شعب البكتيريا

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 2 صور
الموسوعة الحرة

شجرة تطورية توضح تنوع البكتيريا والعتائق وحقيقيات النوى. [ 1 ] تم تخصيص ألوان اعتباطية للسلالات الرئيسية، مع كتابة أسماء السلالات الموصوفة جيدًا بخط مائل. أما السلالات التي تفتقر إلى ممثل معزول، فقد تم تمييزها بأسماء غير مائلة ونقاط حمراء.

تُشكّل الشعب البكتيرية السلالات الرئيسية في نطاق البكتيريا . وبينما لا يزال التعريف الدقيق للشعبة البكتيرية محل نقاش، فإن التعريف الشائع هو أنها سلالة أحادية النمط من البكتيريا، حيث تتشارك جينات الحمض النووي الريبوزي 16S الخاصة بها في تسلسل متطابق بنسبة 75% أو أقل مع جينات أعضاء الشعب البكتيرية الأخرى. [ 2 ]

تشير التقديرات إلى وجود حوالي 1300 شعبة بكتيرية. [ 2 ] اعتبارًا من مايو 2020، تم قبول 41 شعبة بكتيرية رسميًا من قِبل شبكة علم الأحياء الدقيقة الجزيئية (LPSN) ، [ 3 ] وتم التعرف على 89 شعبة بكتيرية في قاعدة بيانات سيلفا ، [ 4 ] واقتُرحت عشرات أخرى، [ 5 ] [ 6 ] ومن المرجح أن المئات لا تزال غير مكتشفة. [ 2 ] اعتبارًا من عام 2017، كانت حوالي 72% من الشعب البكتيرية المعترف بها على نطاق واسع شعبًا مرشحة [ 7 ] (أي ليس لها ممثلون مستزرعون).

أُدرجت رتبة الشعبة في قواعد المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى ، باستخدام اللاحقة -ota لأسماء الشعب التي يجب أن تستند إلى اسم الجنس كنمط تسميته. [ 8 ] [ 9 ]

قائمة شعب البكتيريا

فيما يلي قائمة بشعب البكتيريا التي تم نشرها بشكل صحيح اعتبارًا من ديسمبر 2023.

الشعبة المنشورة
الشعبةأسماء بديلةمجموعةالفئات المعروفةملحوظات
" Abditibacteriota " [ 10 ]FBP1
أسيدوباكتيريوتا [ 11 ]"البكتيريا الحمضية"5
الأكتينوميسيتوتا [ 12 ]"الأكتينوبكتيريا"باسيلاتي6
Armatimonadota [ 13 ] [ 14 ]"Armatimonadetes"، OP10باسيلاتي3
أتريبكتروتا [ 13 ]OP9، JS11
أكويفيكوتا"Aquiificae"3
البكتيرويدات"بكتيرويديتس"مجموعة FCB6
بالنيولوتا [ 15 ]1
بديلوفيبريونوتا3
Caldisericota [ 13 ] [ 16 ]OP5، [ 17 ] "Caldiserica"مجموعة FCB
Calditrichota [ 18 ]مجموعة FCB [ 19 ]
كامبيلوباكتيروتا2
الكلاميديوتا"الكلاميديا" [ 20 ]مجموعة PVC1
كلوروبيوتا"كلوروبي"مجموعة FCB1
كلوروفليكسوتا"كلوروفليكسي"باسيلاتي
كريسيوجينوتا"كريسيوجينيتس"
كوبوثيرموباكتيروتا
البكتيريا الزرقاءالبكتيريا الزرقاءباسيلاتي2
ديفيريباكتيروتاديفيريباكتيريس
دينوكوكوتادينوكوكوس ثيرموسباسيلاتي1
ديكتيوجلوموتاDictyoglomi [ 21 ]
Elusimicrobiota [ 22 ]Elusimicrobia, OP7, Termite Group 1 (TG1) [ 17 ]
الفيبروباكتيروتا"البكتيريا الليفية"مجموعة FCB
عصية"البكتيريا المتصلبة"باسيلاتي9
فوسوباكتيريوتا"فيوزوباكتيريا"1
Gemmatimonadota [ 23 ]Gemmatimonadetes [ 23 ]مجموعة FCB [ 19 ]
إغنافيباكتريوتا"إغنافيباكتيريا"، ZB1مجموعة FCB
كيريتيماتيلوتا
Lentisphaerota"Lentisphaerae"، vadinBE97مجموعة PVC
" الميكروبات البحرية "SAR406، المجموعة البحرية أمجموعة FCB [ 19 ]
ميكسوكوكوتا3
Nitrospinota [ 24 ] [ 25 ]"Nitrospinae" [ 26 ]
نيتروسبيروتا"نيتروسبيرا"
بلانكتوميسيتوتا"بلانكتوميسيتات"مجموعة PVC
الزائفة"بروتيوبكتيريا"
الرودوثيرموتا
" البكتيريا السكرية " [ 27 ] [ 28 ]TM7 الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط بالبكتيريا السكرية
سبيروكيتوتا"البكتيريا الحلزونية"
Synergistota"Synergistetes"
الميكوبلازما"التينيريكوتس"
ثيرموديسولفوباكتيريا"ثيرموديسولفوباكتيريا"
الميكروبات الحرارية"الميكروبات الحرارية"
Thermotogota [ 29 ]"Thermotogae"، OP2، EM3 [ 17 ]
الميكروبات الثؤلولية"فيروكوميكروبيا"مجموعة PVC

فيما يلي قائمة بالشعب المرشحة التي لم يتم استزراعها.

الشعب المرشحة
الشعبةأسماء بديلةمجموعةملحوظات
" البكتيريا الأبسكونديتا " [ 30 ] [ 28 ]SR1 الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط ببكتيريا جراسيليباكتيريا
ABY1 [ 31 ]OD1-ABY1 [ 32 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
" Aerophobota " / "Aerophobetes"CD12، BHI80-139
" بكتيريا أندرسن " [ 5 ]RIF9الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4
"Aminicenantota" [ 33 ]OP8
" بكتيريا بيركيل " [ 34 ] [ 28 ]ACD58 الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط بالبكتيريا السكرية
" Bipolaricaulota " [ 13 ]OP1، "العلاج بالخل"
" بكتيريا بلاكبيرن " [ 5 ]RIF35الإنعاش القلبي الرئوي؛ الميكروجينومات
" بكتيريا برينر " [ 5 ] [ 28 ]RIF18الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 3
" البكتيريا البنية " [ 35 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا الطفيلية؛ البكتيريا الطفيلية غير المصنفة
" بكتيريا بوكانان " [ 5 ] [ 28 ]RIF37الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 1
" بكتيريا كامبل " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 4يبدو أنه متعدد الأصول؛ مجموعتان فرعيتان
" Clocimonetes " [ 37 ]WWE1مجموعة FCB [ 19 ]
" بكتيريا كوتس " [ 5 ]RIF8
" البكتيريا الكوليرية " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" بكتيريا كولويل " [ 5 ] [ 28 ]RIF41الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 3
" بكتيريا كورتيس " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" بكتيريا دادا " [ 38 ]لا
" بكتيريا ديفيس " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينوماتلا
" البكتيريا الدلفي " [ 7 ]مجموعة FCBلا
" بكتيريا ديلونج " [ 5 ]RIF26، H-178لا
" Dependentiae " [ 27 ]TM6
" دوجكابكتيريا " [ 28 ]WS6 الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المتعلق بالميكروجينومات
" Dormibacteraeota " [ 39 ]AD3
" Doudnabacteria " [ 36 ] [ 28 ]SM2F11الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة 1
" بكتيريا إدواردز " [ 6 ] [ 5 ]RIF29، UBP-2 [ 40 ]
" Eisenbacteria " [ 5 ]RIF28مجموعة FCB
" Eremiobacteraeota " [ 41 ] [ 39 ]WPS-2، Palusbacterota [ 42 ]
" بكتيريا فالكو " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 1
" بكتيريا التخمر " [ 43 ]Hyd24-12
" بكتيريا الخصوبة " [ 7 ] الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط ببكتيريا جراسيليباكتيريا
" بكتيريا فايرستون " [ 5 ]RIF1
" بكتيريا الفيرفيدي "OctSpa1-106
" البكتيريا السمكية " [ 5 ]RIF25
" بكتيريا فريزر " [ 5 ]RIF31
" البكتيريا الزجاجية " [ 5 ]RIF5لا
" بكتيريا الجيوفانونية " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4لا
" بكتيريا غوتسمان " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينوماتلا
" البكتيريا الرشيقة " [ 44 ] [ 28 ]GN02، BD1-5، SN-2الإنعاش القلبي الرئوي؛ بكتيريا باتيسيباكتيريا؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط  ببكتيريا جراسيليباكتيريالا
" الجريبالدوبكتريا " [ 5 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2لا
" بكتيريا هاندلسمان " [ 5 ]RIF27لا
" بكتيريا هاريسون " [ 5 ] [ 28 ]RIF43الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 3لا
" بكتيريا هاوليت " [ 28 ] الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط بالبكتيريا السكريةلا
" بكتيريا العناق " [ 35 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا الطفيلية؛ البكتيريا الطفيلية غير المصنفة
" Hydrogenedents "NKB19
" بكتيريا جاكسون " [ 5 ] [ 28 ]RIF38الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 1
" بكتيريا يورغنسن " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 3
" بكتيريا القيصر " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 4
" كاتانوبكتيريا " [ 45 ] [ 28 ]WWE3الإنعاش القلبي الرئوي؛ ذو صلة بالميكروجينومات
" كازانباكتيريا " [ 28 ] [ 5 ]كازان الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط بالبكتيريا السكرية
" بكتيريا كيرفيلد " [ 5 ] [ 28 ]RIF4الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 1
" البكتيريا الكويليبية " [ 5 ] [ 28 ]RIF6الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 1
" كريبتونيا " [ 46 ]
" Krumholzibacteriota " [ 40 ]
" البكتيريا كوينينباكتيريا " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 1
" لامدا بروتيوبكتيريا " [ 5 ]RIF24البروتيوبكتيريا
" Latescibacteria "WS3مجموعة FCB [ 19 ]
" البكتيريا الليفية " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينوماتلا
" بكتيريا ليندو " [ 5 ]RIF2 الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط بالبكتيريا السكريةلا
" بكتيريا ليبتون " [ 5 ] [ 28 ]RIF42الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 3لا
" بكتيريا لويد " [ 5 ] [ 28 ]RIF45الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 4لا
" بكتيريا المجازانيك " [ 36 ] [ 47 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 1لا
" Margulisbacteria " [ 5 ]RIF30لا
" بكتيريا الميلانين " [ 48 ]
" الجينومات الدقيقة " [ 49 ]OP11الإنعاش القلبي الرئوي؛ بكتيريا باتيسيباكتيريا
" البكتيريا المعدلة " [ 44 ] [ 50 ]KSB3، GN06
" البكتيريا المورانية " [ 36 ] [ 28 ]OD1-i [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسيباكتيريا؛ باركوباكتيريا؛ باركوباكتيريا غير مصنفة
" Muproteobacteria " [ 5 ]RIF23البروتيوبكتيريا
NC10 [ 51 ] [ 31 ]
" بكتيريا نيلسون " [ 5 ] [ 28 ]RIF40الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2
" Niyogibacteria " [ 5 ]RIF11الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4
" نوموراباكتيريا " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 1
" أومنيتروفيكا " [ 13 ]OP3مجموعة PVC
" بكتيريا السلام " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" البكتيريا الجزئية " [ 30 ]OD1الإنعاش القلبي الرئوي
"البكتيريا الجزئية" 1 [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
"البكتيريا الجزئية" 2 [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
"البكتيريا الجزئية" 3 [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
"البكتيريا الجزئية" 4 [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
" Parcunitrobacteria " [ 52 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المتكيسة؛ البكتيريا المتكيسة غير المصنفة [ 53 ]
PAUC34f [ 54 ]السلالة غير المصنفة المرتبطة بالإسفنج (SAUL)مجموعة FCB
" Peregrinibacteria " [ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] [ 28 ]لكل الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط ببكتيريا جراسيليباكتيريا
" البكتيريا المحيطة " [ 28 ] الإنعاش القلبي الرئوي؛ الإنعاش القلبي الرئوي المرتبط ببكتيريا جراسيليباكتيريا
" البكتيريا المسامية " [ 59 ]مجموعة PVC
" بورتنويباكتيريا " [ 5 ]RIF22الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4
" بكتيريا ريموند " [ 5 ]RIF7
بكتيريا البنادق [ 5 ]RIF32
" Roizmanbacteria " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" Rokubacteria " [ 38 ]
" بكتيريا رايان " [ 5 ] [ 28 ]RIF10الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المكورة؛ البكتيريا المكورة  4 ذات الصلة
" Saltatorellota " [ 60 ]
" بكتيريا شيكمان " [ 5 ]ريف3البروتيوبكتيريا
" شابيروباكتيريا " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" البكتيريا الطيفية " [ 5 ] [ 28 ]RIF19الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2
" بكتيريا ستاسكافيكز " [ 5 ] [ 28 ]RIF20الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2
" Sumerlaeota " [ 61 ] [ 62 ]BRC1
" بكتيريا الشمس " [ 5 ] [ 28 ]RIF17الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4
TA06 [ 63 ]
" Tagabacteria " [ 5 ] [ 28 ]RIF12الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة بـ 4
" بكتيريا تايلور " [ 5 ] [ 28 ]RIF16الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 4
" تكتوميكروبيا " [ 64 ]
" بكتيريا تيري " [ 5 ] [ 28 ]RIF13الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2
" بكتيريا توروك " [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية غير المصنفة
UBP-1 [ 6 ]
" Uhrbacteria " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 1
" Veblenbacteria " [ 5 ]RIF39الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية  ذات الصلة 1
" بكتيريا فوجيلباكتريا " [ 5 ] [ 28 ]RIF14الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 4
" بكتيريا الجدار " [ 5 ]RIF33
" بكتيريا وايلدرموث " [ 5 ] [ 28 ]RIF21الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 2
" بكتيريا ويرث " [ 65 ]البكتيريا المرتبطة بالإنعاش القلبي الرئوي
" بكتيريا ووسي " [ 36 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ الميكروجينومات
" البكتيريا الذئبية " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسكيباكتيريا. الباركوبكتريا. الباركوبتيريا 3
" Woykebacteria " [ 5 ] [ 35 ]RIF34الإنعاش القلبي الرئوي؛ الميكروجينومات
" يانوفسكي بكتيريا " [ 36 ] [ 28 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ باتيسيباكتيريا؛ باركوباكتيريا؛ باركوباكتيريا غير مصنفة
" Yonathbacteria " [ 5 ] [ 28 ]RIF44الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 4
" بكتيريا الزامبريسكي " [ 5 ] [ 28 ]RIF15الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية؛ البكتيريا المعوية 4
ZB2OD1-ZB2 [ 32 ]الإنعاش القلبي الرئوي؛ البكتيريا المعوية
" زيكسيباكتيريا " [ 66 ]مجموعة FCB

الفرق الموسيقية الخارقة

على الرغم من عدم وضوح ترتيب تفرع معظم شعب البكتيريا، تتجمع عدة مجموعات من الشعب معًا باستمرار، ويُشار إليها باسم المجموعات الفائقة أو الشعب الفائقة. في بعض الحالات، تتجمع الفروع البكتيرية معًا بشكل واضح، ولكن يبقى من غير الواضح تسمية هذه المجموعة. على سبيل المثال، يشمل إشعاع الشعب المرشحة مجموعة Patescibacteria التي تضم مجموعة Microgenomates التي تضم أكثر من 11 شعبة بكتيرية. يعترف نظام تصنيف البكتيريا في لويزيانا (LPSN) بأربع ممالك من البكتيريا كتصنيفات منشورة بشكل صحيح: Bacillati و Fusobacteriati و Pseudomonadati و Thermotogati . [ 67 ]

إشعاع الشعب المرشحة (CPR)

يشير مصطلح CPR إلى انتشار أحادي النمط الوراثي واسع النطاق لشعب مرشحة موجودة ضمن نطاق البكتيريا. [ 68 ] ويشمل فرعين رئيسيين، هما مجموعتا Microgenomates وParcubacteria، تحتوي كل منهما على الشعبة الفائقة التي تحمل الاسم نفسه وعدد قليل من الشعب الأخرى.

باتيسيباكتيريا

كان يُعتقد في الأصل أن شعبة Patescibacteria الفائقة تضم شعب Microgenomates (OP11) وParcubacteria (OD1) و Gracilibacteria (GNO2 / BD1-5). [ 19 ] تُظهر تحليلات التطور الجيني الحديثة أن السلف المشترك الأخير لهذه التصنيفات هو نفس العقدة التي تنتمي إليها CPR. [ 69 ]

سفينغوباكتيريا

تضمّ شعبة Sphingobacteria (مجموعة FCB) كلاً من Bacteroidota وCalditrichota وChlorobiota، بالإضافة إلى شعبة مرشحة تُدعى "Cloacimonetes"، وFibrobacterota وGemmatimonadota وIgnavibacteriota، وشعبة مرشحة تُدعى "Latescibacteria"، وشعبة مرشحة تُدعى "Marinimicrobia"، وشعبة مرشحة تُدعى "Zixibacteria". [ 19 ] [ 70 ]

ميكروجينوميتس

كان يُعتقد في الأصل أن Microgenomates عبارة عن شعبة واحدة على الرغم من أن الأدلة تشير إلى أنها تشمل في الواقع أكثر من 11 شعبة بكتيرية، [ 36 ] [ 5 ] بما في ذلك Curtisbacteria و Daviesbacteria و Levybacteria و Gottesmanbacteria و Woesebacteria و Amesbacteria و Shapirobacteria و Roizmanbacteria و Beckwithbacteria و Collierbacteria و Pacebacteria.

بكتيريا صغيرة

وُصفت شعبة الباركوباكتريا في الأصل بأنها شعبة واحدة باستخدام أقل من 100 تسلسل من الحمض النووي الريبوزي 16S. ومع توفر تنوع أكبر من تسلسلات الحمض النووي الريبوزي 16S من الكائنات غير المستزرعة، يُقدّر أنها قد تتكون من 28 شعبة بكتيرية. [ 2 ] وبناءً على ذلك، وُصفت أكثر من 14 شعبة ضمن مجموعة الباركوباكتريا، [ 36 ] [ 5 ] بما في ذلك كايزرباكتيريا، وأدلرباكتيريا، وكامبلباكتيريا، ونوموراباكتيريا، وجيوفانونيباكتيريا، وولفباكتيريا، ويورغنسنباكتيريا، ويانوفسكيباكتيريا، وأزامباكتيريا، ومورانباكتيريا، وأورباكتيريا، وماغاسانيكباكتيريا.

البروتيوبكتيريا

لقد طُرحت فكرة أن بعض أصناف شعبة البروتيوكتيريا قد تُشكّل شعبًا مستقلة، مما يجعل البروتيوكتيريا شعبة فائقة. [ 71 ] فعلى سبيل المثال، لا تُشكّل مجموعة دلتا بروتيوكتيريا سلالة أحادية النمط مع أصناف البروتيوكتيريا الأخرى بشكلٍ ثابت. [ 72 ]

بلانكتوبكتيريا

تشمل البكتيريا العصوية (مجموعة PVC) الكلاميديات ، واللينتيسفيروتا ، والشعبة المرشحة " أومنيتروفيكا "، والبلانكتوميسيتوتا ، والشعبة المرشحة " بوريبكتيريا "، والفيروكوميكروبيوتا . [ 19 ] [ 70 ]

باسيلاتي

تشمل مملكة Bacillati ، [ 73 ] الأكتينوميسيتوتا ، و "مجموعة البكتيريا الزرقاء/البكتيريا الميلينية" ، والدينوكوكوتا ، والكلوروفليكسوتا ، والباسيلوتا ، والشعبة المرشحة OP10. [ 73 ] [ 74 ] [ 19 ] [ 70 ]

شعبة فائقة خفية

تم اقتراح أن العديد من الشعب المرشحة ( مثل Microgenomates و Omnitrophica و Parcubacteria و Saccharibacteria ) والعديد من الشعب المقبولة ( مثل Elusimicrobiota و Caldisericota و Armatimonadota ) هي في الواقع شعب فائقة تم وصفها بشكل خاطئ على أنها شعب، إما بسبب نقص قواعد تعريف الشعب البكتيرية أو بسبب نقص تنوع التسلسل في قواعد البيانات عند إنشاء الشعبة لأول مرة. [ 2 ] على سبيل المثال، يُقترح أن شعبة Parcubacteria المرشحة هي في الواقع شعبة فائقة تضم 28 شعبة فرعية، وأن شعبة Elusimicrobia هي في الواقع شعبة فائقة تضم 7 شعب فرعية. [ 71 ]

منظور تاريخي

التركيب الذري للوحدة الفرعية 30S للريبوسوم من بكتيريا Thermus thermophilus، والتي تشكل الوحدة الفرعية 16S جزءًا منها. تظهر البروتينات باللون الأزرق، وشريط الحمض النووي الريبوزي المفرد باللون البني الفاتح. [ 75 ]

بالنظر إلى التاريخ الغني لمجال تصنيف البكتيريا وسرعة التغيرات التي طرأت عليه في العصر الحديث، فمن المفيد غالبًا أن يكون لدينا منظور تاريخي حول كيفية تطور هذا المجال من أجل فهم الإشارات إلى التعريفات أو المفاهيم القديمة.

عندما كانت تسمية البكتيريا تخضع لقانون علم النبات ، كان مصطلح الشعبة مستخدمًا، ولكن الآن بعد أن أصبحت تسمية البكتيريا (باستثناء البكتيريا الزرقاء ) تخضع لقانون علم البكتيريا ، فإن مصطلح الشعبة هو المفضل.

في عام 1987، قام كارل ووز ، الذي يُعتبر رائد ثورة علم الوراثة الجزيئية، بتقسيم البكتيريا الحقيقية إلى 11 شعبة بناءً على تسلسلات الحمض النووي الريبوزي 16S (SSU)، والمذكورة أدناه. [ 76 ] [ 77 ]

تقليديًا، كان يُستدل على العلاقات التطورية وتُحدد التصنيفات بناءً على دراسات الشكل. وقد أتاح ظهور علم الوراثة الجزيئية تحسين فهم العلاقات التطورية بين الأنواع من خلال تحليل تسلسلات الحمض النووي والبروتينات ، مثل الحمض النووي الريبوزي . [ 88 ] وقد أعاق نقص السمات المورفولوجية سهلة الوصول، كتلك الموجودة في الحيوانات والنباتات ، الجهود المبكرة للتصنيف، مما أدى إلى تصنيفات خاطئة ومشوّهة ومربكة، ومن الأمثلة على ذلك، كما أشار كارل ووز ، بكتيريا الزائفة (Pseudomonas) التي تطابقت مشتقاتها اللغوية ، ويا ​​للمفارقة، مع تصنيفها، أي "الوحدة الزائفة". [ 76 ] وقد أُعيد تصنيف أو تعريف العديد من التصنيفات البكتيرية باستخدام علم الوراثة الجزيئية.

أتاح ظهور تقنيات التسلسل الجزيئي استخلاص الجينومات مباشرةً من العينات البيئية (أي تجاوز مرحلة الاستزراع)، مما أدى إلى توسع سريع في معرفتنا بتنوع شعب البكتيريا. وتشمل هذه التقنيات علم الجينوم البيئي وعلم جينوم الخلية الواحدة .

انظر أيضاً

الحواشي

  1. ↑ حتى وقت قريب، كان يُعتقد أن البكتيريا العصوية (Bacillota) والأكتينوميسيتوتا (Actinomycetota) فقط هي التي تُصبغ بصبغة غرام. مع ذلك،قد تكون الشعبة المرشحة TM7 موجبة لصبغة غرام أيضًا. [ 79 ] أما بكتيريا الكلوروفليكسي (Chloroflexi) فتمتلك طبقة ثنائية واحدة، لكنها لا تُصبغ (باستثناءات قليلة [ 80 ] ). [ 81 ]
  2. ↑ تم تصنيف Pasteuria الآن ضمن شعبة Bacillota ، وليس ضمن شعبة Planctomycetota .
  3. ↑ تم اقتراح تسمية المجموعة Xenobacteria [ 84 ] أو Hadobacteria [ 85 ] (يعتبر الاسم الأخير اسمًا غير شرعي [ 86 ] ).

مراجع

  1. ↑ هوغ، لورا أ.؛ بيكر، بريت ج.؛ أنانثارامان، كارتيك؛ براون، كريستوفر ت.؛ بروبست، ألكسندر ج.؛ كاستيل، سيندي ج.؛ باترفيلد، كريستينا ن.؛ هيرنسدورف، أليكس و.؛ أمانو، يوكي؛ إيسي، كوتارو؛ سوزوكي، يوهي (11 أبريل 2016). "نظرة جديدة لشجرة الحياة" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ISSN 2058-5276 . PMID 27572647 .  
  2. 1 2 3 4 5 يارزا، بابلو؛ يلماز، بيلين؛ برويس، إلمار؛ غلوكنر، فرانك أوليفر؛ لودفيغ، فولفغانغ؛ شلايفر، كارل هاينز؛ ويتمان، ويليام ب.؛ أوزيبي، جان؛ أمان، رودولف؛ روسيلو-مورا، رامون (سبتمبر 2014). "توحيد تصنيف البكتيريا والعتائق المستزرعة وغير المستزرعة باستخدام تسلسلات جين 16S rRNA" . مجلة Nature Reviews Microbiology . 12 (9): 635-645 . doi : 10.1038/nrmicro3330 . ISSN 1740-1534 . PMID 25118885. S2CID 21895693 .   
  3. ↑ شعب البكتيريا في قائمة أسماء بدائيات النوى المعتمدة في التسمية ( LPSN ) ؛ بارتي، أيدان سي.؛ ساردا كارباس، جواكيم؛ ماير-كولثوف، يان بي.؛ رايمر، لورنز سي.؛ جوكر، ماركوس (1 نوفمبر 2020). "قائمة أسماء بدائيات النوى المعتمدة في التسمية (LPSN) تنتقل إلى DSMZ" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 70 (11): 5607-5612 . doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  4. ↑ "سيلفا" . www.arb-silva.de .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 أنانثارامان، كارتيك؛ براون، كريستوفر تي.؛ هوغ، لورا أ.؛ شارون، إيتاي؛ كاستيل، سيندي جيه.؛ بروبست، ألكسندر جيه.؛ توماس، برايان سي.؛ سينغ، أندريا؛ ويلكينز، مايكل جيه.؛ كاراوز، أولاس؛ برودي، إوين إل. (24 أكتوبر 2016). "آلاف الجينومات الميكروبية تُلقي الضوء على العمليات البيوجيوكيميائية المترابطة في نظام طبقة المياه الجوفية" . مجلة نيتشر كوميونيكيشنز ، 7 (1)، 13219. رمز Bibcode : 2016NatCo...713219A . doi : 10.1038/ncomms13219 . ISSN 2041-1723 . PMC 5079060. PMID 27774985 .   
  6. باركس ، دونوفان هـ.؛ رينكه، كريستيان؛ تشوفوشينا، ماريا؛ شوميل، بيير آلان؛ وودكروفت، بن ج.؛ إيفانز، بول ن.؛ هوغنهولتز، فيليب؛ تايسون، جين و. (نوفمبر 2017). "استعادة ما يقرب من 8000 جينوم مُجمَّع من الميتاجينوم تُوسِّع شجرة الحياة بشكلٍ كبير" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 2 (11): 1533-1542 . doi : 10.1038/s41564-017-0012-7 . ISSN 2058-5276 . PMID 28894102 .  
  7. دوديك ، ناتاشا ك.؛ صن، كريستين ل.؛ بورستين، ديفيد؛ كانتور، روز س.؛ ألياجا غولتسمان، دانييلا س.؛ بيك، إليزابيث م.؛ توماس، برايان س.؛ بانفيلد، جيليان ف.؛ ريلمان، ديفيد أ. (18 ديسمبر 2017). " تنوع ميكروبي جديد وإمكانات وظيفية في الميكروبيوم الفموي للثدييات البحرية" . علم الأحياء الحالي . 27 (24): 3752-3762.e6. Bibcode : 2017CBio...27E3752D . doi : 10.1016/j.cub.2017.10.040 . ISSN 1879-0445 . PMID 29153320 .  
  8. ↑ أورين، أهارون؛ أراهال، ديفيد ر.؛ روسيلو-مورا، رامون؛ سوتكليف، إيان س.؛ مور، إدوارد ر.ب. (23 يونيو 2021). "تعديل القواعد 5ب، 8، 15، و22 من المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى لتشمل رتبة الشعبة" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 71 (6). doi : 10.1099/ijsem.0.004851 . PMID 34161220. S2CID 235625014 .  
  9. ↑ أورين، أهارون؛ غاريتي، جورج م. (20 أكتوبر 2021). "نشرٌ مُعتمد لأسماء اثنين وأربعين شعبة من بدائيات النوى" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 71 (10). doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308 .  
  10. ^ طاهون، غيوم. تيتجات، بيورن؛ ليبي، ليزبث؛ كارلير، أوريليان. ويليمز، آن (1 يوليو 2018). "Abditibacterium utsteinense sp. nov.، أول عضو مزروع في الشعبة المرشحة FBP، معزول من عينات التربة الخالية من الجليد في القطب الجنوبي" . علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . 41 (4): 279– 290. بيب كود : 2018SyApM..41..279T . دوى : 10.1016/j.syapm.2018.01.009 . ISSN 0723-2020 . بميد 29475572 . S2CID 3515091 .   
  11. ^ ثراش ، ج. كاميرون. كوتس، جون د. (2010)، “Phylum XVII. Acidobacteria phyl. Nov.”، دليل بيرجي® لعلم البكتيريا المنهجي ، سبرينغر نيويورك، الصفحات من 725 إلى 735، دوى : 10.1007/978-0-387-68572-4_6 (غير نشط في 30 يناير 2026)، ISBN  978-0-387-95042-6{{citation}}: صيانة CS1: تم تعطيل DOI اعتبارًا من يناير 2026 ( رابط )
  12. ↑ غودفيلو، مايكل (2012). "الشعبة السادسة والعشرون. شعبة الأكتينوبكتيريا الجديدة". دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . سبرينغر نيويورك. ص 33-2028 . doi : 10.1007/978-0-387-68233-4_3 . ISBN  978-0-387-95043-3.
  13. 1 2 3 4 5 هوغنهولتز وآخرون (1998). "تنوع بكتيري جديد على مستوى التقسيم في نبع حار في يلوستون" . مجلة علم البكتيريا . 180 (2): 366-376 . doi : 10.1128/JB.180.2.366-376.1998 . PMC 106892. PMID 9440526 .   
  14. ^ تاماكي ، هيديوكي. تاناكا، ياسوهيرو؛ ماتسوزاوا، هيرواكي؛ موراماتسو، ميزوهو؛ منغ، شيان يينغ؛ هانادا، ساتوشي؛ موري، كازوهيرو؛ كاماجاتا ، يويتشي (يونيو 2011). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov.، من شعبة بكتيرية جديدة، Armatimonadetes phyl. nov.، تسمى رسميًا الشعبة المرشحة OP10" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 61 (الجزء 6): 1442– 1447. بيب كود : 2011IJSEM..61.1442T . دوى : 10.1099/ijs.0.025643-0 . ISSN 1466-5034 . PMID 20622056 .  
  15. ^ هانكي، ريتشارد إل. ماير كولثوف، جان P.؛ غارسيا لوبيز، مارينا؛ موخيرجي، سوبراتيم؛ هنتمان، مارسيل. إيفانوفا، ناتاليا ن.؛ ويكي، تانيا؛ كيربيدس، نيكوس سي؛ كلينك، هانز بيتر؛ جوكر، ماركوس (2016). “التصنيف التصنيفي القائم على الجينوم للبكتيرويدات” . الحدود في علم الأحياء الدقيقة . 7 2003. بيب كود : 2016FrMic...702003H . دوى : 10.3389/fmicb.2016.02003 . ISSN 1664-302X . بمك 5167729 . بميد 28066339 .   
  16. ^ موري، ك. ياماغوتشي، ك.؛ ساكياما، Y.؛ أوراب، T.؛ سوزوكي، K.-i. (23 يوليو 2009). "Caldisericum exile gen. nov., sp. nov.، بكتيريا لا هوائية، محبة للحرارة، خيطية من فصيلة بكتيرية جديدة، Caldiserica phyl. nov.، كانت تسمى في الأصل الشعبة المرشحة OP5، ووصف Caldisericaceae fam. nov.، Caldisericales ord. nov. وCaldisericia classis nov." . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 59 (11): 2894–2898 . دوى : 10.1099/ijs.0.010033-0 . ردمك 1466-5026 . PMID 19628600 .  
  17. 1 2 3 دانفيلد، بيتر ف.؛ تاماس، إيفيكا؛ لي، كيفن س.؛ مورغان، زوتشيل س.؛ ماكدونالد، إيان ر.؛ ستوت، ماثيو ب. (2012). "انتخاب مرشح: تاريخ تخميني لشعبة البكتيريا OP10" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 14 (12): 3069-3080 . Bibcode : 2012EnvMi..14.3069D . doi : 10.1111/j.1462-2920.2012.02742.x . ISSN 1462-2920 . PMID 22497633 .  
  18. ^ كوبلانوف، ايليا ف. سيجالوفا، أولغا م.؛ جافريلوف، سيرجي ن.؛ ليبيدينسكي، الكسندر الخامس. رينكي، كريستيان؛ كوفاليفا، أولغا؛ تشيرنيه، نيكولاي أ؛ إيفانوفا، ناتاليا؛ داوم، كريس؛ ريدي ، تي بي كيه. كلينك ، هانز بيتر (20 فبراير 2017). "التحليل الجينومي لـ Caldithrix abyssi ، البكتيريا اللاهوائية المحبة للحرارة من الشعبة البكتيرية الجديدة Calditrichaeota" . الحدود في علم الأحياء الدقيقة . 8 : 195. دوى : 10.3389/fmicb.2017.00195 . ISSN 1664-302X . بمك 5317091 . بميد 28265262 .   
  19. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 رينك سي وآخرون (2013). "رؤى حول التطور الوراثي وإمكانات الترميز للمادة المظلمة الميكروبية" . نيتشر . 499 (7459): 431-437 . Bibcode : 2013Natur.499..431R . doi : 10.1038/nature12352 . hdl : 10453/27467 . PMID 23851394 .  
  20. ↑ بون، ديفيد ر.؛ كاستنهولز، ريتشارد و.؛ غاريتي، جورج م.، محرران. (2001). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . doi : 10.1007/978-0-387-21609-6 (غير نشط في 30 يناير 2026). ISBN 978-1-4419-3159-7. S2CID 41426624 . {{cite book}}: صيانة CS1: تم تعطيل DOI اعتبارًا من يناير 2026 ( رابط )
  21. ↑ باتيل، بهارات كيه سي (2010). "الشعبة XX. Dictyoglomi phyl. Nov.". دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . سبرينغر نيويورك. ص 775-780 . doi : 10.1007/978-0-387-68572-4_9 (غير نشط في 30 يناير 2026). ISBN  978-0-387-95042-6.{{cite book}}: صيانة CS1: تم تعطيل DOI اعتبارًا من يناير 2026 ( رابط )
  22. ↑ هيرليمان، د.ب.ر.؛ جيسينجر، أ.؛ إيكيدا-أوتسوبو، و.؛ كونين، ف.؛ صن، هـ.؛ لابيدوس، أ.؛ هوجنهولتز، ب.؛ برون، أ. (1 مايو 2009). "التحليل الجينومي لـ "Elusimicrobium minutum"، أول ممثل مُستزرع لشعبة "Elusimicrobia" (المعروفة سابقًا باسم مجموعة النمل الأبيض 1)" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 75 (9): 2841-2849 . Bibcode : 2009ApEnM..75.2841H . doi : 10.1128/AEM.02698-08 . ISSN 0099-2240 . PMC 2681670. PMID 19270133 .   
  23. 1 2 تشانغ، هوي؛ سيكيجوتشي، يوجي؛ هانادا، ساتوشي؛ هوجينهولتز، فيليب؛ كيم، هونغيك؛ كاماجاتا، يويتشي؛ ناكامورا، كازونوري (2003). "Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov.، كائن دقيق سالب الغرام، هوائي، مُراكم للفوسفات المتعدد، وهو أول ممثل مُستزرع لشعبة البكتيريا الجديدة Gemmatimonadetes phyl. nov" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 53 (4): 1155-1163 . doi : 10.1099/ijs.0.02520-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 12892144 .  
  24. ↑ مولر، آنا جيه؛ جونغ، مان-يونغ؛ ستراشان، كاميرون آر؛ هيربولد، كريغ دبليو؛ كيركيغارد، راسموس إتش؛ فاغنر، مايكل؛ دايمز، هولغر (مارس 2021). "التحليل الجينومي والحركي لأنواع جديدة من نيتروسبيناي تم إثراؤها بواسطة فرز الخلايا" . مجلة ISME . 15 (3): 732-745 . Bibcode : 2021ISMEJ..15..732M . doi : 10.1038/ s41396-020-00809-6 . ISSN 1751-7362 . PMC 8026999. PMID 33067588 .   
  25. ↑ سبيك، إيفا؛ كويتر، سابين؛ وينزل، ثيلو؛ بوك، إيبرهارد؛ لودفيج، وولفجانج (مايو 2014). "توصيف بكتيريا جديدة مؤكسدة للنتريت في البيئة البحرية، Nitrospina watsonii sp. nov.، وهي عضو في شعبة "Nitrospinae" المقترحة حديثًا"" . علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . 37 (3): 170–176 . Bibcode : 2014SyApM..37..170S . doi : 10.1016/j.syapm.2013.12.005 . PMID 24581679 . 
  26. ↑ لوكر، سيباستيان؛ ناوكا، بوريس؛ راتي، توماس؛ سبيك، إيفا؛ دايمز، هولجر (2013). " جينوم نيتروسبينا جراسيليس يُلقي الضوء على استقلاب وتطور مُؤكسد النتريت البحري الرئيسي" . فرونتيرز إن ميكروبيولوجي . 4 : 27. doi : 10.3389/fmicb.2013.00027 . ISSN 1664-302X . PMC 3578206. PMID 23439773 .   
  27. 1 2 ريمس، هـ؛ ريني، ف.أ؛ ستاكبراندت، إ (سبتمبر 1996). "نهج جزيئي للبحث عن التنوع بين البكتيريا في البيئة" . مجلة علم الأحياء الدقيقة الصناعية والتكنولوجيا الحيوية . 17 ( 3-4 ): 159-169 . doi : 10.1007/bf01574689 . ISSN 0169-4146 . S2CID 31868442 .  
  28. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 جافي، ألكسندر ل.؛ كاستيل، سيندي ج.؛ ماثيوس كارنيفالي، باولا ب.؛ غريبالدو، سيمونيتا؛ بانفيلد، جيليان ف. (2020). "صعود التنوع في المنصات الأيضية عبر إشعاع الشعب المرشحة" . بي إم سي بيولوجي . 18 (1) 69. doi : 10.1186/s12915-020-00804-5 . ISSN 1741-7007 . PMC 7304191 . PMID 32560683 .   
  29. ↑ ريسنباخ، آنا لويز؛ هوبر، روبرت؛ ستيتر، كارل أو.؛ ​​ديفي، ماري إلين؛ ماكجريجور، باربرا جيه.؛ ستال، ديفيد أ. (2001). "الشعبة BII. Thermotogae phy. nov.". دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . نيويورك، نيويورك: سبرينغر نيويورك. ص 369-387 . doi : 10.1007/978-0-387-21609-6_19 (غير نشط في 30 يناير 2026). ISBN  978-1-4419-3159-7.{{cite book}}: صيانة CS1: تم تعطيل DOI اعتبارًا من يناير 2026 ( رابط )
  30. 1 2 هاريس، ج. كيرك؛ كيلي، سكوت ت.؛ بيس، نورمان ر. (فبراير 2004). "منظور جديد حول التقسيم الوراثي للبكتيريا غير المستزرعة OP11" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 70 (2): 845-849 . Bibcode : 2004ApEnM..70..845H . doi : 10.1128/AEM.70.2.845-849.2004 . ISSN 0099-2240 . PMC 348892. PMID 14766563 .   
  31. 1 2 رابيه، مايكل س.؛ جيوفانوني، ستيفن ج. (2003). "الأغلبية الميكروبية غير المستزرعة". المراجعة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 57 : 369-94 . doi : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090759 . PMID 14527284 . 
  32. 1 2 هيلر، كينلي أ.؛ فورمان، كينيث هـ.؛ وايزمان، ديفيد؛ بوين، جينيفر ل. (2015). "حواجز تفاعلية نفاذة مصممة للتخفيف من التخثث، تُغير تكوين المجتمع البكتيري وظروف الأكسدة والاختزال في طبقة المياه الجوفية" (ملف PDF) . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 81 (20): 7114-7124 . Bibcode : 2015ApEnM..81.7114H . doi : 10.1128/AEM.01986-15 . ISSN 1098-5336 . PMC 4579450. PMID 26231655 .   
  33. ↑ بالين، مارك ج. (2024). "التاريخ الديناميكي لشعب بدائيات النوى: الاكتشاف والتنوع والانقسام" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 74 (9): 006508. doi : 10.1099 / ijsem.0.006508 . ISSN 1466-5034 . PMC 11382960. PMID 39250184 .   
  34. ↑ رايتون، كيلي سي؛ كاستيل، سيندي جيه؛ ويلكينز، مايكل جيه؛ هوغ، لورا إيه؛ شارون، إيتاي؛ توماس، برايان سي؛ هاندلي، كيم إم؛ مولين، شون دبليو؛ نيكورا، كاري دي؛ سينغ، أندريا؛ ليبتون، ماري إس. (يوليو 2014). "الترابطات الأيضية بين الكائنات المخمرة والكائنات التنفسية الجديدة من الناحية التطورية في طبقة مياه جوفية غير محصورة" . مجلة ISME . 8 (7): 1452-1463 . Bibcode : 2014ISMEJ...8.1452W . doi : 10.1038/ismej.2013.249 . ISSN 1751-7370 . PMC 4069391. PMID 24621521 .   
  35. 1 2 3 دانتشاك، ر. إي.؛ جونستون، م. د.؛ كيناه، س.؛ سلاتري، م.؛ رايتون، ك. س.؛ ويلكينز، م. ج. (سبتمبر 2017). "تتميز أعضاء شعبة الإشعاع المرشحة وظيفيًا بقدراتها على تدوير الكربون والنيتروجين" . ميكروبيوم . 5 ( 1): 112. Bibcode : 2017Micb....5..112D . doi : 10.1186/s40168-017-0331-1 . ISSN 2049-2618 . PMC 5581439. PMID 28865481 .   
  36. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 براون، كريستوفر ت .؛ هوغ، لورا أ.؛ توماس، برايان س.؛ شارون، إيتاي؛ كاستيل، سيندي ج.؛ سينغ، أندريا؛ وآخرون . (يوليو 2015). "بيولوجيا غير عادية عبر مجموعة تضم أكثر من 15% من نطاق البكتيريا" . مجلة نيتشر . 523 (7559): 208-211 . Bibcode : 2015Natur.523..208B . doi : 10.1038/nature14486 . ISSN 0028-0836 . OSTI 1512215 . PMID 26083755 . S2CID 4397558 .     
  37. ↑ شواري، راكيا؛ لو باسلييه، دينيس؛ دوغا، كاثرين؛ دايغلين، باتريك؛ فايسنباخ، جان؛ صغير، عبد الغني (أبريل 2005). " شعبة بكتيرية رئيسية جديدة مرشحة داخل هاضم الحمأة اللاهوائية البلدية" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 71 (4): 2145-2153 . Bibcode : 2005ApEnM..71.2145C . doi : 10.1128/aem.71.4.2145-2153.2005 . ISSN 0099-2240 . PMC 1082523. PMID 15812049 .   
  38. 1 2 هوغ، لورا أ.؛ توماس، برايان س.؛ شارون، إيتاي؛ براون، كريستوفر ت.؛ شارما، ريتين؛ هيتيتش، روبرت ل.؛ ويلكينز، مايكل ج.؛ ويليامز، كينيث هـ.؛ سينغ، أندريا؛ بانفيلد، جيليان ف. (2016). " ترتبط الوظائف البيوجيوكيميائية الحيوية في باطن الأرض ببكتيريا من شعب جديدة وسلالات قليلة الدراسة" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 18 (1): 159-173 . Bibcode : 2016EnvMi..18..159H . doi : 10.1111/ 1462-2920.12930 . ISSN 1462-2920 . OSTI 1328276. PMID 26033198. S2CID 43160538 .    
  39. 1 2 جي، موكان؛ جريننج ، كريس. فانونترجيم، إنكا؛ كارير، كارلو ر. باي، شون ك.؛ ستين، جايسون أ. مونتغمري، كيت؛ خطوط، توماس؛ بيردال، جون. فان دورست، جوزي؛ سناب ، إيان (ديسمبر 2017). "الغازات النزرة في الغلاف الجوي تدعم الإنتاج الأولي في التربة السطحية الصحراوية في القطب الجنوبي" . طبيعة . 552 (7685): 400– 403. بيب كود : 2017Natur.552..400J . دوى : 10.1038 / طبيعة 25014 . اتش دي ال : 2440/124244 . ردمك 1476-4687 . بميد 29211716 .  
  40. يوسف ، نهى ح.؛ فرج، إبراهيم ف.؛ هان، س . رايان؛ بريماثيلاكي، هاسيثا؛ فراي، إميلي؛ هارت، ماثيو؛ هوفاكر، كريستال؛ بيرد، إدوارد؛ هامبرايت، جيمري؛ هوف، ووتر د.؛ الشاهد، مصطفى س. (1 يناير 2019). "كانديداتوس كرومولزيباكتيريوم زودليتونينس، جنس جديد، نوع جديد، أول ممثل لشعبة كرومولزيباكتيريوتا المرشحة، تم استخلاصه من نبع كبريتي لاهوائي باستخدام الميتاجينوميات المُحَلَّلة جينوميًا". علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . تصنيف البكتيريا والعتائق غير المستزرعة. 42 (1): 85-93 . Bibcode : 2019SyApM..42...85Y . doi : 10.1016/j.syapm.2018.11.002 . ISSN 0723-2020 . PMID 30477901 .  
  41. ↑ نوغاليس، بالبينا؛ مور، إدوارد آر بي؛ لوبيت-بروسا، إنريكي؛ روسيلو-مورا، رامون؛ أمان، رودولف؛ تيميس، كينيث إن. (1 أبريل 2001). "الاستخدام المشترك للحمض النووي الريبوزي 16S والحمض النووي الريبوزي 16S لدراسة المجتمع البكتيري في التربة الملوثة بثنائي الفينيل متعدد الكلور" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 67 (4): 1874-1884 . Bibcode : 2001ApEnM..67.1874N . doi : 10.1128/AEM.67.4.1874-1884.2001 . ISSN 0099-2240 . PMC 92809. PMID 11282645 .   
  42. ↑ وارد، لويس م.؛ كاردونا، تاناي؛ هولاند-موريتز، هانا (2019). "الآثار التطورية للنمو الضوئي اللاهوائي في شعبة البكتيريا كانديداتوس إريميوباكتروتا (WPS-2)" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 10 1658. bioRxiv 10.1101/534180 . doi : 10.3389/fmicb.2019.01658 . PMC 6664022 .  
  43. ^ نيتل، كاترين. بوتيوس، أنتجي؛ ليمكي، أندرياس؛ إيلرز، هايك؛ لوكتي، كارين؛ بفانكوتشي، أولاف؛ لينك، بيتر؛ أمان ، رودولف (يوليو 2003). “نشاط وتوزيع وتنوع مخفضات الكبريتات والبكتيريا الأخرى في الرواسب فوق هيدرات الغاز (هامش كاسكاديا، أوريغون)”. مجلة علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية . 20 (4): 269–294 . بيب كود : 2003GmbJ...20..269K . دوى : 10.1080/01490450303896 . اتش دي ال : 21.11116/0000-0001-D20F-2 . ISSN 0149-0451 . S2CID 140639772 .  
  44. 1 2 لي، روث إي.؛ هاريس، ج. كيرك؛ ويلكوكس، جوشوا؛ سبير، جون ر.؛ ميلر، سكوت ر.؛ بيبوت، براد م.؛ ماريسكا، جوليا أ.؛ براينت، دونالد أ.؛ سوغين، ميتشل ل.؛ بيس، نورمان ر. (1 مايو 2006). "التنوع والتعقيد غير المتوقعين للطبقة الميكروبية شديدة الملوحة في غيريرو نيغرو" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 72 (5): 3685-3695 . Bibcode : 2006ApEnM..72.3685L . doi : 10.1128/AEM.72.5.3685-3695.2006 . ISSN 0099-2240 . PMC 1472358 . PMID 16672518 .   
  45. ↑ الجرمازي، سوندا؛ ديجلين، باتريك؛ دوجا، كاثرين. ريفيير، دلفين؛ بوشيز، تيودور؛ جودون، جان جاك؛ جياباي، غابور؛ صغير، عبد الغني؛ بيليتييه، إريك؛ فايسينباخ، جان؛ لو باسلييه ، دينيس (أغسطس 2008). "اكتشاف وتوصيف تقسيم مرشح بكتيري جديد من خلال النهج الميتاجينومي لهضم الحمأة اللاهوائية" . علم الأحياء الدقيقة البيئي . 10 (8): 2111–2123 . بيب كود : 2008EnvMi..10.2111G . دوى : 10.1111/j.1462-2920.2008.01632.x . ردمك 1462-2912 . بمك 2702496 . PMID 18459975 .   
  46. ↑ إيلوي-فادروش، إميلي أ.؛ بايز-إسبينو، ديفيد؛ جاريت، جيسيكا؛ دنفيلد، بيتر ف.؛ هيدلوند، برايان ب.؛ ديكاس، آن إي.؛ جراسبي، ستيفن إي.؛ برادي، أليسون ل.؛ دونغ، هايليانغ؛ بريغز، براندون ر.؛ لي، وين-جون (27 يناير 2016). "مسح ميتاجينومي عالمي يكشف عن شعبة بكتيرية مرشحة جديدة في الينابيع الحرارية الأرضية" . نيتشر كوميونيكيشنز . 7 (1) 10476. Bibcode : 2016NatCo...710476E . doi : 10.1038/ncomms10476 . ISSN 2041-1723 . PMC 4737851. PMID 26814032 .   
  47. ^ "بكتيريا Candidatus Magasanikbacteria (شعبة)" . نكبي .
  48. ↑ دي رينزي، سارة سي؛ شارون، إيتاي؛ رايتون، كيلي سي؛ كورين، عمري؛ هوغ، لورا إيه؛ توماس، برايان سي؛ غودريتش، جوليا كيه؛ بيل، جوردانا تي؛ سبيكتور، تيموثي دي؛ بانفيلد، جيليان إف؛ لي، روث إي (1 أكتوبر 2013). "تحتوي أمعاء الإنسان والمياه الجوفية على بكتيريا غير ضوئية تنتمي إلى شعبة مرشحة جديدة شقيقة للبكتيريا الزرقاء" . eLife . 2 e01102 . doi : 10.7554/eLife.01102 . ISSN 2050-084X . PMC 3787301. PMID 24137540 .   
  49. ↑ هوغنهولتز، فيليب؛ غوبل، بريت م.؛ بيس، نورمان ر. (15 ديسمبر 1998). "تأثير الدراسات غير المعتمدة على الاستزراع على النظرة التطورية الناشئة للتنوع البكتيري" . مجلة علم البكتيريا . 180 (24): 4765-74 . Bibcode : 1998JBact.180.6793H . doi : 10.1128/jb.180.24.6793-6793.1998 . ISSN 1098-5530 . PMC 107498. PMID 9733676 .   
  50. ↑ سيكيجوتشي، يوجي؛ أوهاشي، أكيكو؛ باركس، دونوفان هـ.؛ ياماوتشي، توشيهيرو؛ تايسون، جين و.؛ هوجينهولتز، فيليب (27 يناير 2015). " أولى الرؤى الجينومية حول أعضاء شعبة بكتيرية مرشحة مسؤولة عن انتفاخ مياه الصرف الصحي" . PeerJ . 3 e740. Bibcode : 2015PeerJ...3.e740S . doi : 10.7717/peerj.740 . ISSN 2167-8359 . PMC 4312070. PMID 25650158 .   
  51. ↑ هولمز، أندرو جيه؛ توجولا، نينا أ؛ هولي، ماريتا؛ كونتوس، أناليزا؛ جيمس، جوليا م؛ روجرز، بيتر؛ جيلينجز، مايكل ر. (2001). "البنية التطورية للتكوينات الميكروبية المائية غير العادية في كهوف نولاربور، أستراليا". علم الأحياء الدقيقة البيئية . 3 (4): 256-264 . Bibcode : 2001EnvMi...3..256H . doi : 10.1046/j.1462-2920.2001.00187.x . ISSN 1462-2920 . PMID 11359511 .  
  52. ^ “شعبة “Candidatus Parcunitrobacteria””" . LPSN .
  53. ↑ كاستيل، سيندي جيه؛ براون، كريستوفر تي؛ توماس، برايان سي؛ ويليامز، كينيث إتش؛ بانفيلد، جيليان إف (9 يناير 2017). "سعة تنفسية غير عادية واستقلاب النيتروجين في بكتيريا باركيوبكتيريوم (OD1) من شعبة الإشعاع المرشحة" ( ملف PDF) . التقارير العلمية . 7 (1) 40101. Bibcode : 2017NatSR...740101C . doi : 10.1038/srep40101 . ISSN 2045-2322 . PMC 5220378. PMID 28067254 .   
  54. ↑ أستوديلو-غارسيا، كارمن؛ سلابي، بيات م.؛ وايت، ديفيد و.؛ باير، كريستينا؛ هينتشل، أوتي؛ تايلور، مايكل و. (2018). "علم الوراثة وعلم الجينوم لسلالة SAUL البكتيرية الغامضة، والتي ترتبط غالبًا بالإسفنج البحري" (ملف PDF) . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 20 (2): 561-576 . Bibcode : 2018EnvMi..20..561A . doi : 10.1111/1462-2920.13965 . ISSN 1462-2920 . PMID 29098761. S2CID 23892350 .   
  55. ↑ رايتون، كيه سي؛ توماس، بي سي؛ شارون، آي؛ ميلر، سي إس؛ كاستيل، سي جيه؛ فيربيركموس، إن سي؛ ويلكينز، إم جيه؛ هيتيتش، آر إل؛ ليبتون، إم إس؛ ويليامز، كيه إتش؛ لونغ، بي إي (27 سبتمبر 2012). "التخمر، واستقلاب الهيدروجين والكبريت في العديد من شعب البكتيريا غير المستزرعة". مجلة ساينس . 337 (6102): 1661-1665 . رمز Bibcode : 2012Sci...337.1661W . doi : 10.1126 / science.1224041 . ISSN 0036-8075 . PMID 23019650. S2CID 10362580 .   
  56. ^ "بكتيريا Candidatus Peregrinibacteria (شعبة)" . نكبي .
  57. ^ "التصنيف - بكتيريا Candidatus Peregrinibacteria (PHYLUM)" . يونيبروت .
  58. ↑ أنانثارامان، كارتيك؛ براون، كريستوفر ت.؛ بورستين، ديفيد؛ كاستيل، سيندي ج.؛ بروبست، ألكسندر ج.؛ توماس، برايان س.؛ ويليامز، كينيث هـ.؛ بانفيلد، جيليان ف. (28 يناير 2016). "تحليل خمسة تسلسلات جينومية كاملة لأفراد من فئة البكتيريا المحيطة بالبكتيريا (Peribacteria) ضمن شعبة البكتيريا Peregrinibacteria التي تم التعرف عليها مؤخرًا" . PeerJ . 4 e1607 . Bibcode : 2016PeerJ...4e1607A . doi : 10.7717/peerj.1607 . ISSN 2167-8359 . PMC 4736985. PMID 26844018 .   
  59. ↑ فيزلر، لارس؛ هورن، ماتياس؛ فاغنر، مايكل؛ هينتشل، أوتي (يونيو 2004). "اكتشاف شعبة مرشحة جديدة "بوريبكتيريا" في الإسفنج البحري" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 70 (6): 3724-3732 . Bibcode : 2004ApEnM..70.3724F . doi : 10.1128/AEM.70.6.3724-3732.2004 . ISSN 0099-2240 . PMC 427773. PMID 15184179 .   
  60. ^ يجاند ، ساندرا. جوجلر، ماريكي؛ كون، تيمو؛ أوال، رام براساد؛ أوبيربيكمان، سونيا؛ كيسي، كاتارينا؛ جيسكي، أولغا؛ شومان، بيتر. بيترز ، ستيجن هـ. (24 أكتوبر 2019). “الرواية البكتيرية المتغيرة الشكل Saltatorellota”. بيوركسيف 10.1101/817700 . 
  61. ↑ ديركشاني، مانيجي؛ لوكو، توماس؛ ليساك، فيرنر (1 فبراير 2001). "سلالات بكتيرية جديدة على مستوى (الشعبة الفرعية) كما تم الكشف عنها من خلال استخلاص جينات 16S rRNA المستهدفة بالنيوكليوتيدات المميزة من التربة السائبة وجذور الأرز في بيئات مصغرة للأرز المغمور بالمياه" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 67 (2): 623-631 . Bibcode : 2001ApEnM..67..623D . doi : 10.1128/aem.67.2.623-631.2001 . ISSN 1098-5336 . PMC 92629. PMID 11157225 .   
  62. ↑ كادنيكوف، فيتالي ف.؛ ماردانوف، أندريه ف.؛ بيليتسكي، أليكسي ف.؛ راكيتين، أندريه ل.؛ فرانك، يوليا أ.؛ كارناتشوك، أولغا ف.؛ رافين، نيكولاي ف. (يناير 2019). "التطور والفيزيولوجيا لشعبة BRC1 المرشحة المستنتجة من أول جينوم كامل مُجمَّع من الميتاجينوم تم الحصول عليه من طبقة مياه جوفية عميقة". علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . 42 (1): 67-76 . Bibcode : 2019SyApM..42...67K . doi : 10.1016/j.syapm.2018.08.013 . ISSN 1618-0984 . PMID 30201528. S2CID 52183718 .   
  63. ↑ بيكر، بريت جيه؛ لازار، كاساندري سارة؛ تيسكي، أندرياس ب؛ ديك، غريغوري جيه (13 أبريل 2015). " التحليل الجينومي للروابط في دورة الكربون والنيتروجين والكبريت بين بكتيريا رواسب مصبات الأنهار واسعة الانتشار" . ميكروبيوم . 3 (1): 14. doi : 10.1186/s40168-015-0077-6 . ISSN 2049-2618 . PMC 4411801. PMID 25922666 .   
  64. ↑ ويلسون، مايكل سي؛ موري، تيتسوشي؛ روكيرت، كريستيان؛ أوريا، أغوستينوس ر؛ هيلف، ماكسيميليان ج؛ تاكادا، كينتارو؛ وآخرون . (6 فبراير 2014). "مجموعة بكتيرية بيئية ذات نطاق أيضي واسع ومتميز" (ملف PDF) . مجلة نيتشر . 506 (7486): 58-62 . Bibcode : 2014Natur.506...58W . doi : 10.1038/nature12959 . ISSN 0028-0836 . PMID 24476823 .   
  65. ↑ بروبست، أ. ج.؛ كاستيل، س. ج.؛ سينغ، أ.؛ براون، س. ت.؛ أنانثارامان، ك.؛ شارون، إ.؛ هوغ، ل. أ.؛ بورستين، د.؛ إيمرسون، ج. ب.؛ توماس، ب. س.؛ بانفيلد، ج. ف. (فبراير 2017). "التحليل الجينومي لمجتمع طبقة المياه الجوفية الباردة يوفر رؤى أيضية لميكروبات جديدة متكيفة مع تركيزات عالية من ثاني أكسيد الكربون" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 19 (2): 459-474 . Bibcode : 2017EnvMi..19..459P . doi : 10.1111 / 1462-2920.13362 . OSTI 1567074. PMID 27112493. S2CID 21126011 .   
  66. ↑ كاستيل، سيندي جيه؛ هوغ، لورا أ؛ رايتون، كيلي سي؛ توماس، برايان سي؛ ويليامز، كينيث إتش؛ وو، دونغينغ؛ ترينج، سوزانا جي؛ سينغر، ستيفن دبليو؛ آيزن، جوناثان أ؛ بانفيلد، جيليان إف. (27 أغسطس 2013). "تنوع وراثي استثنائي ومرونة أيضية في رواسب طبقات المياه الجوفية" . نيتشر كوميونيكيشنز . 4 (1): 2120. Bibcode : 2013NatCo...4.2120C . doi : 10.1038 / ncomms3120 . ISSN 2041-1723 . PMC 3903129. PMID 23979677 .   
  67. ↑ "LPSN - قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية" . lpsn.dsmz.de .
  68. ↑ كاستيل سي جيه، بانفيلد جيه إف (مارس 2018). "مجموعات ميكروبية جديدة رئيسية توسع التنوع وتغير فهمنا لشجرة الحياة" . مجلة الخلية . 172 (6): 1181-1197 . doi : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741 . 
  69. ↑ كاستيل، سيندي جيه؛ بانفيلد، جيليان إف. (8 مارس 2018). "مجموعات ميكروبية جديدة رئيسية توسع التنوع وتغير فهمنا لشجرة الحياة" . مجلة الخلية . 172 (6): 1181-1197 . doi : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . ISSN 0092-8674 . PMID 29522741 .  
  70. 1 2 3 سيكيجوتشي وآخرون (2015). "أولى الرؤى الجينومية حول أعضاء شعبة بكتيرية مرشحة مسؤولة عن انتفاخ مياه الصرف الصحي" . PeerJ . 3 e740 . Bibcode : 2015PeerJ...3.e740S . doi : 10.7717/peerj.740 . PMC 4312070. PMID 25650158 .   
  71. 1 2 يارزا وآخرون (2014). "توحيد تصنيف البكتيريا والعتائق المستزرعة وغير المستزرعة باستخدام تسلسلات جين 16S rRNA". مجلة Nature Reviews Microbiology . 12 (9): 635-645 . doi : 10.1038/nrmicro3330 . hdl : 10261/123763 . PMID 25118885. S2CID 21895693 .   
  72. ↑ هوغ إل إيه وآخرون (2016). "نظرة جديدة لشجرة الحياة" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . المقالة 16048 (5) 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID 27572647 .  
  73. 1 2 باتيستوزي، ف. يو.، فيجاو، أ.، هيدجز، س. ب. (نوفمبر 2004). "مقياس زمني جينومي لتطور بدائيات النوى: رؤى حول أصل إنتاج الميثان، والتغذية الضوئية، واستيطان اليابسة" . مجلة بي إم سي لعلم الأحياء التطوري . 4 44. doi : 10.1186/1471-2148-4-44 . PMC 533871. PMID 15535883 .  
  74. ↑ باتيستوزي، ف. يو.؛ هيدجز، س. ب. (6 نوفمبر 2008). "مجموعة رئيسية من بدائيات النوى ذات تكيفات قديمة للحياة على اليابسة". علم الأحياء الجزيئي والتطور . 26 (2): 335-343 . doi : 10.1093/molbev/msn247 . PMID 18988685 . 
  75. ↑ شلوينزن وآخرون (2000). "بنية الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة المنشطة وظيفيًا بدقة 3.3 أنغستروم" . الخلية . 102 (5): 615-23 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00084-2 . PMID 11007480. S2CID 1024446 .   
  76. 1 2 ووز، سي آر (1987). " التطور البكتيري" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 51 (2): 221-71 . doi : 10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987 . PMC 373105. PMID 2439888 .  
  77. ↑ هولاند ل (22 مايو 1990). "كارل ووز في طليعة ثورة تطور البكتيريا" . مجلة العالم . 3 (10).
  78. ↑ ستاك براندت وآخرون (1988). "Proteobacteria classis nov.، اسم للتصنيف الوراثي الذي يشمل "البكتيريا الأرجوانية وأقاربها" " . Int. J. Syst. Bacteriol . 38 (3): 321– 325. doi : 10.1099/00207713-38-3-321 .
  79. ↑ هوغنهولتز، ب.؛ تايسون، ج. و.؛ ويب، ر. إ.؛ فاغنر، أ. م.؛ بلاكول، ل. ل. (2001). "دراسة الشعبة المرشحة TM7، وهي سلالة رئيسية تم التعرف عليها مؤخرًا من نطاق البكتيريا، ولا يوجد لها ممثلون معروفون في المزارع النقية" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 67 (1): 411-419 . Bibcode : 2001ApEnM..67..411H . doi : 10.1128/AEM.67.1.411-419.2001 . PMC 92593. PMID 11133473 .  
  80. ↑ يابي، س.؛ أيبا، ي.؛ ساكاي، ي.؛ هازاكا، م.؛ يوكوتا، أ. (2010). " عزل نوعين جديدين من البكتيريا ، Thermogemmatispora onikobensis gen. nov., sp. nov. و Thermogemmatispora foliorum sp. nov.، من أوراق متساقطة على تربة حرارية أرضية، ووصف عائلة Thermogemmatisporaceae fam. nov. ورتبة Thermogemmatisporales ord. nov. ضمن فئة Ktedonobacteria" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 61 (4): 903-910 . doi : 10.1099/ijs.0.024877-0 . PMID 20495028 . 
  81. ↑ سوتكليف، آي سي (2011). "بنية غلاف الخلية في بكتيريا الكلوروفليكسي: خط جبهة متغيّر في صراع تطوري على النفوذ". علم الأحياء الدقيقة البيئية . 13 (2): 279-282 . Bibcode : 2011EnvMi..13..279S . doi : 10.1111/j.1462-2920.2010.02339.x . PMID 20860732 . 
  82. 1 2 ستاكبراندت، إي.؛ ريني، إف. إيه.؛ وارد-ريني، إن. إل. (1997). "مقترح لنظام تصنيف هرمي جديد، Actinobacteria classis nov" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 47 (2): 479-491 . doi : 10.1099/00207713-47-2-479 .
  83. ↑ جيه بي يوزيبي. "قائمة بأسماء بدائيات النوى ذات مكانة في التسمية: تصنيف دايينوكوكوس-ثيرموس" . مؤرشف من الأصل في 27 يناير 2013. تم الاطلاع عليه في 30 ديسمبر 2010 .
  84. ↑ بون، ديفيد ر.؛ كاستنهولز، ريتشارد و.؛ غاريتي، جورج م.، محرران. (2001). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . doi : 10.1007/978-0-387-21609-6 (غير نشط في 30 يناير 2026). ISBN 978-1-4419-3159-7. S2CID 41426624 . {{cite book}}: صيانة CS1: تم تعطيل DOI اعتبارًا من يناير 2026 ( رابط )
  85. ↑ كافاليير-سميث، ت. (2002). "الأصل النيوموري للبكتيريا القديمة، والجذر النيجيبكتيري للشجرة العالمية والتصنيف الضخم للبكتيريا" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 52 (الجزء 1): 7-76 . Bibcode : 2002IJSEM..52....7C . doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 . 
  86. ↑ "قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية - فئة هادوباكتيريا" . LPSN . مؤرشف من الأصل في 19 أبريل 2012. تم الاسترجاع في 30 ديسمبر 2010 .يوزيبي، جيه بي (1997). "قائمة بأسماء البكتيريا المعتمدة في التسمية: ملف متاح على الإنترنت" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 47 (2): 590-592 . doi : 10.1099/00207713-47-2-590 . ISSN 0020-7713 . PMID 9103655 .  
  87. ↑ بون، د. ر.؛ كاستنهولز، ر. و. (18 مايو 2001) [1984 (ويليامز وويلكنز)]. غاريتي، ج. م. (محرر). العتائق والبكتيريا المتفرعة بعمق والبكتيريا الضوئية . دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا. المجلد 1 ( الطبعة الثانية). نيويورك: سبرينغر. ص 721. ISBN    978-0-387-98771-2رقم المكتبة البريطانية: GBA561951.
  88. ↑ أولسن جي جي، ووز سي آر، أوفربيك آر (1994). "رياح التغيير (التطوري): بث روح جديدة في علم الأحياء الدقيقة" . مجلة علم البكتيريا . 176 (1): 1-6 . doi : 10.2172/205047 . PMC 205007. PMID 8282683 .