هيفوميكروبياليس
الـ Hyphomicrobiales (مرادف Rhizobiales ) هي رتبة من البكتيريا ألفا بروتيوبكتيريا سالبة الجرام .
تظهر بكتيريا الرايزوبيا ، التي تثبت النيتروجين وتعيش في تكافل مع جذور النباتات، في عدة عائلات مختلفة. تضم العائلات الأربع: Nitrobacteraceae و Hyphomicrobiaceae و Phyllobacteriaceae و Rhizobiaceae ، عدة أجناس على الأقل من البكتيريا المثبتة للنيتروجين، والمكونة للعقد الجذرية في البقوليات ، والتي تعيش في تكافل دقيق . ومن الأمثلة على ذلك جنسي Bradyrhizobium و Rhizobium . أما أنواع عائلة Methylocystaceae فهي من البكتيريا الميثانوترافية ؛ إذ تستخدم الميثانول (CH₃OH ) أو الميثان (CH₄ ) كمصدر وحيد للطاقة والكربون. ومن الأجناس المهمة الأخرى مسببات الأمراض البشرية Bartonella و Brucella ، بالإضافة إلى Agrobacterium ، وهي أداة مهمة في الهندسة الوراثية .
التصنيف
العائلات المقبولة
- Aestuarivirgaceae لي وآخرون . 2019
- Afifellaceae Hördt et al . 2020
- Ahrensiaceae Hördt et al . 2020
- البكتريا صن وآخرون . 2018
- غير متبلور Hördt وآخرون . 2020
- Ancalomicrobiaceae داهال وآخرون . 2018
- أورانتيموناداسيا هورت وآخرون . 2020
- Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (القوائم المعتمدة 1980)
- بيجيرينكياسيا غاريتي وآخرون 2006
- Blastochloridaceae Hördt et al . 2020
- Boseaceae Hördt et al . 2020
- Breoghaniaceae Hördt وآخرون . 2020
- Brucellaceae Breed et al . 1957 (القوائم المعتمدة 1980)
- Chelatococcaceae Dedysh et al . 2016
- Cohaesibacteraceae Hwang and Cho 2008
- Devosiaceae Hördt وآخرون . 2020
- Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950 (القوائم المعتمدة 1980)
- Kaistiaceae Hördt وآخرون . 2020
- Lichenibacteriaceae Pankratov et al . 2020
- Lichenihabitantaceae نوح وآخرون . 2019
- Methylobacteriaceae Garrity et al . 2006
- ميثيلوسيستاسي بومان 2006
- Nitrobacteraceae corrig. Buchanan 1917 (القوائم المعتمدة 1980)
- نوتواكميباكتيراسيا هوانغ وآخرون 2017
- Parvibaculaceae Hördt et al . 2020
- Phreatobacteraceae Hördt et al . 2020
- Phyllobacteriaceae Mergaert and Swings 2006
- Pleomorphomonadaceae Hördt et al . 2020
- Pseudoxanthobacteraceae Hördt et al . 2020
- Rhabdaerophilaceae Ming et al . 2020
- Rhizobiaceae Conn 1938 (القوائم المعتمدة 1980)
- رودوبياسيا غاريتي وآخرون 2006
- Roseiarcaceae Kulichevskaya et al . 2014
- Salinarimonadaceae Cole et al . 2018
- Segnochrobactraceae Akter وآخرون . 2020
- ستابياسيا هوردت وآخرون . 2020
- Tepidamorphaceae Hördt وآخرون . 2020
- Xanthobacteraceae Lee et al . 2005
أجناس غير مصنفة
لم يتم تصنيف الجنس التالي ضمن عائلة معينة:
- Flaviflagellibacter Dong et al . 2019 [ 3 ]
التصنيفات المؤقتة
تم نشر هذه التصنيفات، ولكن لم يتم التحقق منها وفقًا لقانون علم البكتيريا :
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية [ 7 ] ، بينما يعتمد علم الوراثة العرقي على تسلسلات الجينوم الكامل. [ 2 ] [ أ ]
| |||||||||||||||||||||||||
التحول الجيني الطبيعي
تم الإبلاغ عن التحول الجيني الطبيعي في أربعة أنواع على الأقل من بكتيريا Hyphomicrobiales : Agrobacterium tumefaciens ، [ 8 ] و Methylobacterium organophilum ، [ 9 ] وEnsifer adhaerens ، [ 10 ] و Bradyrhizobium japonicum . [ 11 ] التحول الجيني الطبيعي هو عملية جنسية تتضمن نقل الحمض النووي من خلية بكتيرية إلى أخرى عبر الوسط الوسيط، ودمج تسلسل الحمض النووي المانح في جينوم الخلية المستقبلة عن طريق إعادة التركيب المتماثل .
انظر أيضاً
ملحوظات
- ↑ لم يتم تضمين Aestuariivirgaceae و Alsobacteraceae و Ancalomicrobiaceae و Lichenibacteriaceae و Lichenihabitantaceae و Rhabdaerophilaceae و Segnochrobactraceae في هذه الشجرة التطورية.
- ↑ بكتيريا Phyllobacterium منفصلة عن باقي أنواع Phyllobacteriaceae .
- ↑ يُعدّ Prosthecomicrobium منفصلاً عن باقي أنواع Hyphomicrobiaceae .
مراجع
- ↑ باركر سي تي، غاريتي جي إم (1 يناير 2003). باركر سي تي، غاريتي جي إم (محرران). "ملخص تصنيفي لعائلات: مابيكيباكتيراسيا ". ملخصات نايمز فور لايف . نايمز فور لايف، ذ.م.م. doi : 10.1601/tx.30673 .
- 1 2 هوردت أ، لوبيز إم جي، ماير-كولثوف جيه بي، شلاينينغ إم، واينهولد إل إم، تيندال بي جيه، وآخرون (2020). " تحليل أكثر من 1000 جينوم من السلالات النمطية يُحسّن بشكل كبير التصنيف التكسونومي للبكتيريا الألفا بروتيو " . فرونتيرز إن ميكروبيولوجي . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689. PMID 32373076 .
- ↑ دونغ إل، هان إم إكس، وانغ دي، ليو إف، عاصم إم دي، جياو جي واي، شياو إم، سلام إن، لي دبليو جي (2019). " Flaviflagellibacter deserti gen. nov., sp. nov.، عضو جديد من رتبة Rhizobiales معزول من تربة صحراوية". Antonie van Leeuwenhoek . 112 (6): 947–954 . doi : 10.1007/s10482-019-01228-0 . PMID 30637538. S2CID 58006833 .
- ^ لا سكولا ب، باراسي إل، راؤول د (2004). "بكتيريا ألفا بروتينية جديدة، Nordella oligomobilis gen. nov., sp. nov.، تم عزلها باستخدام الزراعات الأميبية المشتركة" . الدقة ميكروبيول . 155 (1): 47-51 . دوى : 10.1016/j.resmic.2003.09.012 . بميد 14759708 .
- 1 2 3 Liu YL، Meng D، Wang F، Gong XF، Gu PF، Fan XY، Du ZJ، Zou JD، Li Q (2021). " Propilenella binzhouense gen. nov., sp. nov. معزول من الحمأة المنشطة، ومقترح من Propylellaceae fam. nov". أنتوني فان ليفينهوك . 114 (3): 225-233 . دوى : 10.1007 / s10482-020-01514-2 . بميد 33400070 . S2CID 230665484 .
- ↑ سيسلاك سي دي (2013). بكتيريا محبة للحرارة جديدة معزولة من فتحات حرارية مائية بحرية (رسالة ماجستير). جامعة ولاية بورتلاند. doi : 10.15760/etd.1485.1486 .
- ↑ يوزيبي جيه بي، بارتي إيه سي. " Hyphomicrobiales " . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 15 مايو 2021 .
- ↑ ديمانيش إس، كاي إي، غوربيير إف، سيمونيه بي (يونيو 2001). "التحول الطبيعي لبكتيريا الزائفة المتألقة وبكتيريا الأجروبكتيريوم الورمية في التربة" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 67 (6): 2617-2621 . Bibcode : 2001ApEnM..67.2617D . doi : 10.1128/AEM.67.6.2617-2621.2001 . PMC 92915. PMID 11375171 .
- ↑ أوكونور م، ووبات أ، هانسون ر.س. (يناير 1977). "التحول الجيني في بكتيريا ميثيلوباكتيريوم أورجانوفيلوم" . مجلة علم الأحياء الدقيقة العام . 98 (1): 265-272 . doi : 10.1099/00221287-98-1-265 . PMID 401866 .
- ↑ زونيغا-سوتو إي، مولينز إي، ديديكوفا ب (2015). "التحويل الوراثي بواسطة إنسيفير: بروتوكول فعال غير قائم على أغروباكتيريوم للتعديل الوراثي للأرز" . سبرينغر بلس . 4 : 600. doi : 10.1186/s40064-015-1369-9 . PMC 4628045. PMID 26543735 .
- ↑ راينا جيه إل، مودي في في (أغسطس 1972). " ارتباط الديوكسي ريبونوكليوتيدات وتحولها في بكتيريا الريزوبيوم الياباني" . مجلة علم البكتيريا . 111 (2): 356-360 . doi : 10.1128/JB.111.2.356-360.1972 . PMC 251290. PMID 4538250 .
للمزيد من القراءة
- كويكندال، إل دي، ودازو، إف بي (2005). " ألوريزوبيوم ". في: برينر، دي جيه، وكريج، إن آر، وستالي، جيه تي، وجاريتي، جي (محررون). بروتيوبكتيريا ألفا، وبيتا، ودلتا، وإبسيلون، بروتيوبكتيريا، الجزء ج، دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 2 ( الطبعة الثانية). سبرينغر، نيويورك، نيويورك. الصفحات 345-346 . ISBN 978-0-387-24144-9.
- كويكندال، إل دي (2005). "جنس أزورهيزوبيوم ". في: برينر، دي جيه، وكريج، إن آر، وستالي، جيه تي، وجاريتي، جي (محررون). بروتيوبكتيريا ألفا، وبيتا، ودلتا، وإبسيلون، بروتيوبكتيريا، الجزء ج، دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 2 ( الطبعة الثانية). سبرينغر، نيويورك، نيويورك. الصفحات 505-506 . ISBN 978-0-387-24144-9.
- كويكندال إل دي (2005). "جنس براديريزوبيوم ، عائلة براديريزوبياسيا"في: برينر دي جيه، كريج إن آر، ستالي جيه تي، غاريتي جي (محررون). بروتيوبكتيريا ألفا، وبيتا، ودلتا، وإبسيلون، بروتيوبكتيريا، الجزء ج، دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 2 ( الطبعة الثانية). سبرينغر، نيويورك، نيويورك. الصفحات 438-443 . ISBN 978-0-387-24144-9.
- كويكندال، إل دي، ويونغ، جيه إم، ومارتينيز-روميرو، وكير، إيه، وساوادا، إتش (2005). "جنس الريزوبيوم ، جنس شديد التباين ضمن عائلة منقحة". في: برينر، دي جيه، وكريغ، إن آر، وستالي، جيه تي، وغاريتي، جي (محررون). بروتيوبكتيريا ألفا، وبيتا، ودلتا، وإبسيلون، بروتيوبكتيريا، الجزء ج، دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 2 ( الطبعة الثانية). سبرينغر، نيويورك، نيويورك. الصفحات 324-340 . ISBN 978-0-387-24144-9.
- تشين دبليو إكس، وانغ إي تي، كويكيندال إل دي (2005). "جنس ميزوريزوبيوم ، عائلة فوتوباكتيريا". في برينر دي جيه، كريج إن آر، ستالي جيه تي، غاريتي جي (محررون). بروتيوبكتيريا ألفا، وبيتا، ودلتا، وإبسيلون، بروتيوبكتيريا، الجزء ج، دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 2 ( الطبعة الثانية). سبرينغر، نيويورك، نيويورك. الصفحات 403-408 . ISBN 978-0-387-24144-9.
- هيفوميكروبياليس
- طلبات البكتيريا
- علم الأحياء في التربة
