مؤسسة المعلوماتية الحيوية المفتوحة

مؤسسة Open Bioinformatics Foundation هي منظمة غير ربحية يديرها متطوعون تركز على دعم البرمجة مفتوحة المصدر في مجال المعلوماتية الحيوية . ^[1] تتمثل مهمة المؤسسة في دعم تطوير أدوات مفتوحة المصدر لعلم المعلومات الحيوية، وتنظيم أحداث hackathon التي تركز على المطورين ، والمساعدة بشكل عام في تطوير وتعزيز تطوير البرمجيات مفتوحة المصدر في علوم الحياة. كما تنظم المؤسسة وتدير مؤتمر Bioinformatics Open Source السنوي ، وهو اجتماع تابع لمؤتمر Intelligent Systems for Molecular Biology . ^[2] تشارك المؤسسة في Google Summer of Code ، وتعمل كمنظمة شاملة للمشاريع الفردية المتعلقة بعلم المعلومات الحيوية. ^{[3] [4]}

تأسست مؤسسة Open Bioinformatics Foundation في عام 2001، والتي نشأت من مشاريع BioJava و BioPerl و BioPython . تم إنشاء عضوية رسمية للمؤسسة في عام 2005. ^[1] في أكتوبر 2012، بدأت المؤسسة شراكة مع Software in the Public Interest (SPI)، وهي منظمة غير ربحية مقرها الولايات المتحدة تساعد المنظمات الأخرى في إنشاء وتوزيع البرامج المجانية والمفتوحة المصدر . يسمح الارتباط بـ SPI بالتبرعات المالية للمؤسسة (وهي معفاة من الضرائب بموجب المادة 501(c)3 في الولايات المتحدة). ^{[1] [5]}

تُدار المؤسسة من قبل مجلس إدارة يمثل مشاريع Bio* المختلفة. اعتبارًا من عام 2019، أصبح رئيس OBF هو بيتر كوك ( BioPython ). ^[6] ومن بين رؤساء OBF السابقين إيوان بيرني وهيلمار لاب ( NESCent )، ومن بين أعضاء مجلس الإدارة السابقين ستيفن إي برينر . ^[7]

تستضيف المؤسسة خوادم لقوائم البريد ومواقع الويب ومستودعات التعليمات البرمجية لعدد من مشاريع المصدر المفتوح المتعلقة بعلم الأحياء الحاسوبي، بما في ذلك: ^[8]

• BioJava – مجموعة أدوات Java
• BioMOBY – تنفيذ البيانات والتطبيقات من خلال خدمات الويب
• BioPerl – مجموعة أدوات Perl
• BioPython – مجموعة أدوات Python
• BioRuby – مجموعة أدوات Ruby
• بيوفي بي اتش بي
• EMBOSS – مجموعة أدوات تحليل التسلسل.

• قائمة ببرامج المعلوماتية الحيوية مفتوحة المصدر
• قاعدة بيانات الكائنات النموذجية العامة

• موقع مؤسسة المعلوماتية الحيوية المفتوحة