ناترونوموناس
Natronomonas (اختصار شائع Nmn. ) هو جنس من العتائق في عائلة Halobacteriaceae . [ 1 ]
الوصف والأهمية
Natronomonas pharaonis هو نوع من العتائق الهوائية المحبة للملوحة والقلوية الشديدة التي تنمو بشكل مثالي في 3.5 مولار من كلوريد الصوديوم وعند درجة حموضة 8.5، ولكنه حساس لتركيزات المغنيسيوم العالية .
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 2 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 1 ]
| LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] | 53 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB 10-RS226 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
بنية الجينوم
يتكون جينوم بكتيريا ناترونوموناس فرعونيس من ثلاثة نسخ دائرية متكررة، والكروموسوم الذي يبلغ طوله 2,595,221 زوجًا قاعديًا، وبلازميد نموذجي للبكتيريا القديمة المحبة للملوحة يبلغ طوله 131 كيلوبايت، وبلازميد فريد متعدد النسخ يبلغ طوله 23 كيلوبايت. يتميز كروموسومها بمحتوى عالٍ من الجوانين والسيتوزين (63.4%). كما تحتوي بروتينات ناترونوموناس فرعونيس على نسبة عالية من الأحماض الأمينية الحمضية (بمعدل 19.3%) ، مما ينتج عنه انخفاض في نقطة التعادل الكهربائي (بمعدل 4.6). يُعتبر هذا أحد السمات التكيفية للبكتيريا القديمة المحبة للملوحة، والتي تُعرف بتطبيقها استراتيجية "التملح الداخلي" (تركيزات عالية من الأملاح الداخلية) للبقاء على قيد الحياة في بيئتها شديدة الملوحة (فالب وآخرون). علاوة على ذلك، تجدر الإشارة إلى أن هذه البكتيريا القديمة تفتقر إلى الترميز الجيني للإنزيمات الرئيسية في مسارات تحلل الجلوكوز، مما يجعلها غير قادرة على استخدام السكريات.
بنية الخلية واستقلابها
تتميز بكتيريا ناترونوموناس ، كغيرها من أعضاء عائلة هالوباكتيرياسيا، بخصائص فيزيولوجية فريدة، إذ لا تتطلب فقط تركيزات عالية من كلوريد الصوديوم، بل تتطلب أيضًا درجة حموضة عالية وتركيزات منخفضة من أيونات المغنيسيوم للنمو. تستخدم عادةً الأحماض الأمينية كمصدر للكربون، إلا أن سلسلة من الدراسات كشفت أن هذه البكتيريا القديمة تتمتع بدرجة عالية من الاكتفاء الذاتي الغذائي. كما أنها، على عكس الكائنات المحبة للقلويات الأخرى التي تستخدم أيونات الصوديوم (Na+) بدلاً من أيونات الهيدروجين (H+) كأيونات ربط بين سلسلة التنفس وإنزيم ATP سينثاز، تستخدم البروتونات كأيونات ربط.
تنمو هذه البكتيريا القديمة في ظروف قلوية عالية، حيث يبلغ الرقم الهيدروجيني حوالي 11، مما يؤدي إلى انخفاض مستويات الأمونيا بالإضافة إلى نقص أيونات المعادن. يُظهر تحليل الجينوم أن هذه البكتيريا القديمة، في عملية استقلاب النيتروجين، تمتلك ثلاث آليات لتوفير الأمونيا، التي تُدمج لاحقًا في الغلوتامات: الامتصاص المباشر للأمونيا، وامتصاص النترات واختزالها لاحقًا إلى أمونيا، وامتصاص اليوريا التي يُحللها إنزيم اليورياز لإطلاق الأمونيا. تُمثل الأسهم الخضراء في الشكل نواقل مصادر النيتروجين الخارجية: الأمونيا ( AmtB )، والنترات (NarK)، واليوريا (UrtA-E)، بينما تُمثل الأسهم الزرقاء إنزيمات اختزال النترات (NarB + Nir A) وتحلل اليوريا (UreA-G). اختصارات أخرى: GlnA + GltB = غلوتامات؛ 2-OG = أوكسوغلوتارات؛ fdx = فيريدوكسين.
من المحتمل أن تستخدم بكتيريا ناترونوموناس الفيريدوكسين، وليس NADH، كمصدر للإلكترونات في جميع عمليات الاختزال الثلاث. ويتضح ذلك من وجود بقايا محفوظة ترتبط بالفيريدوكسين ضمن بروتين NirA في بكتيريا ناترونوموناس فرعونيس، ومن اعتماد مختزلات النترات والنتريت على الفيريدوكسين في بكتيريا هالوفراكس ميديتراني المحبة للملوحة .
علم البيئة
تم عزل سلالات N. pharaonis لأول مرة من بحيرات الصودا شديدة الملوحة في مصر وكينيا، والتي تظهر قيم الأس الهيدروجيني حوالي 11.
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 سايرز وآخرون . "ناترونوموناس" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 10-10-2023 .
- ↑ جيه بي يوزيبي. "ناترونوموناس" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 10-10-2023 .
- ↑ "برنامج النقل طويل الأجل" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "ar53_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
للمزيد من القراءة
- أورين أ؛ فينتوسا أ (2000). "اللجنة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي، اللجنة الفرعية المعنية بتصنيف البكتيريا المحبة للملوحة. محاضر الاجتماعات، 16 أغسطس 1999، سيدني، أستراليا" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 50 (3): 1405-1407 . doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .
- كاميكورا م . ديال سميث مل . أوباساني الخامس . فينتوسا أ . وآخرون . (1997). "تنوع البكتيريا الهالوبكتريا القلوية: مقترحات لنقل Natronobacterium vacuolatum و Natronobacterium magadii و Natronobacterium pharaonis إلى Halorubrum و Natrialba و Natronomonas gen. nov.، على التوالي، مثل Halorubrum vacuolatum comb. nov.، Natrialba magadii comb. nov.، و Natronomonas pharaonis مشط نوفمبر على التوالي". كثافة العمليات. J. النظام. بكتريول . 47 (3): 853-857 . دوى : 10.1099/00207713-47-3-853 . بميد 9226918 .
- ناتاراجان، جاناني؛ شولتز، أنيتا؛ كورتز، أورسولا؛ شولتز، يواكيم إي. (2014). "التوصيف البيوكيميائي لنطاق HAMP المزدوج من بكتيريا ناترونوموناس فرعونيس كناقل إشارة داخل البروتين". مجلة FEBS . 281 (14): 3218-3227 . doi : 10.1111/febs.12855 . PMID 24863503 .
روابط خارجية
- أجناس العتائق
- التصنيفات الموصوفة في عام 1997
- هالواركيا