الترميز الفائق للحمض النووي البيئي. ويعود غياب المعايير إلى تباين التجارب والدراسات التي أُجريت حتى الآن، والتي تناولت تنوعات ووفرة الأسماك المختلفة، وأنواع النظم البيئية المائية، وعدد المؤشرات وخصوصياتها. [ 32 ]

يُعدّ تحديد وفرة الأسماك باستخدام البيانات الجزيئية تحديًا كبيرًا آخر لهذه الطريقة. ورغم وجود بعض الحالات التي أمكن فيها تحديد الوفرة [ 33 ]، إلا أنه لا يوجد إجماع حول كيفية أو مدى إمكانية استخدام البيانات الجزيئية لتحقيق هذا الهدف في رصد الأسماك. [ 34 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ريس، هيلين سي؛ ماديسون، بن سي؛ ميدلديتش، ديفيد جيه؛ باتمور، جيمس آر إم؛ غوف، كيفن سي (2014). كريسبو، إريكا (محرر). " مراجعة : الكشف عن أنواع الحيوانات المائية باستخدام الحمض النووي البيئي - مراجعة للحمض النووي البيئي كأداة مسح في علم البيئة" (ملف PDF) . مجلة علم البيئة التطبيقي . 51 (5): 1450-1459 . Bibcode : 2014JApEc..51.1450R . doi : 10.1111/1365-2664.12306 . مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 22-07-2018 . تم الاسترجاع بتاريخ 16-11-2019 .
  2. 1 2 غولدبيرغ، كارين س.؛ تيرنر، كاميرون ر.؛ دينر، كريستي؛ كليموس، كاتي إي.؛ تومسن، فيليب فرانسيس؛ مورفي، ميلاني أ.؛ سبير، ستيفن ف.؛ ماكي، آنا؛ أويلر-ماكانس، سارة ج. (2016). جيلبرت، م. (محرر). "اعتبارات حاسمة لتطبيق طرق الحمض النووي البيئي للكشف عن الأنواع المائية" . طرق في علم البيئة والتطور . 7 (11): 1299-1307 . Bibcode : 2016MEcEv...7.1299G . doi : 10.1111/2041-210X.12595 . hdl : 20.500.11850/502281 .
  3. ↑ تومسن، فيليب فرانسيس؛ ويلرسليف، إسكي (2015). "الحمض النووي البيئي - أداة ناشئة في مجال الحفاظ على البيئة لرصد التنوع البيولوجي في الماضي والحاضر" . الحفاظ على البيئة . 183 : 4-18 . doi : 10.1016/j.biocon.2014.11.019 .
  4. 1 2 "FISH-BOL" . www.fishbol.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 12 أبريل 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 مارس 2019 .
  5. ↑ هانفلينغ، بيرند؛ لوسون هاندلي، لوري؛ ريد، دانيال س.؛ هان، كريستوف؛ لي، جيانلونغ؛ نيكولز، بول؛ بلاكمان، روزيتا س.؛ أوليفر، آنا؛ وينفيلد، إيان ج. (2016). "الترميز الفائق للحمض النووي البيئي لمجتمعات أسماك البحيرات يعكس بيانات طويلة الأجل من أساليب المسح الراسخة" ( ملف PDF) . علم البيئة الجزيئية . 25 (13): 3101-3119 . doi : 10.1111/mec.13660 . PMID 27095076. S2CID 21984641 .  
  6. 1 2 3 4 جيرد، كريستوفر ل.؛ ماهون، أندرو ر.؛ تشادرتون، دبليو. ليندسي؛ لودج، ديفيد م. (2011). "الكشف عن الأنواع المائية النادرة دون رؤيتها باستخدام الحمض النووي البيئي: مراقبة الأنواع المائية النادرة بواسطة الحمض النووي البيئي . رسائل الحفظ . 4 (2): 150-157 . doi : 10.1111/j.1755-263X.2010.00158.x . S2CID 39849851 . 
  7. ↑ شيرالييف، بختيور؛ بينغ، زوغانغ (2021). " التنوع الجزيئي لأسماك أوزبكستان مُقَيَّمًا باستخدام الترميز الشريطي للحمض النووي" . التقارير العلمية . 11 (1): 16894. Bibcode : 2021NatSR..1116894S . doi : 10.1038/ s41598-021-96487-1 . ISSN 2045-2322 . PMC 8376971. PMID 34413445. S2CID 237242923 .    
  8. ↑ شو، لو؛ لودفيج، آرني؛ بينغ، زوغانغ (2020). "معايير طرق استخدام الحمض النووي البيئي للكشف عن أنواع الأسماك" . جينات . 11 ( 3): 296. doi : 10.3390/genes11030296 . ISSN 2073-4425 . PMC 7140814. PMID 32168762 .   
  9. ^ كيم هيون وو. بارك، هيون؛ بايك، جون ووك؛ لي، جاي بونج؛ لي، سو رين؛ كانغ، هاي يون؛ يون ، تاي هو (2017/11/07). "تحليل Metabarcoding لمحتويات معدة أسماك القطب الجنوبي المسننة (Dissostichus mawsoni) التي تم جمعها في المحيط المتجمد الجنوبي" . بيرج . 5 إي3977. دوى : 10.7717/peerj.3977 . ردمك 2167-8359 . بمك 5680711 . بميد 29134141 .   
  10. ↑ بالاسينغهام، كاثرين د.؛ والتر، رايان ب.؛ ماندراك، نيكولاس إي.؛ هيث، دانيال د. (يناير 2018). "الكشف عن الحمض النووي البيئي لأنواع الأسماك النادرة والغازية في رافدين من روافد البحيرات العظمى" . علم البيئة الجزيئية . 27 (1): 112-127 . Bibcode : 2018MolEc..27..112B . doi : 10.1111/mec.14395 . ISSN 1365-294X . PMID 29087006. S2CID 25718606 .   
  11. ↑ كوستا، فيليبي أو؛ كارفاليو، غاري ر (ديسمبر 2007). "مبادرة الباركود الحيوي: ملخص وتأثيرات مجتمعية محتملة للباركود الجيني للأسماك" . علم الجينوم، المجتمع والسياسة . 3 (2): 29. doi : 10.1186/1746-5354-3-2-29 . ISSN 1746-5354 . PMC 5425017 .  
  12. ↑ بلو، لويس ف.؛ أوغبورن، ماثيو ب.؛ فيتزجيرالد، كاثرين ل.؛ جيرانيو، روز؛ مارافينو، غابرييلا أ.؛ ريتشي، كيمبرلي د. (2018-11-01). دوي، هيديوكي (محرر). "تحليل الحمض النووي البيئي لأسماك الرنجة النهرية في خليج تشيسابيك: أداة فعالة لرصد الأنواع الرئيسية المهددة بالانقراض" . PLOS ONE . 13 (11) e0205578. Bibcode : 2018PLoSO..1305578P . doi : 10.1371/ journal.pone.0205578 . ISSN 1932-6203 . PMC 6211659. PMID 30383750 .   
  13. ↑ إيفانز، ناثان ت.؛ لامبرتي، غاري أ. (يناير 2018). "تقييم مصايد الأسماك في المياه العذبة باستخدام الحمض النووي البيئي: مقدمة عن المنهجية، وإمكانياتها، وعيوبها كأداة للحفظ". بحوث مصايد الأسماك . 197 : 60-66 . doi : 10.1016/j.fishres.2017.09.013 .
  14. ↑ باركاتشيا، جياني؛ لوتشين، مارغريتا؛ كاساندرو، مارتينو (29-12-2015). "الترميز الجيني كأداة جزيئية لتتبع التضليل في وضع العلامات وقرصنة الأغذية" . التنوع . 8 (4): 2. doi : 10.3390/d8010002 . hdl : 11577/3199867 . ISSN 1424-2818 . 
  15. ^ فالنتيني، باولا. جالمبرتي، أندريا؛ ميزاسالما، فاليريو؛ دي ماتيا، فابريزيو؛ كاسيراغي، ماوريتسيو؛ لابرا، ماسيمو؛ بومبا ، بيير باولو (2017/07/03). “التشفير الشريطي للحمض النووي يلتقي بتقنية النانو: تطوير اختبار لوني عالمي لتوثيق الأغذية”. Angewandte Chemie الطبعة الدولية . 56 (28): 8094-8098 . دوى : 10.1002/anie.201702120 . بميد 28544553 . 
  16. ↑ سياتل، أخبار سلامة الغذاء، 1012 الجادة الأولى، الطابق الخامس، واشنطن 98104-1008 (18 ديسمبر 2018). "دراسة تكشف عن انتشار الغش في بيع الأسماك في ولاية نيويورك: المدعي العام يحذر سلاسل المتاجر الكبرى" . أخبار سلامة الغذاء . تاريخ الاسترجاع: 28 مارس 2019 .{{cite web}}: صيانة CS1: الأسماء الرقمية: قائمة المؤلفين ( رابط )
  17. ↑ ستينكه، ديرك؛ برنارد، أندريا م.؛ هورن، ريبيكا ل.؛ هيلتون، بول؛ هانر، روبرت؛ شيفجي، محمود س. (25 أغسطس/آب 2017). "تحليل الحمض النووي لزعانف أسماك القرش المتداولة وصفائح خياشيم أسماك الموبوليد يكشف عن نسبة عالية من الأنواع المهددة بالانقراض" . التقارير العلمية . 7 (1): 9505. Bibcode : 2017NatSR...7.9505S . doi : 10.1038/ s41598-017-10123-5 . ISSN 2045-2322 . PMC 5573315. PMID 28842669 .   
  18. ^ تومسن، فيليب فرانسيس. كيلغاست، جوس. ايفرسن، لارس لونسمان؛ مولر، بيتر راسك. راسموسن، مورتن؛ ويلرسليف ، إسكي (29/08/2012). لين ، سينجي (محرر). "الكشف عن حيوانات الأسماك البحرية المتنوعة باستخدام الحمض النووي البيئي من عينات مياه البحر" . بلوس واحد . 7 (8) هـ41732. بيب كود : 2012PLoSO...741732T . دوى : 10.1371/journal.pone.0041732 . ردمك 1932-6203 . بمك 3430657 . بميد 22952584 .   
  19. ↑ غولدبيرغ، كارين س.؛ ستريكلر، كاثرين م.؛ فريمير، ألكسندر ك. (أغسطس 2018). "التدهور والتشتت يحدّان من الكشف عن الحمض النووي البيئي للبرمائيات النادرة في الأراضي الرطبة: زيادة فعالية تصميمات أخذ العينات" . مجلة علوم البيئة الشاملة . 633 : 695-703 . Bibcode : 2018ScTEn.633..695G . doi : 10.1016/j.scitotenv.2018.02.295 . PMID 29602110 . 
  20. ↑ هاربر، لينزي ر.؛ بوكستون، أندرو س.؛ ريس، هيلين س.؛ بروس، كات؛ برايس، رين؛ هالفمارتن، ديفيد؛ ريد، دانيال س.؛ واتسون، هايلي ف.؛ ساير، كارل د. (2019-01-01). "آفاق وتحديات رصد الحمض النووي البيئي (eDNA) في برك المياه العذبة" . مجلة هيدروبيولوجيا . 826 (1): 25-41 . doi : 10.1007/s10750-018-3750-5 . ISSN 1573-5117 . 
  21. ↑ إيفانز، ناثان ت.؛ أولدز، بريت ب.؛ رينشو، مارك أ.؛ تيرنر، كاميرون ر.؛ لي، ييوان؛ جيرد، كريستوفر ل.؛ ماهون، أندرو ر.؛ بفريندر، مايكل إي.؛ لامبرتي، غاري أ. (يناير 2016). "تحديد كمية تنوع أنواع الأسماك والبرمائيات في البيئات التجريبية المصغرة باستخدام الترميز الفائق للحمض النووي البيئي" . موارد علم البيئة الجزيئية . 16 (1): 29-41 . doi : 10.1111/1755-0998.12433 . PMC 4744776. PMID 26032773 .  
  22. 1 2 فالنتيني، أليس؛ تابيرليه، بيير؛ ميود، كلود؛ سيفاد، رافائيل؛ هيردر، ييلجر؛ تومسن، فيليب فرانسيس؛ بيلمان، إيفا؛ بيسنارد، أوريليان؛ كويساك، إريك (فبراير 2016). "الجيل القادم من رصد التنوع البيولوجي المائي باستخدام الترميز الفائق للحمض النووي البيئي" ( ملف PDF) . علم البيئة الجزيئية . 25 (4): 929-942 . doi : 10.1111/mec.13428 . PMID 26479867. S2CID 2801412. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 27 أبريل 2019. تم الاسترجاع بتاريخ 13 يوليو 2019 .  
  23. ↑ هانفلينغ، بيرند؛ هاندلي، لوري لوسون؛ ريد، دانيال س.؛ هان، كريستوف؛ لي، جيانلونغ؛ نيكولز، بول؛ بلاكمان، روزيتا س.؛ أوليفر، آنا؛ وينفيلد، إيان ج. (2016). "الترميز الفائق للحمض النووي البيئي لمجتمعات أسماك البحيرات يعكس بيانات طويلة الأجل من أساليب المسح الراسخة" ( ملف PDF) . علم البيئة الجزيئية . 25 (13): 3101-3119 . doi : 10.1111/mec.13660 . ISSN 1365-294X . PMID 27095076. S2CID 21984641 .   
  24. ↑ وارد، آر دي؛ هانر، آر؛ هيبرت، بي دي إن (2009). "حملة ترميز الحمض النووي لجميع الأسماك، FISH-BOL". مجلة بيولوجيا الأسماك . 74 (2): 329-356 . doi : 10.1111/j.1095-8649.2008.02080.x . ISSN 1095-8649 . PMID 20735564. S2CID 3905635 .   
  25. ^ بيكر، سفين. هانر، روبرت. ستينكي ، ديرك (2011). "خمس سنوات من FISH-BOL: تقرير حالة موجز" . الحمض النووي الميتوكوندريا . 22 (sup1): 3– 9. دوى : 10.3109/19401736.2010.535528 . ISSN 1940-1736 . بميد 21271850 .  
  26. ↑ ستينكه، ديرك؛ هانر، روبرت (2011). "بروتوكول المتعاونين في مشروع FISH-BOL" . الحمض النووي للميتوكوندريا . 22 (ملحق 1): 10-14 . doi : 10.3109/19401736.2010.536538 . ISSN 1940-1736 . PMID 21261495 .  
  27. 1 2 هارمز-توهي، كاليفورنيا؛ شيزاس، نيفادا؛ أبيلدورن، روتشستر (25 أكتوبر 2016). "استخدام الترميز الجيني الفائق لتحليل محتوى معدة سمكة الأسد الغازية (Pterois volitans) في بورتوريكو" . سلسلة التقدم في علم البيئة البحرية . 558 : 181-191 . Bibcode : 2016MEPS..558..181H . doi : 10.3354/meps11738 . ISSN 0171-8630 . 
  28. ^ كورس ، إيمانويل. كوستيدوت، كارولين؛ شاباز، ريمي؛ بيش، نيكولاس. مارتن، جان فرانسوا؛ جيل ، أندريه (يناير 2010). "طريقة تعتمد على PCR لتحليل النظام الغذائي في كائنات المياه العذبة باستخدام تشفير الحمض النووي الريبوزي 18S على البراز: تشفير الحمض النووي في النظام الغذائي لكائنات المياه العذبة". موارد البيئة الجزيئية . 10 (1): 96-108 . دوى : 10.1111 / j.1755-0998.2009.02795.x . بميد 21564994 . S2CID 25358568 .  
  29. ↑ تاغوتشي، ت.؛ ميورا، ي.؛ كروجر، د.؛ سوجيورا، س. (مايو 2014). "استخدام تقنيات تحليل محتوى المعدة والحمض النووي البرازي لتقييم سلوك التغذية لسمك القاروص كبير الفم (Micropterus salmoides) وسمك الشمس الأزرق (Lepomis macrochirus): تحليل محتوى المعدة والحمض النووي البرازي". مجلة بيولوجيا الأسماك . 84 (5): 1271-1288 . doi : 10.1111/jfb.12341 . PMID 24661110 . 
  30. ↑ غييرو، ن.؛ بوليترو، س.؛ إيريبار، أ.؛ فالنتيني، أ.؛ سانتول، ف. (مايو 2017). "تطبيق تقنية الترميز الجيني للحمض النووي على براز سمك السلور الأوروبي (Silurus glanis) لتحديد نظامه الغذائي: الترميز الجيني للحمض النووي لبراز سمك السلور الأوروبي". مجلة بيولوجيا الأسماك . 90 (5): 2214-2219 . doi : 10.1111/jfb.13294 . PMID 28345142. S2CID 38780611 .  
  31. ↑ هارتيكاينن، هانا؛ جروهل، ألكسندر؛ أوكامورا، بيث (يوليو 2014). "التنوع والتحولات المورفولوجية المتكررة في اللاسعات الطفيلية الداخلية (الميكسوزوا: المالاكوسبوريا)". علم الوراثة الجزيئية والتطور . 76 : 261-269 . doi : 10.1016/j.ympev.2014.03.010 . PMID 24675700 . 
  32. إيفانز ، ناثان ت.؛ لي، ييوان؛ رينشو، مارك أ.؛ أولدز، بريت ب.؛ دينر، كريستي؛ تيرنر، كاميرون ر.؛ جيرد، كريستوفر ل.؛ لودج، ديفيد م.؛ لامبرتي، غاري أ. (سبتمبر 2017). " تقييم مجتمعات الأسماك باستخدام الترميز الفائق للحمض النووي البيئي: تأثيرات تصميم أخذ العينات والترشيح المعلوماتي الحيوي" . المجلة الكندية لعلوم مصايد الأسماك والأحياء المائية . 74 (9): 1362-1374 . doi : 10.1139/cjfas-2016-0306 . hdl : 1807/77359 . ISSN 0706-652X . 
  33. ↑ ماروياما، أتسوكي؛ سوغاتاني، كوسوكي؛ واتانابي، كازوكي؛ ياماناكا، هيروكي؛ إمامورا، أكيو (2018). " تحليل الحمض النووي البيئي كأداة كمية غير جراحية للهجرة التناسلية لسمكة مستوطنة مهددة بالانقراض في الأنهار" . علم البيئة والتطور . 8 (23): 11964-11974 . doi : 10.1002/ece3.4653 . PMC 6303803. PMID 30598791 .  
  34. ↑ شو، جينيفر إل إيه؛ كلارك، لورانس جيه؛ ويدربورن، سكوت دي؛ بارنز، توماس سي؛ ويريتش، لورا إس؛ كوبر، آلان (2016). "مقارنة بين الترميز الفائق للحمض النووي البيئي وطرق مسح الأسماك التقليدية في نظام نهري". الحفاظ البيولوجي . 197 : 131-138 . doi : 10.1016/j.biocon.2016.03.010 .