الصيغة البنائية

الصيغة الهيكلية لفيتامين ب 12 . العديد من الجزيئات العضوية معقدة للغاية بحيث لا يمكن تحديدها بصيغة جزيئية .

الصيغة البنائية للمركب الكيميائي هي تمثيل بياني للبنية الجزيئية (المحددة بأساليب الكيمياء البنائية )، توضح كيفية ارتباط الذرات ببعضها البعض. [ 1 ] كما تُظهر الروابط الكيميائية داخل الجزيء، سواءً بشكل صريح أو ضمني. على عكس أنواع الصيغ الكيميائية الأخرى، [ أ ] التي تحتوي على عدد محدود من الرموز وقدرتها الوصفية محدودة، توفر الصيغ البنائية تمثيلاً هندسيًا أكثر اكتمالاً للبنية الجزيئية. على سبيل المثال، توجد العديد من المركبات الكيميائية في أشكال متماثلة مختلفة ، لها بنى متماثلة ضوئيًا مختلفة ولكن لها نفس الصيغة الجزيئية . هناك طرق متعددة لرسم هذه الصيغ البنائية، مثل: تراكيب لويس ، والصيغ المكثفة، والصيغ الهيكلية ، وإسقاطات نيومان ، وتشكيلات سيكلوهكسان ، وإسقاطات هاوورث ، وإسقاطات فيشر . [ 3 ]

تُستخدم العديد من أنظمة التسمية الكيميائية المنهجية ، كما هو الحال في قواعد البيانات الكيميائية ، والتي تُعادل البنى الهندسية في فعاليتها وقوتها. تشمل هذه الأنظمة SMILES و InChI و CML . يمكن تحويل هذه الأسماء الكيميائية المنهجية إلى صيغ بنائية والعكس، ولكن الكيميائيين يصفون التفاعلات الكيميائية أو عمليات التخليق باستخدام الصيغ البنائية بدلاً من الأسماء الكيميائية، لأن الصيغ البنائية تُمكّن الكيميائي من تصور الجزيئات والتغيرات البنيوية التي تطرأ عليها أثناء التفاعلات الكيميائية. يُعدّ برنامجا ChemSketch و ChemDraw من البرامج/المواقع الإلكترونية الشائعة التي تُمكّن المستخدمين من رسم التفاعلات والصيغ البنائية، عادةً بأسلوب بنية لويس.

الهياكل في الصيغ البنائية

السندات

تُصوَّر الروابط عادةً بخط يصل بين ذرتين. يشير خط واحد إلى رابطة أحادية ، وخطان إلى رابطة ثنائية ، وثلاثة خطوط إلى رابطة ثلاثية . في بعض الصيغ، تُحدَّد الذرات الواقعة بين كل رابطة وتُوضَّح. مع ذلك، في بعض الصيغ الأخرى، لا تُكتب جزيئات الكربون صراحةً، بل يُشار إليها بزاوية تتشكل عند التقاء خطين. إضافةً إلى ذلك، تُستدل على وجود ذرات الهيدروجين ضمنيًا، ولا تُرسم عادةً. يُمكن استنتاج وجودها بناءً على عدد الذرات الأخرى المرتبطة بها. على سبيل المثال، إذا كانت ذرة الكربون A مرتبطة بذرة كربون B، فسيكون لذرة الكربون A ثلاث ذرات هيدروجين لإكمال غلافها الإلكتروني الخارجي (ثمانية إلكترونات). [ 4 ]

يوضح هذا الروابط فيما يتعلق بالإلكترونات التي يتم مشاركتها.
يوضح هذا كيف يتم تصوير الروابط للربط مع الذرات الأخرى في الصيغ الهيكلية المختلفة المستخدمة.

الإلكترونات

الشحنات على الذرات وتكوينها

تُمثل الإلكترونات عادةً بدوائر ملونة. تشير دائرة واحدة إلى إلكترون واحد، بينما تشير دائرتان إلى زوج من الإلكترونات. عادةً، يشير زوج الإلكترونات أيضًا إلى شحنة سالبة. باستخدام الدوائر الملونة، يُشار إلى عدد الإلكترونات في غلاف التكافؤ لكل ذرة، مما يوفر معلومات وصفية إضافية حول قدرة تلك الذرة على التفاعل في الجزيء. [ 4 ]

رسوم

في كثير من الأحيان، تحمل الذرات شحنة موجبة أو سالبة لأن غلافها الخارجي قد لا يكون مكتملاً. إذا كانت الذرة تفتقر إلى زوج من الإلكترونات أو تحتوي على بروتون، فإنها تحمل شحنة موجبة. أما إذا كانت الذرة تحتوي على إلكترونات غير مرتبطة بذرة أخرى، فإنها تحمل شحنة سالبة. في الصيغ البنائية، يُرمز للشحنة الموجبة بالرمز ⊕، وللشحنة السالبة بالرمز ⊖. [ 4 ]

تُظهر هذه الصورة الأشكال الإسفينية في الصيغة البنائية وكيف تشير إلى الكيمياء الفراغية للمركب.

الكيمياء الفراغية (الصيغة الهيكلية)

الصيغة الهيكلية للستريكنين . تشير الرابطة الإسفينية الصلبة التي تُرى على سبيل المثال عند النيتروجين (N) في الأعلى إلى رابطة تشير إلى أعلى المستوى، بينما تشير الرابطة الإسفينية المتقطعة التي تُرى على سبيل المثال عند الهيدروجين (H) في الأسفل إلى رابطة أسفل المستوى.

تُشير طريقة إسقاط ناتا إلى الكيرالية في الصيغ الهيكلية . تُستخدم الكيمياء الفراغية لإظهار الترتيب المكاني النسبي للذرات في الجزيء. تُستخدم الأوتاد لهذا الغرض، وهناك نوعان: متقطع وممتلئ. يشير الوتد الممتلئ إلى أن الذرة تقع في مقدمة الجزيء؛ أي أنها تشير إلى أعلى مستوى الورقة باتجاه الأمام. بينما يشير الوتد المتقطع إلى أن الذرة تقع خلف الجزيء؛ أي أنها تشير إلى أسفل مستوى الورقة. عند استخدام خط مستقيم غير متقطع، تكون الذرة في مستوى الورقة. يُعطي هذا الترتيب المكاني فكرة عن الجزيء في فضاء ثلاثي الأبعاد، وهناك قيود على كيفية ترتيب هذه الذرات. [ 4 ]

الكيمياء الفراغية غير المحددة

الفركتوز ، برابطة عند مجموعة الهيدروكسيل (OH) في أعلى يسار الصورة، مع كيمياء فراغية غير معروفة أو غير محددة.

تمثل الروابط الأحادية المتموجة كيمياء فراغية غير معروفة أو غير محددة ، أو خليطًا من المتصاوغات. على سبيل المثال، يُظهر الرسم التخطيطي المجاور جزيء الفركتوز برابطة متموجة مع مجموعة HOCH₂⁻ على اليسار. في هذه الحالة ، يكون تركيبا الحلقة المحتملان في حالة توازن كيميائي مع بعضهما البعض، وكذلك مع التركيب ذي السلسلة المفتوحة. تنفتح الحلقة وتُغلق تلقائيًا، فتُغلق أحيانًا بإحدى الكيمياء الفراغية وأحيانًا بالأخرى.

يمكن للصيغ الهيكلية أن تُمثل المتصاوغات سيس وترانس للألكينات. تُعد الروابط الأحادية المتموجة الطريقة القياسية لتمثيل الكيمياء الفراغية غير المعروفة أو غير المحددة أو خليط من المتصاوغات (كما هو الحال مع المراكز الفراغية رباعية الأوجه). وقد استُخدمت الرابطة الثنائية المتقاطعة في بعض الأحيان، ولكنها لم تعد تُعتبر أسلوبًا مقبولًا للاستخدام العام. [ 5 ]

الكيمياء الفراغية للألكين

هياكل لويس

تمثيل الجزيئات بواسطة بنية لويس

تُعدّ تراكيب لويس (أو "تراكيب لويس النقطية") صيغًا بيانية ثنائية الأبعاد تُظهر ترابط الذرات والإلكترونات غير المزدوجة ، ولكنها لا تُظهر البنية ثلاثية الأبعاد. يُستخدم هذا الترميز غالبًا للجزيئات الصغيرة. يُمثل كل خط إلكترونين في رابطة أحادية . ويمثل خطان أو ثلاثة خطوط متوازية بين أزواج الذرات روابط ثنائية أو ثلاثية، على التوالي. كما يُمكن استخدام أزواج من النقاط لتمثيل أزواج الروابط. بالإضافة إلى ذلك، تُشير هذه التراكيب إلى جميع الإلكترونات غير المرتبطة (المزدوجة أو غير المزدوجة) وأي شحنات رسمية على الذرات. من خلال استخدام تراكيب لويس ، يُتيح تحديد مواقع الإلكترونات، سواء كانت في رابطة أو في أزواج غير مزدوجة ، تحديد الشحنات الرسمية للذرات في الجزيء لفهم استقراره وتحديد الجزيء الأكثر احتمالًا (بناءً على اختلاف الهندسة الجزيئية ) الذي سيتكون في التفاعل. تُراعي تراكيب لويس هندسة الجزيء، حيث تُرسَم الروابط غالبًا بزوايا مُحددة لتمثيل الجزيء في الواقع. يُعدّ تركيب لويس الأنسب لحساب الشحنات الرسمية أو كيفية ارتباط الذرات ببعضها، حيث يُظهر كلاً من الإلكترونات والروابط. كما يُعطي تركيب لويس فكرة عن الهندسة الجزيئية والإلكترونية التي تختلف باختلاف وجود الروابط والأزواج الإلكترونية الحرة، ومن خلاله يُمكن تحديد زوايا الروابط والتهجين أيضًا.

الصيغ المختصرة

في منشورات الكيمياء العضوية المبكرة، حيث كان استخدام الرسومات محدودًا للغاية، ظهر نظام طباعي لوصف التراكيب العضوية في سطر نصي. ورغم أن هذا النظام يميل إلى أن يكون إشكاليًا عند تطبيقه على المركبات الحلقية، إلا أنه لا يزال وسيلة ملائمة لتمثيل التراكيب البسيطة.

CH3CH2OH ( إيثانول )

تُستخدم الأقواس للإشارة إلى مجموعات متطابقة متعددة، مما يدل على ارتباطها بأقرب ذرة غير هيدروجينية على اليسار عند ظهورها داخل الصيغة، أو بالذرة الموجودة على اليمين عند ظهورها في بداية الصيغة:

(CH 3 ) 2 CHOH أو CH(CH 3 ) 2 OH ( 2-بروبانول )

في جميع الحالات، تُعرض جميع الذرات، بما في ذلك ذرات الهيدروجين. ومن المفيد أيضًا إظهار مجموعات الكربونيل حيث يُستدل على وجود الرابطة C=O من خلال وضع ذرة الأكسجين بين قوسين. على سبيل المثال:

CH3C ( O) CH3 ( أسيتون )

لذا، من المهم النظر إلى يسار الذرة داخل القوسين للتأكد من الذرة التي ترتبط بها. يُفيد هذا عند التحويل من الصيغة المكثفة إلى صيغة بنائية أخرى، مثل الصيغة الهيكلية أو بنية لويس . توجد طرق مختلفة لتمثيل المجموعات الوظيفية في الصيغ المكثفة، مثل الألدهيدات (CHO ) ، والأحماض الكربوكسيلية (CO₂H أو COOHوالإسترات ( CO₂R أو COOR ) . مع ذلك، لا تُعطي الصيغ المكثفة فكرة مباشرة عن الشكل الجزيئي للمركب أو عدد الروابط بين ذرات الكربون، بل يجب تحديد ذلك بناءً على عدد الذرات المرتبطة بذرات الكربون ، وما إذا كانت هناك أي شحنات عليها. [ 6 ]

الصيغ الهيكلية

تُعدّ الصيغ الهيكلية الترميز القياسي للجزيئات العضوية الأكثر تعقيدًا. في هذا النوع من المخططات، الذي استخدمه لأول مرة الكيميائي العضوي فريدريك أوغست كيكوليه فون سترادونيتز ، [ 7 ] يُفترض وجود ذرات الكربون عند رؤوس (زوايا) ونهايات القطع المستقيمة، بدلًا من الإشارة إليها بالرمز الذري C. لا تُذكر ذرات الهيدروجين المرتبطة بذرات الكربون، إذ يُفترض أن كل ذرة كربون مرتبطة بعدد كافٍ من ذرات الهيدروجين لتكوين أربع روابط. وجود شحنة موجبة أو سالبة على ذرة الكربون يحل محل إحدى ذرات الهيدروجين المفترضة. يجب كتابة ذرات الهيدروجين المرتبطة بذرات أخرى غير الكربون بشكل صريح. من الميزات الإضافية للصيغ الهيكلية أنه بإضافة بعض التراكيب ، يمكن تحديد الكيمياء الفراغية ، أي البنية ثلاثية الأبعاد، للمركب. في كثير من الأحيان، يمكن للصيغة الهيكلية الإشارة إلى الكيمياء الفراغية باستخدام الأوتاد بدلًا من الخطوط. تمثل الأوتاد الصلبة الروابط التي تشير إلى أعلى مستوى الورقة، بينما تمثل الأوتاد المتقطعة الروابط التي تشير إلى أسفل المستوى.

رسومات منظور

إسقاط نيومان وإسقاط الحامل المنشاري

يُستخدم إسقاط نيومان وإسقاط الحامل لتصوير متماثلات محددة أو لتمييز التكوين الفراغي المتجاور . في كلتا الحالتين، تُركز الدراسة على ذرتي كربون محددتين والرابطة التي تربطهما. الفرق الوحيد بينهما هو اختلاف المنظور قليلاً: يُظهر إسقاط نيومان الرابطة مباشرةً، بينما يُظهر إسقاط الحامل الرابطة نفسها من زاوية مائلة نوعًا ما . في إسقاط نيومان، تُستخدم دائرة لتمثيل مستوى عمودي على الرابطة، مما يميز البدائل على ذرة الكربون الأمامية عن تلك الموجودة على ذرة الكربون الخلفية. أما في إسقاط الحامل، فعادةً ما تكون ذرة الكربون الأمامية على اليسار وأقل ارتفاعًا قليلاً. أحيانًا، يُستخدم سهم للإشارة إلى ذرة الكربون الأمامية. يُشبه إسقاط الحامل الصيغة الهيكلية إلى حد كبير، ويمكنه حتى استخدام أشكال إسفينية بدلًا من الخطوط للإشارة إلى التكوين الفراغي للجزيء. يتميز إسقاط الحامل عن الصيغ الهيكلية بأنه ليس مؤشرًا دقيقًا لهندسة الجزيء وترتيبه. يمكن استخدام كل من إسقاط نيومان وإسقاط سوهورس لإنشاء إسقاط فيشر.

تشكيلات السيكلوهكسان

يمكن تمثيل بعض التشكيلات الفراغية للسيكلوهكسان ومركبات أخرى ذات حلقات صغيرة باستخدام اصطلاح قياسي. على سبيل المثال، يُظهر التشكيل الفراغي القياسي للسيكلوهكسان منظورًا من أعلى مستوى ذرات الكربون بقليل، ويُبين بوضوح المجموعات المحورية ( المتجهة عموديًا لأعلى أو لأسفل) والمجموعات الاستوائية (شبه أفقية، مائلة قليلًا لأعلى أو لأسفل). قد تُبرز الروابط الأمامية بخطوط أو أشكال إسفينية أكثر وضوحًا أو لا. تتطور التشكيلات الفراغية كالتالي: من الكرسي إلى نصف الكرسي إلى القارب الملتوي إلى القارب إلى القارب الملتوي إلى نصف الكرسي إلى الكرسي. يمكن أيضًا استخدام تشكيلات السيكلوهكسان لإظهار طاقة الوضع في كل مرحلة كما هو موضح في الرسم التخطيطي. تتميز تشكيلات الكرسي (أ) بأقل طاقة، بينما تتميز تشكيلات نصف الكرسي (د) بأعلى طاقة. توجد ذروة/قيمة عظمى محلية في تشكيل القارب (ج)، وتوجد وديان/قيم دنيا محلية في تشكيلات القارب الملتوي (ب). بالإضافة إلى ذلك، يمكن استخدام تشكيلات السيكلوهكسان للإشارة إلى ما إذا كان الجزيء يحتوي على أي تفاعلات ثنائية المحور 1،3، وهي تفاعلات فراغية بين البدائل المحورية على ذرات الكربون 1 و3 و5. [ 8 ]

شكل الكرسي لبيتا-دي-جلوكوز
أشكال السيكلوهكسان وعلاقتها بالطاقة الكامنة عند كل شكل

إسقاط هاوورث

يُستخدم إسقاط هاوورث للسكريات الحلقية . لا يتم التمييز بين المواضع المحورية والاستوائية؛ بدلاً من ذلك، توضع البدائل مباشرةً فوق أو تحت ذرة الحلقة التي ترتبط بها. وعادةً ما تُحذف بدائل الهيدروجين.

مع ذلك، من المهم أن نضع في اعتبارنا عند قراءة إسقاط هاوورث أن بنية الحلقات ليست مسطحة. لذا، لا يُظهر إسقاط هاوورث الشكل ثلاثي الأبعاد. كان السير نورمان هاوورث كيميائيًا بريطانيًا حائزًا على جائزة نوبل لأبحاثه حول الكربوهيدرات واكتشافه بنية فيتامين سي. خلال اكتشافه، استنتج أيضًا صيغًا بنائية مختلفة تُعرف الآن باسم إسقاطات هاوورث. في إسقاط هاوورث، يُصوَّر سكر البيرانوز على شكل سداسي، وسكر الفيورانوز على شكل خماسي. عادةً ما توضع ذرة أكسجين في الزاوية العلوية اليمنى في سكر البيرانوز، وفي المنتصف العلوي في سكر الفيورانوز. تشير الروابط الأرق في أعلى الحلقة إلى بُعد الروابط، بينما تشير الروابط الأكثر سمكًا في أسفل الحلقة إلى قرب نهاية الحلقة من المشاهد. [ 9 ]

إسقاط فيشر وهاوورث للجلوكوبيرانوز
إسقاط هاوورث لبيتا-دي-جلوكوز

إسقاط فيشر

يُستخدم إسقاط فيشر في الغالب للسكريات الأحادية الخطية . عند أي ذرة كربون، تُعادل خطوط الروابط العمودية علاماتٍ فراغية متقطعة، مُوجهة بعيدًا عن المُشاهد، بينما تُعادل الخطوط الأفقية علاماتٍ مُتعامدة، مُوجهة نحو المُشاهد. هذا الإسقاط غير واقعي، إذ لا يُمكن للسكريات أن تتخذ هذا التكوين المُتعدد المُتراكب . مع ذلك، يُعد إسقاط فيشر طريقةً بسيطةً لتصوير مراكز فراغية مُتتابعة مُتعددة، لا تتطلب أو تُشير إلى أي معرفة بالتكوين الفعلي. يُقيد إسقاط فيشر الجزيء ثلاثي الأبعاد إلى ثنائي الأبعاد، وبالتالي، توجد قيود على تغيير تكوين المراكز الكيرالية. تُستخدم إسقاطات فيشر لتحديد التكوين R و S على ذرة كربون كيرالية، ويتم ذلك باستخدام قواعد كان-إنجولد-بريلوغ . إنها طريقة مُلائمة لتمثيل المُتَماثِلات المرآتية والمُتَماثِلات الفراغية والتمييز بينها . [ 9 ]

القيود

الصيغة البنائية نموذج مبسط لا يمكنه تمثيل بعض جوانب البنية الكيميائية. على سبيل المثال، قد لا يكون الترابط الرسمي قابلاً للتطبيق على الأنظمة الديناميكية كالروابط غير المتمركزة . تُعدّ الخاصية العطرية مثالاً على ذلك، إذ تعتمد على الاصطلاح لتمثيل الترابط. قد تُمثل أنماط الصيغ البنائية المختلفة الخاصية العطرية بطرق متباينة، مما يؤدي إلى تصويرات مختلفة للمركب الكيميائي نفسه. مثال آخر هو الروابط الثنائية الرسمية ، حيث تنتشر كثافة الإلكترون خارج الرابطة الرسمية، مما يؤدي إلى خاصية الرابطة الثنائية الجزئية وبطء التحول المتبادل عند درجة حرارة الغرفة. بالنسبة لجميع التأثيرات الديناميكية، ستؤثر درجة الحرارة على معدلات التحول المتبادل، وقد تُغير كيفية تمثيل البنية. لا توجد درجة حرارة محددة مرتبطة بالصيغة البنائية، على الرغم من أن الكثيرين يفترضون أنها ستكون درجة الحرارة القياسية .

انظر أيضاً

ملحوظات

  1. الصيغة البنائية هي نوع من أنواع الصيغ الكيميائية. [ 2 ]

مراجع

  1. أولمستيد، جون؛ ويليامز، غريغوري م. (1997). الكيمياء: العلم الجزيئي . جونز وبارتليت ليرنينج. ISBN 978-0-8151-8450-8.
  2. دينيس ديكومان (2022-04-08). "ما هي الصيغ الكيميائية وكيف تُستخدم؟" . Study.com. sec. أمثلة على الصيغ الكيميائية. مؤرشف من الأصل بتاريخ 2022-06-23.
  3. غودوين، دبليو إم (13 أبريل 2007). "الصيغ البنائية وشرحها في الكيمياء العضوية". أسس الكيمياء . 10 (2): 117-127 . doi : 10.1007/s10698-007-9033-2 . ISSN 1386-4238 . S2CID 93952251 .  
  4. 1 2 3 4 براون، ويليام هنري؛ برنت ل. إيفرسون؛ إريك ف. أنسلين؛ كريستوفر س. فوت (2018). الكيمياء العضوية ( الطبعة الثامنة). بوسطن. ISBN  978-1-305-58035-0. OCLC 974377227 . {{cite book}}: CS1 maint: موقع الناشر مفقود ( رابط )
  5. ج. بريشر (2006). "التمثيل البياني للتكوين الفراغي (توصيات الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية 2006)" (ملف PDF) . الكيمياء البحتة والتطبيقية 78 (10): 1897-1970 . doi : 10.1351/pac200678101897 . S2CID 97528124 . 
  6. ليو، شين (2021)، "2.1 هياكل الألكينات" ، الكيمياء العضوية 1 ، جامعة كوانتلين للفنون التطبيقية، ISBN 9781989864524تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 يونيو 2025
  7. "فريدريش أوغست كيكولي فون سترادونيتز - مخترع بنية البنزين - عالم الكيماويات" . www.worldofchemicals.com . تاريخ الوصول: 4 أبريل 2022 .
  8. براون، ويليام هنري (2018). الكيمياء العضوية . برنت ل. إيفرسون، إريك ف. أنسلين، كريستوفر س. فوت ( الطبعة الثامنة). بوسطن، ماساتشوستس. ISBN  978-1-305-58035-0. OCLC 974377227 . {{cite book}}: CS1 maint: موقع الناشر مفقود ( رابط )
  9. 1 2 تشانغ، تشينغ-تشي؛ تشانغ، شين-سونغ (يونيو 1999). "طريقة جديدة لتحويل إسقاط فيشر للسكريات الأحادية إلى إسقاط هاوورث" . مجلة التعليم الكيميائي . 76 (6): 799. doi : 10.1021/ed076p799 . ISSN 0021-9584 .