التشابه المستمر
- انظر علم التشابه للحصول على مقدمة حول التدوين.
التماثل المستمر هو طريقة لحساب السمات الطوبولوجية لمساحة ما بدقة مكانية مختلفة. يتم اكتشاف السمات الأكثر ثباتًا على نطاق واسع من المقاييس المكانية ويُعتقد أنها أكثر احتمالية لتمثيل السمات الحقيقية للمساحة الأساسية بدلاً من التحف الناتجة عن أخذ العينات أو الضوضاء أو الاختيار المحدد للمعلمات. [1]
لإيجاد التماثل المستمر لمساحة ما، يجب أولاً تمثيل المساحة كمركب تبسيطي . تتوافق دالة المسافة على المساحة الأساسية مع ترشيح المركب التبسيطي، أي تسلسل متداخل من المجموعات الفرعية المتزايدة. إحدى الطرق الشائعة للقيام بذلك هي عن طريق أخذ الترشيح الفرعي للمسافة إلى سحابة نقاط ، أو على نحو مكافئ، الترشيح الإزاحي على سحابة النقاط وأخذ عصبها من أجل الحصول على الترشيح التبسيطي المعروف باسم ترشيح Čech . [2] يستخدم بناء مماثل تسلسلًا متداخلًا من مجمعات فيتوريس-ريبس المعروفة باسم ترشيح فيتوريس-ريبس . [3]
تعريف
رسميًا، ضع في اعتبارك دالة ذات قيمة حقيقية على مركب تبسيطي غير متناقص على تسلسلات متزايدة من الوجوه، لذا كلما كان وجهًا في . إذن لكل مجموعة فرعية هي مركب فرعي لـ K ، وترتيب قيم على المبسطات في (وهو في الممارسة العملية دائمًا محدود) يحث على ترتيب على المركبات الفرعية التي تحدد الترشيح
عندما ، يحفز التضمين تماثلًا في مجموعات التماثل البسيطة لكل بُعد . مجموعات التماثل المستمرة هي صور هذه التماثلات، وأرقام بيتي المستمرة هي رتب تلك المجموعات. [4] تتطابق أرقام بيتي المستمرة لـ مع دالة الحجم ، وهي سلف التماثل المستمر. [5]
يمكن تحويل أي مركب مفلتر على حقل عن طريق تحويل خطي يحافظ على الترشيح إلى ما يسمى بالشكل القياسي ، وهو مجموع مباشر محدد بشكل قياسي للمركب المفلتر من نوعين: مركب أحادي البعد مع تفاضل تافه ومركب ثنائي الأبعاد مع تشابه تافه . [6]
وحدة الثبات على مجموعة مرتبة جزئيًا هي مجموعة من مساحات المتجهات المفهرسة بواسطة ، مع خريطة خطية كلما ، مع تساوي الهوية و لـ . على نحو مكافئ، يمكننا اعتبارها مُستدِل من يعتبر كفئة إلى فئة مساحات المتجهات (أو - وحدات ). يوجد تصنيف لوحدات الثبات على حقل مفهرس بواسطة : الضرب ب يتوافق مع التحرك للأمام خطوة واحدة في وحدة الثبات. بديهيًا، تتوافق الأجزاء الحرة على الجانب الأيمن مع مولدات التماثل التي تظهر عند مستوى الترشيح ولا تختفي أبدًا، بينما تتوافق أجزاء الالتواء مع تلك التي تظهر عند مستوى الترشيح وتستمر لخطوات الترشيح (أو على نحو مكافئ، تختفي عند مستوى الترشيح ). [7] [6]
كل من هاتين النظريتين تسمح لنا بتمثيل التماثل المستمر لمركب بسيط مفلتر بشكل فريد باستخدام رمز شريطي للاستمرارية أو رسم بياني للاستمرارية . يمثل الرمز الشريطي كل مولد مستمر بخط أفقي يبدأ عند مستوى الترشيح الأول حيث يظهر وينتهي عند مستوى الترشيح حيث يختفي، بينما يرسم رسم بياني للاستمرارية نقطة لكل مولد مع إحداثيات x الخاصة به لوقت الميلاد وإحداثيات y الخاصة به لوقت الوفاة. على نحو مكافئ، يتم تمثيل نفس البيانات بواسطة الشكل التقليدي لبارانيكوف ، [6] حيث يتم تمثيل كل مولد بقطعة تربط قيم الميلاد والوفاة المرسومة على خطوط منفصلة لكل منها .
استقرار
التماثل المستمر مستقر بمعنى دقيق، مما يوفر قوة ضد الضوضاء. مسافة عنق الزجاجة هي مقياس طبيعي على مساحة مخططات الثبات التي تعطى بواسطة حيث تتراوح على التطابقات. يؤدي الاضطراب الصغير في الترشيح المدخل إلى اضطراب صغير في مخطط الثبات الخاص به في مسافة عنق الزجاجة. من أجل الوضوح، ضع في اعتبارك الترشيح على مساحة متماثلة الشكل لمركب تبسيطي تحدده مجموعات المستويات الفرعية لدالة ترويض مستمرة . الخريطة التي تأخذ مخطط الثبات لتماثلها هي 1-Lipschitz فيما يتعلق بالمقياس - على الدوال ومسافة عنق الزجاجة على مخططات الثبات. أي، . [8]
حساب
توجد حزم برامج مختلفة لحساب فترات الثبات للترشيح المحدود. [9] تعتمد الخوارزمية الأساسية على جلب المركب المرشح إلى شكله التقليدي من خلال مصفوفات مثلثية علوية. [6]
| حزمة البرامج | الخالق | أحدث إصدار | تاريخ الافراج عنه | رخصة البرمجيات [10] | المصدر المفتوح | لغة البرمجة | سمات |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| برنامج OpenPH | رودريجو ميندوزا سميث، جاريد تانر | 0.0.1 | 25 أبريل 2019 | أباتشي 2.0 | نعم | ماتلاب ، كودا | تسريع وحدة معالجة الرسوميات |
| جافا بليكس | أندرو تاوز، ميكائيل فيجديمو جوهانسون، هنري آدامز | 4.2.5 | 14 مارس 2016 | مخصص | نعم | جافا ، ماتلاب | |
| ديونيسوس | ديمتري موروزوف | 2.0.8 | 24 نوفمبر 2020 | BSD المعدل | نعم | ارتباطات C++ و Python | |
| برسيوس | فيديت ناندا | 4.0 بيتا | رخصة جنو العمومية | نعم | سي++ | ||
| فات [11] | أولريش باور، مايكل كيربر، يان رينينجهاوس | 1.4.1 | نعم | سي++ | |||
| ديفا | يان راينينجهاوس | نعم | سي++ | ||||
| جودي [12] | إينريا | 3.4.0 | 15 ديسمبر 2020 | معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا / GPLv3 | نعم | ارتباطات C++ و Python | |
| سي تي إل | ريان لويس | 0.2 | بي إس دي | نعم | سي++ | ||
| فوم | أندرو تاوسز | نعم | ر | ||||
| تي دي ايه | بريتاني تي فاسي، جيسو كيم، فابريزيو ليتشي، كليمنت ماريا، فينسنت روفريو | 1.5 | 16 يونيو 2016 | نعم | ر | يوفر واجهة R لـ GUDHI وDionysus وPHAT | |
| ايرين | جريجوري هينسلمان | 1.0.1 | 9 مارس 2019 | رخصة جنو العمومية الإصدار 3 | نعم | جوليا | |
| الممزق | أولريش باور | 1.0.1 | 15 سبتمبر 2016 | معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا | نعم | سي++ | |
| حجرة صغيرة | هوبرت فاغنر | الإصدار التجريبي v0.8 | مايو 2018 | رخصة جنو العمومية | نعم | سي++ | يتعامل مع صور كبيرة ثلاثية الأبعاد وثنائية الأبعاد بدرجات الرمادي (بيانات فوكسل قياسية) |
| مجموعة أدوات الطوبولوجيا | جوليان تيرني، غيوم فافيلير، جوشوا ليفين، تشارلز جوينت، مايكل ميشو | 0.9.8 | 29 يوليو 2019 | بي إس دي | نعم | روابط C++ و VTK و Python | |
| ليبستيك | ستيفان هوبر | 0.2 | 27 نوفمبر 2014 | معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا | نعم | سي++ | |
| ريبس++ | سيمون تشانغ، ومينجباي شياو، وهاو وانغ | 1.0 | مارس 2020 | معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا | نعم | روابط CUDA و C++ و Python | تسريع وحدة معالجة الرسوميات |
انظر أيضا
مراجع
- ^ كارلسون، جونار (2009). "الطوبولوجيا والبيانات". نشرة الجمعية الأمريكية للطب 46(2) ، 255-308.
- ^ Kerber, Michael; Sharathkumar, R. (2013). "Approximate Čech Complex in Low and High Dimensions". في Cai, Leizhen; Cheng, Siu-Wing; Lam, Tak-Wah (eds.). Algorithms and Computation . Lecture Notes in Computer Science. المجلد 8283. برلين، هايدلبرغ: سبرينغر. ص 666-676. doi :10.1007/978-3-642-45030-3_62. ISBN 978-3-642-45030-3. S2CID 5770506.
- ^ دي، تامال ك.؛ شي، دايو؛ وانج، يوسو (2019-01-30). "سيمبا: أداة فعّالة لتقريب استمرارية الترشيح بالتمزق عبر انهيار الدفعة البسيط". مجلة الخوارزميات التجريبية التابعة لـ ACM . 24 : 1.5:1–1.5:16. doi : 10.1145/3284360 . ISSN 1084-6654. S2CID 216028146.
- ^ Edelsbrunner, H و Harer, J (2010). Computational Topology: An Introduction . الجمعية الرياضية الأمريكية.
- ^ Verri, A.; Uras, C.; Frosini, P.; Ferri, M. (1993). "حول استخدام دوال الحجم لتحليل الشكل". علم التحكم الآلي البيولوجي . 70 (2): 99–107. doi :10.1007/BF00200823. S2CID 39065932.
- ^ أ ب ج د بارانيكوف، سيرجي (1994). "مجمع مورس المؤطر وثوابته". التقدم في الرياضيات السوفييتية . 21 : 93–115.
- ^ زوموروديان، أفرا؛ كارلسون، جونار (19 نوفمبر 2004). "حساب التماثل المستمر". الهندسة المنفصلة والحسابية . 33 (2): 249-274. doi : 10.1007/s00454-004-1146-y . ISSN 0179-5376.
- ^ كوهين-ستاينر، ديفيد؛ إيدلسبرونر، هربرت؛ هارر، جون (2006-12-12). "استقرار مخططات الثبات". الهندسة المنفصلة والحسابية . 37 (1): 103-120. doi : 10.1007/s00454-006-1276-5 . ISSN 0179-5376.
- ^ Otter, Nina; Porter, Mason A; Tillmann, Ulrike; et al. (2017-08-09). "A roadmap for the computation of persistent homology". EPJ Data Science . 6 (1). Springer: 17. doi : 10.1140/epjds/s13688-017-0109-5 . ISSN 2193-1127. PMC 6979512. PMID 32025466 .
- ^ التراخيص هنا عبارة عن ملخص، ولا تعتبر بيانات كاملة للتراخيص. قد تستخدم بعض الحزم مكتبات بموجب تراخيص مختلفة.
- ^ باور، أولريش؛ كيربر، مايكل؛ رينينجهاوس، جان؛ فاغنر، هوبرت (2014). "PHAT – Persistent Homology Algorithms Toolbox". Mathematical Software – ICMS 2014. Springer Berlin Heidelberg. ص. 137–143. doi :10.1007/978-3-662-44199-2_24. ISBN 978-3-662-44198-5.ISSN 0302-9743 .
- ^ ماريا، كليمنت؛ بواسونات، جان دانييل؛ جليس، مارك؛ وآخرون (2014). "مكتبة جودي: المجمعات التبسيطية والتماثل المستمر". البرمجيات الرياضية – ICMS 2014 (PDF) . برلين، هايدلبرغ: سبرينغر. ص 167-174. doi :10.1007/978-3-662-44199-2_28. ISBN 978-3-662-44198-5. ISSN 0302-9743. S2CID 17810678.
