شارع واي

نطاقات معدلات STR اعتبارًا من عام 2008 لـ 16 Y-STRs
موقع STRمعدل الطفرة (× 10 −3 )
LB-96%CI'معدل'UB-96%CIملحوظات
DYS191.52.43.523 من 9658
DYS3851.42.13.031 من 14896
DYS389I0.951.83.014 من 7862
DYS389II1.82.84.222 من 7849
DYS3901.42.33.521 من 9140
DYS3912.03.04.528 من 9089
DYS3920.180.551.35 من 9053
DYS3930.360.891.87 من 7842
DYS4370.601.53.17 من 4672
DYS4380.0510.431.52 من 4709
DYS4393.85.78.427 من أصل 4686
DYS4480.191.65.72 من 1258
DYS4561.84.8106 من 1258
DYS4582.86.4128 من 1258
DYS6351.63.87.48 من 2131
GATA H4.10.712.25.15 من 2294
من الجدول 1. سانشيز-ديز وآخرون، 2008. لاحظ أن بعض قيم N في 17 STR منخفضة التردد نسبيًا.

يُعدّ Y-STR تكرارًا ترادفيًا قصيرًا ( STR) على الكروموسوم Y. ويُستخدم Y-STR بشكل شائع في الطب الشرعي ، وإثبات النسب، واختبارات الحمض النووي للأنساب . تُؤخذ عينات Y-STR تحديدًا من الكروموسوم Y الذكري. توفر هذه العينات تحليلًا أضعف من تحليل STR الجسدي ، لأن الكروموسوم Y موجود فقط لدى الذكور، وينتقل إليهم من الأب فقط، مما يجعل الكروموسوم Y في أي سلالة أبوية متطابقًا عمليًا. وهذا يُقلل بشكل كبير من التباين بين عينات Y-STR. بينما توفر تحليلات STR الجسدية قوة تحليلية أكبر بكثير نظرًا للتطابق العشوائي الذي يحدث بين أزواج الكروموسومات أثناء عملية تكوين الزيجوت . [ 1 ]

التسمية

يتم تعيين أسماء لعلامات Y-STR بواسطة لجنة تسمية الجينات HUGO (HGNC).

تختلف بعض شركات الاختبار في طريقة كتابة علامات STR. على سبيل المثال، قد تُكتب العلامة DYS455 على النحو التالي: DYS455، أو DYS 455، أو DYS#455، أو DYS# 455. أما المعيار العلمي المعتمد من قبل HUGO و NIST فهو DYS455. [ 2 ]

عسر الهضم

DYS هو شكل مختلف من المصطلحات المستخدمة في اختبار STR للكروموسومات الجسدية البشرية حيث يتم عادةً حجز الحرف الثاني لرقم الكروموسوم (على سبيل المثال D8S1179).

D = الحمض النووي Y = الكروموسوم Y S = قطعة (فريدة)

تحليل Y-STR

توجد مناطق في الحمض النووي تتكون من نسخ متعددة من تسلسلات قصيرة متكررة من القواعد (مثل TATT)، وتتكرر هذه التسلسلات عددًا متغيرًا من المرات يختلف باختلاف الأفراد. تُعرف هذه المناطق باسم "التكرارات الترادفية القصيرة ذات العدد المتغير"، وهي ما يُركز عليه عند إجراء تحليل STR. احتمال وجود نفس عدد التسلسلات المتكررة لدى شخصين ضئيل للغاية، ويقلّ هذا الاحتمال كلما زاد عدد المناطق التي يتم تحليلها. هذا هو أساس تحليل التكرارات الترادفية القصيرة. [ 1 ] مع ذلك، فإن حجر الزاوية في هذه العملية هو تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR). يسمح هذا التفاعل لعلماء الطب الشرعي بإنتاج ملايين النسخ من مناطق STR. ثم يُحدد الفصل الكهربائي الهلامي عدد مرات ظهور كل وحدة تكرار في القطعة. وهذا يُسهّل مقارنة الحمض النووي. [ 3 ]

لا يُعد تحليل Y-STR طريقةً موثوقةً لتحديد الهوية نظرًا لاحتمالية تقارب النمط الفرداني، حيث يكتسب رجلان أو أكثر نفس عدد تكرارات Y-STR بمحض الصدفة وليس عن طريق النسب المشترك. وتُعد بعض السلالات في المجموعة الفردانية R1b Y (الأكثر شيوعًا في أوروبا) مثالًا بارزًا على ذلك. [ 4 ]

التحليلات الجنائية والتحليلات الجنائية

في الولايات المتحدة، تُستخدم 13 موقعًا مختلفًا من مواقع STR الصبغية الجسدية كأساس للتحليل لأغراض الطب الشرعي. إذا كان الحمض النووي في مسرح الجريمة وفيرًا، وكانت جميع المواقع الصبغية الجسدية الـ 13 متاحة، فإن احتمال تطابق عينة الحمض النووي لشخصين غير مرتبطين ببعضهما البعض يبلغ واحدًا من كل مليار تقريبًا. [ 1 ]

تعتمد طريقة العد على أساس تقدير احتمالية النمط الجيني في تحليل Y-STR. [ 5 ] ويُراعي تطبيق فاصل الثقة حجم قاعدة البيانات وتفاوت العينات. يُحسب تردد النمط الفرداني Y ( p ) باستخدام الصيغة p = x / N ، حيث x يساوي عدد مرات ظهور النمط الفرداني في قاعدة بيانات تحتوي على N من الأنماط الفردانية. على سبيل المثال، إذا ظهر نمط فرداني مرتين في قاعدة بيانات N = 2000، فسيكون تردد هذا النمط الفرداني: 2/2000 = 0.001. يُعدّ الإبلاغ عن تردد النمط الفرداني Y دون فاصل ثقة مقبولاً، ولكنه يُقدّم بيانًا واقعيًا حول مشاهدات نمط فرداني Y واحد فقط في قاعدة البيانات. ينبغي حساب الحد الأعلى لفترة الثقة لاحتمالية وجود النمط الفرداني Y في المجتمع باستخدام الطريقة التي وصفها كلوبر وبيرسون (1934). [ 6 ] يستخدم هذا التوزيع ذو الحدين لاحتمالات العد، بما في ذلك الصفر أو الأرقام الصغيرة الأخرى التي تم العثور عليها لأنماط Y الفردية.

قواعد البيانات

قواعد البيانات الجنائية (بدون معلومات فردية، لأغراض التكرار):

في علم الأنساب الجيني ، كان موقع Ysearch آخر قاعدة بيانات مدعومة تضم أسماء العائلات وأنماط هابلوتايب Y-STR المُقدمة علنًا ، وذلك حتى إيقاف تشغيله في 24 مايو 2018، أي قبل يوم واحد من تطبيق اللائحة العامة لحماية البيانات في الاتحاد الأوروبي ، بعد فترة طويلة من انقطاع الدعم من مُنشئه، شركة Family Tree DNA . تأسست قاعدة البيانات عام 2003، ووصلت إلى 219 ألف سجل (من بينها 152 ألف نمط هابلوتايب فريد) قبل إغلاقها. وقد اختفت قواعد بيانات أخرى مماثلة في وقت سابق. [ 8 ] [ 9 ]

بيانات خاصة بالمجموعة الفردانية (Y-SNP):

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3"تحليل STR"
  2. "صحائف حقائق Y-STR" .
  3. "جيل جديد من المحققين ذوي التقنية العالية"
  4. ^ لارموسو، مارتن إتش دي ؛ فاندرهايدن، نانسي؛ فان جيستيلين، أنيلين؛ فان فرن، مانيس؛ دي كنيف، بيتر؛ ديكورتي روني (2014). “الإشعاع الأخير داخل Y-chromosomal Haplogroup R-M269 أدى إلى ارتفاع تشابه النمط الفرداني Y-STR”. حوليات علم الوراثة البشرية . 78 (2): 92-103 . دوى : 10.1111/ahg.12050 .
  5. تمت أرشفة "إرشادات تفسير SWGDAM لتحديد النمط الجيني لـ STR للكروموسوم Y" بتاريخ 2016-03-05 في Wayback Machine
  6. Clopper, C. and Pearson, E. The use of confidence or fiducial limits illustrated in the case of binomial, Biometrika (1934) 26:404-413.
  7. روور، ساشا ويلويت ولوتز. "YHRD : قاعدة بيانات مرجعية لنمط هابلوتايب STR للكروموسوم Y" . yhrd.org . 
  8. إستس، روبرتا (14 مايو 2018). "شبكة العائلات العالمية، وYsearch، وMitosearch تُغلق أبوابها - شكرًا جزيلًا للائحة العامة لحماية البيانات" . DNAeXplained - علم الأنساب الجيني .
  9. "Ysearch" .

الرسوم البيانية

صحائف معلومات

قواعد البيانات

دروس تعليمية