العلوم المفتوحة

علم الدفتر المفتوح هو ممارسة إتاحة السجل الأولي الكامل لمشروع بحثي للجمهور عبر الإنترنت فور تسجيله. يتضمن ذلك نشر دفتر الباحث الشخصي أو المختبري على الإنترنت، إلى جانب جميع البيانات الأولية والمعالجة، وأي مواد مرتبطة بها، فور إنتاجها. يمكن تلخيص هذا النهج بشعار "لا معلومات داخلية". وهو يمثل أقصى درجات الشفافية في البحث العلمي، ويشمل صراحةً إتاحة التجارب الفاشلة أو الأقل أهمية أو غير المنشورة؛ ما يُعرف بـ"البيانات المظلمة". [ 1 ] على الرغم من أن ممارسة علم الدفتر المفتوح ليست شائعة في الأوساط الأكاديمية ، إلا أنها حظيت باهتمام كبير مؤخرًا في وسائل الإعلام البحثية [ 2 ] [ 3 ] والعامة [ 1 ] [ 4 ] ، كجزء من اتجاه عام نحو مزيد من الانفتاح في ممارسات البحث والنشر. لذا، يمكن وصف علم الدفتر المفتوح بأنه جزء من حركة أوسع للعلوم المفتوحة ، تشمل الدعوة إلى تبني النشر المفتوح ، والبيانات المفتوحة ، وجمع البيانات من مصادر متعددة، وعلم المواطن . وقد استلهم هذا جزئياً من نجاح البرمجيات مفتوحة المصدر [ 5 ] ويعتمد على العديد من أفكارها.

تاريخ

استُخدم مصطلح "علم الدفتر المفتوح" [ 6 ] لأول مرة عام 2006 في تدوينة كتبها جان كلود برادلي ، الأستاذ المشارك في الكيمياء بجامعة دريكسل آنذاك. وقد وصف برادلي علم الدفتر المفتوح على النحو التالي: [ 7 ]

... يوجد رابط إلكتروني لدفتر ملاحظات المختبر، وهو متاح مجانًا ومفهرس في محركات البحث الشائعة. ليس من الضروري أن يكون شكله كدفتر ورقي، ولكن من الضروري أن تكون جميع المعلومات المتاحة للباحثين للوصول إلى استنتاجاتهم متاحة بالتساوي لبقية العالم.

جان كلود برادلي

الممارسون

نشيط

تجريبي (مرتب أبجديًا حسب اسم العائلة)

"يقوم فريق من العلماء الرواد في مركز SGC الآن بمشاركة دفاتر مختبراتهم عبر الإنترنت" . [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]

نظري

  • توبياس ج. أوزبورن [ 22 ]
  • كارل بوتيجر، النظرية والنمذجة الحاسوبية في علم البيئة والتطور. [ 23 ] [ 24 ]
  • درور بار ناتان [ 25 ]
  • أندريس ج. سارافيا، [ 26 ] دكتوراه في الفيزياء. طالب في سينفيستاف ميريدا .
  • دانيال هيميلشتاين، الذي قاد مشروع Rephetio - وهي دراسة لإعادة استخدام الأدوية استخدمت GitHub وThinklab للعلوم والتعاون في الوقت الفعلي باستخدام دفاتر الملاحظات المفتوحة. [ 27 ]

مؤرشف (حسب الترتيب الأبجدي للاسم الأخير)

  • بريجيت بلاك [ 28 ] )، طالبة دكتوراه في الفيزياء في مختبر كوخ بجامعة نيو مكسيكو.
  • جان كلود برادلي [ 29 ]
  • جيريميا فيث [ 30 ]
  • ناديزدا فرنانديز-أوروبيزا، [ 31 ] طالبة دكتوراه في الهندسة الطبية الحيوية في مختبر كوخ بجامعة نيو مكسيكو.
  • مايك لورانس
  • لين لي، [ 32 ] طالبة جامعية متخصصة في الفيزياء وخريجة مختبر كوخ في جامعة نيو مكسيكو.
  • أندي مالوني، [ 33 ] باحث ما بعد الدكتوراه في مختبر سميث بجامعة تكساس. حاصل على درجة الدكتوراه من مختبر كوخ بجامعة نيو مكسيكو (2011) [ 34 ] [ 35 ]
  • كاميرون نيلون [ 36 ]
  • أليخاندرو تامايو [ 37 ]
  • أصول وتطور الإنفلونزا [ 38 ]

متكرر (تعليمي)

دفاتر ملاحظات مفتوحة جزئياً/شبه مفتوحة

هذه مبادرات أكثر انفتاحاً من دفاتر المختبرات التقليدية، لكنها تفتقر إلى عنصر أساسي لعلم الدفاتر المفتوحة بالكامل. عادةً ما تتم مشاركة الدفتر جزئياً فقط أو تتم مشاركته بتأخير كبير. [ 40 ]

  • شبكة Open Notebook Science Network [ 41 ] هي شبكة مدونات ووردبريس مصممة لإنشاء دفاتر الملاحظات الفردية/المخبرية وصيانتها. اعتبارًا من يناير 2018، بلغ عدد الأعضاء النشطين في هذه المجموعة 126 عضوًا. [ 42 ]
  • تتيح منصة Protocolpedia مشاركة وتخزين بروتوكولات المختبر.
  • يسمح برنامج Sci-Mate للمستخدمين بتحديد أذونات الوصول، ولكن يمكن استخدامه كأداة دفتر ملاحظات مفتوحة.
  • فينود سكاريا [ 43 ]
  • OpenWetWare (يستضيف العديد من المختبرات ويسمح بالمشاركة الانتقائية للمعلومات المتعلقة بكل مجموعة بحثية)
  • كالب مورس [ 44 ]
  • غوس روزانيا [ 45 ]
  • أنتوني غاريت ليسي [ 46 ]
  • روزي ريدفيلد، [ 47 ] عالمة الأحياء الدقيقة في جامعة كولومبيا البريطانية؛ تمت مناقشة جميع النتائج ولكن لم يتم الكشف عن دفتر الملاحظات التجريبي الخام.
  • مارتن جونسون، [ 48 ] كيميائي بحري في جامعة إيست أنجليا . [ 49 ]
  • غريغ لانغ، [ 50 ] باحث ما بعد الدكتوراه في مختبر ديفيد بوتستين بجامعة برينستون. [ 51 ] - تتم مشاركته أسبوعيًا تقريبًا

فوائد

يُسهّل دفتر المختبر العام الاستشهاد بالحالات الدقيقة للتجارب المستخدمة لدعم الحجج في المقالات. على سبيل المثال، في ورقة بحثية حول تحسين تفاعل أوجي ، [ 52 ] [ 53 ] استُخدمت ثلاث دفعات مختلفة من المنتج في عملية التوصيف، ويشير كل طيف إلى التجربة المحددة التي استُخدمت فيها كل دفعة: EXP099، [ 54 ] و EXP203، [ 55 ] وEXP206. [ 56 ] نُشر هذا العمل لاحقًا في مجلة التجارب المصورة ، [ 57 ] مما يُثبت إمكانية الحفاظ على سلامة مصدر البيانات من دفتر المختبر إلى النشر النهائي في مجلة مُحكّمة.

بدون مزيد من التوضيحات، يُشير مفهوم "العلوم المفتوحة" إلى أن البحث يُنشر بشكل مستمر دون تأخير أو حجب غير مبرر. وهذا يُتيح للآخرين فهم كيفية سير البحث بدقة ضمن مجال معين أو مجموعة بحثية محددة. قد تكون هذه المعلومات قيّمة للمتعاونين والطلاب المحتملين وأصحاب العمل المستقبليين. إن إتاحة الوصول إلى صفحات مُنتقاة من دفتر الملاحظات أو فرض فترة حظر نشر يتعارض مع معنى مصطلح "مفتوح" في هذا السياق. فما لم يتم الإبلاغ عن تصحيحات الأخطاء والتجارب الفاشلة والنتائج الغامضة، لن يكون بإمكان أي مراقب خارجي فهم كيفية إجراء البحث العلمي بدقة. وقد استُخدمت مصطلحات مثل "زائف" [ 58 ] أو "جزئي " [ 40 ] لوصف مشاركة معلومات دفتر المختبر بشكل انتقائي أو مع تأخير كبير.

العيوب

تنقسم الحجج المعارضة لتبني منهجية البحث العلمي المفتوح إلى ثلاث فئات رئيسية، تختلف أهميتها باختلاف المجالات العلمية. يتمثل الشاغل الرئيسي، الذي يُعرب عنه علماء الأحياء والطب على وجه الخصوص، في " سرقة البيانات " أو "السبق العلمي". وبينما لا يزال مدى لجوء فرق البحث إلى سرقة نتائج الآخرين أو تعديلها موضع نقاش، فمن المؤكد أن الخوف من عدم السبق في النشر يُحرك الكثير من السلوكيات، لا سيما في بعض المجالات. ويرتبط هذا بالتركيز في هذه المجالات على الورقة البحثية المنشورة والمُحكّمة باعتبارها المعيار الرئيسي للنجاح المهني.

الحجة الثانية المُقدمة ضد علم الدفاتر المفتوحة هي أنه يُعدّ نشرًا سابقًا، مما يجعل الحصول على براءة اختراع أمرًا مستحيلاً ، ويصعب معه نشر النتائج في المجلات العلمية التقليدية المُحكّمة . وبالنظر إلى براءات الاختراع، يُصنّف النشر على الإنترنت بوضوح على أنه إفصاح . لذا، ورغم وجود جدل حول قيمة براءات الاختراع، والأساليب المُتاحة لتجاوز هذه المشكلة، فمن الواضح أن علم الدفاتر المفتوحة غير مناسب للأبحاث التي يُتوقع الحصول على براءة اختراع لها. أما فيما يتعلق بالنشر في المجلات العلمية المُحكّمة، فالأمر أقل وضوحًا. فمعظم ناشري المجلات العلمية يقبلون المواد التي عُرضت سابقًا في مؤتمر أو في شكل نسخة أولية. وقد أشار هؤلاء الناشرون، بشكل غير رسمي، إلى أن نشر البيانات على الإنترنت، بما في ذلك علم الدفاتر المفتوحة، يندرج ضمن هذه الفئة. وقد نُشرت مشاريع الدفاتر المفتوحة بنجاح في مجلات علمية مُحكّمة ذات معامل تأثير عالٍ [ 59 ] [ 60 ولكن لم يتم اختبار ذلك مع نطاق واسع من الناشرين. من المتوقع أن الناشرين الذين يستبعدون صراحة هذه الأشكال من النشر المسبق لن يقبلوا المواد التي تم الكشف عنها مسبقًا في دفتر ملاحظات مفتوح.

ثمة حجة ثالثة تُطرح ضدّ علم الدفاتر المفتوحة، وهي أنه يُضعف استقلالية الأبحاث المتنافسة، وبالتالي قد يؤدي إلى غياب التحقق المستقل الضروري من النتائج. وهذا لا يُعدّ استيلاءً على البيانات، بل احتمالًا أكثر دقةً يتمثل في السماح للبيانات المتطورة بالتأثير على بعضها البعض. في العلوم التقليدية، غالبًا ما تضع فرق التجارب الكبيرة قواعد صارمة تمنع التواصل بين أعضاء الفرق المتنافسة، ليس فقط لمنع تسريب البيانات، بل أيضًا لمنع التأثير على منهجية تحليلها.

تتعلق الحجة الأخيرة بمشكلة "طوفان البيانات". إذا كان حجم الأدبيات المُحكّمة حاليًا يفوق قدرة أي شخص على إدارتها، فكيف يُمكن لأي شخص التعامل مع الكم الهائل من المواد غير المُحكّمة التي يُمكن أن تكون متاحة، خاصةً وأن بعضها، وربما معظمها، سيكون رديء الجودة؟ وهناك حجة أخرى ذات صلة مفادها أن "دفتر ملاحظاتي مُتخصص جدًا" لدرجة أنه لن يكون ذا فائدة لأي شخص آخر. وتُعد مسألة كيفية اكتشاف مواد عالية الجودة وذات صلة قضيةً مُرتبطة. إن مسألة تنظيم البيانات والتحقق من صحتها، بالإضافة إلى جودة المنهجية، تُعد قضيةً بالغة الأهمية، ولها أهمية تتجاوز نطاق علم دفاتر الملاحظات المفتوحة، ولكنها تُمثل تحديًا خاصًا هنا.

التمويل والرعاية

حظيت مسابقة "تحدي دفتر الملاحظات المفتوح للعلوم " [ 61 ] ، الموجهة الآن نحو الإبلاغ عن قياسات الذوبان في المذيبات غير المائية، برعاية من شركة "سابميتا" [ 62 ] ، ومجلة "نيتشر" [ 63 ] ، وشركة "سيجما-ألدريتش" [ 64 ] . وكانت جيني هيل أول الفائزين العشرة في مسابقة ديسمبر 2008 [ 65 ] .

الشعارات

يمكن استخدام الشعارات على دفاتر الملاحظات للإشارة إلى شروط المشاركة. تُصنّف دفاتر الملاحظات المفتوحة بالكامل على أنها "كاملة المحتوى" و"متاحة فورًا". أما دفاتر الملاحظات المفتوحة جزئيًا، فيمكن تصنيفها على أنها "محتوى مُختار" و/أو "مؤجلة". [ 66 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 تحرير البيانات المظلمة للتجارب العلمية الفاشلة ، غوتز، تي، مجلة وايرد، 25 سبتمبر 2007
  2. ساندرسون، ك؛ نيلون، س (سبتمبر 2008). "بيانات معروضة". نيتشر . 455 (7211): 273. doi : 10.1038/455273a . PMID 18800097 . 
  3. سينغ، س. (أبريل 2008). "البيانات المعروضة" . الخلية . 133 (2): 201-203 . doi : 10.1016/j.cell.2008.04.003 . PMID 18423188 . 
  4. ويليامز، أ. (2008). "أدوات الإنترنت للتواصل والتعاون في الكيمياء". اكتشاف الأدوية اليوم . 13 ( 11-12 ): 502-506 . doi : 10.1016/j.drudis.2008.03.015 . PMID 18549976 . 
  5. "أخبار الكيمياء والهندسة - تخدم عوالم الكيمياء وعلوم الحياة والمختبرات" .
  6. برادلي، جيه سي (2007). "علم الدفتر المفتوح باستخدام المدونات والويكي" . وقائع الطبيعة . doi : 10.1038/npre.2007.39.1 .
  7. برادلي، جان كلود (26 سبتمبر 2006). "علوم دفتر الملاحظات المفتوح" . التعلم الإلكتروني لكلية العلوم والآداب بجامعة دريكسل .
  8. "العلم المفتوح: باحثون من جامعة تورنتو ينشرون ملاحظات المختبر في الوقت الفعلي" . أخبار جامعة تورنتو . تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 يناير 2018 .
  9. "الباحث كتاب مفتوح: أول من يشارك ملاحظات المختبر في الوقت الفعلي" . 26 فبراير 2016. مؤرشف من الأصل في 6 مارس 2016. تم الاطلاع عليه في 6 مارس 2016 .
  10. ريسنيك، برايان (3 مارس 2016). "العلم سري وبطيء للغاية. لذا تقوم هذه الباحثة بتدوين عملها مباشرةً عبر مدونتها" . Vox.com . مؤرشف من الأصل في 4 مارس 2016. تم الاطلاع عليه في 6 مارس 2016 .
  11. "العلوم المفتوحة المتطرفة في مركز SGC - فريق من العلماء الرواد في مركز SGC يشاركون الآن دفاتر مختبراتهم عبر الإنترنت" . opennotebook.thesgc.org . تاريخ الوصول: 26 يناير 2018 .
  12. قناة SGC (24 يناير 2018)، بث مباشر: دفاتر المختبر المفتوحة: مبادرة علمية مفتوحة رائدة، 19 يناير 2018 ، تاريخ الاطلاع : 26 يناير 2018
  13. "نبذة عن – العلوم المفتوحة المتطرفة في مركز علوم الحوسبة المتقدمة" . opennotebook.thesgc.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 27 يناير 2018. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 يناير 2018 .
  14. "مفكرة نيكولاس ج. لاسورت للعلوم المفتوحة" . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 19 أغسطس 2014. تم الاطلاع عليها بتاريخ 15 أغسطس 2014 .
  15. "تامارا مايوري" . fhs.mcmaster.ca . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22-01-2018 .
  16. ContentMine (2015-11-03)، محاضرة 2014: علوم دفتر الملاحظات المفتوح لبيتر موراي-راست ، تم الاطلاع عليها بتاريخ 21-01-2018
  17. "أبحاث IheartAnthony" .
  18. "مشروع الملاريا مفتوح المصدر" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 13 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 مايو 2016 .
  19. "تجربتنا - برنامج مفتوح المصدر لمكافحة الملاريا" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 14 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 مايو 2016 .
  20. تود، ماثيو (7 مايو 2016). "المصدر المفتوح يزيل السرية في أبحاث الأدوية" . برنامج العلوم (مقابلة). أجرت المقابلة أليس ويليامسون. هيئة الإذاعة الأسترالية . مؤرشف من الأصل في 7 مايو 2016.
  21. ^ "ONSchallenge - قائمة التجارب" .
  22. "ملاحظات بحثية لتوبياس ج. أوزبورن" .
  23. ^ كارل بوتيجر. "مفكرة المختبر" .
  24. "مقدمة إلى دفتر الملاحظات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 11-11-2010 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 08-11-2010 .
  25. ^ "درور بار ناتان: الفكر الأكاديمي" .
  26. "محرك البحث - أندريس" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 21-10-2013 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 21-10-2013 .
  27. ^ هيملستين ، دانيال. ليزي، أنطوان؛ خانخانيان، بويا؛ بروجمان، ليو؛ تشين، صابرينا؛ هادلي، دكستر. هيسلر، كريسي. بارانزيني، سيرجيو؛ جرين ، آري (2015). "Rephetio: إعادة استخدام الأدوية على شبكة Hetnet [ مشروع ] " . ثينك لاب . دوى : 10.15363/ثينكلاب.4 .
  28. ^ "المستخدم: بريجيت د. بلاك/دفتر ملاحظات/مفكرة بريجيت" .
  29. "UsefulChem - جميع التفاعلات" .
  30. تمت أرشفة دفتر الملاحظات في 15 أبريل 2008
  31. ^ "المستخدم: ناديزدا فرنانديز أوروبيزا/مفكرة/مفكرة" .
  32. "المستخدم: Linh N Le/Notebook" .
  33. "آندي مالوني" .
  34. "المستخدم: آندي مالوني/دفتر الملاحظات/دفتر ملاحظات المختبر الخاص بآندي مالوني/جدول المحتويات/جدول المحتويات" .
  35. "المستخدم: آندي مالوني/مقدمة للأطروحة" .
  36. "دفتر ملاحظات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 18-10-2008 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 13-10-2008 .
  37. مختبر حاسوب الفاكهة، مؤرشف بتاريخ 20 مايو 2009 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine) ، دفتر ملاحظات ، مدونة
  38. "التطور الجزيئي، وعلم الوراثة العرقي، وعلم الأوبئة" .
  39. "فيزياء 307L" .
  40. 1 2 برادلي، جان كلود تعليق على علم دفتر الملاحظات المفتوح الزائف؟ من Quantum Pontiff 27 يونيو 2008
  41. "شبكة العلوم المفتوحة" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 19 يناير 2015. تم الاطلاع عليه بتاريخ 18 يناير 2015 .
  42. "الأعضاء" . شبكة Open Notebook Science . 18-07-2014. مؤرشف من الأصل في 12-07-2017 . تم الاطلاع عليه في 26-01-2018 .
  43. "دفتر ملاحظات، يتطلب تسجيل دخول" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 1 نوفمبر 2008. تم الاطلاع عليه بتاريخ 25 أبريل 2020 .
  44. "User:Cmorse/Notebook/MediaWiki for Open Science" .
  45. "دفتر ملاحظات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2008-10-03 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2008-10-08 .
  46. "الهندسة التفاضلية -" .
  47. "RRResearch" .
  48. دفتر ملاحظات)
  49. "محتوى انتقائي، مشاركة فورية" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28-05-2012 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26-02-2009 .
  50. "موقع مختبر اللغات" .
  51. "جميع المحتويات، مشاركة مؤجلة" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28-05-2012 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26-02-2009 .
  52. برادلي، جان كلود؛ ميرزا، خالد؛ أوينز، كيفن؛ أوزبورن، توم؛ ويليامز، أنتوني (أغسطس 2008). "تحسين تفاعل أوجي باستخدام التخليق المتوازي والمعالجة الآلية للسوائل" . Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2008.2237.1 . hdl : 10101/npre.2008.2237.1 .
  53. "UsefulChem - paper03" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 23-09-2008 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 08-10-2008 .
  54. "UsefulChem - EXP099" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2008-10-08 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2008-10-08 .
  55. "مادة كيميائية مفيدة - التجربة 203" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 7 أكتوبر 2008. تم الاطلاع عليه بتاريخ 8 أكتوبر 2008 .
  56. "UsefulChem - EXP206" .
  57. برادلي، جان كلود؛ ميرزا، خالد؛ أوينز، كيفن؛ أوزبورن، توم؛ ويليامز، أنتوني (نوفمبر 2008). " تحسين تفاعل أوجي باستخدام التخليق المتوازي والمعالجة الآلية للسوائل" . مجلة التجارب المصورة (21): 942. doi : 10.3791/942 . PMC 2762777. PMID 19066532 .  
  58. بيكون، ديفيد: هل هو علم دفتر الملاحظات المفتوح الزائف؟ من موقع Quantum Pontiff، 26 يونيو 2008
  59. ^ مايكل وولفلي. سيردين، جان بول؛ دي جويير، جيسي؛ باور، كيس. أوليارو، بييرو؛ تود ، ماثيو هـ. (19 سبتمبر 2011). جيري، تيموثي ج. (محرر). "قرار البرازيكوانتيل" . PLOS الأمراض الاستوائية المهملة . 5 (9) هـ1260. دوى : 10.1371/journal.pntd.0001260 . بمك 3176743 . بميد 21949890 .  
  60. وولفلي، مايكل؛ أوليارو، بييرو؛ تود، ماثيو هـ. (22 سبتمبر 2011). "العلم المفتوح مُسرِّعٌ للبحث" . مجلة نيتشر كيمستري . 3 (10): 745-748 . Bibcode : 2011NatCh...3..745W . doi : 10.1038/nchem.1149 . PMID 21941234 . 
  61. تحدي العلوم في دفتر الملاحظات المفتوح
  62. "الكيمياء المفيدة" .
  63. "الكيمياء المفيدة" .
  64. "الكيمياء المفيدة" .
  65. "الكيمياء المفيدة" .
  66. صفحة الادعاءات العلمية في دفتر الملاحظات المفتوح