البكتيريا المخاطية
| البكتيريا المخاطية | |
|---|---|
| ميكسوكوكوس زانثوس | |
| التصنيف العلمي | |
| اِختِصاص: | البكتيريا |
| الشعبة: | ميكسوكوكوتا |
| فصل: | ميكسوكوشيا وايت وآخرون 2020 [1] |
| طلب: | ميكسوكوكاليس تشان وآخرون. 1948 |
| العائلات والأجناس | |
| |
| المرادفات | |
|
"Myxococcidae" كافاليير سميث 2020 | |
البكتيريا المخاطية (" بكتيريا المخاط ") هي مجموعة من البكتيريا التي تعيش بشكل أساسي في التربة وتتغذى على المواد العضوية غير القابلة للذوبان. تحتوي البكتيريا المخاطية على جينومات كبيرة جدًا مقارنة بالبكتيريا الأخرى، على سبيل المثال 9-10 ملايين نوكليوتيد باستثناء Anaeromyxobacter [2] و Vulgatibacter . [3] أحد أنواع البكتيريا المخاطية، Minicystis rosea ، [4] لديه أكبر جينوم بكتيري معروف بأكثر من 16 مليون نوكليوتيد. ثاني أكبر جينوم بكتيري هو Sorangium cellulosum . [5] [6]
يمكن للبكتيريا المخاطية أن تتحرك بالانزلاق . [7] وعادة ما تسافر في أسراب (تُعرف أيضًا باسم مجموعات الذئاب )، تحتوي على العديد من الخلايا التي يتم الاحتفاظ بها معًا بواسطة إشارات جزيئية بين الخلايا . يستفيد الأفراد من التجمع لأنه يسمح بتراكم الإنزيمات خارج الخلية المستخدمة في هضم الطعام؛ وهذا بدوره يزيد من كفاءة التغذية. تنتج البكتيريا المخاطية عددًا من المواد الكيميائية المفيدة طبيًا وصناعيًا، مثل المضادات الحيوية ، وتصدر تلك المواد الكيميائية خارج الخلية. [8]
تُستخدم البكتيريا المخاطية لدراسة إنتاج السكاريد في البكتيريا سلبية الجرام مثل نموذج Myxococcus xanthus الذي يحتوي على أربع آليات مختلفة [9] لإفراز السكاريد حيث تم تحديد آلية Wzx / Wzy جديدة لإنتاج سكاريد جديد في عام 2020. [9]
تعتبر البكتيريا المخاطية أيضًا نماذج جيدة لدراسة التعدد الخلوي في عالم البكتيريا . [10]
دورة الحياة
عندما تكون العناصر الغذائية شحيحة، تتجمع خلايا البكتيريا المخاطية في أجسام ثمرية (لا ينبغي الخلط بينها وبين تلك الموجودة في الفطريات )، وهي عملية كان يُعتقد منذ فترة طويلة أنها تتم بوساطة التاكسي الكيميائي ولكنها تعتبر الآن وظيفة لشكل من أشكال الإشارات التي تتم بوساطة التلامس. [11] [12] يمكن أن تأخذ هذه الأجسام الثمرية أشكالًا وألوانًا مختلفة، اعتمادًا على الأنواع. داخل الأجسام الثمرية، تبدأ الخلايا كخلايا نباتية على شكل قضيب، وتتطور إلى جراثيم مخاطية مستديرة بجدران خلوية سميكة. من المرجح أن تبقى هذه الجراثيم المخاطية، المشابهة للجراثيم في الكائنات الحية الأخرى، على قيد الحياة حتى تصبح العناصر الغذائية أكثر وفرة. يُعتقد أن عملية الإثمار تفيد البكتيريا المخاطية من خلال ضمان استئناف نمو الخلايا مع مجموعة (سرب) من البكتيريا المخاطية، بدلاً من الخلايا المعزولة. تطورت دورات حياة مماثلة بين بعض الأميبا ، والتي تسمى العفن المخاطي الخلوي .
على المستوى الجزيئي، يتم تنظيم بدء تطور الجسم الثمرى في Myxococcus xanthus بواسطة Pxr sRNA . [13] [14]
تُستخدم البكتيريا المخاطية مثل Myxococcus xanthus و Stigmatella aurantiaca ككائنات نموذجية لدراسة التطور.
وقد اقترح أن السلف المشترك الأخير للبكتيريا المخاطية كان هوائيًا وأن أسلافها اللاهوائية عاشت بشكل متزامن مع حقيقيات النوى المبكرة. [16]
الاستخدام السريري
لوحظ أن المستقلبات التي يفرزها Sorangium cellulosum والمعروفة باسم epothilones لها نشاط مضاد للورم . وقد أدى هذا إلى تطوير نظائر تحاكي نشاطها. أحد هذه النظائر، المعروف باسم Ixabepilone، هو عامل علاج كيميائي معتمد من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية لعلاج سرطان الثدي النقيلي . [17]
ومن المعروف أيضًا أن البكتيريا المخاطية تنتج حمض الجيفيرونيك ، وهو مثبط لتخليق البروتين حقيقيات النوى وعامل محتمل للعلاج الكيميائي للسرطان. [18]
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء الكائنات الحية البدائية التي لها مكانة في التسمية (LPSN) [19] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) [20]
| 16S rRNA القائم على LTP _08_2023 [21] [22] [23] | 120 بروتينًا مميزًا يعتمد على GTDB 08-RS214 [24] [25] [26] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
انظر أيضا
مراجع
- ^ Waite DW، Chuvochina M، Pelikan C، Parks DH، Yilmaz P، Wagner M، Loy A، Naganuma T، Nakai R، Whitman WB، Hahn MW، Kuever J، Hugenholtz P. (2020). "اقتراح لإعادة تصنيف فئات البروتيوباكتيريا دلتا بروتيوباكتيريا وأوليجوفلكسيا، وشعبة ثيرموديسولفوباكتيريا إلى أربع شعب تعكس القدرات الوظيفية الرئيسية". Int J Syst Evol Microbiol . 70 (11): 5972–6016. doi : 10.1099/ijsem.0.004213 . PMID 33151140.
- ^ Thomas SH, Wagner RD, Arakaki AK, Skolnick J, Kirby JR, Shimkets LJ, Sanford RA, Löffler FE (مايو 2008). "يشير الجينوم الفسيفسائي لسلالة Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C إلى وجود سلف مشترك هوائي للدلتا بروتيوباكتريا". PLOS ONE . 3 (5): e2103. Bibcode :2008PLoSO...3.2103T. doi : 10.1371/journal.pone.0002103 . PMC 2330069. PMID 18461135 .
- ^ "سلالة Vulgatibacter incomptus DSM 27710، الجينوم الكامل". 2015-08-19.
{{cite journal}}: تتطلب المجلة الاستشهاد بها|journal=( مساعدة ) - ^ شيلبي بال، وجوراف شارما وسريكريشنا سوبرامانيان (2021-09-13). "التسلسل الكامل للجينوم وتحديد جينات تخليق الأحماض الدهنية غير المشبعة في البكتيريا المخاطية Minicystis rosea DSM 24000T". BMC Genomics . 22 (1): 655. doi : 10.1186/s12864-021-07955-x . PMC 8436480. PMID 34511070 .
- ^ Schneiker S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, et al. (نوفمبر 2007). "تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا الميكسوباكتريوم، Sorangium cellulosum". Nat. Biotechnol . 25 (11): 1281–9. doi : 10.1038/nbt1354 . PMID 17965706.
- ^ Land M, Hauser L, Jun SR, Nookaew I, Leuze MR, Ahn TH, Karpinets T, Lund O, Kora G, Wassenaar T, Poudel S, Ussery DW (مارس 2015). "رؤى من 20 عامًا من تسلسل الجينوم البكتيري". Funct. Integr. Genomics . 15 (2): 141–61. doi :10.1007/s10142-015-0433-4. PMC 4361730. PMID 25722247 .
- ^ Mauriello EM, Mignot T, Yang Z, Zusman DR (يونيو 2010). "إعادة النظر في الحركة الانزلاقية: كيف تتحرك البكتيريا المخاطية بدون أسواط؟". Microbiol. Mol. Biol. Rev. 74 ( 2): 229–49. doi :10.1128/MMBR.00043-09. PMC 2884410. PMID 20508248 .
- ^ Reichenbach H (سبتمبر 2001). "البكتيريا المخاطية، منتجو المواد الحيوية النشطة الجديدة". J. Ind. Microbiol. Biotechnol . 27 (3): 149–56. doi : 10.1038/sj.jim.7000025 . PMID 11780785. S2CID 34964313.
- ^ ab Islam ST, Vergara Alvarez I, Saïdi F, Guiseppi A, Vinogradov E, Sharma G, et al. (يونيو 2020). "تعديل التعدد الخلوي للبكتيريا عبر إفراز السكاريد المتعدد المكاني". PLOS Biology . 18 (6): e3000728. doi : 10.1371/journal.pbio.3000728 . PMC 7310880. PMID 32516311 .
- ^ Islam ST, Vergara Alvarez I, Saïdi F, Guiseppi A, Vinogradov E, Sharma G, et al. (يونيو 2020). "تعديل التعدد الخلوي للبكتيريا عبر إفراز السكاريد المتعدد المكاني". PLOS Biology . 18 (6): e3000728. doi : 10.1371/journal.pbio.3000728 . PMC 7310880. PMID 32516311 .
- ^ Kiskowski MA, Jiang Y, Alber MS (ديسمبر 2004). "دور الجداول في تكوين تجمعات البكتيريا المخاطية". Phys Biol . 1 (3–4): 173–83. Bibcode :2004PhBio...1..173K. doi :10.1088/1478-3967/1/3/005. PMID 16204837. S2CID 18846289.
- ^ Sozinova O, Jiang Y, Kaiser D, Alber M (أغسطس 2005). "نموذج ثلاثي الأبعاد لتجمع البكتيريا المخاطية عن طريق التفاعلات التي تتم بوساطة الاتصال". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (32): 11308–12. Bibcode :2005PNAS..10211308S. doi : 10.1073 /pnas.0504259102 . PMC 1183571. PMID 16061806.
- ^ Yu YT, Yuan X, Velicer GJ (مايو 2010). "التطور التكيفي لـ sRNA الذي يتحكم في نمو Myxococcus". Science . 328 (5981): 993. Bibcode :2010Sci...328..993Y. doi :10.1126/science.1187200. PMC 3027070. PMID 20489016 .
- ^ Fiegna F, Yu YT, Kadam SV, Velicer GJ (مايو 2006). "تطور الغشاش الاجتماعي الملزم إلى متعاون متفوق". Nature . 441 (7091): 310–4. Bibcode :2006Natur.441..310F. doi :10.1038/nature04677. PMID 16710413. S2CID 4371886.
- ^ ثاكستر ر (1892). "حول Myxobacteriaceæ، نظام جديد من Schizomycetes". Botanical Gazette . 17 (12): 389–406. doi : 10.1086/326866 . ISSN 0006-8071.
- ^ Hoshino, Y.; Gaucher, EA (2021). "تطور تخليق الستيرويدات البكتيرية وتأثيرها على نشوء حقيقيات النوى". PNAS . 118 (25): e2101276118. doi : 10.1073/pnas.2101276118 . ISSN 0027-8424. PMC 8237579. PMID 34131078 .
- ^ "موافقة إدارة الغذاء والدواء على عقار إيكسابيلون". المعهد الوطني للسرطان .
- ^ Sasse F, Steinmetz H, Höfle G, Reichenbach H (يناير 1995). "حمض الجيفيرونيك، مثبط جديد لتخليق البروتين حقيقيات النوى من Archangium gephyra (myxobacteria). الإنتاج والعزل والخصائص الفيزيائية والكيميائية والبيولوجية وآلية العمل". J. Antibiot . 48 (1): 21–5. doi : 10.7164/antibiotics.48.21 . PMID 7868385.
- ^ JP Euzéby. "Deltaproteobacteria". قائمة أسماء الكائنات الحية البدائية التي لها مكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 2022-09-09 .
- ^ Sayers; et al. "Deltaproteobacteria". قاعدة بيانات تصنيف المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 2022-09-09 .
- ^ "The LTP" . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "شجرة LTP_all بتنسيق newick" . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "ملاحظات إصدار LTP_08_2023" (PDF) . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "GTDB release 08-RS214". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ^ "bac120_r214.sp_label". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ^ "تاريخ التصنيف". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
روابط خارجية
- صفحة الويب الخاصة بـ Myxobacteria
- Schwarmentwicklung und Morphogenese bei Myxobakterien على موقع YouTube
- البكتيريا المخاطية تشكل أجسامًا ثمرية على اليوتيوب
- Myxococcus xanthus تفترس مستعمرة E. coli على YouTube
