PDK4

إنزيم بيروفات ديهيدروجينيز ليبواميد كيناز إيزوزيم 4، الميتوكوندري (PDK4) هو إنزيم يتم ترميزه في البشر بواسطة جين PDK4 . [ 5 ] [ 6 ] وهو يرمز إلى إيزوزيم من بيروفات ديهيدروجينيز كيناز .

ينتمي هذا الجين إلى عائلة بروتينات كيناز PDK/BCKDK ، ويُشفّر بروتينًا ميتوكوندريًا يحتوي على نطاق كيناز الهيستيدين . يتواجد هذا البروتين في مصفوفة الميتوكوندريا ، ويُثبّط مُركّب نازعة هيدروجين البيروفات عن طريق فسفرة إحدى وحداته الفرعية، مما يُقلّل من تحويل البيروفات ، الناتج عن أكسدة الجلوكوز والأحماض الأمينية ، إلى أسيتيل-CoA، ويُساهم في تنظيم استقلاب الجلوكوز . يتم تنظيم التعبير عن هذا الجين بواسطة الجلوكوكورتيكويدات وحمض الريتينويك والأنسولين . [ 6 ] يزداد مستوى PDK4 أثناء السبات الشتوي، ويُساعد على خفض معدل الأيض والحفاظ على الجلوكوز عن طريق تقليل تحويله إلى أسيتيل-CoA، الذي يدخل دورة حمض الستريك ويتحوّل إلى ATP . [ 7 ]

بناء

يحتوي البروتين الناضج المشفر بواسطة جين PDK4 على 294 حمضًا أمينيًا في تسلسله. ولتكوين البروتين النشط، تتحد سلسلتان من عديد الببتيد لتشكيل بنية مفتوحة. [ 6 ] وعلى وجه التحديد، تتحد الوحدتان الفرعيتان لتشكيل جيب ارتباط النيوكليوتيدات؛ وهذا الجيب هو الأكثر استهدافًا بواسطة المثبطات. [ 8 ]

وظيفة

يجب تنظيم معقد نازعة هيدروجين البيروفات (PDH) بدقة نظرًا لدوره المحوري في عمليات الأيض العامة. يحتوي هذا المعقد على ثلاثة بقايا سيرين في المكون E1، وهي مواقع فسفرة تؤدي إلى تعطيل المعقد. في البشر، تم تحديد أربعة نظائر إنزيمية لكيناز نازعة هيدروجين البيروفات قادرة على فسفرة هذه المواقع الثلاثة: PDK1 و PDK2 و PDK3 وPDK4. لا يُدمج PDK4 أكبر عدد من مجموعات الفوسفات في كل تفاعل تحفيزي، لأنه لا يستطيع فسفرة سوى الموقعين 1 و2؛ ومعدل فسفرته أقل من PDK1، ومساوٍ لـ PDK3، وأكثر من PDK2. عند ارتباط مرافق الإنزيم ثيامين بيروفوسفات (TPP) ، تتأثر معدلات الفسفرة بشكل كبير بواسطة جميع النظائر الإنزيمية الأربعة. الموقع 1 هو الأكثر تأثرًا، حيث ينخفض ​​معدل الفسفرة فيه بشكل ملحوظ. ومع ذلك، فإن النشاط الإجمالي لـ PDK4 لا يتأثر. [ 9 ]

أنظمة

باعتبارها المنظمات الرئيسية لخطوة حاسمة في مسار الأيض المركزي، تخضع عائلة نازعة هيدروجين البيروفات لتنظيم دقيق بواسطة عدد كبير من العوامل، بما في ذلك عوامل النسخ Sp1 وعامل ربط صندوق CCAAT (CBF). يعزز حمض الريتينويك نسخ PDK4 من خلال تمكين أفراد عائلة مستقبلات حمض الريتينويك من استقطاب المنشطات المساعدة للنسخ إلى عناصر استجابة حمض الريتينويك (RAREs) في محفز PDK4 . كما يزداد النسخ أيضًا عن طريق تثبيط مثبطات نازعة أسيتيل الهيستون (HDACs) باستخدام تريشوستاتين أ (TSA). [ 10 ] يزيد روزيجليتازون ، وهو ثيازوليدينديون معروف بتنشيط مسار التخليق الحيوي للجلسرين ، من نسخ mRNA لـ PDK4 في الأنسجة الدهنية البيضاء ، ولكن ليس في الكبد أو الأنسجة العضلية. [ 11 ] يُثبّط مستقبل فارنيسويد إكس ، أو FXR، عملية تحلل الجلوكوز ويُعزز أكسدة الأحماض الدهنية عن طريق زيادة التعبير عن PDK4 وتعطيل مُركب PDH. [ 12 ] تعمل عوامل أخرى، مثل الأنسولين ، على خفض نسخ mRNA لكل من PDK2 و PDK4 بشكل مباشر . ويتم ذلك من خلال مسار مُقترح يعتمد على فوسفاتيديل إينوزيتول 3-كيناز (PI3K). في الواقع، حتى عند تعريض الخلايا للديكساميثازون لزيادة التعبير عن mRNA، فإن الأنسولين يمنع هذا التأثير. [ 13 ] تُنظم مُستقبلات مُنشطات مُكاثرات البيروكسيسوم أيضًا التعبير؛ فقد وُجد أن PPAR ألفا ودلتا يزيدان من التعبير عن mRNA لـ PDK4 ، بينما يُؤدي تنشيط PPAR غاما إلى خفض التعبير. [ 14 ]

الأهمية السريرية

يُعدّ PDK4 ذا أهمية في العديد من الحالات السريرية. يُحفّز الصيام قصير الأمد زيادة في نسخ PDK4 بمقدار عشرة أضعاف تقريبًا. [ 15 ] وعند إعادة التغذية، ازداد نسخ PDK4 بشكلٍ ملحوظ، ليصل إلى خمسين ضعفًا تقريبًا مقارنةً بمستوياته قبل بدء الصيام. [ 16 ] ويمكن ملاحظة هذا التأثير على المدى الطويل أيضًا. يُفرط في التعبير عن PDK4 في العضلات الهيكلية لدى مرضى السكري من النوع الثاني ، مما يؤدي إلى ضعف استخدام الجلوكوز. [ 17 ] لدى المرضى الذين عانوا من السمنة، يُلاحظ انخفاضٌ كبير في التعبير عن mRNA الخاص بـ PDK4 ، بالتزامن مع زيادة امتصاص الجلوكوز؛ ويُعزى ذلك على الأرجح إلى تثبيط PDK4 بواسطة الأنسولين. وهذا يُؤكد فكرة أن انخفاض توافر الأحماض الدهنية الحرة يُؤثر على استقلاب الجلوكوز من خلال تنظيم مُركّب PDH. [ 18 ] في الواقع، لقد ثبت أن عدم كفاية تثبيط mRNA الخاص بـ PDK لدى الأفراد المقاومين للأنسولين قد يكون سببًا لزيادة التعبير عن PDK مما يؤدي إلى ضعف أكسدة الجلوكوز متبوعًا بزيادة أكسدة الأحماض الدهنية. [ 19 ]

ثبت أن التمارين الرياضية تُحدث تغييرات في هذا الجين أيضًا، وأن التغييرات المؤقتة قد يكون لها تأثير تراكمي عبر جلسات التمرين المتعددة. يزداد مستوى الحمض النووي الريبوزي المرسال (mRNA) لجين PDK4 ، إلى جانب جين PPARGC1A ، في كلا نوعي الأنسجة العضلية بعد التمرين. [ 20 ] [ 21 ]

يمكن ملاحظة هذه التأثيرات الأيضية في حالات أخرى. فقد ثبت أن نقص الأكسجين يحفز التعبير الجيني لـ PDK4 عبر آلية ERR gamma . [ 22 ] في المقابل، ينخفض ​​مستوى PDK4 في أنسجة عضلة القلب أثناء قصور القلب. [ 23 ]

سرطان

يُعزى الدور المحوري لهذا الجين إلى تورطه في العديد من الأمراض، بما في ذلك السرطان. يُحفز أحد نواتج أيضه، وهو البيوتيرات ، فرط أستلة الهستونات المحيطة بجين PDK4 . ويرتبط ذلك بزيادة مستوى نسخ mRNA الخاص بـ PDK4 ، مما يُعكس انخفاض مستوى PDK4 في خلايا سرطان القولون. في خلايا سرطان القولون البشري، يُحد استهداف مُركب PDH وتعطيله من معدل الأيض وينظم استقلاب الجلوتامين ، مما يُثبط نمو الخلايا جزئيًا. [ 24 ] مع ذلك، فقد ثبت أيضًا أن PDK4 يُعزز تكوّن الأورام وانتشارها عبر مسار مختلف، وهو سلسلة إشارات CREB - RHEB - mTORC1 . [ 25 ]

خريطة المسارات التفاعلية

انقر على الجينات والبروتينات والمستقلبات أدناه للانتقال إلى المقالات ذات الصلة. [ § 1 ]

[[ملف:
TCACycle_WP78Go to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to WikiPathwaysGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to article
TCACycle_WP78Go to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to WikiPathwaysGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to article
]]
TCACycle_WP78 تعديل
  1. يمكن تعديل خريطة المسار التفاعلية على موقع WikiPathways: "TCACycle_WP78" .

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000004799 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000019577 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. غودي ر، بوكر-كينلي م م، كيديشفيلي ن ي، تشاو ي، بوبوف ك م (ديسمبر 1995). "تنوع عائلة جينات كيناز نازعة هيدروجين البيروفات في البشر" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 270 (48): 28989-94 . doi : 10.1074/jbc.270.48.28989 . PMID 7499431 . 
  6. 1 2 3 "Entrez Gene: PDK4 pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4" .
  7. أندروز إم تي، سكواير تي إل، بوين سي إم، رولينز إم بي (يوليو 1998). "يتم تنظيم استخدام الكربون في درجات الحرارة المنخفضة بواسطة نشاط جيني جديد في قلب حيوان ثديي في حالة سبات شتوي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (14): 8392-7 . Bibcode : 1998PNAS...95.8392A . doi : 10.1073 / pnas.95.14.8392 . PMC 20986. PMID 9653197 .  
  8. كوكيموتو-نينو م، توكماكوف أ، تيرادا ت، أوباياشي ن، فوجيموتو ت، غومي س، شيروميزو إ، كاواموتو م، ماتسوسو ت، شيروزو م، يوكوياما س (سبتمبر 2011). "بنية كيناز نازعة هيدروجين البيروفات البشري 4 المرتبط بالمثبط". مجلة أكتا كريستالوغرافيكا، القسم د . 67 (الجزء 9): 763-773 . doi : 10.1107/S090744491102405X . PMID 21904029 . 
  9. كولوبوفا إي، توغانوفا أ، بولاتنيكوف إي، بوبوف ك م (أغسطس 2001). "تنظيم نشاط نازعة هيدروجين البيروفات من خلال الفسفرة في مواقع متعددة" . المجلة البيوكيميائية . 358 (الجزء 1): 69-77 . doi : 10.1042/0264-6021:3580069 . PMC 1222033. PMID 11485553 .  
  10. كوون إتش إس، هوانغ بي، هو جيونغ إن، وو بي، ستوسي سي إن، هاريس آر إيه (2006). "تحفز أحماض الريتينويك والتريكوستاتين أ (TSA)، وهو مثبط لهيستون دي أسيتيلاز، التعبير الجيني لكيناز نازعة هيدروجين البيروفات 4 (PDK4) البشري". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - بنية الجينات والتعبير الجيني . 1759 ( 3-4 ): 141-151 . doi : 10.1016/j.bbaexp.2006.04.005 . PMID 16757381 . 
  11. كادودال تي، ديستيل إي، دورانت إس، فوك إف، بلوان جي إم، كولينيه إم، بورتولي إس، فورست سي، بينيللي سي (سبتمبر 2008). "كيناز نازعة هيدروجين البيروفات 4: تنظيمه بواسطة الثيازوليدينديونات ودوره في تكوين الجلسرين في الأنسجة الدهنية" . داء السكري . 57 (9): 2272-2279 . doi : 10.2337/db08-0477 . PMC 2518477. PMID 18519799 .  
  12. سافكور آر إس، برامليت كيه إس، مايكل إل إف، بوريس تي بي (أبريل 2005). "تنظيم التعبير عن كيناز نازعة هيدروجين البيروفات بواسطة مستقبل فارنيسويد إكس". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 329 (1): 391-396 . doi : 10.1016/j.bbrc.2005.01.141 . PMID 15721319 . 
  13. كوون إتش إس، هوانغ بي، أنترمان تي جي، هاريس آر إيه (أبريل 2004). "بروتين كيناز بي-ألفا يثبط تحفيز جين كيناز نازعة هيدروجين البيروفات-4 البشري بواسطة ديكساميثازون من خلال تعطيل عوامل النسخ FOXO" . داء السكري . 53 (4): 899-910 . doi : 10.2337/diabetes.53.4.899 . PMID 15047604 . 
  14. أبوت إي إل، ماكورماك جي جي، رينيه سي، هاسال دي جي، بوكان كيه دبليو، ييمان إس جيه (يونيو 2005). " التنظيم المتباين لتعبير جين نظائر كيناز نازعة هيدروجين البيروفات في خلايا العضلات البشرية المستزرعة" . مجلة FEBS . 272 ​​(12): 3004-14 . doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04713.x . PMID 15955060. S2CID 21366281 .  
  15. سبريت إل إل، تونستال آر جيه، وات إم جيه، ميهان كيه إيه، هارجريفز إم، كاميرون-سميث دي (يونيو 2004). "تنشيط نازعة هيدروجين البيروفات وتعبير الكيناز في العضلات الهيكلية البشرية أثناء الصيام". مجلة علم وظائف الأعضاء التطبيقي . 96 (6): 2082-2087 . doi : 10.1152 / japplphysiol.01318.2003 . PMID 14966024. S2CID 13601849 .  
  16. بايلغارد هـ، سالتين ب، نيفر ب د (مارس 2003). "تأثير الصيام قصير الأمد وإعادة التغذية على تنظيم النسخ الجيني للجينات الأيضية في العضلات الهيكلية البشرية" . داء السكري . 52 (3): 657-662 . doi : 10.2337/diabetes.52.3.657 . PMID 12606505 . 
  17. وين آر إم، كاتو إم، تشوانغ جيه إل، تسو إس سي، لي جيه، تشوانغ دي تي (سبتمبر 2008). " تكشف بنى كيناز نازعة هيدروجين البيروفات-4 عن بنية مفتوحة شبه مستقرة تعزز نشاطًا قاعديًا قويًا خاليًا من النواة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (37): 25305-15 . doi : 10.1074/jbc.M802249200 . PMC 2533096. PMID 18658136 .  
  18. روزا جي، دي روكو بي، مانكو إم، جريكو إيه في، كاستانيتو إم، فيدال إتش، مينغرون جي (فبراير 2003). "انخفاض التعبير عن PDK4 يرتبط بزيادة حساسية الأنسولين لدى مرضى ما بعد السمنة" . أبحاث السمنة . 11 (2): 176-182 . doi : 10.1038/oby.2003.28 . PMID 12582211 . 
  19. ماجر م، بوبوف ك م، هاريس ر أ، بوغاردوس س، بروشازكا م (أكتوبر 1998). "يُثبِّط الأنسولين التعبير عن الحمض النووي الريبوزي المرسال لكيناز نازعة هيدروجين البيروفات (PDK): آلية محتملة تُسهم في زيادة أكسدة الدهون لدى الأفراد المقاومين للأنسولين" . علم الوراثة الجزيئية والأيض . 65 (2): 181-186 . doi : 10.1006/mgme.1998.2748 . PMID 9787110 . 
  20. بايلغارد إتش، أوردواي جي إيه، سالتين بي، نيوفر بي دي (أكتوبر 2000). "التنظيم النسخي للتعبير الجيني في العضلات الهيكلية البشرية أثناء التعافي من التمرين". المجلة الأمريكية لعلم وظائف الأعضاء والغدد الصماء والتمثيل الغذائي. 279 ( 4): E806-14. doi : 10.1152/ajpendo.2000.279.4.e806 . PMID 11001762. S2CID 1008940 .  
  21. وانغ ل، ساهلين ك (أبريل 2012). "تأثير التمارين المستمرة والمتقطعة على الحمض النووي الريبوزي المرسال لـ PGC-1α وPDK4 في ألياف العضلات الهيكلية من النوع الأول والثاني لدى الإنسان". مجلة Acta Physiologica . 204 (4): 525-532 . doi : 10.1111/j.1748-1716.2011.02354.x . PMID 21883960. S2CID 13208033 .  
  22. لي جيه إتش، كيم إي جيه، كيم دي كيه، لي جيه إم، بارك إس بي، لي آي كيه، هاريس آر إيه، لي إم أو، تشوي إتش إس (2012). "يحفز نقص الأكسجين التعبير الجيني لـ PDK4 من خلال تحفيز مستقبل ERRγ النووي اليتيم" . PLOS ONE . 7 (9) e46324. Bibcode : 2012PLoSO...746324L . doi : 10.1371/journal.pone.0046324 . PMC 3457976. PMID 23050013 .  
  23. رازغي ب، يونغ م.إ، يينغ ج، ديبري س، أوراي إ.ب، كوليسار ج، شيبلي ج.ل، مورافيك س.س، ديفيز ب.ج، فريزر أ.ه، تاغتماير هـ (2002). "انخفاض تنظيم التعبير الجيني الأيضي في قلب الإنسان المصاب بالفشل قبل وبعد إزالة الحمل الميكانيكي". طب القلب . 97 (4): 203-209 . doi : 10.1159/000063122 . PMID 12145475. S2CID 46861699 .  
  24. بلوان جي إم، بينو جي، كولينيه إم، ناكفر إم، فوريست سي، لوران-بويغ بي، كومول إكس، باروكي آر، بينيللي سي، بورتولي إس (يونيو 2011). "يحفز البيوتيرات تحولًا أيضيًا في خلايا سرطان القولون البشري عن طريق استهداف مركب نازعة هيدروجين البيروفات" . المجلة الدولية للسرطان . 128 (11): 2591-2601 . doi : 10.1002/ijc.25599 . PMID 20715114. S2CID 27407499 .  
  25. ليو ز، تشين إكس، وانغ واي، بينغ إتش، وانغ واي، جينغ واي، تشانغ إتش (أكتوبر 2014). "بروتين PDK4 يعزز تكوين الأورام من خلال تنشيط مسار إشارات بروتين ربط عنصر استجابة cAMP (CREB)-RHEB-mTORC1" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 289 (43): 29739-49 . doi : 10.1074/jbc.M114.584821 . PMC 4207987. PMID 25164809 .  

للمزيد من القراءة