Oscillospiraceae
تُعرف عائلة Oscillospiraceae ، والتي تُسمى أيضاً Ruminococcaceae ، بأنها عائلة من البكتيريا تنتمي إلى فئة Clostridia . جميع بكتيريا Oscillospiraceae لاهوائية إجبارية . ومع ذلك، فإن أفراد هذه العائلة لها أشكال متنوعة، فبعضها عصوي الشكل والبعض الآخر كروي . [ 2 ]
تُعدّ بكتيريا Faecalibacterium prausnitzii ، ضمن هذه العائلة، من البكتيريا المتعايشة الوفيرة في الميكروبيوم المعوي البشري . إضافةً إلى ذلك، توجد عدة أنواع من بكتيريا Ruminococcus في الأمعاء البشرية. [ 3 ] وقد أدى جنس Oscillospira وتأثيره على صحة الإنسان إلى ظهور العديد من النظريات حول تطوره ودوره في صحة الإنسان.
المعرفة الحالية
تم اكتشاف أول نوع من جنس Oscillospira ، وهي بكتيريا تُسمى O. guillermondii ، عام 1913 في محتويات الأعور لخنزير غينيا على يد تشاتون وبيرارد، وهي النوع الوحيد الموصوف رسميًا في هذا الجنس . [ 4 ] لا تزال معرفتنا ببكتيريا Oscillospira ووظائفها الحيوية وتفاعلاتها البيئية محدودة، مع نجاح محدود في زراعتها . ولا تزال المكونات الضرورية لنمو Oscillospira غير محددة أو غير معروفة. [ 5 ] من خصائص هذه البكتيريا قدرتها على تكوين الأبواغ واتخاذ أشكال فيزيائية مختلفة مثل العصيات والمكورات . يُفترض أن أنواع Oscillospira بطيئة النمو، إذ توجد بكثرة في البراز الصلب أو المتماسك ، مما يدل على قضائها وقتًا أطول في القولون قبل خروجها، وهو ما يُعرف بالإمساك . ويدعم هذه النظرية ارتباطها بأمراض حصى المرارة، حيث يُعد الإمساك عامل خطر. [ 4 ]
التأثير على صحة الأمعاء
لوحظ وجود أفراد هذه العائلة بكثرة في الميكروبات المعوية . وقد وُجد أن بكتيريا Oscillospira تحديدًا لها صلة محتملة بالنحافة من خلال جين 16S rRNA الخاص بها في دراسات حديثة للميكروبات المعوية، كما رُبطت بنقص هذه البكتيريا لدى الأشخاص المصابين بالتهاب الكبد الدهني ، وهو مرض كبدي، وأمراض الأمعاء الالتهابية مثل داء كرون والتهاب القولون التقرحي . [ 4 ] بالإضافة إلى ذلك، ثبت أن بكتيريا Oscillospira تخمر الكربوهيدرات النباتية المعقدة ، ويجري البحث في دورها المحتمل في إنتاج البروبيوتيك . [ 4 ] كما وُجدت بكتيريا Oscillospira في حيوانات مثل الأبقار والأغنام، ومثل البشر، يعتمد وفرة وشكل هذه البكتيريا بشكل كبير على النظام الغذائي. وقد وُجد أن وفرتها تكون أكبر مع تناولها بشكل أساسي للأعلاف الطازجة لدى هذه الحيوانات. [ 5 ]
نسالة
تتبع التسمية قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN)، [ 1 ] مع استخدام قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) كمرجع إضافي. [ 6 ]
تقارن الأشجار أدناه بين شجرة تطور جين 16S rRNA من LTP_10_2024 مع شجرة تطور قائمة على الجينوم من إصدار GTDB R11-RS232.
| LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] | 120 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB R11-RS232 [ 10 ] [ 11 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
تُظهر شجرة GTDB الأجناس المُسماة المُمثلة في R11-RS232؛ أما الأجناس المُحددة بناءً على رقم الوصول فقد تم حذفها. مجموعات الأنواع التي تنتهي بحروف تُمثل تجمعات GTDB مُميزة. الأجناس غير المُصنفة:
- أميغدالوباكتر سرينيفاسان وآخرون 2023
- بينجتسونيلا بارديسي وآخرون. 2024
- درانكورتيلا دوراند وآخرون. 2023
- " Ca. Faecousia " هيتش وآخرون 2024 غير جيلروي وآخرون 2021
- فلينتيباكتر كوريج. لاكوفردوس وآخرون. 2016
- " هومينيكولا " هيتش وآخرون 2024
- " المكورات المعوية " تشو وآخرون. 2023
- " جيلونيا " ليو وآخرون 2021ب
- " جيرينيا " هوانغ وآخرون 2024
- " ماراسميترونكوس " فام وآخرون. 2017
- " ماركوس " هوانغ وآخرون. 2024 غير فانتي وبانكوفسكي 2018
- " منجينجيا " هوانغ وآخرون. 2024
- Neglectibacter Zgheib et al. 2024
- " نيوبويروس " سلمى رويو وآخرون. 2023
- Oscillospira corrig. Chatton & Pérard 1913
- Owariibacterium Hamaguchi وآخرون. 2025
- Paludihabitans Deshmukh & Oren 2023 [ Paludicola Li et al. 2017 غير بلاسيوس 1857 غير هودجسون 1837 غير نيكشي وفيس 2020 غير واغلر 1830 ]
- " كينجيوزينجيلا " هوانغ وآخرون. 2024
- Ruminococcoides مولينيرو وآخرون. 2021
- " شوزينجيا " ليو وآخرون. 2021ب
- " Ca. Vesiculincola " تريتلي وآخرون. 2023
كانت سابقًا ضمن عائلة Oscillospiraceae
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 Oscillospiraceae في LPSN ؛ فريز، إتش إم؛ ماير-كولثوف، جيه بي؛ ساردا كارباس، جيه؛ أفولايان، إيه أو؛ جوكر، إم. (29 أكتوبر 2025). "TYGS وLPSN في عام 2025: مورد بيانات حيوية أساسي عالمي للتصنيف والتسمية الجينية للكائنات بدائية النواة ضمن التنوع الرقمي DSMZ". أبحاث الأحماض النووية . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
- ^ ريني FA (2015). "Ruminococcaceae fam.nov." في ويتمان WB (محرر). دليل بيرجي لمنهجيات العتائق والبكتيريا . ص 1 – 2. دوى : 10.1002/9781118960608.fbm00136 . رقم ISBN 9781118960608.
- ↑ راجيليتش-ستويانوفيتش م، دي فوس دبليو إم (سبتمبر 2014). " أول 1000 نوع مُستزرع من الميكروبات المعوية البشرية" . مجلة FEMS لاستعراضات علم الأحياء الدقيقة . 38 (5): 996-1047 . doi : 10.1111/1574-6976.12075 . PMC 4262072. PMID 24861948 .
- 1 2 3 4 غوفنا، أوري؛ كونيكوف، توم؛ نيلسن، هنريك بيورن (مارس 2017). " بكتيريا أوسيلوسبيرا والبكتيريا ذات الصلة - من الأنواع الميتاجينومية إلى السمات الأيضية" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 19 (3): 835-841 . doi : 10.1111/1462-2920.13658 . ISSN 1462-2912 .
- 1 2 ماكي، رودريك آي؛ أمينوف، رستم آي؛ هو، وينبينغ؛ كليف، أثول في؛ أويركيرك، ديان؛ سوندست، مونيكا أ؛ كاماغاتا، يويتشي (نوفمبر 2003). "بيئة أنواع Oscillospira غير المستزرعة في كرش الأبقار والأغنام والرنة كما تم تقييمها بواسطة المجهر والأساليب الجزيئية" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 69 (11): 6808-6815 . doi : 10.1128/AEM.69.11.6808-6815.2003 . ISSN 0099-2240 . PMC 262257. PMID 14602644 .
- ↑ شوخ سي إل وآخرون . "Oscillospiraceae" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية . تم الاسترجاع في 27 يوليو 2026 .
- ↑ "برنامج LTP وبرنامج LTPlus" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 يوليو 2026 .
- ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق Newick" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "إصدار GTDB R11-RS232" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 27 يوليو 2026 .
- ↑ "bac120_r232.sp_labels.tree" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 27 يوليو 2026 .
- ↑ تشين إس، دونغ إكس (2004). " Acetanaerobacterium elongatum gen. nov., sp. nov., from paper mill waste water" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 54 (6): 2257–2262 . doi : 10.1099/ijs.0.63212-0 . PMID 15545467 .
- ↑ باركر سي تي، غاريتي جي إم (1 يناير 2003). باركر سي تي، غاريتي جي إم (محرران). "ملخص تصنيفي للأجناس". ملخصات NamesforLife . doi : 10.1601/tx.29383 .
- ↑ لوسون، ب. أ.، سونغ، ي.، ليو، س.، موليتوريس، د. ر.، فايسانين، م. ل.، كولينز، م. د.، فاينغولد، س. م. (2004). " Anaerotruncus colihominis gen. nov., sp. nov., from human faeces" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 54 (2): 413-417 . doi : 10.1099/ijs.0.02653-0 . PMID 15023953 .
- ↑ دنكان، د.هـ.، هولد، ج.ل.، هارمسن، هـ.ج.، ستيوارت، س.س.، فلينت، هـ.ج. (2002). "متطلبات النمو ونواتج التخمر لبكتيريا Fusobacterium prausnitzii ، واقتراح لإعادة تصنيفها كجنس جديد Faecalibacterium prausnitzii ، تركيبة جديدة" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 52 (6): 2141-2146 . doi : 10.1099/00207713-52-6-2141 . PMID 12508881 .
- يوباكتيراليس
- عائلات البكتيريا